MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Limb_E13.5_H3K4me1_52_111_0.519_1.57336e-60
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.123746	0.065096	0.811158
0.015803	0.914305	0.04341	0.026482
0.818903	0.002162	0.012453	0.166482
0.016897	0.047246	0.903901	0.031956
0.897814	0.006491	0.036482	0.059213
0.885993	0.046136	0.048044	0.019827
0.936795	0.019492	0.034284	0.009428
0.028653	0.881291	0.073758	0.016299
0.489643	0.43002	0.028783	0.051554
0.0	0.912388	0.021633	0.065979
0.0	0.305341	0.694659	0.0

MOTIF	Limb_E14.5_H3K4me1_39_119_0.517_1.246322e-33
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.044937	0.940344	0.0	0.014719
0.90885	0.0	0.060793	0.030357
0.038056	0.017489	0.926367	0.018087
0.984302	0.0	0.0	0.015698
0.937315	0.034759	0.0	0.027926
0.471603	0.010058	0.498987	0.019352
0.037122	0.946644	0.0	0.016234
0.12778	0.668394	0.186204	0.017622
0.014556	0.897308	0.024205	0.063931

MOTIF	Midbrain_E11.5_H3K4me1_29_82_0.525_1.073305e-36
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.036748	0.657618	0.302497	0.003137
0.938274	0.02479	0.028853	0.008083
0.08105	0.013538	0.892021	0.01339
0.933211	0.012077	0.047341	0.007372
0.934692	0.049632	0.009635	0.006041
0.434691	0.016811	0.52468	0.023818
0.019161	0.914379	0.040592	0.025868
0.045699	0.660127	0.282471	0.011704
0.04848	0.851506	0.055859	0.044155
0.0	0.046657	0.610577	0.342766
0.058368	0.036143	0.762419	0.143071

MOTIF	Hindbrain_E11.5_H3K9me3_54_8_0.517_1.07196e-10
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.016611	0.040256	0.941981	0.001152
0.932252	0.002918	0.047734	0.017096
0.088215	0.019471	0.860448	0.031867
0.941874	0.02222	0.028892	0.007013
0.898447	0.068079	0.016236	0.017239
0.715505	0.063795	0.20424	0.016461
0.041257	0.772695	0.119936	0.066112
0.047002	0.80005	0.082195	0.070754
0.082236	0.686088	0.084664	0.147012
0.175179	0.0213	0.008428	0.795093
0.508152	0.14997	0.097849	0.244029

MOTIF	Heart_E15.5_H3K9me3_28_2_0.527_1.766469e-27
letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.083187	0.0903	0.82024	0.006273
0.91914	0.004897	0.040046	0.035916
0.106784	0.022756	0.844894	0.025566
0.940451	0.012359	0.041463	0.005726
0.862494	0.078663	0.037396	0.021448
0.839145	0.007755	0.137811	0.015289
0.035364	0.833888	0.067298	0.06345
0.041083	0.881563	0.033508	0.043846
0.169442	0.612831	0.075435	0.142293
0.127533	0.162003	0.012533	0.697931
0.629841	0.196166	0.056383	0.11761
0.105816	0.322045	0.006247	0.565892
0.390595	0.182523	0.407096	0.019785

MOTIF	Lung_E14.5_H3K9me3_58_2_0.515_6.36747e-17
letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.109828	0.046718	0.830933	0.012521
0.951973	0.003273	0.029001	0.015753
0.087978	0.035886	0.848163	0.027973
0.957825	0.011396	0.024396	0.006383
0.926977	0.024552	0.02587	0.022601
0.812677	0.010906	0.161182	0.015235
0.022202	0.834998	0.043231	0.099569
0.073089	0.81131	0.064425	0.051177
0.108905	0.547586	0.102384	0.241125
0.086939	0.185618	0.026057	0.701386
0.832393	0.012767	0.121182	0.033658
0.135099	0.308003	0.003143	0.553755
0.224023	0.200197	0.575779	0.0

