MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Cranio-Facial_E14.5_H3K4me2_47_170_0.575_1.32674e-177 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.39 0.213 0.213 0.183 0.725 0.101 0.097 0.077 0.709 0.09 0.115 0.086 0.182 0.528 0.136 0.154 0.144 0.134 0.556 0.166 0.095 0.117 0.11 0.678 0.127 0.103 0.129 0.641 0.677 0.121 0.098 0.104 0.697 0.108 0.112 0.083 0.178 0.544 0.137 0.141 0.173 0.12 0.546 0.161 0.229 0.309 0.226 0.236 MOTIF Intestine_E16.5_H3K4me2_51_174_0.579_5.143103e-173 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.723 0.096 0.083 0.098 0.697 0.102 0.104 0.097 0.687 0.109 0.083 0.121 0.106 0.108 0.683 0.103 0.091 0.113 0.079 0.717 0.119 0.085 0.138 0.658 0.706 0.113 0.09 0.091 0.733 0.097 0.095 0.075 0.115 0.712 0.079 0.094 0.113 0.098 0.682 0.107 MOTIF Forebrain_E14.5_H3K4me2_21_164_0.635_5.258644e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.411 0.008 0.189 0.391 0.194 0.134 0.532 0.14 0.001 0.98 0.001 0.018 0.063 0.001 0.925 0.011 0.147 0.251 0.111 0.49 0.001 0.027 0.068 0.904 0.872 0.111 0.016 0.001 0.7 0.009 0.283 0.008 0.154 0.642 0.001 0.203 0.203 0.085 0.664 0.048 MOTIF Hindbrain_E15.5_H3K4me2_21_157_0.632_1.772557e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.261 0.245 0.264 0.229 0.238 0.208 0.348 0.206 0.063 0.776 0.005 0.156 0.122 0.002 0.706 0.17 0.068 0.23 0.109 0.593 0.163 0.07 0.077 0.69 0.639 0.12 0.005 0.236 0.609 0.154 0.189 0.048 0.327 0.367 0.069 0.236 0.257 0.192 0.292 0.258 MOTIF Kidney_E14.5_H3K4me2_33_173_0.626_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 MOTIF Limb_E14.5_H3K4me2_42_166_0.590_9.372949e-253 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.115 0.101 0.117 0.667 0.653 0.121 0.117 0.109 0.108 0.704 0.094 0.094 0.121 0.092 0.67 0.117 0.085 0.086 0.098 0.731 0.096 0.082 0.102 0.72 0.754 0.082 0.079 0.085 0.708 0.095 0.109 0.088 0.119 0.676 0.099 0.106 0.092 0.09 0.719 0.099 MOTIF Forebrain_P0_H3K4me2_30_171_0.614_1.891509e-314 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.099 0.682 0.075 0.144 0.065 0.029 0.769 0.137 0.065 0.192 0.076 0.667 0.111 0.028 0.067 0.794 0.827 0.032 0.056 0.085 0.801 0.048 0.092 0.059 0.086 0.681 0.056 0.177 0.124 0.047 0.778 0.051 MOTIF Limb_E13.5_H3K4me2_37_162_0.587_9.747792e-263 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.072 0.688 0.05 0.19 0.025 0.018 0.853 0.104 0.071 0.153 0.108 0.668 0.067 0.04 0.036 0.857 0.77 0.036 0.043 0.151 0.797 0.055 0.082 0.066 0.11 0.561 0.072 0.257 0.065 0.053 0.805 0.077 MOTIF Neural-Tube_E11.5_H3K4me2_37_167_0.604_3.784608e-218 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.189 0.638 0.083 0.09 0.084 0.071 0.74 0.105 0.079 0.081 0.075 0.765 0.039 0.013 0.076 0.872 0.847 0.042 0.012 0.099 0.747 0.058 0.141 0.054 0.099 0.648 0.079 0.174 0.058 0.109 0.744 0.089 MOTIF Forebrain_E15.5_H3K4me2_14_164_0.665_4.374224e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.026 0.748 0.058 0.168 0.114 0.012 0.666 0.208 0.156 0.174 0.143 0.527 0.164 0.124 0.089 0.623 0.483 0.142 0.107 0.268 0.425 0.172 0.259 0.144 0.215 0.624 0.026 0.135 0.212 0.019 0.621 0.148 0.205 0.226 0.144 0.425 0.161 0.182 0.161 0.495 MOTIF Heart_E12.5_H3K4me2_28_161_0.586_4.15614e-292 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.663 0.051 