MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Cranio-Facial_E11.5_H3K4me2_63_95_0.579_9.648738e-187
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.962811	0.025937	0.011253
0.038837	0.896606	0.030822	0.033736
0.007116	0.019422	0.802135	0.171328
0.161397	0.043193	0.76828	0.02713
0.02547	0.019772	0.929469	0.025289
0.02168	0.420225	0.170572	0.387523
0.048753	0.0	0.931046	0.020201
0.042607	0.0	0.070032	0.887361
0.0	0.857352	0.02527	0.117378

MOTIF	Limb_E12.5_H3K4me2_17_40_0.629_7.520215e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.716119	0.0	0.21239	0.071492
0.0	0.040854	0.959146	0.0
0.542947	0.269655	0.026708	0.16069
0.0	1.0	0.0	0.0
0.049343	0.0	0.950657	0.0
0.0	0.967132	0.026635	0.006233
0.036972	0.810596	0.10001	0.052422
0.028081	0.928209	0.034354	0.009356
0.0	0.045744	0.732272	0.221984

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K4me3_44_28_0.633_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.881362	0.0	0.075045	0.043593
0.0	0.0	0.931204	0.068796
0.353688	0.558144	0.065976	0.022192
0.038603	0.644333	0.167937	0.149126
0.021827	0.0	0.959291	0.018882
0.024747	0.912542	0.054187	0.008524
0.058416	0.888134	0.045169	0.008281
0.118355	0.720178	0.034823	0.126644
0.062012	0.028053	0.897661	0.012273
0.0	0.815826	0.026937	0.157237

MOTIF	Kidney_E15.5_H3K4me3_47_56_0.628_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.902551	0.035039	0.06241	0.0
0.007554	0.033457	0.950273	0.008716
0.23062	0.748187	0.021192	0.0
0.055806	0.696162	0.0	0.248032
0.062783	0.0	0.85641	0.080807
0.113271	0.824962	0.038606	0.023161
0.205317	0.620083	0.076355	0.098245
0.057881	0.882314	0.031798	0.028008
0.171708	0.0	0.801257	0.027035

MOTIF	Heart_E13.5_H3K4me3_36_60_0.643_6.116533e-321
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.887784	0.0	0.039977	0.072239
0.0	0.0	0.979483	0.020517
0.433309	0.506563	0.060127	0.0
0.024522	0.945394	0.021111	0.008973
0.055587	0.093408	0.783163	0.067841
0.038701	0.543549	0.41775	0.0
0.028011	0.926476	0.045513	0.0
0.079123	0.920877	0.0	0.0
0.041503	0.063946	0.894551	0.0

MOTIF	Hindbrain_E15.5_H3K4me3_35_51_0.656_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.862379	0.045457	0.0	0.092165
0.0	0.031339	0.968661	0.0
0.176322	0.722914	0.019578	0.081186
0.0	1.0	0.0	0.0
0.276207	0.035279	0.640693	0.047821
0.0	0.65357	0.34643	0.0
0.188284	0.738502	0.032888	0.040325
0.025524	0.834582	0.078971	0.060923
0.033365	0.0	0.966635	0.0

MOTIF	Kidney_E16.5_H3K4me3_46_52_0.620_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.708064	0.0	0.134549	0.157387
0.0	0.011224	0.892642	0.096134
0.160104	0.819467	0.020429	0.0
0.0	0.960918	0.010038	0.029044
0.173782	0.01479	0.774249	0.037179
0.0	0.875612	0.124388	0.0
0.095127	0.795721	0.093216	0.015936
0.043803	0.578659	0.052841	0.324697
0.068299	0.0	0.931701	0.0

MOTIF	Limb_E14.5_H3K4me3_76_70_0.581_1.401334e-167
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.967146	0.032854	0.0
0.861422	0.0	0.029534	0.109044
0.0	0.043918	0.938989	0.017093
0.186402	0.64985	0.028452	0.135297
0.023533	0.921888	0.029784	0.024794
0.188721	0.005688	0.737209	0.068381
0.0	0.934794	0.054128	0.011077
0.028807	0.639283	0.012413	0.319497
0.0	0.703092	0.044334	0.252574
0.256297	0.0	0.683748	0.059955

MOTIF	Limb_E12.5_H3K4me3_8_3_0.723_1.546425e-321
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.292031	0.010633	0.183926	0.51341
0.054845	0.678132	0.169745	0.097278
0.074925	0.776361	0.087826	0.060887
0.032991	0.77578	0.101871	0.089358
0.083696	0.028907	0.836034	0.051362
0.05029	0.821839	0.094997	0.032874
0.055208	0.678142	0.229191	0.03746
0.02997	0.773457	0.103477	0.093096
0.025917	0.024409	0.931687	0.017988
0.001271	0.927821	0.056509	0.014399

MOTIF	Cranio-Facial_E13.5_H3K4me3_9_4_0.732_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.037586	0.706877	0.175524	0.080013
0.050293	0.779166	0.139604	0.030937
0.040934	0.760885	0.104857	0.093324
0.062413	0.042442	0.767501	0.127643
0.040827	0.835993	0.088588	0.034592
0.02954	0.724098	0.161248	0.085115
0.071041	0.747693	0.144849	0.036417
0.033199	0.009379	0.935834	0.021589
0.0023	0.924645	0.057658	0.015398

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K4me3_4_4_0.739_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.04056	0.770181	0.096612	0.092648
0.021734	0.758061	0.133629	0.086576
0.041181	0.788619	0.087224	0.082975
0.053531	0.017805	0.781244	0.14742
0.043895	0.852411	0.069879	0.033815
0.027471	0.675299	0.206724	0.090506
0.087551	0.787903	0.085259	0.039287
0.026841	0.008396	0.916933	0.047831
0.012008	0.921522	0.050983	0.015486

MOTIF	Stomach_E15.5_H3K4me3_4_4_0.735_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.033826	0.690256	0.188836	0.087082
0.048108	0.718304	0.150232	0.083356
0.039429	0.785478	0.110486	0.064607
0.058782	0.037274	0.768456	0.135488
0.042461	0.831838	0.087813	0.037888
0.030932	0.710174	0.176654	0.082239
0.034776	0.80989	0.091637	0.063697
0.01392	0.016896	0.920549	0.048635
0.012993	0.960275	0.01177	0.014962

