MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K27me3_64_120_0.502_6.004273e-15
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.101533	0.898467	0.0
0.783949	0.039434	0.072081	0.104537
0.009902	0.41953	0.570568	0.0
0.968395	0.00332	0.017053	0.011232
0.0	0.036399	0.960859	0.002742
0.924874	0.017655	0.049719	0.007752
0.015206	0.156626	0.828168	0.0
0.680751	0.28361	0.028288	0.00735
0.825988	0.030107	0.115854	0.02805

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K27me3_54_134_0.502_0.01872744
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.936047	0.011951	0.021091	0.030911
0.017317	0.246814	0.731882	0.003987
0.83493	0.053167	0.063579	0.048323
0.003479	0.025025	0.970062	0.001434
0.847484	0.056225	0.091119	0.005172
0.040763	0.042461	0.90872	0.008056
0.743482	0.14492	0.085128	0.02647
0.663957	0.13496	0.066812	0.134271
0.0	0.118004	0.865814	0.016182

MOTIF	Forebrain_E12.5_H3K4me1_87_134_0.505_1.750813e-06
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.844494	0.097724	0.050227	0.007555
0.228796	0.086789	0.669988	0.014427
0.911392	0.049455	0.028687	0.010465
0.00246	0.0	0.996417	0.001123
0.935332	0.0	0.057437	0.007231
0.076828	0.005954	0.916086	0.001131
0.849732	0.043962	0.106306	0.0
0.672054	0.204579	0.084836	0.038531
0.0	0.275312	0.718682	0.006005

MOTIF	Limb_E14.5_H3K4me1_146_289_0.501_0.0002837071
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.024855	0.952006	0.01822	0.004919
0.804499	0.069742	0.069453	0.056306
0.02257	0.024099	0.931167	0.022164
0.475271	0.084565	0.138916	0.301247
0.005064	0.016184	0.970353	0.008399
0.84532	0.000701	0.061014	0.092966
0.01553	0.036511	0.944602	0.003356
0.789706	0.059117	0.11771	0.033467
0.586047	0.303938	0.046475	0.06354
0.36796	0.320343	0.032409	0.279289

MOTIF	Cranio-Facial_E14.5_H3K4me1_101_129_0.503_2.872578e-05
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.076018	0.908927	0.009913	0.005142
0.570772	0.14362	0.104566	0.181043
0.0	0.072162	0.918805	0.009033
0.881263	0.040788	0.038367	0.039581
0.062836	0.08462	0.851837	0.000707
0.904788	0.002933	0.057824	0.034455
0.026741	0.011364	0.951874	0.010022
0.806341	0.104905	0.059875	0.028879
0.49256	0.224764	0.053991	0.228686
0.106953	0.135352	0.354318	0.403377

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K4me1_98_127_0.502_1.026143e-17
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.026507	0.965457	0.0	0.008036
0.669347	0.133372	0.038145	0.159136
0.052779	0.074018	0.860545	0.012658
0.651136	0.045947	0.085311	0.217606
0.008671	0.035414	0.954784	0.001131
0.839163	0.00609	0.079307	0.075439
0.023451	0.016293	0.951159	0.009097
0.922182	0.020894	0.052582	0.004342
0.639054	0.302402	0.041687	0.016856
0.205829	0.246073	0.510985	0.037113

MOTIF	Lung_E15.5_H3K4me1_82_148_0.504_1.208686e-10
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.978077	0.021923	0.0
0.473197	0.02064	0.028686	0.477477
0.003935	0.051604	0.924984	0.019477
0.730272	0.011033	0.054587	0.204107
0.0	0.0	1.0	0.0
0.789666	0.01476	0.082325	0.113249
0.054453	0.037932	0.734476	0.173138
0.850963	0.041358	0.092845	0.014834
0.891156	0.064024	0.030975	0.013845