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K9me3_41_25_0.518_2.040635e-21
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.076362	0.511213	0.391513	0.020912
0.925181	0.00802	0.025471	0.041329
0.066939	0.010488	0.900876	0.021698
0.941972	0.013633	0.027529	0.016867
0.857288	0.051464	0.051776	0.039472
0.829517	0.013701	0.137937	0.018845
0.143097	0.735537	0.072132	0.049233
0.097868	0.787243	0.022092	0.092797
0.287638	0.545894	0.06208	0.104387
0.074136	0.071472	0.018576	0.835817

MOTIF	Cranio-Facial_E14.5_H3K9me3_72_66_0.516_8.298098e-17
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.913437	0.012687	0.037926	0.035949
0.040778	0.062481	0.833156	0.063585
0.947392	0.006623	0.027385	0.0186
0.814023	0.088418	0.038098	0.05946
0.90771	0.026456	0.050953	0.014882
0.043281	0.777824	0.126923	0.051972
0.21772	0.657259	0.071027	0.053994
0.267321	0.612316	0.070458	0.049905
0.174253	0.043189	0.029421	0.753138
0.146745	0.242219	0.459942	0.151094

MOTIF	Kidney_E16.5_H3K9me3_77_114_0.516_3.052032e-26
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.913054	0.01034	0.03058	0.046026
0.05394	0.065748	0.758275	0.122037
0.93371	0.013348	0.028481	0.024461
0.718872	0.077489	0.075967	0.127672
0.876128	0.027716	0.059826	0.03633
0.011974	0.890457	0.066634	0.030935
0.121413	0.778511	0.040793	0.059283
0.198326	0.680481	0.066215	0.054978
0.112445	0.033168	0.054316	0.800071

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K9me3_66_27_0.518_2.390881e-21
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.955211	0.002601	0.02584	0.016348
0.077027	0.011448	0.886519	0.025006
0.940659	0.024816	0.028966	0.005559
0.886174	0.018361	0.032102	0.063363
0.831662	0.007878	0.144678	0.015781
0.011955	0.834777	0.083843	0.069425
0.26565	0.693534	0.022035	0.018781
0.089472	0.737644	0.043791	0.129093
0.216456	0.070787	0.018288	0.694469

MOTIF	Neural-Tube_E15.5_H3K9me3_108_35_0.507_8.990722e-21
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.851408	0.04192	0.04465	0.062022
0.029546	0.103596	0.820946	0.045913
0.899436	0.009715	0.030596	0.060253
0.850135	0.045531	0.05787	0.046463
0.8301	0.012632	0.139283	0.017985
0.036251	0.747293	0.158733	0.057723
0.154724	0.786824	0.030669	0.027782
0.049518	0.82714	0.03384	0.089503
0.235876	0.011713	0.011488	0.740923

MOTIF	Liver_E11.5_H3K9me3_79_16_0.506_5.803473e-06
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.857908	0.009764	0.087997	0.044331
0.067514	0.09079	0.811792	0.029905
0.952729	0.009401	0.031233	0.006637
0.877701	0.064314	0.029093	0.028893
0.769244	0.031955	0.18017	0.018631
0.014062	0.911176	0.065107	0.009655
0.188505	0.751451	0.02891	0.031134
0.198306	0.570874	0.085255	0.145565
0.031002	0.050881	0.033406	0.884711
0.407267	0.101064	0.436985	0.054684
0.527092	0.09941	0.031801	0.341697
0.192091	0.190151	0.446948	0.17081

MOTIF	Cranio-Facial_E12.5_H3K9me3_72_68_0.513_2.260499e-07
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.844594	0.011752	0.040341	0.103312
0.055758	0.024516	0.884869	0.034857
0.924678	0.004797	0.061047	0.009478
0.69801	0.099152	0.168356	0.034482
0.822172	0.013944	0.142497	0.021387
0.058188	0.819559	0.113938	0.008315
0.113792	0.806249	0.014631	0.065327
0.199343	0.672991	0.052882	0.074785
0.058474	0.050463	0.051405	0.839658

MOTIF	Intestine_E14.5_H3K9me3_81_56_0.514_7.555431e-10
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.878839	0.009483	0.073574	0.038104
0.049226	0.043347	0.842076	0.06535
0.934069	0.018834	0.036246	0.010851
0.852245	0.046743	0.031923	0.069088
0.835508	0.053272	0.088535	0.022685
0.022078	0.813202	0.146617	0.018102
0.140812	0.779617	0.032297	0.047273
0.182473	0.621546	0.07997	0.116011
0.036763	0.132657	0.031348	0.799232
0.552559	0.058081	0.35135	0.03801

