MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Liver_E12.5_H3K4me2_35_168_0.566_2.702059e-131 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.175 0.823 0.001 0.001 0.155 0.001 0.76 0.084 0.508 0.001 0.18 0.311 0.421 0.021 0.557 0.001 0.217 0.265 0.065 0.453 0.06 0.323 0.045 0.572 0.06 0.001 0.001 0.938 0.178 0.135 0.227 0.46 MOTIF Forebrain_E13.5_H3K4me2_30_158_0.603_2.366318e-318 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.391 0.062 0.051 0.496 0.714 0.038 0.049 0.199 0.708 0.013 0.091 0.188 0.158 0.091 0.19 0.561 0.092 0.63 0.27 0.008 0.629 0.257 0.065 0.049 0.078 0.873 0.048 0.001 0.13 0.006 0.849 0.015 MOTIF Midbrain_E11.5_H3K4me2_28_157_0.639_4.659418e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.129 0.451 0.299 0.12 0.048 0.192 0.606 0.154 0.085 0.896 0.013 0.006 0.001 0.063 0.9 0.036 0.057 0.001 0.427 0.515 0.001 0.128 0.87 0.001 0.412 0.303 0.049 0.236 0.064 0.181 0.091 0.664 0.001 0.001 0.001 0.997 0.225 0.02 0.176 0.579 MOTIF Cranio-Facial_E12.5_H3K4me2_22_154_0.632_3.078072e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.109 0.678 0.126 0.087 0.089 0.086 0.739 0.086 0.091 0.718 0.098 0.093 0.078 0.099 0.719 0.104 0.102 0.087 0.148 0.663 0.097 0.102 0.698 0.103 0.651 0.135 0.1 0.114 0.123 0.106 0.096 0.675 0.076 0.089 0.072 0.763 0.1 0.103 0.1 0.697 MOTIF Heart_E14.5_H3K4me2_1_157_0.638_1.087606e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.232 0.446 0.173 0.149 0.083 0.131 0.735 0.051 0.13 0.646 0.122 0.102 0.055 0.097 0.678 0.17 0.192 0.216 0.216 0.375 0.238 0.16 0.378 0.224 0.493 0.209 0.113 0.184 0.188 0.135 0.103 0.574 0.112 0.113 0.064 0.711 0.253 0.201 0.187 0.36 MOTIF Midbrain_E12.5_H3K4me2_6_153_0.661_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.599 0.129 0.147 0.125 0.616 0.143 0.136 0.105 0.586 0.16 0.137 0.117 0.152 0.144 0.558 0.146 0.152 0.572 0.144 0.132 0.149 0.541 0.173 0.137 0.122 0.594 0.157 0.127 0.097 0.137 0.665 0.101 0.113 0.668 0.122 0.097 0.128 0.131 0.602 0.139 MOTIF Limb_E14.5_H3K4me2_5_155_0.681_7.312172e-322 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.603 0.136 0.203 0.058 0.736 0.112 0.151 0.001 0.565 0.185 0.119 0.131 0.216 0.113 0.206 0.465 0.195 0.471 0.126 0.208 0.196 0.629 0.026 0.149 0.064 0.645 0.223 0.068 0.051 0.077 0.828 0.044 0.155 0.58 0.119 0.146 0.147 0.196 0.48 0.177 MOTIF Neural-Tube_E14.5_H3K4me2_5_154_0.704_7.050811e-320 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.694 0.105 0.115 0.086 0.718 0.11 0.118 0.054 0.538 0.156 0.136 0.17 0.152 0.17 0.146 0.532 0.127 0.598 0.168 0.107 0.129 0.579 0.127 0.165 0.095 0.718 0.102 0.085 0.062 0.091 0.777 0.07 0.08 0.774 0.068 0.078 0.103 0.088 0.703 0.106 MOTIF Forebrain_E11.5_H3K27ac_3_158_0.584_1.229065e-115 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.745 0.08 0.09 0.085 0.776 0.06 0.09 0.074 0.702 0.089 0.091 0.118 0.109 0.122 0.101 0.668 0.658 0.128 0.107 0.107 0.121 0.669 0.125 0.085 0.129 0.683 0.075 0.113 0.081 0.098 0.73 0.091 0.102 0.697 0.106 0.095 0.092 0.119 0.672 0.117 MOTIF Cranio-Facial_E15.5_H3K27ac_4_162_0.555_2.156588e-133 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.103 0.73 0.106 0.061 0.075 