MOTIF	Hindbrain_E15.5_H3K4me3_7_2_0.738_5.807214e-315
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.052213	0.03578	0.822191	0.089816
0.046688	0.815614	0.070611	0.067087
0.123051	0.736419	0.046114	0.094416
0.073952	0.02948	0.749381	0.147187
0.045862	0.851329	0.049601	0.053207
0.055703	0.714157	0.106343	0.123797
0.051132	0.820073	0.028813	0.099982
0.022327	0.038613	0.88402	0.05504
0.014543	0.871677	0.075263	0.038517
0.278368	0.02943	0.615151	0.077052
0.096944	0.363986	0.415325	0.123745
0.098464	0.223729	0.360445	0.317363

MOTIF	Forebrain_E12.5_H3K4me3_6_7_0.748_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.046611	0.821608	0.055123	0.076659
0.171895	0.651568	0.055364	0.121173
0.02885	0.024517	0.883537	0.063096
0.018259	0.857701	0.060502	0.063538
0.021821	0.82646	0.067739	0.083981
0.0748	0.782457	0.028522	0.114222
0.067706	0.048733	0.749962	0.133598
0.095143	0.791008	0.063857	0.049992
0.085655	0.037378	0.834686	0.042282
0.219219	0.205173	0.493135	0.082473

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K4me3_2_2_0.765_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.029585	0.827207	0.08042	0.062788
0.120296	0.78813	0.035877	0.055697
0.06418	0.036031	0.754232	0.145557
0.043865	0.840889	0.054863	0.060383
0.059682	0.80769	0.066796	0.065832
0.073779	0.789229	0.044465	0.092527
0.041929	0.032609	0.860991	0.064471
0.064776	0.811875	0.086041	0.037308
0.068019	0.075757	0.794453	0.061772
0.243106	0.223824	0.291086	0.241984

MOTIF	Liver_P0_H3K4me3_2_8_0.717_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.054309	0.77929	0.075865	0.090536
0.127701	0.730401	0.049796	0.092102
0.022881	0.039915	0.778169	0.159035
0.066718	0.7926	0.064132	0.07655
0.017664	0.836737	0.067837	0.077762
0.066389	0.822687	0.026563	0.084362
0.058099	0.03082	0.809495	0.101586
0.054801	0.82666	0.073253	0.045285
0.029855	0.054095	0.800708	0.115342

MOTIF	Intestine_E14.5_H3K4me3_5_7_0.763_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.06798	0.863365	0.03463	0.034025
0.043898	0.774554	0.061665	0.119883
0.082955	0.072076	0.681982	0.162987
0.051141	0.772426	0.126502	0.04993
0.042897	0.844452	0.036778	0.075873
0.073182	0.773747	0.040938	0.112132
0.020576	0.045003	0.810253	0.124168
0.050436	0.866254	0.050422	0.032887
0.030229	0.083101	0.85281	0.03386

MOTIF	Heart_E15.5_H3K4me3_5_10_0.710_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.049462	0.784499	0.067015	0.099023
0.105509	0.770173	0.034877	0.089441
0.123199	0.032619	0.672054	0.172128
0.052525	0.777952	0.085929	0.083594
0.024503	0.910617	0.02941	0.03547
0.033942	0.848098	0.032703	0.085256
0.052788	0.058698	0.760954	0.12756
0.049445	0.834987	0.07768	0.037888
0.076337	0.04643	0.828593	0.04864

MOTIF	Liver_E14.5_H3K4me3_5_6_0.704_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.02041	0.853707	0.045837	0.080045
0.045802	0.78662	0.05425	0.113328
0.086948	0.052737	0.614021	0.246294
0.059292	0.800214	0.064547	0.075947
0.024434	0.818349	0.079559	0.077658
0.058457	0.853288	0.020227	0.068027
0.023247	0.035111	0.831678	0.109964
0.057323	0.84396	0.061372	0.037345
0.040859	0.086861	0.819723	0.052557

MOTIF	Midbrain_E14.5_H3K4me3_2_5_0.770_2.479391e-312
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.028914	0.866966	0.043828	0.060291
0.135778	0.699067	0.057057	0.108097
0.075689	0.075603	0.674102	0.174606
0.056909	0.791313	0.075201	0.076577
0.025792	0.821845	0.076719	0.075643
0.061108	0.856064	0.027758	0.05507
0.019082	0.037567	0.838257	0.105094
0.055703	0.846492	0.063034	0.034771
0.070803	0.06493	0.810902	0.053365

MOTIF	Liver_E12.5_H3K4me3_1_4_0.728_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.049363	0.827079	0.058811	0.064747
0.090856	0.5488	0.248044	0.1123
0.032501	0.038895	0.737438	0.191166
0.064113	0.690578	0.148835	0.096474
0.018017	0.860468	0.053475	0.06804
0.056904	0.82182	0.044153	0.077124
0.026497	0.06801	0.875788	0.029705
0.026623	0.862045	0.050334	0.060998
0.03486	0.015217	0.895131	0.054792

MOTIF	Neural-Tube_E12.5_H3K4me3_1_2_0.780_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.023854	0.86049	0.062245	0.053411
0.084928	0.64545	0.172862	0.096759
0.069521	0.014983	0.75675	0.158745
0.048683	0.809588	0.060652	0.081078
0.020896	0.796512	0.098996	0.083596
0.059237	0.83894	0.0439	0.057923
0.023788	0.047049	0.848616	0.080546
0.050773	0.834776	0.075139	0.039312
0.072996	0.073759	0.803847	0.049399

MOTIF	Cranio-Facial_E15.5_H3K4me3_7_6_0.712_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.028896	0.054763	0.833464	0.082877
0.045377	0.812768	0.078763	0.063092
0.110472	0.686977	0.097501	0.105051
0.073208	0.044789	0.745841	0.136162
0.040003	0.881151	0.047541	0.031305
0.05173	0.736304	0.122243	0.089724
0.071676	0.774342	0.075722	0.07826
0.03361	0.024577	0.899906	0.041907
0.011325	0.835178	0.136052	0.017445

MOTIF	Heart_E11.5_H3K4me3_8_7_0.702_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.031368	0.040883	0.838523	0.089226
0.051066	0.792768	0.107488	0.048678
0.119327	0.649224	0.120693	0.110756
0.074834	0.070789	0.734681	0.119696
0.032632	0.878023	0.043926	0.045419
0.051125	0.691827	0.155123	0.101926
0.103032	0.787881	0.048224	0.060862
0.037191	0.070899	0.842297	0.049613
0.006414	0.827085	0.147837	0.018664

