MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Hindbrain_P0_H3K36me3_99_150_0.509_9.058833e-08 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.838 0.034 0.039 0.089 0.031 0.035 0.851 0.083 0.041 0.033 0.071 0.855 0.041 0.064 0.034 0.861 0.806 0.046 0.064 0.084 0.847 0.053 0.064 0.036 0.084 0.8 0.077 0.039 0.106 0.018 0.046 0.83 0.076 0.057 0.049 0.818 0.02 0.028 0.102 0.85 0.06 0.073 0.044 0.823 0.825 0.072 0.032 0.071 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K27me3_21_171_0.524_8.017459e-09 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.748 0.105 0.078 0.069 0.783 0.035 0.056 0.126 0.179 0.12 0.585 0.116 0.097 0.057 0.131 0.715 0.076 0.072 0.137 0.715 0.622 0.129 0.109 0.14 0.683 0.111 0.084 0.122 0.136 0.604 0.1 0.16 0.066 0.081 0.034 0.819 0.022 0.083 0.077 0.818 0.027 0.026 0.035 0.912 0.181 0.188 0.336 0.295 MOTIF Liver_E11.5_H3K4me2_61_171_0.533_2.81675e-54 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.103 0.087 0.724 0.086 0.756 0.085 0.082 0.077 0.783 0.066 0.097 0.054 0.802 0.065 0.075 0.058 0.78 0.045 0.085 0.09 0.113 0.101 0.692 0.094 0.102 0.088 0.08 0.73 0.096 0.079 0.087 0.738 0.755 0.082 0.076 0.087 0.745 0.086 0.085 0.084 0.105 0.71 0.088 0.097 0.097 0.072 0.047 0.784 MOTIF Liver_E15.5_H3K4me2_64_172_0.535_1.61573e-54 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 MOTIF Intestine_E15.5_H3K4me3_58_162_0.594_9.471649e-142 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.105 0.094 0.693 0.108 0.058 0.055 0.047 0.84 0.04 0.055 0.082 0.823 0.773 0.085 0.036 0.106 0.854 0.061 0.038 0.047 0.069 0.735 0.124 0.072 0.085 0.062 0.02 0.833 0.082 0.064 0.055 0.799 0.04 0.057 0.056 0.847 0.058 0.064 0.074 0.804 MOTIF Liver_E15.5_H3K4me3_60_161_0.576_1.28463e-122 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.448 0.061 0.193 0.298 0.1 0.091 0.678 0.131 0.061 0.07 0.062 0.807 0.084 0.044 0.058 0.814 0.758 0.048 0.065 0.129 0.818 0.058 0.051 0.073 0.099 0.706 0.082 0.113 0.07 0.053 0.017 0.86 0.053 0.043 0.044 0.86 0.031 0.041 0.055 0.873 0.055 0.052 0.066 0.827 0.249 0.228 0.155 0.367 MOTIF Liver_E16.5_H3K4me3_59_168_0.557_2.578586e-64 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.79 0.034 0.038 0.138 0.201 0.017 0.762 0.02 0.312 0.064 0.063 0.561 0.168 0.01 0.052 0.77 0.769 0.012 0.138 0.081 0.705 0.224 0.009 0.062 0.022 0.722 0.169 0.087 0.142 0.068 0.052 0.738 0.138 0.009 0.13 0.723 0.008 0.115 0.105 0.772 0.095 0.158 0.05 0.697 0.137 0.039 0.019 0.805 MOTIF Lung_E14.5_H3K4me3_66_163_0.593_1.208751e-143 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.139 0.088 0.688 0.085 0.752 0.079 0.086 0.083 0.716 0.082 0.107 0.095 0.119 0.063 0.068 0.75 0.096 0.063 0.081 0.76 0.747 0.083 0.066 0.104 0.752 0.074 0.091 0.083 0.093 0.698 0.09 0.119 0.089 0.078 0.056 0.777 0.068 0.074 0.068 0.79 0.07 0.075 0.063 0.792 0.063 0.074 0.084 0.779 MOTIF Liver_E12.5_H3K4me2_75_163_0.527_2.830276e-38 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.099 0.078 0.726 0.097 0.083 0.081 0.07 0.766 0.09 0.072 0.081 0.757 0.746 0.091 0.072 0.091 0.738 0.074 0.076 0.112 0.112 0.695 0.086 0.107 0.08 0.071 0.037 0.812 0.068 0.077 0.097 0.758 0.085 0.098 0.08 0.737 0.721 0.105 0.083 0.091 0.8 0.027 0.073 0.1 0.096 0.076 0.745 0.083 MOTIF Liver_E12.5_H3K27ac_62_162_0.526_4.170861e-22 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.08 0.091 0.086 0.743 0.078 0.039 0.116 0.767 0.118 0.105 0.658 0.119 0.776 0.076 0.065 0.083 0.794 0.074 0.081 0.051 