MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Hindbrain_E15.5_H3K4me2_72_36_0.551_9.15255e-193
letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.273577	0.0	0.726423	0.0
0.454687	0.189684	0.336691	0.018938
0.930174	0.028233	0.005943	0.03565
0.125904	0.075401	0.798695	0.0
0.154131	0.303695	0.501854	0.040321
0.029087	0.870693	0.055277	0.044943
0.096931	0.162098	0.668442	0.07253
0.078987	0.035497	0.883893	0.001623
0.893732	0.016938	0.016311	0.07302
0.024499	0.013891	0.954671	0.006938
0.092634	0.007115	0.804031	0.096221
0.133764	0.19789	0.4759	0.192446
0.227247	0.026606	0.68759	0.058557

MOTIF	Forebrain_E16.5_H3K4me2_88_94_0.505_1.768943e-08
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.938206	0.061794	0.0	0.0
0.05362	0.053951	0.886894	0.005535
0.02471	0.088146	0.872439	0.014705
0.008108	0.969372	0.013162	0.009358
0.07106	0.186647	0.318522	0.423771
0.0	0.0	1.0	0.0
0.75401	0.0	0.18902	0.056971
0.209871	0.0	0.77643	0.013699
0.0	0.05279	0.888817	0.058393

MOTIF	Hindbrain_E14.5_H3K4me2_61_56_0.556_2.433366e-211
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.465889	0.49615	0.037961	0.0
0.8258	0.105763	0.068438	0.0
0.149095	0.052922	0.788438	0.009545
0.240026	0.074684	0.586655	0.098635
0.023875	0.833456	0.023847	0.118822
0.049617	0.016936	0.912145	0.021302
0.004984	0.252991	0.742024	0.0
0.862365	0.031194	0.037611	0.06883
0.019492	0.03212	0.933987	0.014402
0.023822	0.015333	0.858052	0.102793

MOTIF	Limb_E13.5_H3K4me2_84_58_0.528_1.165589e-41
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.844533	0.0	0.155467	0.0
0.590522	0.396896	0.0	0.012583
0.866935	0.072849	0.033339	0.026876
0.09924	0.258401	0.642359	0.0
0.048124	0.158376	0.768952	0.024548
0.0	0.891776	0.037825	0.0704
0.142421	0.168681	0.504081	0.184817
0.0	0.039442	0.958862	0.001695
0.919532	0.005341	0.018418	0.056708
0.065194	0.013884	0.91835	0.002571

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K27ac_94_109_0.502_3.898788e-23
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.822365	0.028136	0.079876	0.069623
0.088753	0.058999	0.776435	0.075812
0.04528	0.142207	0.750166	0.062347
0.068067	0.91982	0.012114	0.0
0.137305	0.131099	0.026871	0.704726
0.0	0.115997	0.884003	0.0
0.828218	0.057879	0.011165	0.102738
0.007879	0.021997	0.927509	0.042615
0.098332	0.271648	0.56778	0.062239

MOTIF	Liver_E14.5_H3K27ac_28_25_0.558_6.963184e-149
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.055275	0.43022	0.261316	0.253189
0.070287	0.064695	0.780085	0.084932
0.03492	0.787509	0.121577	0.055995
0.021344	0.856947	0.052234	0.069474
0.06902	0.037848	0.137368	0.755764
5.5e-05	0.89739	0.090052	0.012503
0.107104	0.16502	0.068415	0.65946
0.019254	0.05361	0.859652	0.067484
0.039388	0.832046	0.075963	0.052603
0.030037	0.808805	0.075155	0.086003

