MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Hindbrain_P0_H3K27me3_23_172_0.525_1.703583e-06 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.078 0.023 0.009 0.89 0.043 0.057 0.841 0.059 0.043 0.815 0.064 0.078 0.082 0.028 0.84 0.05 0.747 0.066 0.066 0.121 0.773 0.067 0.041 0.119 0.772 0.074 0.076 0.078 0.09 0.066 0.129 0.715 0.762 0.088 0.05 0.1 0.811 0.071 0.06 0.058 MOTIF Heart_E13.5_H3K27me3_4_156_0.518_1.199478e-14 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.806 0.068 0.068 0.058 0.063 0.052 0.042 0.843 0.055 0.056 0.065 0.824 0.047 0.074 0.05 0.829 0.127 0.706 0.083 0.084 0.084 0.096 0.694 0.126 0.043 0.853 0.053 0.051 0.88 0.034 0.013 0.073 0.058 0.058 0.097 0.787 0.08 0.779 0.04 0.101 MOTIF Limb_E14.5_H3K27me3_28_176_0.536_1.117252e-13 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Midbrain_E13.5_H3K27me3_19_175_0.513_4.156509e-13 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.059 0.05 0.012 0.879 0.051 0.001 0.904 0.044 0.076 0.803 0.053 0.068 0.107 0.069 0.732 0.092 0.96 0.018 0.021 0.001 0.957 0.03 0.001 0.012 0.875 0.054 0.07 0.001 0.018 0.022 0.001 0.959 MOTIF Neural-Tube_E15.5_H3K4me1_25_169_0.536_2.417143e-128 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.567 0.431 0.001 0.135 0.004 0.622 0.239 0.895 0.001 0.103 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.045 0.039 0.001 0.915 MOTIF Midbrain_E12.5_H3K4me1_22_167_0.538_3.65368e-113 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.047 0.094 0.031 0.828 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.623 0.135 0.241 0.664 0.001 0.247 0.088 0.617 0.001 0.246 0.136 0.997 0.001 0.001 0.001 0.611 0.001 0.308 0.08 0.275 0.075 0.153 0.496 MOTIF Heart_E15.5_H3K4me1_29_167_0.525_3.608804e-65 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.672 0.103 0.094 0.131 0.105 0.114 0.09 0.691 0.106 0.094 0.098 0.702 0.087 0.096 0.079 0.738 0.139 0.618 0.118 0.125 0.192 0.097 0.606 0.105 0.111 0.697 0.079 0.113 0.703 0.105 0.082 0.11 0.104 0.658 0.132 0.106 0.11 0.09 0.09 0.71 MOTIF Lung_E14.5_H3K4me1_22_170_0.525_1.876916e-30 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.709 0.1 0.09 0.101 0.115 0.102 0.08 0.703 0.083 0.079 0.064 0.774 0.108 0.103 0.069 0.72 0.115 0.64 0.123 0.122 0.13 0.125 0.63 0.115 0.075 0.745 0.084 0.096 0.698 0.11 0.093 0.099 0.094 0.69 0.108 0.108 0.119 0.097 0.096 0.688 MOTIF Midbrain_E14.5_H3K4me1_16_170_0.541_9.429044e-110 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.121 0.091 0.093 0.695 0.023 0.062 0.854 0.061 0.088 0.631 0.156 0.125 0.121 0.063 0.691 0.125 0.749 0.038 0.099 0.114 0.901 0.034 0.038 0.027 0.834 0.046 0.072 0.048 0.152 0.135 0.068 0.645 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K4me1_11_167_0.542_2.43782e-115 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.095 0.064 0.088 0.753 0.025 0.064 0.863 0.048 0.074 0.583 0.167 0.176 0.198 0.082 0.593 0.127 0.785 0.029 0.113 0.073 0.912 0.015 0.041 0.032 0.798 0.037 0.088 0.077 0.124 0.09 0.072 0.714 MOTIF Neural-Tube_E14.5_H3K4me1_13_170_0.543_2.395634e-103 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.087 0.081 0.053 0.779 0.049 0.071 0.822 0.058 0.067 0.647 0.127 0.159 0.2 0.074 0.648 0.078 0.734 0.056 0.118 0.092 0.878 0.032 0.061 0.029 0.768 0.043 0.12 0.069 0.106 0.096 0.073 0.725 MOTIF Forebrain_E11.5_H3K4me1_11_167_0.550_1.809559e-124 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.046 0.756 0.197 0.001 0.119 0.001 0.001 0.879 0.001 0.011 0.971 0.017 0.043 0.52 0.214 0.223 0.2 0.001 0.395 0.404 0.83 0.001 0.066 0.103 0.954 0.001 0.03 0.015 0.771 0.001 0.111 0.117 MOTIF Forebrain_E14.5_H3K4me1_15_169_0.544_1.266028e-123 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.15 0.422 0.368 0.059 0.06 0.08 0.023 0.837 0.012 0.095 0.674 0.219 0.064 0.65 0.143 0.143 0.13 0.187 0.476 0.207 0.878 0.001 0.015 0.106 0.874 0.021 0.076 0.029 0.607 0.05 0.235 0.108 MOTIF Midbrain_E13.5_H3K4me1_21_168_0.538_2.583225e-137 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 MOTIF Neural-Tube_E12.5_H3K4me1_18_170_0.540_1.327256e-100 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.094 0.673 0.18 0.053 0.112 0.072 0.038 0.778 0.03 0.027 0.867 0.076 0.113 0.595 0.089 0.203 0.111 0.141 0.539 0.209 0.864 0.018 0.104 0.014 0.877 0.008 0.071 0.044 0.809 0.047 0.091 0.053 MOTIF Stomach_E15.5_H3K4me1_5_170_0.543_2.503591e-114 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.136 0.089 0.111 0.664 0.119 0.116 0.084 0.681 0.113 0.121 0.054 0.712 0.104 0.127 0.099 0.67 0.14 0.664 0.081 0.115 0.15 0.092 0.671 0.087 0.105 0.689 0.128 0.078 0.834 0.024 0.016 0.126 0.126 0.07 0.722 0.082 0.102 0.696 0.103 0.099 MOTIF Forebrain_E12.5_H3K4me1_20_163_0.536_1.015022e-121 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.056 0.861 0.053 0.03 0.001 0.021 0.001 0.977 0.001 0.043 0.894 0.062 0.001 0.395 0.001 0.603 0.153 0.279 0.567 0.001 0.934 0.001 0.052 0.013 0.962 0.001 0.022 0.015 0.803 0.022 0.001 0.174 MOTIF Stomach_E16.5_H3K4me1_13_165_0.536_1.986441e-78 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.001 0.965 0.014 0.02 0.001 0.001 0.001 0.997 0.025 0.019 0.883 0.073 0.001 0.725 0.206 0.068 0.097 0.244 0.658 0.001 0.992 0.001 0.001 0.006 0.948 0.037 0.014 0.001 0.872 0.008 0.051 0.069 MOTIF Neural-Tube_E15.5_H3K4me2_45_165_0.586_4.699252e-248 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.001 0.001 0.001 0.997 0.173 0.001 0.504 0.322 0.001 0.994 0.004 0.001 0.001 0.005 0.99 0.004 0.997 0.001 0.001 0.001 0.826 0.172 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.179 0.137 0.683