0.856 0.024 0.063 0.057 0.083 0.079 0.742 0.096 0.116 0.083 0.06 0.741 0.116 0.085 0.093 0.706 0.748 0.087 0.066 0.099 0.789 0.069 0.073 0.069 0.123 0.68 0.104 0.093 MOTIF Liver_E13.5_H3K4me1_46_155_0.528_1.316269e-44 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.887 0.024 0.055 0.034 0.824 0.072 0.065 0.039 0.831 0.046 0.081 0.042 0.044 0.058 0.833 0.065 0.156 0.057 0.055 0.732 0.081 0.05 0.085 0.784 0.878 0.059 0.028 0.035 0.857 0.059 0.042 0.042 0.109 0.741 0.064 0.086 0.171 0.067 0.711 0.051 MOTIF Heart_E16.5_H3K4me3_52_168_0.584_1.558105e-170 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.001 0.059 0.033 0.907 0.047 0.001 0.001 0.951 0.63 0.28 0.001 0.089 0.953 0.001 0.045 0.001 0.072 0.869 0.058 0.001 0.039 0.038 0.001 0.922 0.046 0.026 0.021 0.907 0.027 0.001 0.033 0.939 MOTIF Intestine_P0_H3K4me3_42_162_0.636_5.35752e-278 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.112 0.616 0.07 0.202 0.048 0.01 0.887 0.055 0.713 0.153 0.108 0.026 0.877 0.013 0.069 0.041 0.929 0.019 0.046 0.006 0.261 0.154 0.456 0.129 0.034 0.186 0.088 0.692 0.254 0.004 0.164 0.578 0.776 0.003 0.131 0.09 0.766 0.088 0.082 0.064 MOTIF Lung_E16.5_H3K4me3_45_162_0.614_5.405905e-252 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.683 0.104 0.113 0.097 0.074 0.735 0.094 0.677 0.11 0.138 0.075 0.732 0.089 0.095 0.084 0.723 0.102 0.079 0.096 0.111 0.117 0.658 0.114 0.093 0.1 0.094 0.713 0.15 0.086 0.13 0.634 0.728 0.086 0.089 0.097 0.718 0.106 0.086 0.09 MOTIF Liver_E12.5_H3K9ac_51_168_0.542_6.293721e-48 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.775 0.058 0.05 0.117 0.124 0.091 0.716 0.069 0.058 0.056 0.063 0.823 0.058 0.054 0.074 0.814 0.811 0.034 0.045 0.11 0.827 0.036 0.064 0.073 0.078 0.787 0.086 0.049 0.089 0.066 0.077 0.768 0.045 0.053 0.037 0.865 0.04 0.064 0.08 0.816 MOTIF Liver_E13.5_H3K9ac_78_167_0.521_2.346326e-23 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.779 0.087 0.062 0.072 0.771 0.093 0.071 0.065 0.796 0.058 0.069 0.077 0.101 0.094 0.714 0.091 0.088 0.087 0.077 0.748 0.1 0.074 0.079 0.747 0.746 0.09 0.078 0.086 0.734 0.085 0.092 0.089 0.08 0.724 0.097 0.099 0.101 0.072 0.058 0.769 0.087 0.717 0.1 0.096 0.099 0.756 0.052 0.093 MOTIF Heart_E13.5_H3K9ac_38_171_0.546_7.470345e-93 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.001 0.091 0.078 0.83 0.222 0.001 0.001 0.776 0.731 0.177 0.001 0.091 0.804 0.001 0.001 0.194 0.084 0.67 0.245 0.001 0.135 0.033 0.007 0.825 0.001 0.061 0.309 0.629 0.13 0.082 0.057 0.731 MOTIF Kidney_P0_H3K9ac_51_164_0.567_1.734844e-76 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.202 0.023 0.703 0.072 0.048 0.032 0.026 0.894 0.086 0.001 0.028 0.885 0.817 0.052 0.001 0.13 0.934 0.018 0.001 0.047 0.014 0.884 0.051 0.051 0.001 0.001 0.001 0.997 0.047 0.014 0.001 0.938 MOTIF Liver_E14.5_H3K9ac_40_170_0.566_1.70885e-74 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.721 0.089 0.099 0.091 0.708 0.105 0.093 0.094 0.712 0.095 0.09 0.103 0.091 0.123 0.68 0.106 0.128 0.093 0.093 0.686 0.125 0.079 0.106 0.69 0.72 0.096 0.089 0.095 0.72 0.095 0.107 0.078 0.116 0.71 0.091 0.083 0.118 0.099 0.658 0.125 MOTIF Lung_E15.5_H3K9ac_54_166_0.586_1.036088e-123 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.985 0.013 0.001 0.001 0.803 0.1 0.096 0.001 0.957 0.001 0.014 0.028 0.059 0.254 0.686 0.001 0.025 0.135 0.005 0.835 0.13 0.007 0.168 0.695 0.866 0.025 0.013 0.096 0.882 0.025 0.036 0.057 0.183 0.73 0.056 0.031 0.193 0.075 0.563 0.169