MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Liver_E13.5_H3K4me2_43_34_0.555_1.493609e-289
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.933609	0.020597	0.045794
0.052954	0.114368	0.773274	0.059404
0.048378	0.017573	0.903204	0.030846
0.07238	0.041618	0.712828	0.173174
0.027198	0.010705	0.955468	0.006629
0.02295	0.950442	0.026608	0.0
0.031606	0.020016	0.0	0.948378
0.0	0.398912	0.593955	0.007133
0.038226	0.768781	0.0	0.192993

MOTIF	Kidney_E14.5_H3K4me2_39_21_0.615_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.030324	0.922269	0.036439	0.010968
0.131746	0.036699	0.749089	0.082466
0.034255	0.038699	0.795174	0.131872
0.176477	0.174764	0.626392	0.022367
0.069841	0.053275	0.811239	0.065646
0.104917	0.876505	0.018579	0.0
0.095298	0.108697	0.0512	0.744804
0.025165	0.039635	0.880846	0.054354
0.032424	0.848304	0.018233	0.101038
0.25039	0.252606	0.420953	0.076051

MOTIF	Heart_E12.5_H3K4me2_55_25_0.549_5.343136e-163
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.08367	0.877163	0.031764	0.007403
0.127034	0.046078	0.659154	0.167734
0.05199	0.032036	0.781339	0.134635
0.14641	0.076299	0.743923	0.033368
0.041955	0.052644	0.828401	0.076999
0.05988	0.917727	0.019071	0.003322
0.10562	0.078165	0.019978	0.796238
0.021235	0.123298	0.776442	0.079026
0.061459	0.817163	0.012427	0.108951

MOTIF	Intestine_P0_H3K4me2_61_27_0.553_6.71531e-159
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.090531	0.843092	0.047429	0.018949
0.14241	0.035488	0.678623	0.143478
0.040599	0.028903	0.832122	0.098377
0.163591	0.076236	0.689778	0.070394
0.097136	0.081395	0.790748	0.030721
0.052789	0.924352	0.016331	0.006528
0.148278	0.070605	0.060693	0.720424
0.035767	0.041907	0.839784	0.082543
0.038527	0.881961	0.01758	0.061933

MOTIF	Cranio-Facial_E13.5_H3K4me2_45_23_0.574_1.229637e-271
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.02065	0.951435	0.027916	0.0
0.084779	0.047549	0.675677	0.191995
0.03214	0.050455	0.827665	0.089741
0.17321	0.177217	0.618495	0.031079
0.056758	0.034382	0.803544	0.105316
0.077193	0.914754	0.0028	0.005253
0.135731	0.042036	0.02896	0.793273
0.014128	0.062461	0.856436	0.066975
0.043404	0.810064	0.035945	0.110587

MOTIF	Lung_E14.5_H3K4me2_58_31_0.556_3.034877e-299
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.008532	0.938285	0.041676	0.011508
0.13351	0.048031	0.670654	0.147806
0.015664	0.037306	0.78769	0.159339
0.198044	0.045033	0.732023	0.024901
0.049598	0.043311	0.787067	0.120024
0.076184	0.904359	0.017664	0.001793
0.088072	0.089195	0.015442	0.807292
0.042896	0.068314	0.79167	0.09712
0.03366	0.824916	0.040768	0.100656

MOTIF	Midbrain_E13.5_H3K4me2_59_31_0.571_9.560686e-210
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.001253	0.92873	0.035078	0.034939
0.125593	0.058129	0.660734	0.155545
0.039127	0.023869	0.799082	0.137922
0.155689	0.072546	0.750946	0.020818
0.105225	0.039597	0.836975	0.018203
0.072688	0.90274	0.019899	0.004674
0.094028	0.088215	0.028352	0.789406
0.030837	0.150106	0.715009	0.104048
0.038197	0.885393	0.027311	0.049099

MOTIF	Kidney_E16.5_H3K4me2_43_9_0.598_5.365553e-321
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.060925	0.323298	0.402339	0.213437
0.059934	0.800126	0.129314	0.010626
0.847087	0.021232	0.055751	0.075931
0.023913	0.022539	0.936409	0.017139
0.073064	0.753981	0.128749	0.044207
0.067818	0.712176	0.089855	0.13015
0.085481	0.750745	0.060361	0.103413
0.040796	0.728733	0.151916	0.078555
0.027728	0.02342	0.88836	0.060492
0.022503	0.668421	0.293334	0.015742
0.021232	0.0	0.897757	0.081011

MOTIF	Liver_E12.5_H3K4me2_31_25_0.571_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.035825	0.669649	0.26534	0.029186
0.826272	0.03625	0.099042	0.038437
0.055363	0.029871	0.906512	0.008254
0.061249	0.837693	0.012423	0.088634
0.009017	0.79268	0.042993	0.15531
0.047342	0.864966	0.066945	0.020747
0.033675	0.797786	0.053737	0.114802
0.146452	0.011915	0.822134	0.019499
0.007632	0.697024	0.269358	0.025986

MOTIF	Forebrain_E12.5_H3K4me2_34_16_0.612_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.092681	0.086584	0.47589	0.344845
0.081593	0.757201	0.142892	0.018314
0.85221	0.01907	0.062005	0.066714
0.003439	0.019386	0.965179	0.011996
0.073699	0.811053	0.028365	0.086882
0.106929	0.659891	0.056786	0.176394
0.096506	0.73317	0.050482	0.119842
0.040559	0.771408	0.064968	0.123064
0.028954	0.029089	0.919303	0.022654
0.030382	0.876699	0.069264	0.023654