MOTIF	Lung_E16.5_H3K4me3_8_9_0.694_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.044704	0.077045	0.79463	0.083621
0.064288	0.788558	0.090444	0.05671
0.099083	0.735628	0.06942	0.095869
0.057364	0.049622	0.775521	0.117493
0.038356	0.85482	0.063061	0.043764
0.04802	0.691991	0.173689	0.0863
0.0841	0.728846	0.095992	0.091063
0.032171	0.050688	0.86957	0.04757
0.046458	0.846739	0.091923	0.01488

MOTIF	Midbrain_E13.5_H3K4me3_6_10_0.733_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.053619	0.051269	0.815581	0.079531
0.046619	0.805392	0.081265	0.066725
0.097345	0.670056	0.138833	0.093766
0.072736	0.116176	0.696212	0.114877
0.029306	0.843513	0.084325	0.042856
0.052908	0.700794	0.15575	0.090549
0.086425	0.723214	0.117234	0.073127
0.03128	0.053885	0.866872	0.047963
0.050369	0.858657	0.066903	0.024071

MOTIF	Midbrain_E15.5_H3K4me3_7_6_0.738_1.19218e-320
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.02326	0.119555	0.79216	0.065024
0.037568	0.814953	0.097051	0.050428
0.072234	0.678971	0.159264	0.089531
0.059701	0.09428	0.730544	0.115475
0.04237	0.823067	0.09441	0.040152
0.051814	0.716053	0.142488	0.089645
0.089243	0.784809	0.063683	0.062265
0.034348	0.080628	0.809263	0.075761
0.020552	0.789055	0.159543	0.03085

MOTIF	Midbrain_P0_H3K4me3_8_6_0.746_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.038295	0.099109	0.797855	0.064741
0.041912	0.811669	0.100649	0.04577
0.089447	0.693514	0.140347	0.076692
0.062687	0.116812	0.707917	0.112584
0.044514	0.788684	0.126329	0.040473
0.048197	0.705348	0.156075	0.09038
0.076592	0.756205	0.106817	0.060386
0.053296	0.095886	0.798563	0.052255
0.022589	0.783246	0.159483	0.034682

MOTIF	Cranio-Facial_E12.5_H3K4me3_6_6_0.737_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.045633	0.045703	0.7978	0.110864
0.023252	0.850141	0.079285	0.047322
0.040538	0.731241	0.112563	0.115658
0.092844	0.052639	0.737661	0.116856
0.046898	0.753152	0.151444	0.048506
0.086068	0.684294	0.150952	0.078686
0.03983	0.779949	0.0629	0.117321
0.014426	0.04897	0.896957	0.039646
0.007287	0.82435	0.141963	0.0264

MOTIF	Neural-Tube_E12.5_H3K4me3_10_10_0.735_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.021755	0.070336	0.808217	0.099691
0.045397	0.844785	0.052162	0.057656
0.039982	0.724001	0.127438	0.108579
0.070377	0.06348	0.735397	0.130745
0.037445	0.789564	0.124082	0.048909
0.052991	0.703835	0.138025	0.105149
0.08702	0.758787	0.072024	0.082169
0.021491	0.065977	0.832001	0.08053
0.011855	0.870484	0.069306	0.048356

MOTIF	Stomach_E14.5_H3K4me3_9_7_0.740_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.051521	0.043393	0.795286	0.1098
0.054112	0.8014	0.076691	0.067798
0.120909	0.655271	0.10046	0.12336
0.078789	0.043816	0.826464	0.050931
0.036189	0.832552	0.080434	0.050825
0.069545	0.70052	0.138752	0.091184
0.040079	0.820019	0.039422	0.10048
0.032085	0.017263	0.864761	0.085891
0.016209	0.891988	0.060933	0.030871

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K4me3_6_6_0.745_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.046945	0.059252	0.814756	0.079046
0.046808	0.790229	0.099776	0.063187
0.12621	0.761743	0.037057	0.074989
0.062837	0.024344	0.802847	0.109973
0.038431	0.87483	0.03975	0.04699
0.052368	0.658574	0.189334	0.099724
0.093894	0.761054	0.079904	0.065149
0.03243	0.005642	0.898318	0.063611
0.03427	0.865124	0.068898	0.031708

MOTIF	Intestine_P0_H3K4me3_9_6_0.706_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.049422	0.043023	0.822668	0.084887
0.049663	0.828922	0.071748	0.049667
0.121871	0.674258	0.108838	0.095033
0.065532	0.031348	0.771774	0.131346
0.035765	0.835401	0.086282	0.042552
0.057348	0.739278	0.110169	0.093205
0.081162	0.799463	0.034491	0.084885
0.020151	0.013285	0.877352	0.089212
0.011935	0.863138	0.086355	0.038572

MOTIF	Limb_E11.5_H3K4me3_13_8_0.734_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.026612	0.04018	0.8415	0.091708
0.047931	0.824639	0.068167	0.059263
0.124187	0.66727	0.114077	0.094466
0.072197	0.028351	0.791622	0.10783
0.044903	0.814817	0.092349	0.047931
0.049215	0.772716	0.111622	0.066447
0.090268	0.793179	0.038541	0.078012
0.029539	0.017656	0.860561	0.092245
0.013729	0.81286	0.139505	0.033906

MOTIF	Lung_E15.5_H3K4me3_9_6_0.721_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.030856	0.040947	0.844348	0.083849
0.043845	0.861934	0.052352	0.041868
0.114901	0.685127	0.096989	0.102982
0.069321	0.052049	0.753763	0.124866
0.038082	0.797057	0.120485	0.044376
0.055907	0.697847	0.142137	0.10411
0.076534	0.762743	0.076713	0.08401
0.024866	0.046963	0.86585	0.062321
0.011963	0.788712	0.164173	0.035152

MOTIF	Heart_E12.5_H3K4me3_21_8_0.668_3.07079e-316
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.030427	0.03975	0.834283	0.09554
0.052438	0.82759	0.055642	0.064331
0.123946	0.720696	0.03961	0.115748
0.057821	0.034287	0.757112	0.15078
0.052035	0.827754	0.068458	0.051753
0.057386	0.730785	0.098226	0.113603
0.124494	0.759346	0.030979	0.085181
0.03193	0.013688	0.888602	0.065779
0.018442	0.879077	0.065284	0.037198