MOTIF	Forebrain_E11.5_H3K27ac_81_52_0.508_3.228271e-06
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.033019	0.032916	0.912183	0.021882
0.019683	0.153633	0.824438	0.002246
0.792597	0.077895	0.06222	0.067288
0.020047	0.129385	0.844832	0.005736
0.711266	0.082068	0.176924	0.029742
0.02688	0.117944	0.855175	0.0
0.779654	0.118075	0.065062	0.037208
0.037171	0.062883	0.895939	0.004007
0.525236	0.193566	0.231681	0.049516
0.534572	0.278859	0.160952	0.025617

MOTIF	Liver_E16.5_H3K27me3_55_76_0.508_1.665892e-13
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.036252	0.080109	0.85726	0.026378
0.014412	0.222724	0.760084	0.00278
0.850577	0.027253	0.034482	0.087688
0.021214	0.212555	0.761063	0.005168
0.8597	0.024829	0.095405	0.020065
0.023526	0.072227	0.903316	0.000931
0.794644	0.035849	0.071447	0.098059
0.076418	0.069217	0.834842	0.019523
0.59075	0.057757	0.323136	0.028356
0.213491	0.448945	0.290492	0.047072
0.33674	0.134932	0.504003	0.024325

MOTIF	Hindbrain_E14.5_H3K4me2_77_81_0.528_3.220159e-45
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.01786	0.086832	0.885739	0.00957
0.025851	0.153816	0.813245	0.007088
0.74522	0.045509	0.142388	0.066883
0.029866	0.121146	0.847831	0.001157
0.83054	0.086514	0.052208	0.030737
0.019096	0.126151	0.85371	0.001044
0.575705	0.257051	0.074091	0.093153
0.036779	0.059553	0.90052	0.003149
0.620581	0.265289	0.089259	0.024871
0.0	0.250403	0.74728	0.002318
0.18801	0.652811	0.12936	0.029818

MOTIF	Cranio-Facial_E15.5_H3K4me2_70_27_0.567_7.891589e-140
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.022082	0.072769	0.898204	0.006945
0.00773	0.162182	0.829734	0.000355
0.814625	0.095457	0.061421	0.028497
0.014422	0.116365	0.86851	0.000703
0.723509	0.181776	0.081278	0.013437
0.007189	0.138103	0.854708	0.0
0.567285	0.264779	0.064885	0.103051
0.017923	0.070822	0.908698	0.002557
0.77563	0.069824	0.119448	0.035099
0.188703	0.588747	0.213498	0.009052
0.018621	0.025517	0.955862	0.0
0.0	0.834245	0.153721	0.012034

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K4me2_88_100_0.526_5.768118e-22
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.028719	0.036965	0.923301	0.011014
0.026521	0.155954	0.80688	0.010645
0.749113	0.039283	0.162383	0.049221
0.036712	0.111827	0.843364	0.008098
0.774883	0.062691	0.101466	0.06096
0.038495	0.062183	0.899322	0.0
0.71989	0.168204	0.049934	0.061972
0.033965	0.05556	0.900292	0.010182
0.579406	0.307278	0.091842	0.021475
0.10183	0.781959	0.079328	0.036883
0.257503	0.124605	0.617892	0.0

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K4me2_83_84_0.514_2.537604e-10
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.006803	0.070757	0.917615	0.004825
0.011777	0.23822	0.749518	0.000485
0.890997	0.030136	0.037133	0.041735
0.028281	0.127597	0.836224	0.007898
0.59931	0.173838	0.172015	0.054838
0.015781	0.110598	0.873621	0.0
0.791379	0.059825	0.055392	0.093404
0.034563	0.07185	0.890684	0.002903
0.605166	0.210832	0.076534	0.107468
0.036639	0.193975	0.44409	0.325296
0.0	0.301204	0.698258	0.000538

MOTIF	Midbrain_E15.5_H3K4me2_89_82_0.523_5.005687e-23
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.034156	0.078796	0.877298	0.00975
0.007951	0.157117	0.826305	0.008628
0.797244	0.04197	0.128574	0.032211
0.0189	0.104905	0.874849	0.001346
0.798857	0.129718	0.050772	0.020652
0.023187	0.117444	0.856112	0.003256
0.661514	0.149467	0.107745	0.081273
0.023535	0.05855	0.910679	0.007236
0.618507	0.254466	0.097935	0.029092
0.132026	0.209259	0.35716	0.301556
0.017473	0.183083	0.799444	0.0
0.209882	0.069172	0.400179	0.320767

