MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Lung_E15.5_H3K4me1_52_29_0.517_1.340126e-29
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.130867	0.250506	0.463176	0.155452
0.057494	0.530397	0.407511	0.004597
0.765713	0.042467	0.059373	0.132447
0.016962	0.054273	0.920901	0.007864
0.146324	0.149443	0.701064	0.003168
0.790778	0.047658	0.036023	0.125541
0.065854	0.075826	0.804828	0.053492
0.106556	0.133003	0.721497	0.038944
0.062394	0.898342	0.031872	0.007392
0.063478	0.030521	0.130968	0.775033
0.004024	0.096301	0.877286	0.022388

MOTIF	Lung_E15.5_H3K4me1_43_19_0.519_5.1207e-36
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.011608	0.06765	0.869513	0.051229
0.015942	0.90869	0.019189	0.056178
0.009404	0.941143	0.017495	0.031957
0.176908	0.016169	0.193085	0.613838
0.002126	0.91432	0.039096	0.044458
0.028776	0.634509	0.013189	0.323526
0.023694	0.037289	0.279611	0.659406
0.008909	0.947381	0.024771	0.018938
0.180351	0.720947	0.030533	0.068169
0.117142	0.0	0.859889	0.022969

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K4me1_69_25_0.515_3.256108e-24
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.421012	0.341121	0.22965	0.008217
0.018592	0.057722	0.877771	0.045915
0.021773	0.687771	0.129168	0.161288
0.094324	0.792839	0.07145	0.041386
0.039887	0.046893	0.06482	0.848401
0.000911	0.82415	0.030902	0.144037
0.030341	0.783025	0.015535	0.171099
0.125103	0.049026	0.196075	0.629797
0.02205	0.881809	0.072624	0.023516
0.027323	0.953731	0.018946	0.0

MOTIF	Neural-Tube_E12.5_H3K4me1_62_36_0.514_1.059488e-25
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.028243	0.06419	0.824995	0.082572
0.018386	0.755317	0.184756	0.04154
0.056749	0.876454	0.01711	0.049687
0.04091	0.06108	0.08419	0.81382
0.000496	0.793119	0.035086	0.171299
0.016934	0.7617	0.042256	0.17911
0.120116	0.054729	0.147147	0.678008
0.003526	0.957834	0.0	0.03864
0.020866	0.768401	0.068734	0.141999

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K4me1_74_17_0.511_8.554149e-18
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.019039	0.081541	0.85173	0.047691
0.010655	0.793869	0.09905	0.096425
0.057457	0.837073	0.065373	0.040097
0.070406	0.047747	0.112513	0.769334
0.002413	0.78628	0.038515	0.172792
0.01978	0.81039	0.052231	0.117598
0.034286	0.041718	0.131625	0.792371
0.010132	0.802273	0.157845	0.02975
0.035156	0.734407	0.088348	0.142089
0.113164	0.440468	0.271465	0.174903
0.293561	0.129435	0.294583	0.28242

MOTIF	Midbrain_E12.5_H3K4me1_57_22_0.517_5.180703e-46
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.032112	0.052495	0.858058	0.057335
0.014418	0.782416	0.103162	0.100004
0.067932	0.816989	0.056037	0.059042
0.042944	0.032664	0.05677	0.867622
0.000217	0.83099	0.030769	0.138024
0.016003	0.801052	0.051474	0.131471
0.029592	0.04192	0.138039	0.790449
0.017655	0.791528	0.155548	0.03527
0.043998	0.663777	0.077094	0.215131
0.08059	0.46001	0.349686	0.109714

MOTIF	Lung_P0_H3K4me1_101_17_0.501_1.369901e-06
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.018242	0.072287	0.877392	0.032079
0.009911	0.717805	0.117286	0.154999
0.057619	0.877052	0.030409	0.03492
0.076265	0.053427	0.125071	0.745237
0.001837	0.732679	0.129159	0.136324
0.046417	0.773189	0.022418	0.157976
0.075225	0.035977	0.133707	0.75509
0.010422	0.909843	0.054452	0.025284
0.018393	0.85089	0.024803	0.105915
0.31521	0.316218	0.088813	0.279759

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K4me1_73_32_0.509_2.963462e-14
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.324393	0.089688	0.218783	0.367137
0.007907	0.04352	0.915038	0.033535
0.027935	0.633869	0.132414	0.205782
0.050322	0.827754	0.068344	0.05358
0.031957	0.04346	0.039063	0.88552
0.000752	0.78633	0.054092	0.158826
0.011049	0.838375	0.016184	0.134392
0.03497	0.041136	0.132659	0.791234
0.017196	0.861513	0.076164	0.045128
0.076484	0.718092	0.026916	0.178507

MOTIF	Limb_E11.5_H3K4me1_81_34_0.511_1.139743e-12
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.341332	0.060545	0.265429	0.332694
0.03732	0.016981	0.91459	0.031109
0.010929	0.672691	0.134511	0.181869
0.071381	0.797316	0.063696	0.067608
0.033445	0.044933	0.05026	0.871363
0.000414	0.806152	0.031116	0.162317
0.023242	0.842888	0.066894	0.066976
0.084957	0.035161	0.138729	0.741153
0.019972	0.837307	0.115275	0.027446
0.019808	0.833073	0.007231	0.139888

MOTIF	Cranio-Facial_E13.5_H3K4me1_87_39_0.506_1.233992e-15
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.027105	0.072791	0.824934	0.07517
0.033109	0.675295	0.134124	0.157471
0.057582	0.854774	0.048855	0.03879
0.070087	0.039644	0.037261	0.853008
0.001219	0.810497	0.077146	0.111138
0.011808	0.796031	0.01778	0.174381
0.037383	0.034493	0.109747	0.818377
0.022309	0.876574	0.065478	0.035639
0.008096	0.762602	0.074845	0.154457