0.163 0.123 0.426 0.196 0.328 0.05 0.173 0.724 0.001 0.102 0.048 0.001 0.777 0.174 0.1 0.193 0.086 0.621 0.14 0.018 0.022 0.82 0.865 0.017 0.041 0.077 0.579 0.091 0.238 0.092 0.138 0.833 0.002 0.027 0.111 0.03 0.696 0.163 MOTIF Liver_E13.5_H3K4me2_33_160_0.573_4.851385e-157 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.745 0.093 0.143 0.019 0.249 0.18 0.43 0.141 0.181 0.658 0.001 0.16 0.031 0.018 0.935 0.016 0.22 0.195 0.074 0.511 0.104 0.003 0.042 0.851 0.838 0.089 0.02 0.053 0.556 0.081 0.129 0.234 0.227 0.742 0.01 0.021 0.18 0.049 0.578 0.193 MOTIF Hindbrain_P0_H3K4me2_29_169_0.623_3.504631e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.758 0.073 0.067 0.102 0.293 0.032 0.508 0.167 0.06 0.893 0.001 0.046 0.087 0.001 0.805 0.107 0.077 0.225 0.075 0.623 0.116 0.064 0.064 0.756 0.758 0.12 0.048 0.074 0.606 0.156 0.162 0.076 0.154 0.632 0.069 0.145 0.095 0.062 0.767 0.076 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K4me2_39_169_0.601_5.764033e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.677 0.101 0.111 0.111 0.124 0.1 0.68 0.096 0.091 0.73 0.085 0.094 0.11 0.085 0.715 0.09 0.101 0.088 0.106 0.705 0.099 0.094 0.086 0.721 0.709 0.101 0.082 0.108 0.713 0.096 0.095 0.096 0.117 0.675 0.098 0.11 0.093 0.109 0.677 0.121 MOTIF Cranio-Facial_E15.5_H3K4me2_42_167_0.600_2.479386e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.681 0.098 0.118 0.103 0.129 0.096 0.679 0.096 0.096 0.721 0.082 0.101 0.094 0.094 0.713 0.099 0.089 0.109 0.112 0.69 0.084 0.096 0.111 0.709 0.711 0.093 0.101 0.095 0.713 0.102 0.106 0.079 0.108 0.687 0.091 0.114 0.114 0.086 0.693 0.107 MOTIF Midbrain_P0_H3K4me2_39_169_0.604_2.09409e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.714 0.091 0.1 0.095 0.131 0.098 0.68 0.091 0.103 0.699 0.085 0.113 0.097 0.094 0.69 0.119 0.102 0.092 0.102 0.704 0.1 0.093 0.103 0.704 0.731 0.09 0.095 0.084 0.69 0.094 0.116 0.1 0.116 0.692 0.089 0.103 0.117 0.087 0.699 0.097 MOTIF Forebrain_E11.5_H3K4me2_39_168_0.625_1.819937e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.13 0.622 0.114 0.134 0.13 0.121 0.606 0.143 0.125 0.142 0.143 0.59 0.14 0.125 0.138 0.597 0.612 0.127 0.128 0.133 0.599 0.14 0.135 0.126 0.134 0.621 0.119 0.126 0.132 0.108 0.623 0.137 0.146 0.561 0.136 0.157 0.148 0.144 0.141 0.567 MOTIF Neural-Tube_E12.5_H3K4me2_33_164_0.608_3.258659e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.579 0.148 0.135 0.138 0.154 0.139 0.565 0.142 0.125 0.632 0.108 0.135 0.134 0.112 0.613 0.141 0.132 0.147 0.144 0.577 0.14 0.117 0.125 0.618 0.608 0.124 0.113 0.155 0.58 0.142 0.149 0.129 0.141 0.607 0.112 0.14 0.132 0.118 0.621 0.129 MOTIF Liver_E12.5_H3K9ac_33_162_0.573_4.795718e-130 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.452 0.001 0.244 0.303 0.315 0.276 0.222 0.187 0.195 0.686 0.001 0.118 0.175 0.001 0.823 0.001 0.001 0.314 0.23 0.455 0.174 0.131 0.105 0.59 0.487 0.09 0.111 0.312 0.365 0.206 0.189 0.24 MOTIF Neural-Tube_E13.5_H3K9ac_27_159_0.586_2.473611e-270 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.001 0.997 0.001 0.001 0.1 0.001 0.872 0.027 0.001 0.294 0.204 0.501 0.107 0.001 0.001 0.891 0.78 0.02 0.001 0.199 0.43 0.194 0.375 0.001 0.143 0.639 0.001 0.217 0.19 0.001 0.713 0.096 0.041 0.239 0.25 0.47 0.183 0.248 0.099 0.471