MOTIF	Midbrain_E12.5_H3K4me2_94_93_0.506_1.344876e-12
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.048289	0.071567	0.86843	0.011714
0.019599	0.187486	0.787603	0.005312
0.695151	0.04875	0.196658	0.059442
0.022518	0.114127	0.860474	0.00288
0.794668	0.123306	0.060522	0.021504
0.022972	0.126268	0.850498	0.000262
0.741313	0.04763	0.141436	0.069622
0.033259	0.053213	0.909753	0.003775
0.707005	0.135135	0.100947	0.056914
0.28444	0.016427	0.57282	0.126313

MOTIF	Midbrain_E13.5_H3K4me2_91_84_0.526_4.260134e-31
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.047773	0.05173	0.887358	0.013139
0.02591	0.121951	0.8466	0.005538
0.73734	0.072635	0.144541	0.045485
0.018	0.101908	0.87487	0.005222
0.786767	0.08917	0.09103	0.033034
0.01717	0.103425	0.875803	0.003602
0.683685	0.137787	0.106814	0.071714
0.042078	0.047493	0.904973	0.005456
0.579934	0.241488	0.159176	0.019401
0.312964	0.17911	0.436921	0.071005
0.043693	0.658229	0.294227	0.003851
0.204105	0.608385	0.150416	0.037093

MOTIF	Hindbrain_E15.5_H3K4me2_87_75_0.521_1.478645e-22
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.026263	0.048675	0.912185	0.012877
0.026858	0.155162	0.812145	0.005835
0.733832	0.082038	0.123084	0.061046
0.019926	0.082571	0.895027	0.002476
0.772936	0.101036	0.072838	0.05319
0.024741	0.097595	0.877463	0.000201
0.697648	0.107134	0.128079	0.06714
0.034475	0.053147	0.905848	0.00653
0.57016	0.196538	0.216809	0.016493
0.173915	0.346105	0.433413	0.046568
0.059596	0.234694	0.511484	0.194226

MOTIF	Forebrain_E12.5_H3K4me2_102_85_0.511_5.586983e-14
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.054581	0.044089	0.891121	0.010209
0.022957	0.181128	0.791081	0.004834
0.76222	0.027955	0.169995	0.03983
0.034614	0.101824	0.861129	0.002432
0.827525	0.087235	0.05174	0.033499
0.021575	0.124893	0.848593	0.004939
0.654656	0.182154	0.130137	0.033053
0.033919	0.067425	0.894028	0.004628
0.657148	0.211169	0.099967	0.031716
0.349755	0.261037	0.383697	0.005512

MOTIF	Limb_E12.5_H3K4me2_91_77_0.521_7.169783e-25
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.044273	0.042566	0.899243	0.013918
0.028259	0.130389	0.833787	0.007564
0.7625	0.03158	0.159755	0.046164
0.01889	0.09019	0.883907	0.007013
0.769148	0.062937	0.136335	0.03158
0.01509	0.090171	0.892041	0.002699
0.613664	0.120693	0.191242	0.0744
0.055541	0.048275	0.89326	0.002924
0.653373	0.176885	0.15747	0.012272
0.433572	0.159881	0.326008	0.080539
0.13456	0.075774	0.714654	0.075012

MOTIF	Neural-Tube_E12.5_H3K4me2_84_62_0.533_3.478089e-36
letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.277364	0.330655	0.389768	0.002212
0.338367	0.091851	0.289296	0.280485
0.026895	0.080873	0.878874	0.013358
0.032813	0.159555	0.802056	0.005577
0.788631	0.043677	0.134037	0.033654
0.025087	0.094266	0.875902	0.004746
0.706653	0.067996	0.147827	0.077524
0.018776	0.104103	0.873796	0.003325
0.692031	0.163228	0.096229	0.048512
0.042828	0.048817	0.903409	0.004946
0.613939	0.203495	0.163773	0.018793
0.30228	0.220341	0.453454	0.023925
0.061279	0.221931	0.6906	0.026191