MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Heart_E14.5_H3K4me2_10_36_0.613_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.991083	0.0	0.008917
0.046033	0.0	0.953967	0.0
0.031196	0.0	0.907028	0.061776
0.010603	0.969907	0.0	0.01949
0.024479	0.94091	0.0	0.034611
0.0	0.056199	0.943801	0.0
0.111592	0.145633	0.528943	0.213832
0.252068	0.342053	0.111504	0.294375
0.056586	0.793348	0.137138	0.012927

MOTIF	Midbrain_E11.5_H3K4me2_20_6_0.648_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.182073	0.053549	0.463966	0.300412
0.126182	0.362819	0.373035	0.137964
0.078504	0.066583	0.763655	0.091258
0.023572	0.935887	0.024682	0.015858
0.111702	0.684466	0.067215	0.136618
0.042604	0.027847	0.884587	0.044962
0.058291	0.067537	0.777577	0.096595
0.096657	0.786405	0.05741	0.059528
0.109965	0.722296	0.043493	0.124246
0.069689	0.0299	0.805927	0.094484
0.022272	0.874895	0.062128	0.040705

MOTIF	Midbrain_P0_H3K4me2_25_15_0.626_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.154265	0.164484	0.435709	0.245542
0.061321	0.044318	0.765971	0.12839
0.023559	0.955132	0.011777	0.009531
0.094861	0.785549	0.041779	0.077812
0.059779	0.042715	0.85046	0.047045
0.052002	0.061537	0.836586	0.049875
0.11528	0.793482	0.023825	0.067413
0.199944	0.613837	0.04899	0.137229
0.088816	0.051954	0.779362	0.079869
0.037331	0.86611	0.06415	0.03241

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K4me2_51_31_0.574_1.037118e-313
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.263347	0.262336	0.0	0.474317
0.0	0.768436	0.166439	0.065126
0.132715	0.025238	0.481376	0.360671
0.04373	0.052733	0.848529	0.055007
0.007542	0.982659	0.009799	0.0
0.077318	0.826497	0.040721	0.055464
0.026219	0.044222	0.858262	0.071297
0.015829	0.054739	0.911239	0.018192
0.207091	0.745553	0.027286	0.02007
0.139811	0.734186	0.032354	0.093648

MOTIF	Cranio-Facial_E15.5_H3K4me2_29_26_0.613_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.012335	0.93603	0.0459	0.005735
0.115145	0.0	0.830209	0.054646
0.095195	0.068878	0.773655	0.062272
0.07039	0.735279	0.057082	0.137249
0.009033	0.796218	0.012293	0.182456
0.0	0.0	0.962587	0.037413
0.121855	0.078238	0.715601	0.084306
0.039162	0.814978	0.04354	0.102321
0.016946	0.73814	0.05869	0.186223

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K4me2_32_30_0.624_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.815071	0.020749	0.16418
0.058995	0.0	0.84947	0.091535
0.007251	0.042496	0.769624	0.180629
0.116404	0.778088	0.026374	0.079134
0.0	0.862762	0.091426	0.045812
0.047276	0.0	0.883912	0.068812
0.042083	0.096953	0.736123	0.124841
0.019558	0.920286	0.041945	0.018211
0.072991	0.652074	0.018305	0.256629

MOTIF	Forebrain_P0_H3K4me2_79_44_0.543_7.547543e-105
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.908847	0.091153	0.0	0.0
0.104965	0.7759	0.077453	0.041682
0.202429	0.0	0.642959	0.154612
0.044534	0.063102	0.639206	0.253158
0.043391	0.932554	0.008518	0.015537
0.010944	0.922308	0.046908	0.01984
0.17407	0.021538	0.697561	0.106832
0.006205	0.018086	0.927324	0.048385
0.023212	0.823518	0.075444	0.077825
0.038634	0.933017	0.0	0.028349

MOTIF	Limb_E11.5_H3K4me2_57_38_0.573_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.24337	0.688708	0.026402	0.04152
0.19641	0.012686	0.694644	0.096261
0.04028	0.010156	0.931766	0.017798
0.045921	0.916477	0.034441	0.00316
0.028778	0.816153	0.02258	0.13249
0.144825	0.02216	0.733343	0.099671
0.009783	0.039899	0.88804	0.062278
0.028617	0.855335	0.06135	0.054699
0.087016	0.743746	0.119836	0.049403

MOTIF	Neural-Tube_E11.5_H3K4me2_56_38_0.576_6.375393e-318
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.15642	0.736513	0.072478	0.034589
0.192939	0.037783	0.637151	0.132128
0.040745	0.0	0.929806	0.02945
0.025686	0.967585	0.0	0.006729
0.053523	0.833527	0.085961	0.026989
0.198511	0.034448	0.676801	0.090241
0.004365	0.0	0.986201	0.009434
0.158624	0.721863	0.080065	0.039448
0.151367	0.788292	0.0	0.060341

MOTIF	Intestine_E15.5_H3K4me3_27_9_0.664_4.299853e-320
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.159245	0.454146	0.294378	0.092231
0.025466	0.025694	0.913464	0.035376
0.084279	0.856242	0.04862	0.010858
0.05174	0.872755	0.022691	0.052814
0.062989	0.030895	0.861286	0.044831
0.047583	0.040071	0.890979	0.021368
0.161218	0.732614	0.041224	0.064945
0.163067	0.573931	0.077241	0.185762
0.082356	0.036603	0.764423	0.116618
0.013807	0.916414	0.054448	0.015331
0.469678	0.074827	0.086119	0.369376
0.081923	0.34011	0.41864	0.159326