MOTIF	Hindbrain_P0_H3K4me3_14_14_0.716_2.489251e-312
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.028438	0.03427	0.849201	0.088091
0.043936	0.819119	0.063094	0.073851
0.118694	0.724088	0.051602	0.105616
0.085725	0.046199	0.739052	0.129024
0.047052	0.837798	0.078813	0.036336
0.047481	0.712837	0.122019	0.117664
0.106426	0.789456	0.0356	0.068519
0.023917	0.006083	0.901135	0.068865
0.016319	0.884879	0.061592	0.037209

MOTIF	Liver_E13.5_H3K4me3_8_8_0.676_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.027332	0.040695	0.833761	0.098212
0.054847	0.817304	0.064879	0.06297
0.112893	0.723384	0.07428	0.089443
0.081803	0.056346	0.725787	0.136064
0.042986	0.826589	0.083889	0.046536
0.073675	0.708644	0.112984	0.104698
0.066774	0.835579	0.037565	0.060082
0.023113	0.014435	0.876935	0.085517
0.027867	0.88385	0.053092	0.035192

MOTIF	Lung_E14.5_H3K4me3_11_8_0.728_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.049205	0.05861	0.839629	0.052556
0.061136	0.803157	0.086746	0.048961
0.108318	0.684137	0.105268	0.102277
0.067248	0.062486	0.733668	0.136597
0.039995	0.816625	0.08975	0.05363
0.049611	0.73843	0.109908	0.102051
0.088542	0.800525	0.033536	0.077397
0.035663	0.012675	0.904832	0.04683
0.013842	0.871549	0.078735	0.035873

MOTIF	Neural-Tube_E13.5_H3K4me3_10_6_0.724_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.024066	0.050485	0.852839	0.07261
0.061759	0.836135	0.062618	0.039488
0.09934	0.709168	0.084823	0.106669
0.079436	0.051872	0.749726	0.118966
0.041412	0.843216	0.078554	0.036819
0.054256	0.717808	0.123474	0.104461
0.081664	0.775383	0.0539	0.089053
0.071366	0.018947	0.865437	0.04425
0.011276	0.865508	0.086345	0.03687

MOTIF	Heart_E13.5_H3K4me3_15_9_0.666_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.032751	0.071414	0.840183	0.055652
0.019189	0.87541	0.061512	0.043889
0.11713	0.808525	0.029842	0.044503
0.058317	0.021521	0.777327	0.142835
0.041139	0.818319	0.104367	0.036175
0.056875	0.756078	0.077676	0.109371
0.111702	0.717254	0.081567	0.089477
0.064625	0.042359	0.791682	0.101335
0.047591	0.820254	0.087142	0.045013

MOTIF	Limb_E13.5_H3K4me3_12_8_0.706_2.221319e-320
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.04467	0.035726	0.841637	0.077967
0.044343	0.8116	0.081543	0.062514
0.120998	0.734039	0.055304	0.089658
0.067264	0.039819	0.760067	0.13285
0.035253	0.879082	0.046817	0.038848
0.053667	0.742197	0.11246	0.091677
0.072641	0.758646	0.074111	0.094602
0.037642	0.037553	0.855116	0.069689
0.030623	0.827981	0.107659	0.033737

MOTIF	Hindbrain_E14.5_H3K4me3_12_8_0.735_1.516782e-321
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.041499	0.056387	0.81263	0.089484
0.051339	0.813989	0.076053	0.058619
0.123317	0.751791	0.035666	0.089226
0.066482	0.024424	0.799967	0.109126
0.030012	0.835167	0.089945	0.044876
0.067274	0.729527	0.101613	0.101586
0.079474	0.744332	0.079507	0.096687
0.042032	0.03032	0.85852	0.069128
0.033093	0.871364	0.064161	0.031383

MOTIF	Kidney_E16.5_H3K4me3_12_7_0.685_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.035382	0.052445	0.820158	0.092015
0.053651	0.821699	0.069708	0.054942
0.130396	0.75705	0.03739	0.075163
0.079743	0.0277	0.779275	0.113281
0.038589	0.82953	0.086763	0.045118
0.053593	0.768306	0.082988	0.095112
0.085181	0.734508	0.079492	0.100819
0.045001	0.037521	0.844266	0.073212
0.027181	0.867239	0.070266	0.035314

MOTIF	Stomach_P0_H3K4me3_20_9_0.691_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.031359	0.055707	0.819197	0.093737
0.025111	0.854991	0.060569	0.059328
0.1375	0.749804	0.033692	0.079004
0.080626	0.030354	0.771129	0.11789
0.038478	0.843225	0.069939	0.048357
0.050692	0.755629	0.087852	0.105827
0.115837	0.718182	0.081173	0.084807
0.05168	0.03101	0.848204	0.069106
0.033739	0.859766	0.071602	0.034893

MOTIF	Forebrain_P0_H3K27me3_19_12_0.528_8.778424e-17
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.063744	0.817185	0.040622	0.078449
0.068631	0.89673	0.012293	0.022346
0.03093	0.072167	0.839891	0.057013
0.133244	0.098452	0.591113	0.177192
0.149102	0.015974	0.829273	0.00565
0.042588	0.85559	0.043342	0.05848
0.035947	0.027903	0.879229	0.05692
0.009945	0.057207	0.818073	0.114775
0.042208	0.858168	0.002928	0.096696
0.365354	0.0	0.044935	0.589711

MOTIF	Cranio-Facial_E12.5_H3K4me2_64_87_0.555_1.45471e-114
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.92485	0.0	0.0	0.07515
0.0	0.049004	0.907269	0.043727
0.17813	0.788799	0.021787	0.011284
0.046517	0.586382	0.0	0.367101
0.157105	0.0	0.786754	0.056141
0.0	0.969615	0.011606	0.018779
0.026208	0.897094	0.031663	0.045035
0.247767	0.552852	0.06305	0.136331
0.037201	0.0	0.942054	0.020745

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K4me2_43_61_0.593_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.808168	0.0	0.124026	0.067806
0.0	0.025367	0.936089	0.038544
0.155558	0.823061	0.021381	0.0
0.017084	0.729279	0.016379	0.237257
0.101649	0.0	0.898351	0.0
0.070163	0.755567	0.17427	0.0
0.014337	0.985663	0.0	0.0
0.087977	0.688323	0.057836	0.165864
0.108604	0.065595	0.825801	0.0