MOTIF	Hindbrain_E15.5_H3K4me1_72_38_0.511_1.834278e-17
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.015902	0.062153	0.859146	0.062798
0.033934	0.69325	0.1206	0.152216
0.040487	0.829176	0.068166	0.062171
0.04046	0.042369	0.070729	0.846441
0.000485	0.819166	0.026648	0.153701
0.013806	0.826185	0.010679	0.14933
0.034015	0.027313	0.149214	0.789458
0.010032	0.856337	0.110771	0.02286
0.037676	0.633077	0.100035	0.229212

MOTIF	Kidney_E14.5_H3K4me1_58_30_0.516_5.195083e-23
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.013774	0.024452	0.902713	0.05906
0.013274	0.705032	0.112944	0.168751
0.069114	0.801098	0.049641	0.080148
0.040626	0.037683	0.10265	0.819041
0.002283	0.825494	0.04785	0.124373
0.019407	0.879737	0.033238	0.067617
0.050564	0.026136	0.088499	0.834801
0.016127	0.734668	0.228424	0.020781
0.026591	0.745707	0.034634	0.193068

MOTIF	Midbrain_E14.5_H3K4me1_65_35_0.512_3.649646e-20
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.013752	0.055924	0.888498	0.041826
0.019328	0.668858	0.1156	0.196214
0.067762	0.792984	0.080456	0.058798
0.039011	0.044555	0.049701	0.866733
0.001166	0.805156	0.023972	0.169706
0.008526	0.865536	0.066814	0.059125
0.033287	0.031709	0.145784	0.789221
0.024169	0.862869	0.093967	0.018995
0.034054	0.735733	0.089302	0.140911

MOTIF	Intestine_E14.5_H3K4me1_72_30_0.512_4.91198e-20
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.022962	0.064329	0.853927	0.058783
0.012068	0.702089	0.11872	0.167123
0.060461	0.831549	0.047387	0.060603
0.066008	0.039148	0.064616	0.830228
0.0	0.723565	0.106964	0.169471
0.03467	0.852748	0.053101	0.059481
0.035876	0.031353	0.128511	0.804259
0.00717	0.86123	0.102396	0.029204
0.026473	0.710924	0.091351	0.171252

MOTIF	Midbrain_P0_H3K4me1_85_20_0.508_7.822846e-08
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.074612	0.044425	0.809859	0.071103
0.009373	0.77384	0.108903	0.107884
0.064279	0.843774	0.048513	0.043433
0.09174	0.037208	0.085136	0.785916
0.001695	0.72983	0.16179	0.106686
0.022819	0.877309	0.039634	0.060238
0.066821	0.035268	0.107412	0.790499
0.020816	0.81401	0.132268	0.032906
0.032262	0.768675	0.059156	0.139907

MOTIF	Limb_E14.5_H3K4me1_110_42_0.505_4.735014e-11
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.033278	0.079822	0.838669	0.048231
0.037713	0.618982	0.176651	0.166653
0.07868	0.809457	0.054267	0.057596
0.081709	0.064932	0.053469	0.799889
0.000111	0.778495	0.023459	0.197936
0.013017	0.774249	0.069124	0.143609
0.033485	0.014702	0.043028	0.908786
0.016803	0.856024	0.089303	0.03787
0.002192	0.844982	0.088749	0.064077

MOTIF	Neural-Tube_E13.5_H3K4me1_78_45_0.510_8.239911e-23
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.014904	0.065309	0.879649	0.040138
0.028525	0.658235	0.122571	0.190669
0.03051	0.869977	0.058741	0.040772
0.085904	0.05168	0.030638	0.831777
0.0	0.720037	0.073181	0.206782
0.026088	0.795375	0.017768	0.160769
0.042237	0.007435	0.140203	0.810126
0.009691	0.873313	0.073645	0.043352
0.019389	0.887285	0.015345	0.07798

MOTIF	Hindbrain_E14.5_H3K4me1_58_25_0.516_5.990539e-22
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.081114	0.448796	0.386707	0.083383
0.513995	0.292709	0.178474	0.014821
0.015951	0.045738	0.901438	0.036873
0.02089	0.727139	0.11549	0.136482
0.058589	0.833366	0.072596	0.035449
0.079618	0.049733	0.042003	0.828646
0.000866	0.770308	0.093086	0.135741
0.011841	0.811175	0.018883	0.1581
0.046467	0.060601	0.14713	0.745802
0.013062	0.869452	0.078592	0.038895
0.084767	0.718787	0.07756	0.118886

MOTIF	Stomach_E16.5_H3K4me1_66_23_0.511_6.11305e-12
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.414956	0.377744	0.198727	0.008573
0.037031	0.049855	0.860734	0.052379
0.029379	0.714865	0.118149	0.137607
0.06891	0.799873	0.054518	0.076698
0.072204	0.039074	0.129563	0.759159
0.001241	0.756785	0.145183	0.09679
0.010817	0.944466	0.01595	0.028767
0.057641	0.024358	0.027015	0.890985
0.012263	0.754196	0.203202	0.030338
0.030323	0.718694	0.072652	0.178332

MOTIF	Hindbrain_P0_H3K4me3_42_54_0.640_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.045327	0.915783	0.0	0.03889
0.002091	0.876436	0.032567	0.088906
0.016919	0.0	0.968292	0.014789
0.0	0.015546	0.984454	0.0
0.730222	0.027457	0.054448	0.187873
0.12713	0.048868	0.7619	0.062102
0.05198	0.0	0.917318	0.030703
0.350113	0.307163	0.0	0.342724
0.024028	0.014586	0.925791	0.035595