MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Liver_P0_H3K27me3_58_103_0.514_1.152614e-09
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.155639	0.783292	0.022999	0.038071
0.001553	0.939642	0.0	0.058805
0.747486	0.046234	0.141499	0.064781
0.003568	0.080997	0.906369	0.009065
0.021113	0.041449	0.93367	0.003768
0.024552	0.788769	0.0	0.186679
0.266878	0.0	0.19859	0.534532
0.019878	0.095197	0.0	0.884925
0.0	0.982994	0.017006	0.0
0.144117	0.390011	0.201389	0.264484

MOTIF	Midbrain_E14.5_H3K4me1_48_68_0.520_4.500347e-28
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.052875	0.919831	0.026496	0.000797
0.833583	0.069472	0.057828	0.039117
0.010415	0.157185	0.810574	0.021826
0.076832	0.076693	0.719521	0.126954
0.053388	0.749878	0.033366	0.163368
0.092942	0.02329	0.132119	0.75165
0.006969	0.04487	0.024265	0.923896
0.005449	0.712601	0.023293	0.258656
0.006653	0.93935	0.024268	0.02973
0.129592	0.785932	0.018	0.066476
0.063659	0.273591	0.277327	0.385423

MOTIF	Heart_E11.5_H3K4me1_39_81_0.518_2.063242e-26
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.020045	0.961848	0.018107	0.0
0.836814	0.03007	0.038652	0.094463
0.002077	0.09747	0.89445	0.006004
0.108534	0.079956	0.776424	0.035086
0.113536	0.686314	0.088522	0.111629
0.153422	0.052035	0.027001	0.767542
0.014959	0.074253	0.011901	0.898887
0.005566	0.726084	0.062606	0.205744
0.000898	0.812316	0.105539	0.081248
0.140149	0.111812	0.409216	0.338823
0.360855	0.199813	0.029736	0.409596
0.038177	0.449229	0.068547	0.444047

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K4me1_50_53_0.522_2.847209e-49
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.030431	0.461499	0.223326	0.284744
0.565969	0.184761	0.138766	0.110504
0.129758	0.730598	0.138549	0.001095
0.730318	0.032424	0.176403	0.060855
0.017084	0.144375	0.802033	0.036508
0.054907	0.030767	0.842998	0.071328
0.043583	0.786535	0.039053	0.130829
0.02728	0.052627	0.15398	0.766112
0.013117	0.088383	0.047802	0.850699
0.003409	0.918619	0.040048	0.037925
0.0	0.884432	0.075917	0.039651
0.272274	0.133059	0.059571	0.535096

MOTIF	Kidney_P0_H3K4me1_46_58_0.517_6.046533e-20
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.03882	0.440248	0.291831	0.229101
0.858674	0.030817	0.034556	0.075954
0.011425	0.962626	0.025949	0.0
0.770134	0.0346	0.144575	0.050691
0.001218	0.181544	0.778954	0.038285
0.173127	0.071358	0.7107	0.044815
0.099003	0.77072	0.092833	0.037444
0.076766	0.012409	0.080371	0.830454
0.027878	0.09321	0.043488	0.835424
0.013005	0.895702	0.044185	0.047108
0.082149	0.84512	0.018844	0.053887
0.128955	0.319401	0.177431	0.374213

MOTIF	Hindbrain_E11.5_H3K4me1_39_57_0.535_5.284221e-41
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.084881	0.895802	0.016675	0.002642
0.644944	0.193709	0.070461	0.090886
0.021909	0.147234	0.799731	0.031126
0.054059	0.094548	0.787069	0.064324
0.022839	0.748014	0.023179	0.205968
0.01521	0.028346	0.094045	0.862398
0.028932	0.100176	0.002613	0.868279
0.004552	0.936717	0.038137	0.020594
0.063437	0.892512	0.01149	0.03256
0.178126	0.350601	0.191656	0.279617

