MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Heart_E13.5_H3K27me3_41_158_0.509_1.967276e-10 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.737 0.081 0.094 0.088 0.094 0.064 0.098 0.744 0.125 0.075 0.067 0.733 0.681 0.101 0.108 0.11 0.763 0.084 0.047 0.106 0.132 0.071 0.069 0.728 0.089 0.001 0.099 0.811 0.114 0.105 0.674 0.107 0.108 0.759 0.096 0.037 0.834 0.044 0.001 0.121 0.1 0.684 0.121 0.095 0.855 0.052 0.001 0.092 MOTIF Forebrain_E11.5_H3K27me3_39_168_0.518_5.17142e-12 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.747 0.073 0.089 0.091 0.749 0.086 0.083 0.082 0.746 0.087 0.081 0.086 0.082 0.091 0.077 0.75 0.082 0.095 0.077 0.746 0.733 0.08 0.095 0.092 0.738 0.085 0.091 0.086 0.085 0.084 0.077 0.754 0.102 0.044 0.072 0.782 0.084 0.08 0.742 0.094 0.086 0.745 0.091 0.078 0.765 0.094 0.046 0.095 MOTIF Kidney_E15.5_H3K27me3_40_167_0.511_2.126549e-07 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 MOTIF Forebrain_E14.5_H3K4me1_6_153_0.554_3.250693e-163 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.245 0.246 0.253 0.256 0.611 0.144 0.07 0.175 0.523 0.123 0.161 0.193 0.185 0.154 0.119 0.542 0.129 0.119 0.15 0.602 0.688 0.073 0.133 0.106 0.613 0.142 0.073 0.172 0.192 0.172 0.14 0.496 0.154 0.001 0.136 0.709 0.15 0.162 0.55 0.138 0.104 0.666 0.163 0.067 0.343 0.324 0.001 0.332 MOTIF Hindbrain_P0_H3K4me1_9_158_0.536_4.036374e-50 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.786 0.077 0.066 0.071 0.742 0.078 0.082 0.098 0.087 0.073 0.07 0.77 0.096 0.079 0.099 0.726 0.735 0.117 0.088 0.06 0.766 0.088 0.054 0.092 0.122 0.095 0.063 0.72 0.088 0.033 0.076 0.803 0.094 0.112 0.673 0.121 0.075 0.804 0.065 0.056 0.776 0.081 0.031 0.112 0.094 0.697 0.109 0.1 MOTIF Midbrain_E13.5_H3K4me1_27_153_0.533_1.975129e-116 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.091 0.047 0.764 0.098 0.091 0.042 0.769 0.098 0.112 0.099 0.692 0.097 0.751 0.078 0.1 0.071 0.756 0.074 0.08 0.09 0.097 0.064 0.072 0.767 0.082 0.075 0.085 0.758 0.783 0.074 0.076 0.067 0.768 0.069 0.068 0.095 0.104 0.084 0.077 0.735 0.088 0.049 0.087 0.776 0.122 0.097 0.68 0.101 MOTIF Forebrain_E16.5_H3K27ac_24_158_0.546_6.938397e-62 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.102 0.083 0.732 0.083 0.094 0.772 0.102 0.032 0.802 0.102 0.022 0.074 0.713 0.081 0.089 0.117 0.092 0.058 0.074 0.776 0.086 0.074 0.088 0.752 0.753 0.091 0.078 0.078 0.74 0.075 0.062 0.123 0.106 0.065 0.057 0.772 0.076 0.097 0.081 0.746 0.753 0.1 0.033 0.114 0.122 0.688 0.09 0.1 MOTIF Cranio-Facial_E14.5_H3K4me2_61_169_0.560_4.17193e-101 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.092 0.754 0.054 0.1 0.086 0.001 0.001 0.912 0.014 0.049 0.857 0.08 0.152 0.532 0.156 0.16 0.842 0.049 0.001 0.108 0.732 0.038 0.138 0.092 0.245 0.034 0.1 0.621 0.107 0.087 0.102 0.704 0.714 0.098 0.06 0.128 0.773 0.099 0.02 0.108 0.141 0.096 0.076 0.687 0.072 0.103 0.032 0.793 MOTIF Hindbrain_P0_H3K4me2_64_159_0.570_1.915682e-162 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.105 0.09 0.703 0.102 0.077 0.709 0.113 0.101 0.8 0.084 0.032 0.084 0.705 0.075 0.097 0.123 0.104 0.062 0.065 0.769 0.086 0.072 0.071 0.771 0.72 0.116 0.074 0.09 0.706 0.105 0.065 0.124 0.09 0.076 0.059 0.775 0.052 0.057 0.056 0.835 0.072 0.076 0.027 0.825 0.09 0.682 0.096 0.132 MOTIF Forebrain_E16.5_H3K4me2_48_159_0.580_1.389412e-202 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.052 0.074 0.823 0.051 0.076 0.798 0.091 0.035 0.807 0.036 0.069 0.088 0.803 