MOTIF	Liver_E13.5_H3K27ac_55_24_0.526_5.590193e-101
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.775464	0.072275	0.112836	0.039424
0.064578	0.039307	0.862704	0.033411
0.057402	0.057481	0.850219	0.034898
0.089522	0.825484	0.061668	0.023326
0.711709	0.071204	0.129063	0.088024
0.018736	0.050859	0.930305	0.0001
0.675313	0.181418	0.069657	0.073612
0.092342	0.054913	0.803397	0.049348
0.073043	0.08112	0.808972	0.036866
0.074432	0.385408	0.374036	0.166124
0.046453	0.341408	0.452273	0.159866

MOTIF	Heart_E14.5_H3K27ac_88_48_0.506_5.809625e-43
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.78023	0.067824	0.10848	0.043465
0.083864	0.055199	0.83202	0.028917
0.067405	0.089338	0.810527	0.03273
0.091262	0.816317	0.079196	0.013225
0.797797	0.059264	0.029992	0.112948
0.025644	0.105938	0.867317	0.001101
0.784936	0.072947	0.074397	0.06772
0.060936	0.049986	0.836267	0.052811
0.110744	0.127921	0.700963	0.060373

MOTIF	Heart_E12.5_H3K27ac_92_51_0.502_5.479601e-37
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.764962	0.030288	0.15356	0.051191
0.110578	0.053513	0.810719	0.02519
0.061056	0.103818	0.792351	0.042775
0.112372	0.798371	0.077125	0.012132
0.802062	0.06953	0.032814	0.095594
0.025741	0.113284	0.860891	8.4e-05
0.828273	0.050459	0.050859	0.070408
0.076007	0.040099	0.841105	0.042789
0.100088	0.134604	0.709007	0.056301

MOTIF	Heart_E13.5_H3K27ac_81_55_0.505_4.348875e-56
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.832155	0.018677	0.10838	0.040788
0.069342	0.060161	0.848469	0.022028
0.09686	0.090801	0.778559	0.033779
0.103747	0.779741	0.103131	0.013381
0.81982	0.05384	0.018738	0.107602
0.034856	0.077448	0.886733	0.000963
0.793725	0.051539	0.086352	0.068383
0.067664	0.045451	0.832435	0.054451
0.129223	0.117259	0.693854	0.059664

MOTIF	Heart_E15.5_H3K27ac_98_62_0.502_9.880849e-49
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.829667	0.023869	0.106022	0.040442
0.090168	0.062325	0.825566	0.021941
0.091692	0.068812	0.801899	0.037597
0.106353	0.799681	0.080506	0.01346
0.822574	0.059023	0.012148	0.106255
0.034587	0.075065	0.889371	0.000977
0.784289	0.05305	0.083192	0.079468
0.086251	0.046059	0.8139	0.05379
0.114277	0.113224	0.713673	0.058827

MOTIF	Heart_P0_H3K27ac_103_60_0.501_4.662988e-44
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.813527	0.031668	0.114676	0.040129
0.085183	0.062309	0.831769	0.020739
0.060152	0.103702	0.798848	0.037298
0.111252	0.7879	0.0871	0.013748
0.817094	0.061885	0.020488	0.100533
0.039467	0.076076	0.883253	0.001205
0.794117	0.053585	0.072846	0.079453
0.071185	0.040912	0.832318	0.055585
0.120794	0.123259	0.701549	0.054399

MOTIF	Liver_E11.5_H3K27ac_85_68_0.502_2.060162e-43
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.795609	0.03321	0.129941	0.041241
0.069818	0.058773	0.849169	0.022241
0.078778	0.086499	0.803976	0.030748
0.121177	0.726216	0.134144	0.018462
0.793144	0.077088	0.043751	0.086017
0.029683	0.091559	0.878758	0.0
0.815868	0.045733	0.070069	0.06833
0.077546	0.038832	0.836066	0.047556
0.101617	0.103736	0.747058	0.047589