MOTIF	Hindbrain_P0_H3K4me1_37_68_0.524_2.268738e-25
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.131219	0.844671	0.021896	0.002214
0.846016	0.047927	0.05655	0.049507
0.019384	0.154998	0.82134	0.004278
0.064903	0.138864	0.643682	0.152552
0.095043	0.705663	0.022393	0.176901
0.082128	0.015001	0.102531	0.800339
0.020007	0.066119	0.029915	0.883959
0.003578	0.958694	0.011968	0.025761
0.0	0.89738	0.074872	0.027747
0.064369	0.313415	0.121403	0.500813

MOTIF	Stomach_E15.5_H3K4me1_29_94_0.527_5.543282e-45
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.145983	0.848321	0.005696	0.0
0.775552	0.068359	0.041232	0.114856
0.006304	0.197069	0.772418	0.024209
0.108858	0.038296	0.763366	0.08948
0.122242	0.807461	0.029008	0.04129
0.047528	0.073163	0.035809	0.8435
0.05005	0.039243	0.019111	0.891596
0.002407	0.923831	0.029715	0.044047
0.0	0.789913	0.135462	0.074625
0.016309	0.225753	0.27808	0.479858
0.071726	0.069311	0.0	0.858963

MOTIF	Forebrain_E12.5_H3K27ac_61_130_0.518_9.06919e-19
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	1.0	0.0	0.0
0.815036	0.071048	0.070049	0.043867
0.009804	0.056918	0.923258	0.01002
0.073053	0.104968	0.664292	0.157688
0.119757	0.502319	0.036577	0.341347
0.128621	0.03237	0.012211	0.826798
0.006424	0.055713	0.0	0.937862
0.002692	0.960878	0.004204	0.032226
0.004526	0.989986	0.0	0.005488

MOTIF	Forebrain_E12.5_H3K27ac_69_128_0.511_1.373983e-08
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.184006	0.802469	0.0	0.013525
0.0	1.0	0.0	0.0
0.875399	0.026112	0.06924	0.029249
0.0	0.288445	0.711555	0.0
0.042944	0.099194	0.769516	0.088347
0.198687	0.540901	0.07467	0.185742
0.046723	0.098401	0.020841	0.834034
0.014566	0.082632	0.0	0.902803
0.006868	0.934209	0.012278	0.046644

MOTIF	Intestine_E16.5_H3K27ac_61_85_0.516_2.301716e-20
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.026026	0.0	0.973974	0.0
0.787503	0.0	0.123798	0.088699
0.776168	0.17428	0.028831	0.020721
0.067016	0.104326	0.805183	0.023475
0.04189	0.793712	0.019202	0.145196
0.0	0.971165	0.028835	0.0
0.133993	0.032403	0.07187	0.761734
0.028724	0.147932	0.823344	0.0
0.037269	0.0	0.74441	0.218321
0.120341	0.044493	0.802298	0.032868

MOTIF	Limb_E14.5_H3K27ac_53_135_0.528_5.771052e-34
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.040559	0.922161	0.037281	0.0
0.87722	0.065979	0.049316	0.007484
0.019172	0.078631	0.878159	0.024038
0.198216	0.053686	0.722551	0.025547
0.045254	0.653144	0.023056	0.278546
0.030525	0.017122	0.04981	0.902543
0.000723	0.043122	0.0061	0.950055
0.0002	0.613867	0.071586	0.314346
0.00723	0.939592	0.03618	0.016998
0.122078	0.351281	0.02959	0.497051

MOTIF	Cranio-Facial_E11.5_H3K27ac_54_107_0.527_7.454201e-23
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.00394	0.95208	0.037546	0.006434
0.724401	0.062789	0.087788	0.125023
0.019217	0.051432	0.915028	0.014323
0.131321	0.063475	0.794337	0.010868
0.114374	0.613993	0.018955	0.252678
0.016437	0.051914	0.183116	0.748534
0.007913	0.065535	0.019241	0.907311
0.002277	0.772245	0.09124	0.134238
0.005726	0.933619	0.025302	0.035352
0.488512	0.106296	0.146571	0.258622

