MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Intestine_E14.5_H3K27me3_19_20_0.559_5.695804e-81
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.070737	0.04736	0.845694	0.036209
0.086918	0.792942	0.075699	0.044441
0.118343	0.04125	0.798292	0.042114
0.073971	0.783622	0.062957	0.07945
0.05203	0.062749	0.828616	0.056605
0.01857	0.826171	0.106072	0.049186
0.664175	0.080686	0.10406	0.151079
0.029099	0.848319	0.085688	0.036894
0.779145	0.070667	0.060795	0.089393

MOTIF	Neural-Tube_E11.5_H3K27me3_21_16_0.559_4.497959e-50
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.032186	0.035651	0.888367	0.043796
0.028533	0.855527	0.023038	0.092902
0.117496	0.024298	0.77115	0.087055
0.006723	0.823222	0.110335	0.05972
0.196891	0.085422	0.654133	0.063553
0.027436	0.743173	0.170063	0.059329
0.783174	0.134783	0.058207	0.023836
0.023762	0.904156	0.051438	0.020644
0.837836	0.019515	0.067462	0.075186

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K4me3_8_11_0.723_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.08595	0.819446	0.053028	0.041576
0.12518	0.048518	0.733314	0.092988
0.060118	0.733047	0.095025	0.11181
0.134074	0.051969	0.732846	0.081111
0.100925	0.854992	0.018704	0.02538
0.083646	0.042988	0.72133	0.152036
0.005913	0.944781	0.024833	0.024474
0.757111	0.098347	0.016931	0.127612
0.006453	0.948794	0.027475	0.017278
0.271475	0.388831	0.241847	0.097848

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K4me3_41_30_0.633_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.104322	0.026724	0.801905	0.067048
0.123577	0.742634	0.058125	0.075664
0.010723	0.081757	0.899828	0.007691
0.100687	0.824424	0.032567	0.042322
0.01027	0.051552	0.814948	0.12323
0.0	0.930786	0.048903	0.020311
0.844854	0.033823	0.034529	0.086794
0.0	0.941471	0.048998	0.00953
0.771877	0.055266	0.098608	0.074248
0.018418	0.552516	0.167814	0.261252

MOTIF	Liver_E13.5_H3K4me3_32_20_0.630_1.442797e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0159	0.731221	0.129188	0.123691
0.041621	0.016298	0.873297	0.068785
0.045093	0.818138	0.027256	0.109514
0.04226	0.028918	0.879629	0.049192
0.05387	0.773456	0.128202	0.044471
0.659132	0.051272	0.049985	0.239611
0.009974	0.878358	0.110277	0.001391
0.820449	0.044957	0.093355	0.041238
0.0	0.768879	0.158351	0.07277
0.267562	0.096673	0.52295	0.112815
0.035082	0.339612	0.040139	0.585167
0.007028	0.827074	0.149466	0.016432

MOTIF	Midbrain_E15.5_H3K4me3_61_22_0.605_1.420625e-299
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.277882	0.214848	0.335602	0.171668
0.048719	0.737535	0.191168	0.022577
0.122282	0.044565	0.829795	0.003358
0.141514	0.71427	0.036576	0.10764
0.112943	0.017439	0.856587	0.013031
0.040152	0.836021	0.068363	0.055464
0.819433	0.071958	0.036041	0.072568
0.0	0.934296	0.062644	0.00306
0.832117	0.053856	0.067642	0.046385
0.007804	0.69105	0.22812	0.073027
0.404722	0.141206	0.363494	0.090578

MOTIF	Forebrain_P0_H3K4me3_45_16_0.639_2.116636e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.072057	0.885057	0.019634	0.023251
0.106203	0.053924	0.805963	0.03391
0.081808	0.830963	0.016658	0.070571
0.100172	0.164602	0.716484	0.018743
0.037323	0.811147	0.096103	0.055426
0.685439	0.138227	0.031797	0.144536
0.0	0.914196	0.07818	0.007623
0.816608	0.030259	0.058202	0.09493
0.01396	0.88469	0.067913	0.033437
0.243939	0.056329	0.646176	0.053556
0.104126	0.420933	0.422795	0.052145
0.260827	0.377723	0.032166	0.329284

MOTIF	Stomach_E15.5_H3K4me3_48_24_0.629_9.574317e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.051768	0.798612	0.020752	0.128867
0.117892	0.040991	0.746098	0.09502
0.021743	0.802195	0.048943	0.127119
0.140433	0.027536	0.816937	0.015094
0.086197	0.676654	0.220128	0.017022
0.817604	0.043427	0.039755	0.099214
0.014598	0.915925	0.067783	0.001694
0.850926	0.028005	0.072185	0.048884
0.006717	0.886119	0.079515	0.027649
0.048386	0.430246	0.467876	0.053491
0.001011	0.192429	0.608621	0.197939
0.492144	0.021902	0.305221	0.180733

MOTIF	Liver_P0_H3K4me2_42_25_0.558_4.639839e-247
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.074154	0.849169	0.034651	0.042026
0.057263	0.105382	0.774644	0.062712
0.007714	0.731601	0.108114	0.152571
0.085212	0.036059	0.730961	0.147768
0.050055	0.696633	0.22078	0.032532
0.869095	0.045076	0.024063	0.061767
0.013402	0.948028	0.021079	0.01749
0.845746	0.070725	0.052452	0.031076
0.0	0.91129	0.05518	0.033531
0.11296	0.362652	0.450358	0.07403
0.010283	0.049417	0.547938	0.392362