MOTIF	Cranio-Facial_E13.5_H3K9me3_86_42_0.511_3.072106e-19
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.88649	0.007734	0.068311	0.037465
0.053072	0.061241	0.864871	0.020816
0.871956	0.024115	0.058985	0.044944
0.774346	0.049309	0.153175	0.023169
0.870376	0.011071	0.102434	0.016119
0.031281	0.836271	0.118621	0.013827
0.071338	0.807167	0.020589	0.100906
0.151033	0.698304	0.061761	0.088903
0.07368	0.135508	0.056854	0.733958
0.554646	0.022918	0.378145	0.04429

MOTIF	Kidney_E15.5_H3K9me3_97_50_0.506_2.55855e-12
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.870613	0.013465	0.077008	0.038914
0.067674	0.059116	0.844195	0.029014
0.898096	0.016673	0.038937	0.046294
0.78161	0.048757	0.126963	0.04267
0.852566	0.026122	0.095025	0.026288
0.048802	0.838073	0.061633	0.051492
0.109279	0.802901	0.030285	0.057535
0.126665	0.695895	0.076427	0.101014
0.053831	0.11052	0.039786	0.795864
0.474524	0.077222	0.411565	0.03669

MOTIF	Cranio-Facial_E15.5_H3K9me3_41_9_0.517_7.392223e-17
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.884829	0.009884	0.078202	0.027085
0.096129	0.012958	0.864997	0.025916
0.921652	0.024107	0.030308	0.023933
0.873784	0.039978	0.070859	0.015378
0.859375	0.016514	0.105751	0.01836
0.03991	0.802427	0.128582	0.029081
0.072258	0.845683	0.027398	0.054661
0.182559	0.622897	0.063591	0.130952
0.024725	0.03779	0.052826	0.884658
0.57068	0.05961	0.253658	0.116052
0.193342	0.247758	0.112643	0.446256

MOTIF	Heart_P0_H3K9me3_86_37_0.511_1.076308e-13
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.869779	0.008066	0.068252	0.053903
0.068559	0.0491	0.84797	0.034371
0.943404	0.015716	0.030388	0.010493
0.851754	0.062288	0.04327	0.042688
0.840579	0.032203	0.11043	0.016788
0.038166	0.797771	0.108346	0.055718
0.09935	0.813144	0.024514	0.062991
0.24454	0.592985	0.055842	0.106634
0.120777	0.062571	0.019953	0.796698
0.445358	0.043036	0.464226	0.047379
0.197337	0.257635	0.149253	0.395776

MOTIF	Lung_P0_H3K9me3_59_13_0.514_1.463342e-06
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.854076	0.017283	0.068982	0.059659
0.065321	0.057505	0.846632	0.030542
0.883651	0.008231	0.090983	0.017135
0.91105	0.038198	0.034575	0.016177
0.793604	0.019494	0.164146	0.022755
0.033995	0.849757	0.098732	0.017516
0.129235	0.796018	0.033701	0.041046
0.158007	0.625618	0.073133	0.143242
0.073452	0.041943	0.030459	0.854146
0.533818	0.039327	0.335949	0.090907
0.123983	0.233579	0.180844	0.461593

MOTIF	Stomach_P0_H3K9me3_12_14_0.532_5.356037e-14
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.804988	0.014106	0.121023	0.059884
0.05778	0.021414	0.887975	0.032831
0.900025	0.013091	0.0676	0.019284
0.940122	0.021271	0.027838	0.010769
0.727873	0.014254	0.237547	0.020327
0.016035	0.854562	0.090436	0.038968
0.114447	0.807665	0.011382	0.066505
0.173592	0.590461	0.066307	0.169639
0.030567	0.020161	0.015406	0.933866
0.584501	0.043567	0.294296	0.077636
0.143681	0.261415	0.19143	0.403475
0.33413	0.159828	0.445414	0.060629