MOTIF	Heart_E11.5_H3K4me2_28_160_0.598_6.555626e-317
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.063	0.814	0.086	0.037
0.698	0.106	0.093	0.103
0.052	0.087	0.809	0.052
0.061	0.801	0.093	0.045
0.097	0.708	0.09	0.105
0.083	0.08	0.733	0.104
0.049	0.769	0.127	0.055
0.062	0.74	0.097	0.101
0.102	0.701	0.098	0.099
0.079	0.101	0.726	0.094
0.042	0.822	0.086	0.05
0.106	0.114	0.101	0.679

MOTIF	Lung_E14.5_H3K4me2_8_8_0.650_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.04069	0.037601	0.838829	0.08288
0.06314	0.798961	0.096349	0.04155
0.129942	0.612548	0.138924	0.118586
0.058056	0.085686	0.729189	0.127069
0.04407	0.84294	0.063085	0.049905
0.039848	0.729031	0.137273	0.093848
0.040069	0.750482	0.114042	0.095407
0.034078	0.076918	0.847135	0.041869
0.01301	0.778732	0.187781	0.020477

MOTIF	Neural-Tube_E11.5_H3K4me2_9_7_0.698_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.038915	0.062225	0.820615	0.078244
0.071979	0.806933	0.067251	0.053837
0.085399	0.666256	0.147811	0.100534
0.064407	0.103847	0.739227	0.092519
0.046413	0.786428	0.115024	0.052135
0.058432	0.707399	0.17514	0.059029
0.072879	0.685022	0.140497	0.101602
0.034409	0.092793	0.798998	0.073801
0.016265	0.868812	0.094617	0.020306

MOTIF	Neural-Tube_E13.5_H3K4me2_5_4_0.674_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.029702	0.097631	0.805905	0.066763
0.063489	0.783263	0.11534	0.037909
0.10973	0.631653	0.149591	0.109026
0.053523	0.133941	0.706885	0.105651
0.042221	0.758148	0.155722	0.043909
0.04117	0.697936	0.179671	0.081223
0.080772	0.767389	0.083071	0.068768
0.034244	0.08531	0.815757	0.064689
0.015672	0.819072	0.130305	0.034951

MOTIF	Heart_E12.5_H3K4me2_11_8_0.614_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.042758	0.04858	0.856997	0.051665
0.048053	0.810602	0.080985	0.06036
0.13773	0.602233	0.127899	0.132138
0.064186	0.059475	0.82613	0.050209
0.051186	0.821409	0.087857	0.039547
0.051375	0.74569	0.114284	0.08865
0.114042	0.698714	0.083682	0.103562
0.043154	0.015161	0.897676	0.044009
0.029403	0.859944	0.072706	0.037947

MOTIF	Heart_E13.5_H3K4me2_12_7_0.604_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.027981	0.029283	0.863986	0.078751
0.056442	0.840943	0.048916	0.053699
0.138842	0.615658	0.088534	0.156966
0.062726	0.094868	0.786447	0.055959
0.054327	0.848479	0.048637	0.048558
0.062334	0.7676	0.078194	0.091872
0.143827	0.706944	0.042905	0.106324
0.029052	0.017994	0.916039	0.036916
0.017483	0.892144	0.048873	0.0415

MOTIF	Liver_P0_H3K4me2_14_7_0.601_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.027339	0.03567	0.831758	0.105234
0.054583	0.809758	0.070424	0.065235
0.116815	0.640799	0.12946	0.112926
0.059909	0.079416	0.790944	0.069731
0.062431	0.821095	0.058597	0.057877
0.054207	0.782455	0.120072	0.043266
0.073197	0.778843	0.036648	0.111312
0.070853	0.025348	0.83779	0.066009
0.019368	0.891436	0.036316	0.052881

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K4me2_10_7_0.658_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.02466	0.055988	0.834254	0.085098
0.062989	0.823338	0.075971	0.037702
0.097777	0.639399	0.128393	0.134431
0.053692	0.043251	0.757207	0.145849
0.048444	0.83486	0.079878	0.036818
0.04091	0.735694	0.11466	0.108736
0.078347	0.839024	0.036524	0.046105
0.038697	0.019788	0.906956	0.034559
0.009059	0.782234	0.165602	0.043105

MOTIF	Liver_E13.5_H3K4me2_16_9_0.609_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.031812	0.042081	0.828985	0.097122
0.052603	0.839131	0.049057	0.059208
0.124882	0.677063	0.105706	0.092349
0.089111	0.046394	0.695291	0.169204
0.036275	0.88906	0.041649	0.033016
0.055076	0.772844	0.069392	0.102688
0.08756	0.790913	0.03358	0.087947
0.022533	0.014253	0.847692	0.115522
0.022266	0.88832	0.047156	0.042258

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K4me2_7_8_0.647_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.026505	0.048737	0.8464	0.078357
0.040843	0.873813	0.045669	0.039674
0.11446	0.654199	0.103776	0.127565
0.064033	0.082592	0.694353	0.159023
0.039837	0.79064	0.122394	0.047129
0.050575	0.726514	0.112981	0.10993
0.116762	0.717776	0.074119	0.091343
0.045977	0.051249	0.846624	0.05615
0.015776	0.869263	0.070676	0.044285

MOTIF	Intestine_E14.5_H3K4me2_11_11_0.658_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.054715	0.059042	0.799953	0.086291
0.051525	0.8175	0.08448	0.046494
0.130444	0.681543	0.086843	0.101169
0.056929	0.035081	0.758551	0.14944
0.036811	0.870555	0.042836	0.049798
0.057537	0.73429	0.110309	0.097865
0.083099	0.800029	0.037517	0.079355
0.02424	0.006212	0.932031	0.037517
0.039298	0.829951	0.104883	0.025869

MOTIF	Cranio-Facial_E13.5_H3K4me2_8_6_0.637_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.030802	0.036453	0.855211	0.077534
0.046692	0.862682	0.043356	0.047271
0.138252	0.642645	0.092059	0.127044
0.057736	0.043476	0.771448	0.12734
0.037605	0.838081	0.082999	0.041315
0.051269	0.745393	0.098928	0.10441
0.103746	0.739019	0.074805	0.08243
0.023335	0.009611	0.894303	0.07275
0.029765	0.853037	0.087163	0.030035

