MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Cranio-Facial_E13.5_H3K27ac_14_153_0.550_1.176994e-113 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.208 0.281 0.241 0.269 0.756 0.068 0.089 0.087 0.781 0.066 0.091 0.062 0.759 0.089 0.068 0.084 0.062 0.736 0.087 0.115 0.093 0.732 0.08 0.095 0.146 0.084 0.692 0.078 0.086 0.695 0.119 0.1 0.851 0.037 0.045 0.067 0.235 0.232 0.28 0.254 MOTIF Cranio-Facial_E15.5_H3K27ac_2_154_0.559_2.502556e-142 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.256 0.264 0.236 0.244 0.154 0.151 0.136 0.559 0.082 0.167 0.607 0.144 0.097 0.66 0.103 0.14 0.142 0.126 0.577 0.155 0.121 0.144 0.589 0.146 0.125 0.151 0.116 0.608 0.06 0.12 0.112 0.708 0.098 0.117 0.094 0.691 0.252 0.282 0.26 0.206 MOTIF Cranio-Facial_E14.5_H3K27ac_26_153_0.544_6.643671e-61 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.115 0.076 0.719 0.09 0.693 0.111 0.142 0.054 0.887 0.029 0.083 0.001 0.911 0.031 0.054 0.004 0.733 0.094 0.119 0.054 0.101 0.71 0.103 0.086 0.224 0.471 0.069 0.236 0.254 0.145 0.447 0.154 0.114 0.767 0.112 0.007 0.888 0.003 0.021 0.088 0.037 0.042 0.853 0.068 0.09 0.722 0.124 0.064 MOTIF Forebrain_E14.5_H3K27ac_42_157_0.533_5.87297e-31 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.13 0.061 0.129 0.68 0.115 0.095 0.689 0.101 0.653 0.122 0.127 0.098 0.698 0.107 0.12 0.075 0.711 0.094 0.113 0.082 0.671 0.099 0.14 0.09 0.169 0.522 0.146 0.163 0.188 0.093 0.558 0.161 0.114 0.111 0.689 0.086 0.127 0.693 0.111 0.069 0.733 0.062 0.074 0.131 0.1 0.1 0.704 0.096 MOTIF Forebrain_E16.5_H3K27ac_3_173_0.577_1.54031e-154 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.242 0.296 0.224 0.238 0.112 0.128 0.573 0.187 0.093 0.581 0.192 0.134 0.16 0.519 0.16 0.161 0.155 0.111 0.559 0.175 0.173 0.165 0.094 0.568 0.131 0.134 0.139 0.596 0.223 0.243 0.169 0.365 MOTIF Midbrain_E11.5_H3K27ac_21_164_0.557_1.742689e-55 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.109 0.146 0.648 0.097 0.066 0.792 0.073 0.069 0.243 0.086 0.086 0.585 0.054 0.079 0.713 0.154 0.086 0.689 0.101 0.124 0.321 0.41 0.105 0.164 0.226 0.059 0.479 0.236 0.122 0.105 0.179 0.594 0.08 0.252 0.061 0.607 0.089 0.082 0.097 0.732 MOTIF Lung_E15.5_H3K4me3_11_160_0.717_1.472311e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.313 0.066 0.293 0.328 0.23 0.231 0.271 0.267 0.569 0.1 0.005 0.326 0.23 0.382 0.138 0.25 0.042 0.741 0.175 0.042 0.1 0.042 0.816 0.042 0.154 0.555 0.042 0.249 0.514 0.231 0.062 0.193 0.079 0.25 0.421 0.249 0.004 0.704 0.231 0.061 0.042 0.457 0.345 0.155 0.178 0.046 0.447 0.329 MOTIF Stomach_E15.5_H3K4me3_45_173_0.634_8.448362e-302 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 MOTIF Forebrain_E15.5_H3K4me3_76_169_0.554_7.274145e-52 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.834 0.038 0.078 0.05 0.869 0.053 0.062 0.016 0.885 0.022 0.064 0.029 0.785 0.036 0.124 0.055 0.036 0.878 0.041 0.045 0.074 0.097 0.031 0.798 0.055 0.062 0.827 0.056 0.069 0.817 0.078 0.036 0.881 0.029 0.018 0.072 0.063 0.059 0.849 0.029 0.092 0.812 0.051 0.045 0.065 0.06 0.764 0.111 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K4me3_64_172_0.573_1.393271e-93 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 MOTIF Hindbrain_E15.5_H3K4me3_86_176_0.544_1.506177e-39 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.74 0.104 0.097 0.059 0.759 0.08 0.103 0.058 0.776 0.063 0.098 0.063 0.727 0.077 0.119 0.077 0.116 0.721 0.085 0.078 0.105 0.064 0.066 0.765 0.064 0.071 0.796 0.069 0.083 0.799 0.065 0.053 0.8 0.061 0.055 0.084 0.09 0.07 0.769 0.071 0.13 