MOTIF	Neural-Tube_E13.5_H3K4me2_76_34_0.525_8.337254e-137
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.462321	0.177067	0.330221	0.03039
0.011477	0.801383	0.048089	0.139051
0.125107	0.043525	0.797783	0.033584
0.117896	0.66814	0.03048	0.183485
0.04147	0.034568	0.80585	0.118111
0.01416	0.858154	0.05819	0.069496
0.871969	0.052988	0.027151	0.047892
0.0	0.930654	0.032471	0.036875
0.856939	0.026218	0.106924	0.009919
0.0	0.845501	0.086217	0.068281
0.409773	0.364273	0.090185	0.135769

MOTIF	Midbrain_E11.5_H3K27me3_25_17_0.540_1.323051e-49
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.081775	0.368744	0.476925	0.072556
0.116877	0.63998	0.063579	0.179564
0.052207	0.034619	0.881454	0.03172
0.090137	0.710349	0.077089	0.122425
0.045756	0.079253	0.824317	0.050674
0.033221	0.737369	0.186326	0.043084
0.754602	0.092367	0.07258	0.080451
0.017567	0.890058	0.0503	0.042075
0.824392	0.044266	0.051767	0.079575
0.0	0.874234	0.056837	0.068929

MOTIF	Midbrain_E14.5_H3K27me3_23_25_0.534_2.540434e-35
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.139691	0.667715	0.053557	0.139037
0.044985	0.024655	0.876397	0.053963
0.054156	0.734879	0.106296	0.104669
0.057497	0.039859	0.857148	0.045495
0.027243	0.840194	0.099112	0.03345
0.742394	0.052716	0.06367	0.14122
0.012967	0.833017	0.112817	0.041199
0.801509	0.039455	0.060364	0.098672
0.026106	0.752998	0.155592	0.065304

MOTIF	Heart_E16.5_H3K9ac_69_34_0.527_1.291072e-43
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.218965	0.72569	0.034489	0.020856
0.163909	0.040246	0.764172	0.031673
0.067718	0.71583	0.097149	0.119303
0.08343	0.028584	0.854638	0.033347
0.089528	0.741191	0.101577	0.067704
0.872915	0.014176	0.032776	0.080134
0.000992	0.946581	0.041661	0.010767
0.932681	0.012611	0.024882	0.029826
0.004462	0.710474	0.254502	0.030562
0.377645	0.102812	0.414655	0.104888
0.351508	0.043765	0.461503	0.143224
0.436722	0.31501	0.126233	0.122034

MOTIF	Midbrain_E13.5_H3K9ac_60_23_0.547_1.370894e-99
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.122888	0.665617	0.025538	0.185957
0.03355	0.044483	0.852475	0.069491
0.048776	0.722691	0.090869	0.137665
0.054527	0.045613	0.83077	0.069089
0.054545	0.857876	0.049008	0.038572
0.706852	0.110219	0.027359	0.15557
0.003474	0.943283	0.040858	0.012384
0.921737	0.02276	0.03318	0.022324
0.020407	0.636881	0.336671	0.006042
0.520307	0.150655	0.240874	0.088164
0.06242	0.188361	0.484257	0.264961

MOTIF	Heart_E11.5_H3K9ac_82_35_0.513_3.667731e-64
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.082537	0.887354	0.016773	0.013336
0.176503	0.071227	0.675722	0.076548
0.140798	0.605509	0.09968	0.154012
0.054636	0.064998	0.852102	0.028264
0.054362	0.796866	0.063117	0.085656
0.679141	0.083661	0.068154	0.169045
0.002783	0.943863	0.048165	0.005189
0.920546	0.011666	0.034298	0.033491
0.012403	0.929821	0.026359	0.031417

MOTIF	Heart_E12.5_H3K9ac_61_42_0.535_3.627095e-88
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.139859	0.70278	0.1255	0.03186
0.051127	0.056691	0.829481	0.062701
0.137099	0.578403	0.152577	0.131921
0.073297	0.032606	0.866809	0.027289
0.051105	0.696672	0.185158	0.067065
0.749789	0.049848	0.049177	0.151185
0.005914	0.939109	0.035584	0.019393
0.858412	0.020715	0.090595	0.030278
0.002193	0.948381	0.043553	0.005872

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K9ac_29_20_0.592_6.650931e-305
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.082868	0.852948	0.027161	0.037023
0.030677	0.032591	0.837086	0.099646
0.089627	0.735448	0.038319	0.136605
0.029833	0.0367	0.856406	0.07706
0.024796	0.703702	0.211515	0.059988
0.65978	0.079382	0.053649	0.207189
0.005714	0.968869	0.006418	0.018999
0.812841	0.05794	0.053165	0.076055
0.007564	0.8861	0.077295	0.029042
0.10375	0.138027	0.440342	0.317881

MOTIF	Forebrain_E16.5_H3K9ac_76_34_0.529_4.269498e-108
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.122033	0.783442	0.060044	0.03448
0.141442	0.059709	0.785695	0.013154
0.095585	0.804505	0.035444	0.064465
0.218263	0.030445	0.682892	0.0684
0.028885	0.885176	0.050736	0.035203
0.782209	0.052753	0.068341	0.096697
0.003579	0.94061	0.042873	0.012938
0.844852	0.046424	0.041802	0.066922
0.02177	0.782455	0.161677	0.034098

MOTIF	Stomach_E16.5_H3K9ac_85_43_0.514_4.916732e-63
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.268124	0.325034	0.17354	0.233302
0.114898	0.683195	0.142201	0.059706
0.060197	0.034843	0.866108	0.038851
0.076134	0.675665	0.116928	0.131273
0.11251	0.040944	0.732512	0.114035
0.052167	0.88637	0.021664	0.039799
0.756963	0.041692	0.080251	0.121094
0.002679	0.97748	0.014558	0.005283
0.906364	0.008399	0.026085	0.059152
0.009813	0.939185	0.043646	0.007355