MOTIF	Heart_P0_H3K4me2_11_6_0.628_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.043715	0.040764	0.835119	0.080402
0.057393	0.807391	0.080716	0.0545
0.122749	0.649963	0.099138	0.12815
0.080263	0.072491	0.719473	0.127773
0.040316	0.819709	0.098483	0.041492
0.055178	0.717563	0.136163	0.091096
0.096959	0.770486	0.046401	0.086154
0.0363	0.027592	0.881509	0.054599
0.054622	0.857917	0.063297	0.024165

MOTIF	Forebrain_P0_H3K4me2_7_8_0.664_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.026877	0.056701	0.828492	0.08793
0.050872	0.804981	0.084142	0.060005
0.134061	0.642624	0.115883	0.107432
0.059544	0.064142	0.745493	0.130821
0.045434	0.830006	0.076909	0.04765
0.03974	0.752724	0.106736	0.1008
0.095502	0.778072	0.042977	0.083448
0.033025	0.016938	0.892593	0.057444
0.019342	0.879409	0.066936	0.034314

MOTIF	Cranio-Facial_E12.5_H3K4me2_4_8_0.668_4.940656e-322
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.043192	0.057581	0.823244	0.075982
0.051659	0.848036	0.056872	0.043433
0.102183	0.642041	0.129849	0.125926
0.047044	0.052674	0.751378	0.148903
0.04652	0.830574	0.079409	0.043497
0.047445	0.734991	0.117528	0.100035
0.093777	0.798004	0.025176	0.083043
0.065119	0.014131	0.874884	0.045866
0.010041	0.863185	0.08835	0.038424

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K4me2_10_9_0.670_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.023441	0.046261	0.837761	0.092537
0.040523	0.834527	0.069452	0.055499
0.13266	0.647298	0.114283	0.105759
0.07009	0.052672	0.763577	0.113661
0.050129	0.828079	0.081544	0.040248
0.043484	0.745633	0.108409	0.102474
0.089744	0.793835	0.033061	0.083359
0.067562	0.016627	0.856392	0.059419
0.011459	0.860943	0.095627	0.031971

MOTIF	Liver_E14.5_H3K4me2_17_12_0.615_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.030689	0.060554	0.81352	0.095236
0.049463	0.813526	0.076673	0.060338
0.07692	0.710077	0.103335	0.109668
0.058698	0.047686	0.728872	0.164744
0.053428	0.808303	0.092319	0.045951
0.055932	0.743311	0.094307	0.10645
0.071636	0.782553	0.031267	0.114544
0.041353	0.01879	0.877499	0.062358
0.014152	0.89062	0.053559	0.041669

MOTIF	Kidney_E14.5_H3K4me2_14_6_0.661_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.030436	0.044195	0.834	0.091368
0.025771	0.842238	0.068951	0.063041
0.139653	0.74194	0.032617	0.08579
0.053512	0.032832	0.773695	0.13996
0.040867	0.841633	0.069638	0.047863
0.054439	0.745806	0.092708	0.107048
0.119965	0.725941	0.079756	0.074338
0.042845	0.013609	0.871662	0.071884
0.023286	0.839723	0.101661	0.03533

MOTIF	Lung_P0_H3K4me2_17_8_0.634_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.032441	0.042874	0.843368	0.081317
0.04106	0.826543	0.063374	0.069023
0.125643	0.726593	0.038236	0.109528
0.049802	0.033649	0.772246	0.144303
0.037593	0.833193	0.076028	0.053186
0.044316	0.761107	0.095132	0.099445
0.099244	0.714481	0.078237	0.108038
0.038783	0.022193	0.88569	0.053335
0.019922	0.846235	0.099708	0.034136

MOTIF	Stomach_E15.5_H3K4me2_19_7_0.643_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.043293	0.053939	0.851989	0.050779
0.066672	0.816634	0.064134	0.05256
0.153511	0.722976	0.03161	0.091903
0.060115	0.036415	0.788673	0.114797
0.043773	0.845796	0.070317	0.040114
0.062177	0.741143	0.107709	0.088971
0.125848	0.712725	0.079535	0.081891
0.029084	0.016414	0.890078	0.064425
0.023732	0.857355	0.080258	0.038655

MOTIF	Forebrain_E16.5_H3K4me2_2_4_0.675_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.027301	0.776547	0.115493	0.08066
0.115331	0.732322	0.038093	0.114254
0.092406	0.037526	0.751695	0.118373
0.052191	0.829111	0.059202	0.059495
0.069767	0.762041	0.072668	0.095524
0.086412	0.769785	0.024136	0.119667
0.046728	0.008912	0.904531	0.039829
0.034325	0.83328	0.090932	0.041463
0.039764	0.07921	0.845681	0.035345

MOTIF	Forebrain_E11.5_H3K4me2_3_5_0.705_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.052058	0.850348	0.036627	0.060967
0.043065	0.773809	0.078986	0.10414
0.110248	0.027204	0.688555	0.173994
0.047767	0.824298	0.061079	0.066855
0.017975	0.811291	0.096738	0.073996
0.083634	0.780667	0.036859	0.09884
0.026547	0.061807	0.783607	0.12804
0.057876	0.874948	0.054974	0.012202
0.044726	0.064057	0.833044	0.058173

MOTIF	Intestine_E16.5_H3K4me2_3_5_0.666_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.045969	0.826432	0.049269	0.078331
0.048164	0.774354	0.059551	0.117931
0.030705	0.022633	0.744429	0.202233
0.05701	0.811467	0.075594	0.05593
0.016688	0.786777	0.086362	0.110172
0.073411	0.850603	0.020858	0.055127
0.076	0.040149	0.784534	0.099317
0.072802	0.809179	0.073786	0.044233
0.025981	0.059035	0.808912	0.106071

MOTIF	Neural-Tube_E11.5_H3K4me2_6_9_0.712_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.087884	0.842906	0.043561	0.025649
0.16722	0.698577	0.017212	0.11699
0.02923	0.085577	0.645246	0.239948
0.061425	0.7448	0.070587	0.123187
0.019299	0.926653	0.03117	0.022879
0.095657	0.815569	0.059574	0.029201
0.030814	0.013727	0.85906	0.096399
0.072726	0.80644	0.105419	0.015414
0.030306	0.049828	0.876821	0.043044