0.681 0.096 0.093 0.108 0.101 0.665 0.126 MOTIF Midbrain_E13.5_H3K4me3_84_172_0.549_6.464203e-40 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.489 0.169 0.195 0.147 0.642 0.144 0.158 0.056 0.651 0.143 0.152 0.054 0.563 0.129 0.167 0.141 0.132 0.588 0.146 0.134 0.157 0.144 0.094 0.605 0.138 0.144 0.582 0.136 0.148 0.59 0.145 0.117 0.668 0.136 0.073 0.123 0.157 0.151 0.624 0.068 0.159 0.55 0.151 0.14 0.174 0.192 0.432 0.202 MOTIF Forebrain_E16.5_H3K9ac_65_173_0.548_3.40311e-54 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.676 0.112 0.119 0.093 0.684 0.108 0.123 0.085 0.661 0.119 0.113 0.107 0.118 0.118 0.135 0.629 0.083 0.713 0.101 0.103 0.134 0.088 0.078 0.7 0.087 0.114 0.697 0.102 0.109 0.713 0.09 0.088 0.649 0.129 0.09 0.132 0.101 0.662 0.142 0.095 0.145 0.603 0.107 0.145 0.117 0.136 0.612 0.135 MOTIF Heart_E11.5_H3K9ac_71_172_0.524_1.751359e-33 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.203 0.053 0.296 0.448 0.001 0.709 0.08 0.21 0.013 0.001 0.001 0.985 0.129 0.044 0.787 0.04 0.089 0.841 0.069 0.001 0.654 0.003 0.002 0.341 0.001 0.028 0.867 0.104 0.143 0.294 0.145 0.418 0.048 0.188 0.06 0.704 0.001 0.109 0.007 0.883 0.022 0.001 0.206 0.771 0.01 0.567 0.04 0.383 MOTIF Hindbrain_E15.5_H3K9ac_69_170_0.546_1.736129e-32 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.849 0.067 0.076 0.008 0.795 0.119 0.085 0.001 0.877 0.038 0.08 0.005 0.748 0.004 0.15 0.098 0.001 0.951 0.034 0.014 0.143 0.062 0.001 0.794 0.062 0.048 0.863 0.027 0.028 0.877 0.061 0.034 0.839 0.037 0.024 0.1 0.069 0.079 0.809 0.043 0.093 0.833 0.056 0.018 0.059 0.101 0.701 0.139 MOTIF Intestine_E16.5_H3K9ac_61_170_0.537_1.394826e-38 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.523 0.169 0.217 0.091 0.631 0.138 0.147 0.084 0.611 0.141 0.174 0.074 0.587 0.096 0.163 0.154 0.143 0.565 0.183 0.109 0.197 0.115 0.112 0.576 0.113 0.167 0.584 0.136 0.188 0.62 0.12 0.072 0.71 0.08 0.066 0.144 0.147 0.154 0.632 0.067 0.271 0.427 0.155 0.147 0.111 0.245 0.403 0.241 MOTIF Forebrain_E12.5_H3K9ac_58_166_0.534_6.759886e-29 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.15 0.637 0.117 0.096 0.107 0.099 0.676 0.118 0.054 0.782 0.086 0.078 0.084 0.062 0.049 0.805 0.044 0.068 0.807 0.081 0.076 0.791 0.067 0.066 0.744 0.065 0.075 0.116 0.063 0.091 0.739 0.107 0.085 0.107 0.084 0.724 0.051 0.097 0.082 0.77 0.052 0.094 0.072 0.782 0.062 0.095 0.101 0.742 MOTIF Limb_E11.5_H3K9ac_64_168_0.547_4.027897e-34 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.109 0.662 0.129 0.1 0.101 0.115 0.662 0.122 0.06 0.793 0.079 0.068 0.087 0.062 0.055 0.796 0.055 0.093 0.773 0.079 0.056 0.812 0.075 0.057 0.768 0.054 0.068 0.11 0.066 0.097 0.755 0.082 0.09 0.106 0.089 0.715 0.054 0.089 0.079 0.778 0.063 0.091 0.077 0.769 0.066 0.102 0.115 0.717 MOTIF Lung_E15.5_H3K9ac_51_167_0.590_1.891627e-95 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.671 0.103 0.101 0.125 0.623 0.138 0.113 0.126 0.622 0.13 0.12 0.128 0.672 0.11 0.102 0.116 0.111 0.658 0.109 0.122 0.09 0.119 0.135 0.656 0.127 0.098 0.665 0.11 0.127 0.635 0.111 0.127 0.642 0.124 0.129 0.105 0.112 0.1 0.657 0.131 0.092 0.721 0.098 0.089 0.078 0.084 0.772 0.066 MOTIF Neural-Tube_E14.5_H3K9ac_67_174_0.553_1.582142e-42 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.103 0.114 0.639 0.144 0.099 0.749 0.118 0.034 0.178 0.095 0.145 0.582 0.001 0.126 0.8 0.073 0.051 0.82 0.079 0.05 0.56 0.125 0.135 0.18 0.003 0.079 0.861 0.057 0.111 0.689 0.068 0.132 0.039 0.245 0.02 0.696 0.006 0.154 0.137 0.703 0.058 0.275 0.202 0.466 0.097 0.636 0.13 0.137