MOTIF	Cranio-Facial_E13.5_H3K4me2_31_14_0.596_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.068574	0.7868	0.116296	0.02833
0.782158	0.026609	0.066565	0.124668
0.031586	0.010977	0.919248	0.038189
0.046133	0.810381	0.120355	0.023131
0.03389	0.681684	0.143469	0.140957
0.067237	0.779985	0.069194	0.083584
0.069602	0.746845	0.070998	0.112554
0.025825	0.028101	0.92117	0.024904
0.01842	0.770994	0.19014	0.020446

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K4me2_39_17_0.603_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.073523	0.797193	0.091572	0.037712
0.760379	0.02332	0.11716	0.099142
0.045686	0.018861	0.861896	0.073557
0.05494	0.773593	0.112034	0.059433
0.02476	0.705856	0.110885	0.158498
0.020517	0.862913	0.028856	0.087714
0.136038	0.691945	0.094099	0.077919
0.012934	0.010177	0.94426	0.032629
0.01346	0.81581	0.156078	0.014652

MOTIF	Limb_E13.5_H3K4me2_41_21_0.578_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.101299	0.745118	0.108287	0.045295
0.811292	0.016136	0.106194	0.066378
0.028129	0.025052	0.900356	0.046464
0.045914	0.861847	0.025096	0.067143
0.090677	0.738851	0.072947	0.097525
0.081854	0.806851	0.047626	0.063668
0.14843	0.629689	0.104837	0.117044
0.043647	0.032503	0.907288	0.016562
0.008198	0.817931	0.150003	0.023867

MOTIF	Intestine_E15.5_H3K4me2_43_23_0.581_5.338363e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.070496	0.796344	0.100994	0.032166
0.864107	0.01068	0.045903	0.07931
0.004902	0.012831	0.964056	0.018211
0.05679	0.786648	0.106933	0.049629
0.085055	0.7674	0.026856	0.120689
0.096528	0.712464	0.105877	0.085132
0.073794	0.637726	0.190252	0.098228
0.029652	0.021911	0.916198	0.03224
0.063921	0.747254	0.171358	0.017467

MOTIF	Midbrain_E16.5_H3K4me2_49_21_0.586_3.514699e-314
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.065763	0.783462	0.13079	0.019985
0.845824	0.02897	0.047097	0.078109
0.008631	0.015098	0.954811	0.02146
0.066288	0.833702	0.031644	0.068366
0.099724	0.696169	0.042262	0.161846
0.050942	0.807472	0.037203	0.104383
0.059922	0.681902	0.128262	0.129913
0.028914	0.032926	0.904388	0.033772
0.044023	0.721441	0.219009	0.015527

MOTIF	Cranio-Facial_E12.5_H3K4me3_55_15_0.625_1.511841e-321
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.040689	0.863918	0.033072	0.062322
0.03598	0.748373	0.09843	0.117217
0.082274	0.034623	0.855755	0.027348
0.02667	0.750463	0.216738	0.006129
0.814182	0.012168	0.117243	0.056408
0.007326	0.021234	0.954931	0.016509
0.016137	0.887482	0.03272	0.063661
0.088464	0.703226	0.064579	0.143731
0.106333	0.785297	0.069938	0.038432
0.157873	0.277203	0.25396	0.310964

MOTIF	Midbrain_E14.5_H3K4me3_50_17_0.629_2.898579e-318
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.015147	0.912243	0.038674	0.033937
0.140068	0.746236	0.062501	0.051195
0.099278	0.030994	0.842215	0.027514
0.038059	0.738964	0.205167	0.01781
0.844106	0.013354	0.086289	0.056252
0.006745	0.013242	0.964766	0.015247
0.070136	0.839805	0.025991	0.064068
0.093756	0.677152	0.069948	0.159144
0.118841	0.745611	0.091982	0.043566
0.216431	0.439299	0.223122	0.121148

MOTIF	Limb_E13.5_H3K4me3_67_34_0.598_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.023481	0.88601	0.051902	0.038607
0.132325	0.054819	0.693154	0.119702
0.038378	0.038171	0.804808	0.118643
0.133148	0.137759	0.650603	0.07849
0.112579	0.011051	0.774928	0.101443
0.074484	0.908536	0.014552	0.002428
0.089966	0.102782	0.0	0.807252
0.041622	0.039454	0.877305	0.041619
0.046367	0.834672	0.036535	0.082426

MOTIF	Liver_E16.5_H3K4me3_50_33_0.598_1.146358e-237
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.010167	0.866982	0.034884	0.087967
0.103987	0.05771	0.816297	0.022006
0.022252	0.035056	0.911704	0.030988
0.314147	0.057908	0.502568	0.125377
0.127394	0.028334	0.68966	0.154612
0.005181	0.977224	0.015059	0.002536
0.060835	0.052075	0.024719	0.862371
0.008361	0.073183	0.855591	0.062866
0.031657	0.792815	0.074976	0.100552
0.523673	0.108236	0.368091	0.0

MOTIF	Midbrain_E15.5_H3K4me3_37_26_0.655_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.004591	0.953406	0.026742	0.015261
0.032899	0.029019	0.895218	0.042864
0.056842	0.032722	0.879634	0.030803
0.032215	0.047826	0.894165	0.025793
0.255026	0.036697	0.533417	0.17486
0.110532	0.836879	0.049012	0.003577
0.184252	0.08666	0.052975	0.676113
0.038117	0.024242	0.825348	0.112293
0.026902	0.82734	0.065673	0.080085
0.332583	0.184401	0.317028	0.165988