0.051 0.073 0.073 0.062 0.066 0.043 0.829 0.059 0.105 0.063 0.773 0.792 0.083 0.094 0.031 0.827 0.045 0.065 0.063 0.078 0.099 0.073 0.75 0.066 0.073 0.062 0.799 MOTIF Limb_E11.5_H3K4me2_49_157_0.589_2.397613e-167 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.831 0.056 0.048 0.065 0.792 0.057 0.104 0.047 0.04 0.093 0.084 0.783 0.028 0.047 0.066 0.859 0.856 0.037 0.046 0.061 0.815 0.037 0.07 0.078 0.074 0.105 0.061 0.76 0.088 0.055 0.064 0.793 0.071 0.11 0.712 0.107 0.042 0.802 0.076 0.08 MOTIF Kidney_E14.5_H3K4me2_80_165_0.543_6.771646e-78 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.118 0.134 0.601 0.147 0.141 0.068 0.124 0.667 0.122 0.052 0.695 0.131 0.148 0.105 0.621 0.126 0.708 0.099 0.097 0.096 0.672 0.094 0.109 0.125 0.137 0.084 0.111 0.668 0.116 0.092 0.12 0.672 0.649 0.109 0.108 0.134 0.671 0.107 0.1 0.122 0.124 0.096 0.103 0.677 0.109 0.088 0.104 0.699 MOTIF Limb_E13.5_H3K4me2_60_172_0.558_1.210264e-140 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.215 0.29 0.223 0.272 0.142 0.071 0.12 0.667 0.114 0.115 0.636 0.135 0.158 0.575 0.13 0.137 0.686 0.113 0.073 0.128 0.615 0.11 0.135 0.14 0.142 0.102 0.116 0.64 0.136 0.106 0.122 0.636 0.64 0.117 0.099 0.144 0.651 0.116 0.105 0.128 0.15 0.12 0.12 0.61 0.234 0.208 0.202 0.357 MOTIF Neural-Tube_E11.5_H3K4me2_71_160_0.551_7.16487e-79 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.093 0.096 0.111 0.656 0.104 0.106 0.134 0.13 0.103 0.102 0.665 0.119 0.114 0.109 0.658 0.626 0.112 0.122 0.14 0.145 0.611 0.102 0.142 0.108 0.109 0.059 0.724 0.112 0.063 0.1 0.725 0.118 0.121 0.608 0.153 0.151 0.621 0.112 0.116 0.718 0.105 0.067 0.11 0.688 0.091 0.119 0.102 MOTIF Kidney_E14.5_H3K4me3_81_168_0.549_1.897051e-67 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.761 0.037 0.086 0.116 0.122 0.07 0.733 0.075 0.099 0.714 0.094 0.093 0.816 0.033 0.038 0.113 0.1 0.107 0.706 0.087 0.08 0.075 0.081 0.764 0.089 0.08 0.094 0.737 0.747 0.089 0.074 0.09 0.702 0.107 0.086 0.105 0.089 0.076 0.077 0.758 0.071 0.066 0.07 0.793 0.087 0.078 0.063 0.772 MOTIF Kidney_E15.5_H3K4me3_72_165_0.570_1.371902e-106 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.097 0.09 0.721 0.092 0.106 0.719 0.087 0.088 0.795 0.042 0.047 0.116 0.082 0.086 0.74 0.092 0.098 0.075 0.073 0.754 0.095 0.072 0.088 0.745 0.73 0.086 0.073 0.111 0.711 0.095 0.087 0.107 0.086 0.088 0.079 0.747 0.077 0.066 0.068 0.789 0.072 0.073 0.058 0.797 0.084 0.08 0.084 0.752 MOTIF Forebrain_E16.5_H3K4me3_61_166_0.590_5.548706e-148 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.069 0.056 0.824 0.051 0.079 0.719 0.113 0.089 0.869 0.048 0.027 0.056 0.781 0.061 0.105 0.053 0.105 0.038 0.034 0.823 0.067 0.078 0.054 0.801 0.818 0.075 0.058 0.049 0.753 0.061 0.083 0.103 0.053 0.059 0.08 0.808 0.074 0.062 0.059 0.805 MOTIF Kidney_E16.5_H3K4me3_65_161_0.585_1.590359e-165 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.783 0.07 0.068 0.079 0.824 0.06 0.046 0.07 0.092 0.07 0.043 0.795 0.049 0.035 0.07 0.846 0.81 0.057 0.061 0.072 0.764 0.062 0.082 0.092 0.055 0.111 0.085 0.749 0.072 0.06 0.05 0.818 0.078 0.091 0.758 0.073 0.037 0.852 0.058 0.053 MOTIF Midbrain_E11.5_H3K4me3_61_167_0.586_1.779863e-108 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.068 0.059 0.819 0.054 0.053 0.807 0.082 0.058 0.858 0.037 0.027 0.078 0.772 0.055 0.109 0.064 0.102 0.084 0.055 0.759 0.057 0.074 0.048 0.821 0.804 0.082 0.063 0.051 0.774 0.065 0.075 0.086 0.078 0.088 0.035 0.799 0.062 0.102 0.048 0.788