MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Cranio-Facial_E15.5_H3K4me3_24_152_0.669_2.5946e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.21 0.268 0.001 0.521 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.236 0.001 0.762 0.382 0.616 0.001 0.001 0.579 0.001 0.295 0.125 MOTIF Limb_E12.5_H3K9ac_14_152_0.616_3.744246e-286 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.276 0.309 0.144 0.271 0.231 0.22 0.291 0.258 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.075 0.083 0.075 0.767 0.001 0.046 0.073 0.88 0.001 0.001 0.027 0.971 0.082 0.199 0.058 0.661 0.54 0.13 0.09 0.24 0.342 0.297 0.26 0.101 0.292 0.221 0.162 0.324 0.262 0.162 0.244 0.331 MOTIF Lung_E14.5_H3K9ac_20_153_0.628_9.406699e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.257 0.382 0.086 0.275 0.001 0.926 0.036 0.037 0.016 0.023 0.956 0.005 0.181 0.356 0.331 0.133 0.057 0.153 0.151 0.639 0.122 0.022 0.001 0.855 0.346 0.253 0.001 0.4 0.633 0.257 0.052 0.058 0.565 0.241 0.103 0.091 0.402 0.142 0.286 0.171 MOTIF Forebrain_E15.5_H3K9ac_7_150_0.666_1.784595e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.329 0.165 0.182 0.324 0.277 0.164 0.244 0.315 0.346 0.116 0.258 0.28 0.53 0.001 0.222 0.247 0.997 0.001 0.001 0.001 0.674 0.234 0.001 0.091 0.293 0.246 0.264 0.196 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.288 0.291 0.247 0.174 MOTIF Midbrain_E11.5_H3K9ac_12_150_0.636_1.131481e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.326 0.224 0.043 0.407 0.206 0.119 0.232 0.444 0.263 0.139 0.209 0.389 0.458 0.112 0.137 0.293 0.991 0.003 0.001 0.005 0.57 0.25 0.007 0.173 0.309 0.31 0.185 0.196 0.008 0.976 0.004 0.012 0.005 0.012 0.974 0.009 0.288 0.315 0.252 0.145 MOTIF Forebrain_P0_H3K9ac_9_150_0.648_1.694645e-321 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.171 0.11 0.024 0.695 0.176 0.111 0.08 0.633 0.534 0.068 0.037 0.361 0.756 0.176 0.001 0.067 0.806 0.127 0.001 0.066 0.249 0.254 0.24 0.257 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 MOTIF Hindbrain_P0_H3K9ac_17_153_0.631_7.909149e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.075 0.123 0.051 0.751 0.113 0.116 0.1 0.671 0.478 0.085 0.048 0.389 0.713 0.148 0.024 0.115 0.966 0.032 0.001 0.001 0.318 0.225 0.207 0.251 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 MOTIF Intestine_E15.5_H3K9ac_15_151_0.640_1.199706e-306 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.001 0.274 0.226 0.499 0.099 0.001 0.115 0.785 0.652 0.001 0.001 0.346 0.959 0.001 0.001 0.039 0.997 0.001 0.001 0.001 0.566 0.281 0.055 0.098 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 MOTIF Cranio-Facial_E11.5_H3K9ac_7_150_0.642_2.430371e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.19 0.237 0.31 0.264 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.265 0.136 0.178 0.42 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.997 0.335 0.064 0.001 0.6 0.424 0.123 0.232 0.22 0.636 0.285 0.078 0.001 0.507 0.001 0.232 0.26 MOTIF Intestine_P0_H3K9ac_24_156_0.633_1.637965e-259 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.205 0.283 0.333 0.179 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.02 0.207 0.068 0.705 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.997 0.148 0.13 0.001 0.721 0.622 0.175 0.03 0.173 0.648 0.212 0.139 0.001 0.658 0.106 0.119 0.117 MOTIF Kidney_P0_H3K9ac_21_151_0.623_3.198919e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.252 0.135 0.25 0.363 0.168 0.022 0.246 0.564 0.476 0.001 0.058 0.466 0.838 0.001 0.001 0.16 0.918 0.08 0.001 0.001 0.503 0.305 0.129 0.063 0.001 0.952 0.046 0.001 0.001 0.001 0.895 0.103 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K9ac_9_150_0.633_8.446381e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.152 0.237 0.397 0.214 0.021 0.935 0.016 0.028 0.038 0.027 0.913 0.022 0.161 0.15 0.214 0.475 0.008 0.011 0.013 0.968 0.016 0.021 0.038 0.925 0.356 0.025 0.021 0.598 0.47 0.178 0.036 0.315 0.423 0.193 0.137 0.246 0.343 0.186 0.148 0.323 MOTIF Midbrain_P0_H3K9ac_11_150_0.634_2.423781e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.098 0.3 0.4 0.202 0.01 0.933 0.03 0.027 0.056 0.044 0.892 0.008 0.093 0.176 0.23 0.501 0.007 0.018 0.005 0.97 0.013 0.007 0.004 0.976 0.327 0.141 0.023 0.509 0.504 0.236 0.039 0.221 0.513 0.23 0.038 0.219 0.447 0.093 0.128 0.332 MOTIF Heart_E14.5_H3K9ac_14_154_0.598_4.452557e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.202 0.016 0.781 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.997 0.159 0.138 0.001 0.702 0.325 0.638 0.001 0.036 0.34 0.279 0.128 0.253 MOTIF Forebrain_E11.5_H3K9ac_15_152_0.619_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.238 0.76 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.206 0.229 0.21 0.355 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.997 0.304 0.179 0.222 0.295 0.329 0.356 0.173 0.143 0.572 0.001 0.344 0.083 MOTIF Forebrain_E16.5_H3K9ac_4_152_0.648_8.678565e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.199 0.25 0.229 0.322 0.001 0.23 0.358 0.41 0.415 0.04 0.345 0.2 0.997 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.379 0.125 0.213 0.283 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K9ac_7_152_0.632_8.149613e-320 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.353 0.273 0.03 0.344 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.373 0.001 0.625 0.273 0.336 0.084 0.307 0.5 0.122 0.286 0.092 MOTIF Cranio-Facial_E13.5_H3K9ac_24_156_0.592_7.172316e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.185 0.544 0.044 0.227 0.112 0.149 0.738 0.001 0.154 0.399 0.001 0.446 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.046 0.001 0.952 0.009 0.294 0.259 0.438 0.314 0.54 0.145 0.001 0.347 0.212 0.23 0.212 MOTIF Limb_E14.5_H3K9ac_14_150_0.630_1.034813e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.344 0.071 0.114 0.471 0.268 0.21 0.164 0.358 0.172 0.364 0.143 0.321 0.242 0.138 0.413 0.207 0.48 0.136 0.254 0.13 0.997 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.386 0.207 0.22 0.187 0.097 0.728 0.006 0.169 0.17 0.069 0.519 0.242 MOTIF Stomach_E15.5_H3K9ac_19_152_0.673_7.655199e-269 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.179 0.747 0.04 0.034 0.018 0.061 0.903 0.018 0.064 0.237 0.156 0.543 0.006 0.011 0.005 0.978 0.001 0.022 0.001 0.976 0.005 0.256 0.029 0.71 0.233 0.407 0.095 0.265 0.418 0.3 0.213 0.068 0.448 0.087 0.366 0.099 0.463 0.18 0.195 0.162