MOTIF	Forebrain_E12.5_H3K4me3_36_13_0.648_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.31911	0.0	0.305728	0.375162
0.068033	0.101852	0.682198	0.147917
0.021178	0.964302	0.007092	0.007428
0.138082	0.689518	0.066882	0.105518
0.049106	0.025777	0.907233	0.017883
0.044434	0.056242	0.857744	0.04158
0.133864	0.744003	0.073316	0.048816
0.124533	0.636136	0.076436	0.162895
0.080269	0.040732	0.808678	0.070321
0.003496	0.931494	0.065009	0.0

MOTIF	Limb_E12.5_H3K4me3_42_39_0.625_1.149691e-320
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.034159	0.90883	0.048568	0.008443
0.079184	0.0	0.875404	0.045412
0.099762	0.094775	0.75984	0.045622
0.026299	0.904653	0.024175	0.044873
0.03739	0.933544	0.020501	0.008565
0.337406	0.041286	0.581224	0.040084
0.054352	0.026907	0.817339	0.101401
0.232851	0.724953	0.01851	0.023687
0.111915	0.841129	0.017691	0.029264

MOTIF	Cranio-Facial_E11.5_H3K4me3_58_46_0.607_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.135954	0.557437	0.12858	0.178029
0.132804	0.0	0.808383	0.058812
0.006429	0.028306	0.912458	0.052808
0.023803	0.922978	0.01951	0.033709
0.0	0.829209	0.028124	0.142667
0.09341	0.0	0.824736	0.081854
0.00599	0.134873	0.853973	0.005163
0.043784	0.890826	0.0	0.065389
0.063555	0.710257	0.070108	0.15608

MOTIF	Kidney_E14.5_H3K4me3_35_29_0.652_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.20395	0.650523	0.035658	0.109869
0.040406	0.037139	0.87819	0.044266
0.093172	0.085246	0.718379	0.103202
0.029225	0.915729	0.036652	0.018394
0.024156	0.874616	0.048252	0.052976
0.105958	0.068433	0.797305	0.028303
0.00702	0.032813	0.889172	0.070996
0.091891	0.818458	0.014241	0.07541
0.070242	0.643597	0.059102	0.227059

MOTIF	Limb_E11.5_H3K4me3_46_29_0.654_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.172105	0.723019	0.068247	0.036629
0.019693	0.006884	0.958987	0.014437
0.01146	0.0	0.91541	0.07313
0.068795	0.777121	0.089477	0.064608
0.032583	0.922404	0.026463	0.018551
0.150785	0.050304	0.772488	0.026423
0.106749	0.080187	0.784171	0.028894
0.196548	0.690392	0.073318	0.039742
0.121158	0.751873	0.082518	0.04445

MOTIF	Intestine_P0_H3K4me3_55_37_0.602_7.138799e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.069538	0.742856	0.109971	0.077635
0.094173	0.031604	0.726049	0.148174
0.026458	0.028378	0.911219	0.033945
0.055781	0.874654	0.043949	0.025616
0.032581	0.806617	0.066349	0.094453
0.151449	0.041328	0.727629	0.079594
0.043984	0.060436	0.878231	0.017348
0.081125	0.799123	0.007353	0.112399
0.073183	0.822763	0.071156	0.032897

MOTIF	Midbrain_E15.5_H3K4me3_30_18_0.668_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.043781	0.815431	0.083267	0.057522
0.097362	0.035619	0.817758	0.049261
0.056539	0.03087	0.860631	0.05196
0.048737	0.814705	0.085625	0.050932
0.026499	0.83783	0.061068	0.074602
0.112429	0.055203	0.806286	0.026082
0.048079	0.075007	0.830202	0.046712
0.139003	0.714944	0.072586	0.073467
0.095028	0.72835	0.075314	0.101309

MOTIF	Midbrain_E12.5_H3K4me3_47_28_0.632_3.112624e-312
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.052778	0.784287	0.132939	0.029997
0.209253	0.668071	0.015834	0.106842
0.155578	0.024813	0.736395	0.083214
0.098225	0.042862	0.843447	0.015467
0.013456	0.968282	0.009001	0.009261
0.019223	0.746703	0.060568	0.173507
0.038978	0.0	0.909721	0.051301
0.01102	0.033132	0.945709	0.010139
0.212182	0.740696	0.02298	0.024142
0.248999	0.316853	0.334727	0.099421

MOTIF	Neural-Tube_E11.5_H3K4me3_44_17_0.646_8.511709e-318
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.018487	0.863145	0.118368	0.0
0.060645	0.782294	0.075924	0.081138
0.145623	0.017144	0.695614	0.14162
0.036893	0.062736	0.881694	0.018676
0.065832	0.900676	0.020742	0.012751
0.023632	0.77936	0.067722	0.129286
0.027343	0.0	0.932502	0.040155
0.070535	0.033406	0.847006	0.049052
0.185702	0.667135	0.069309	0.077854
0.266482	0.536496	0.086417	0.110605