0.081 0.738 0.106 0.06 0.776 0.076 0.088 0.073 0.097 0.733 0.097 0.001 0.001 0.774 0.224 0.081 0.086 0.746 0.087 0.773 0.078 0.085 0.064 0.061 0.072 0.081 0.786 0.038 0.057 0.036 0.869 0.067 0.095 0.063 0.775 MOTIF Midbrain_P0_H3K27ac_10_165_0.570_2.341577e-174 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.695 0.112 0.105 0.088 0.721 0.099 0.113 0.067 0.725 0.087 0.098 0.09 0.121 0.13 0.106 0.643 0.085 0.711 0.11 0.094 0.1 0.709 0.091 0.1 0.086 0.703 0.104 0.107 0.084 0.099 0.711 0.106 0.094 0.717 0.09 0.099 0.116 0.116 0.664 0.104 MOTIF Stomach_E15.5_H3K4me3_39_164_0.645_1.801087e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.091 0.741 0.098 0.07 0.07 0.12 0.697 0.113 0.07 0.768 0.089 0.073 0.095 0.078 0.728 0.099 0.071 0.055 0.796 0.078 0.067 0.09 0.774 0.069 0.667 0.13 0.101 0.102 0.083 0.094 0.083 0.74 0.038 0.1 0.079 0.783 0.041 0.109 0.06 0.79 0.057 0.131 0.084 0.728 0.047 0.789 0.077 0.087 MOTIF Kidney_E15.5_H3K4me3_27_156_0.667_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.168 0.048 0.679 0.105 0.001 0.956 0.001 0.042 0.161 0.001 0.773 0.065 0.604 0.075 0.199 0.122 0.071 0.145 0.12 0.664 0.079 0.11 0.044 0.767 0.032 0.131 0.026 0.811 0.179 0.049 0.153 0.619 MOTIF Kidney_P0_H3K4me3_5_153_0.739_3.161245e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.109 0.736 0.043 0.112 0.001 0.001 0.986 0.012 0.001 0.857 0.091 0.051 0.04 0.074 0.766 0.12 0.276 0.17 0.382 0.172 0.067 0.246 0.465 0.222 0.069 0.283 0.065 0.583 0.001 0.062 0.005 0.932 0.001 0.081 0.043 0.875 0.001 0.257 0.143 0.599 MOTIF Lung_P0_H3K4me3_6_154_0.724_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.75 0.151 0.077 0.022 0.667 0.126 0.178 0.029 0.459 0.425 0.113 0.004 0.034 0.378 0.122 0.466 0.25 0.652 0.003 0.095 0.064 0.176 0.745 0.015 0.05 0.812 0.134 0.004 0.151 0.273 0.572 0.004 MOTIF Forebrain_P0_H3K9ac_26_173_0.620_3.766593e-279 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.524 0.255 0.172 0.049 0.35 0.25 0.169 0.231 0.127 0.577 0.251 0.045 0.127 0.434 0.352 0.087 0.15 0.554 0.209 0.087 0.108 0.168 0.637 0.087 0.004 0.701 0.127 0.168 0.249 0.046 0.289 0.416 0.166 0.046 0.046 0.742 0.248 0.088 0.046 0.618 0.085 0.271 0.231 0.413 0.216 0.215 0.355 0.214 MOTIF Forebrain_E16.5_H3K9ac_28_159_0.601_1.712997e-184 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.667 0.109 0.108 0.116 0.723 0.095 0.106 0.076 0.72 0.109 0.094 0.077 0.699 0.103 0.111 0.087 0.113 0.118 0.658 0.111 0.101 0.691 0.115 0.093 0.118 0.68 0.074 0.128 0.081 0.696 0.106 0.117 0.063 0.089 0.76 0.088 0.087 0.706 0.115 0.092 MOTIF Heart_E11.5_H3K9ac_21_165_0.586_8.246821e-291 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.229 0.399 0.175 0.196 0.108 0.332 0.41 0.15 0.067 0.862 0.004 0.067 0.152 0.164 0.603 0.081 0.108 0.317 0.445 0.13 0.225 0.088 0.502 0.185 0.248 0.598 0.067 0.087 0.045 0.109 0.296 0.55 0.358 0.025 0.165 0.451 0.254 0.046 0.066 0.634 0.212 0.22 0.256 0.312 0.418 0.262 0.175 0.145 MOTIF Forebrain_E13.5_H3K9ac_58_170_0.558_8.776752e-76 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 MOTIF Intestine_E16.5_H3K9ac_40_166_0.558_3.71954e-79 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7