MOTIF	Stomach_P0_H3K4me2_10_4_0.650_2.371021e-319
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.038014	0.874972	0.057597	0.029417
0.156454	0.709983	0.0521	0.081463
0.026561	0.080408	0.733235	0.159795
0.061581	0.802069	0.073265	0.063085
0.023401	0.855631	0.088832	0.032136
0.05573	0.850665	0.038503	0.055102
0.035006	0.033451	0.872696	0.058848
0.068212	0.627228	0.266765	0.037795
0.026766	0.037014	0.865834	0.070386
0.425309	0.046419	0.095266	0.433006

MOTIF	Intestine_E14.5_H3K4me2_16_5_0.647_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.036975	0.826268	0.068775	0.067982
0.070875	0.729248	0.107892	0.091985
0.05558	0.02765	0.781785	0.134984
0.039957	0.880876	0.0463	0.032867
0.059648	0.740795	0.098952	0.100605
0.095232	0.772687	0.044422	0.087659
0.02771	0.01431	0.904807	0.053172
0.011925	0.88685	0.065413	0.035812
0.026064	0.696958	0.239698	0.03728
0.094375	0.461862	0.147785	0.295978

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K4me2_11_6_0.658_9.792154e-318
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.021192	0.824742	0.059942	0.094123
0.033874	0.807566	0.029207	0.129353
0.063421	0.019735	0.844663	0.072181
0.061795	0.830819	0.064646	0.04274
0.08194	0.693275	0.111697	0.113088
0.13518	0.676101	0.040002	0.148716
0.068638	0.037264	0.852586	0.041511
0.005377	0.917839	0.049484	0.0273
0.106005	0.783464	0.060741	0.049789
0.0959	0.431025	0.356961	0.116114
0.106141	0.070362	0.694583	0.128913

MOTIF	Limb_E12.5_H3K4me2_6_7_0.646_1.199709e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.018052	0.814164	0.064183	0.103601
0.037044	0.780238	0.034182	0.148536
0.026846	0.02364	0.886565	0.062949
0.068036	0.828034	0.053966	0.049964
0.090836	0.67924	0.09561	0.134314
0.160833	0.614918	0.042234	0.182015
0.019036	0.04839	0.883468	0.049106
0.004903	0.90202	0.05256	0.040517
0.036711	0.851033	0.062	0.050256
0.063254	0.390534	0.423438	0.122773
0.159946	0.023713	0.764938	0.051402

MOTIF	Heart_E14.5_H3K4me2_19_5_0.595_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.162908	0.371093	0.310843	0.155155
0.134332	0.357357	0.426036	0.082276
0.075024	0.797947	0.060562	0.066466
0.124055	0.705453	0.032858	0.137634
0.027996	0.039444	0.871089	0.06147
0.037965	0.84621	0.044642	0.071183
0.083168	0.700851	0.095234	0.120746
0.104376	0.707881	0.042662	0.145081
0.075721	0.032195	0.839429	0.052655
0.002067	0.903721	0.056173	0.038039
0.03694	0.871087	0.043396	0.048577
0.064704	0.466455	0.34346	0.12538

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K4me2_12_5_0.657_1.952028e-317
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.201352	0.237755	0.462019	0.098873
0.031178	0.816015	0.092112	0.060696
0.082822	0.698552	0.117723	0.100903
0.072579	0.044846	0.779094	0.103481
0.031981	0.882738	0.048495	0.036787
0.058599	0.741487	0.110291	0.089624
0.084302	0.801059	0.040274	0.074366
0.053962	0.019513	0.84249	0.084035
0.003742	0.81349	0.13886	0.043907
0.054638	0.821189	0.057688	0.066485

MOTIF	Midbrain_E15.5_H3K4me2_15_5_0.653_5.879381e-322
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.153205	0.265722	0.492705	0.088368
0.035864	0.808381	0.092023	0.063731
0.085115	0.671961	0.143964	0.09896
0.068334	0.068761	0.745935	0.11697
0.033573	0.879701	0.043069	0.043656
0.070323	0.712824	0.119053	0.097801
0.081035	0.769214	0.038265	0.111485
0.037013	0.02941	0.874619	0.058958
0.008259	0.861495	0.082802	0.047445
0.071096	0.818539	0.067461	0.042904

MOTIF	Cranio-Facial_E11.5_H3K4me2_4_4_0.704_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.047533	0.782525	0.079755	0.090187
0.054331	0.678072	0.167862	0.099735
0.032777	0.837197	0.061094	0.068932
0.083941	0.036762	0.831493	0.047803
0.052712	0.834886	0.077494	0.034908
0.031743	0.668201	0.203783	0.096273
0.024823	0.709459	0.163708	0.102009
0.01304	0.008635	0.933041	0.045284
0.003249	0.92814	0.056762	0.011848

MOTIF	Liver_E12.5_H3K4me2_3_5_0.635_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.040493	0.771458	0.076322	0.111727
0.012383	0.719346	0.181953	0.086318
0.016804	0.766599	0.104209	0.112388
0.057915	0.030879	0.753668	0.157538
0.056319	0.824343	0.083514	0.035824
0.0313	0.765184	0.116071	0.087445
0.034072	0.774506	0.148193	0.043229
0.014619	0.010884	0.904962	0.069535
0.008204	0.952173	0.027983	0.01164

MOTIF	Liver_E15.5_H3K4me2_9_4_0.630_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.045653	0.743744	0.098962	0.111641
0.021319	0.765426	0.145501	0.067754
0.029263	0.823076	0.054413	0.093248
0.087534	0.025396	0.73128	0.15579
0.055015	0.823135	0.079474	0.042375
0.031155	0.702503	0.174638	0.091704
0.049257	0.756722	0.155878	0.038144
0.040686	0.012117	0.922964	0.024233
0.003184	0.93527	0.045092	0.016454

MOTIF	Limb_E13.5_H3K4me2_7_3_0.646_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.041172	0.752721	0.166959	0.039148
0.045113	0.740954	0.1376	0.076333
0.100793	0.716914	0.099385	0.082909
0.043447	0.021657	0.81139	0.123505
0.035432	0.837276	0.095073	0.032218
0.032064	0.73947	0.147333	0.081133
0.040807	0.732849	0.128625	0.097719
0.037548	0.004185	0.934741	0.023525
0.002223	0.914016	0.066029	0.017731

MOTIF	Midbrain_E16.5_H3K4me2_8_5_0.664_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.018638	0.722087	0.183736	0.075539
0.048185	0.684108	0.164889	0.102818
0.040197	0.793576	0.059366	0.106861
0.068509	0.047584	0.784307	0.0996
0.038631	0.839392	0.08651	0.035467
0.065745	0.74589	0.143535	0.04483
0.080684	0.772352	0.106303	0.040661
0.033499	0.00729	0.941115	0.018096
0.002891	0.93028	0.049904	0.016925