MOTIF	Liver_E12.5_H3K27ac_70_37_0.521_3.329529e-128
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.790151	0.071551	0.108309	0.029989
0.061521	0.056545	0.862351	0.019582
0.079581	0.071121	0.81929	0.030009
0.100251	0.787279	0.089692	0.022779
0.749389	0.079919	0.069099	0.101594
0.015176	0.083314	0.900637	0.000872
0.762039	0.077003	0.107772	0.053186
0.092948	0.044444	0.810298	0.05231
0.082382	0.104884	0.768815	0.043919

MOTIF	Liver_E15.5_H3K27ac_72_48_0.521_4.242546e-132
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.778624	0.072538	0.109546	0.039291
0.065369	0.053259	0.861254	0.020118
0.078233	0.072088	0.81824	0.031439
0.106455	0.785379	0.08764	0.020527
0.750831	0.077209	0.073356	0.098604
0.017953	0.086754	0.894336	0.000957
0.744911	0.074662	0.107124	0.073303
0.096435	0.039728	0.817129	0.046707
0.075134	0.097255	0.787723	0.039887

MOTIF	Liver_E16.5_H3K27ac_83_62_0.505_7.574144e-59
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.841424	0.032761	0.086963	0.038851
0.059891	0.041547	0.890732	0.007831
0.066689	0.05086	0.844347	0.038104
0.078172	0.768985	0.1306	0.022243
0.724408	0.089338	0.064333	0.121921
0.030101	0.123298	0.846411	0.000191
0.786312	0.059665	0.098939	0.055084
0.128703	0.041983	0.773893	0.055422
0.102008	0.112364	0.731716	0.053912

MOTIF	Liver_P0_H3K27ac_41_21_0.531_5.339952e-206
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.766341	0.069101	0.118956	0.045602
0.065216	0.056148	0.856723	0.021913
0.076365	0.071044	0.813877	0.038714
0.083759	0.824249	0.066528	0.025464
0.722518	0.065133	0.116323	0.096026
0.014996	0.097954	0.886549	0.000502
0.734683	0.125091	0.087775	0.052451
0.088668	0.054235	0.812506	0.04459
0.068673	0.110422	0.779755	0.04115
0.059888	0.522697	0.292681	0.124733
0.228459	0.16117	0.307119	0.303251
0.242115	0.621129	0.079004	0.057752

MOTIF	Forebrain_P0_H3K27ac_103_124_0.500_5.010397e-12
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.322433	0.255821	0.372276	0.04947
0.91113	0.0119	0.049156	0.027813
0.75456	0.148222	0.078356	0.018862
0.14641	0.118607	0.597152	0.137831
0.047596	0.116707	0.777695	0.058002
0.015917	0.92481	0.056043	0.003229
0.928077	0.029595	0.03487	0.007459
0.130843	0.092041	0.777116	0.0
0.83891	0.036944	0.039045	0.085102
0.079912	0.015184	0.833102	0.071802

MOTIF	Midbrain_E13.5_H3K27ac_62_77_0.522_1.015487e-38
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.826771	0.100452	0.053873	0.018904
0.810744	0.135748	0.03997	0.013539
0.309088	0.240835	0.37924	0.070838
0.008335	0.076205	0.867922	0.047537
0.004836	0.930387	0.062897	0.00188
0.753102	0.204906	0.01672	0.025272
0.02529	0.066867	0.906469	0.001374
0.868852	0.05225	0.051781	0.027118
0.13924	0.043929	0.805303	0.011528
0.040611	0.033114	0.472247	0.454028
0.005322	0.449746	0.544932	0.0

MOTIF	Stomach_E15.5_H3K9me3_55_110_0.501_0.1783196
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.780761	0.07804	0.120488	0.020711
0.06463	0.061286	0.793016	0.081068
0.073666	0.0723	0.818935	0.035099
0.026024	0.872247	0.04043	0.061299
0.005212	0.063937	0.115796	0.815055
0.028736	0.187855	0.778981	0.004428
0.917677	0.060069	0.012152	0.010101
0.222156	0.015999	0.756966	0.004879
0.030803	0.734373	0.199582	0.035242