MOTIF	Midbrain_E15.5_H3K27ac_76_80_0.521_1.475223e-26
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.00808	0.820394	0.171525	0.0
0.765056	0.046988	0.140313	0.047643
0.013868	0.22713	0.72662	0.032381
0.066158	0.039976	0.79659	0.097276
0.02087	0.753208	0.034428	0.191494
0.0	0.069896	0.258544	0.671559
0.005713	0.082292	0.015953	0.896042
0.0	0.978376	0.00659	0.015034
0.00566	0.929107	0.03204	0.033194
0.223159	0.376527	0.109349	0.290964

MOTIF	Midbrain_E16.5_H3K27ac_69_48_0.521_1.108925e-25
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.7651	0.217467	0.017432
0.863232	0.0	0.031427	0.105341
0.027482	0.898163	0.074355	0.0
0.668059	0.088375	0.238812	0.004754
0.0	0.119269	0.859103	0.021628
0.117141	0.089319	0.778754	0.014786
0.025317	0.755062	0.074112	0.145509
0.0263	0.046916	0.2315	0.695284
0.010341	0.118412	0.008047	0.8632
0.001645	0.951319	0.042375	0.004661
0.0	0.971695	0.0	0.028305
0.202468	0.131416	0.200259	0.465857

MOTIF	Cranio-Facial_E12.5_H3K27ac_32_65_0.531_5.806882e-36
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.038986	0.934171	0.023392	0.003451
0.69001	0.161902	0.082011	0.066077
0.005991	0.147385	0.838414	0.00821
0.082873	0.083904	0.80626	0.026963
0.088515	0.634557	0.033489	0.24344
0.036548	0.04218	0.197687	0.723585
0.003492	0.065203	0.024381	0.906924
0.001929	0.971809	0.011417	0.014845
0.0	0.823321	0.014377	0.162301
0.036251	0.241823	0.129669	0.592257
0.199258	0.10354	0.53408	0.163122

MOTIF	Midbrain_E13.5_H3K27ac_33_49_0.537_2.196047e-58
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.02336	0.815227	0.148212	0.013201
0.656999	0.103216	0.180494	0.059292
0.008634	0.159048	0.81046	0.021858
0.109883	0.047446	0.78192	0.060752
0.046902	0.813544	0.022981	0.116573
0.028561	0.077281	0.140162	0.753997
0.004815	0.046253	0.030373	0.918558
0.004166	0.966536	0.018996	0.010302
0.004304	0.847295	0.016979	0.131421
0.108926	0.150186	0.48695	0.253938
0.021753	0.041411	0.584367	0.352469

MOTIF	Neural-Tube_E13.5_H3K27ac_49_68_0.525_1.032136e-31
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.070667	0.820453	0.10888	0.0
0.632541	0.214584	0.051866	0.101009
0.009166	0.035557	0.941336	0.013941
0.077284	0.04139	0.753164	0.128161
0.095466	0.72417	0.025276	0.155088
0.036254	0.061856	0.176217	0.725672
0.008003	0.073273	0.009307	0.909418
0.00671	0.968999	0.006219	0.018072
0.0	0.93904	0.015937	0.045024
0.217833	0.138244	0.357546	0.286377
0.0	0.080987	0.501582	0.417431
0.372982	0.059983	0.379652	0.187383

MOTIF	Kidney_E16.5_H3K9ac_95_143_0.511_3.354318e-26
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.001153	0.981568	0.016226	0.001053
0.880008	0.0	0.066958	0.053034
0.002588	0.102632	0.89478	0.0
0.123962	0.160465	0.605294	0.110279
0.05918	0.665006	0.055143	0.220671
0.008854	0.075562	0.014193	0.901391
0.0	0.109053	0.014553	0.876393
0.0	0.891814	0.00214	0.106046
0.0	0.690523	0.0	0.309477