MOTIF	Heart_E15.5_H3K4me2_10_3_0.623_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.021284	0.809579	0.068366	0.10077
0.026558	0.79853	0.087407	0.087506
0.137996	0.618638	0.130566	0.1128
0.087936	0.036333	0.838277	0.037454
0.047007	0.834257	0.06937	0.049367
0.106118	0.67698	0.187773	0.02913
0.036826	0.814516	0.05233	0.096328
0.029769	0.004063	0.914631	0.051537
0.005825	0.932045	0.0501	0.01203
0.285462	0.236693	0.38765	0.090195

MOTIF	Stomach_P0_H3K4me2_12_8_0.645_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.072754	0.743121	0.062941	0.121184
0.096301	0.807873	0.073814	0.022012
0.040621	0.749257	0.052482	0.157639
0.108361	0.032826	0.820178	0.038635
0.032294	0.845509	0.07435	0.047846
0.093124	0.65517	0.228217	0.023489
0.108586	0.811038	0.044988	0.035388
0.02851	0.009447	0.910109	0.051933
0.009305	0.93211	0.044563	0.014022

MOTIF	Liver_E12.5_H3K9ac_21_10_0.592_1.052292e-313
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.040203	0.732529	0.019979	0.207289
0.057368	0.301045	0.003668	0.637918
0.005003	0.935184	0.018208	0.041605
0.021207	0.893559	0.04698	0.038254
0.023288	0.186529	0.746204	0.043979
0.049988	0.033443	0.878807	0.037763
0.030736	0.04508	0.854411	0.069773
0.237519	0.651947	0.017957	0.092577
0.037123	0.0884	0.836737	0.03774
0.07185	0.17235	0.591623	0.164177
0.032081	0.842296	0.038989	0.086634
0.205644	0.355433	0.214704	0.22422

MOTIF	Heart_E13.5_H3K9ac_21_18_0.567_9.078456e-320
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.041465	0.785062	0.034646	0.138828
0.056218	0.822061	0.047344	0.074377
0.028489	0.871296	0.059156	0.04106
0.090205	0.059189	0.77717	0.073436
0.107389	0.016498	0.797522	0.078591
0.010002	0.030409	0.919142	0.040447
0.298863	0.646574	0.019099	0.035464
0.060349	0.057984	0.824511	0.057156
0.094873	0.071231	0.750446	0.08345

MOTIF	Heart_E16.5_H3K9ac_7_11_0.597_9.981559e-318
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.024004	0.90912	0.058949	0.007927
0.057518	0.827288	0.024428	0.090766
0.037571	0.076058	0.797195	0.089176
0.072716	0.041989	0.844394	0.0409
0.053231	0.063793	0.850108	0.032867
0.188609	0.670236	0.017083	0.124073
0.150743	0.053882	0.72008	0.075294
0.059814	0.161943	0.683355	0.094889
0.05612	0.887778	0.022589	0.033512
0.048583	0.006323	0.49246	0.452634

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K9ac_26_15_0.601_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.041138	0.912901	0.027248	0.018713
0.046437	0.856951	0.022924	0.073688
0.077777	0.079958	0.735376	0.106889
0.116496	0.042219	0.801663	0.039623
0.045669	0.084763	0.835324	0.034243
0.144244	0.755949	0.018951	0.080856
0.112631	0.058533	0.6813	0.147536
0.046976	0.067522	0.816633	0.068869
0.039235	0.861242	0.061996	0.037527

MOTIF	Lung_E15.5_H3K9ac_23_11_0.666_2.747308e-315
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.024902	0.914046	0.025542	0.03551
0.051024	0.876275	0.0337	0.039002
0.075329	0.063911	0.775822	0.084938
0.067114	0.05798	0.83913	0.035775
0.039987	0.117124	0.808792	0.034097
0.13884	0.776087	0.013124	0.07195
0.115642	0.06693	0.673749	0.143678
0.075837	0.079746	0.76882	0.075598
0.048325	0.826042	0.072125	0.053507

MOTIF	Midbrain_E13.5_H3K9ac_27_12_0.590_7.190737e-315
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.020688	0.930509	0.037855	0.010948
0.046612	0.909682	0.004822	0.038884
0.145472	0.071599	0.671444	0.111484
0.097062	0.031687	0.812119	0.059132
0.05365	0.068727	0.842261	0.035363
0.071597	0.793028	0.032164	0.10321
0.053205	0.02497	0.740882	0.180942
0.068391	0.156983	0.672163	0.102462
0.023087	0.880049	0.074638	0.022226
0.219905	0.215687	0.050915	0.513493

MOTIF	Cranio-Facial_E13.5_H3K9ac_22_40_0.594_5.394889e-317
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.681651	0.037269	0.144779	0.136302
0.0	0.204583	0.795417	0.0
0.078333	0.734083	0.093058	0.094526
0.041066	0.731555	0.15598	0.071399
0.146637	0.058232	0.737668	0.057463
0.0	1.0	0.0	0.0
0.021898	0.598775	0.01778	0.361547
0.0	0.585667	0.167494	0.24684
0.049279	0.047878	0.862384	0.040459

MOTIF	Heart_E14.5_H3K9ac_35_44_0.564_1.092252e-217
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.866708	0.03278	0.090885	0.009626
0.009764	0.009963	0.95022	0.030053
0.186695	0.797363	0.0	0.015942
0.0	0.871229	0.035956	0.092815
0.27303	0.0	0.676698	0.050271
0.037619	0.906987	0.055394	0.0
0.132359	0.780124	0.06786	0.019657
0.285149	0.659617	0.038631	0.016604
0.124501	0.022327	0.831482	0.02169

MOTIF	Midbrain_E16.5_H3K9ac_35_51_0.588_1.817431e-269
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.76621	0.0	0.086427	0.147363
0.0	0.016268	0.885941	0.097792
0.279968	0.672778	0.047254	0.0
0.027049	0.956098	0.016853	0.0
0.273231	0.0	0.70772	0.019049
0.0	0.948049	0.046909	0.005042
0.048098	0.701378	0.060705	0.189819
0.146593	0.757769	0.076534	0.019104
0.0207	0.058272	0.872263	0.048765