MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Liver_P0_H3K27me3_61_140_0.513_7.489494e-11
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.087695	0.0	0.912305	0.0
0.896261	0.027801	0.0	0.075938
0.057123	0.009714	0.904845	0.028318
0.022119	0.014693	0.963188	0.0
0.537479	0.381764	0.080757	0.0
0.315314	0.077552	0.04574	0.561394
0.004378	0.0	0.982371	0.013251
0.0	0.971999	0.015167	0.012833
0.015881	0.82128	0.046607	0.116233

MOTIF	Limb_E11.5_H3K4me3_74_116_0.543_1.648134e-97
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.757879	0.167092	0.0	0.075029
0.03803	0.052832	0.909137	0.0
0.040639	0.40919	0.550171	0.0
0.072161	0.791724	0.133058	0.003056
0.929994	0.0	0.0	0.070006
0.0	0.106	0.894	0.0
0.111336	0.888664	0.0	0.0
0.0	0.882108	0.0	0.117892
0.144547	0.017157	0.838296	0.0

MOTIF	Midbrain_P0_H3K27ac_63_106_0.529_3.908019e-43
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.899222	0.011035	0.089743	0.0
0.142374	0.087889	0.747948	0.021789
0.024731	0.013032	0.949584	0.012653
0.292289	0.678368	0.028541	0.000802
0.780131	0.174361	0.013569	0.031939
0.026422	0.005572	0.904742	0.063265
0.029921	0.964583	0.005155	0.00034
0.01727	0.824313	0.066711	0.091706
0.522955	0.288637	0.041855	0.146553
0.124334	0.57983	0.0	0.295836

MOTIF	Stomach_E16.5_H3K27ac_71_131_0.512_1.24914e-15
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.067966	0.0	0.85467	0.077364
0.654367	0.036417	0.034927	0.274289
0.035971	0.0	0.959063	0.004966
0.302299	0.00889	0.681179	0.007632
0.469724	0.461	0.061134	0.008141
0.956233	0.036085	0.007682	0.0
0.018007	0.010802	0.968141	0.003049
0.073606	0.884573	0.0	0.041821
0.043158	0.926748	0.030094	0.0

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K9ac_70_74_0.543_2.473284e-49
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.04348	0.015864	0.931334	0.009323
0.051465	0.94447	0.0	0.004065
0.84773	0.043351	0.026268	0.082652
0.009193	0.030127	0.957668	0.003013
0.037029	0.045855	0.908922	0.008194
0.019236	0.945657	0.018811	0.016296
0.451003	0.022992	0.457795	0.06821
0.009333	0.035601	0.709451	0.245615
0.0337	0.808291	0.061622	0.096387
0.324276	0.351411	0.061343	0.26297

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K9ac_79_97_0.521_2.6991e-71
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.130271	0.055786	0.752293	0.06165
0.124472	0.803155	0.043029	0.029345
0.876877	0.028414	0.044779	0.04993
0.019884	0.02363	0.948063	0.008422
0.199569	0.121309	0.673648	0.005474
0.301473	0.676674	0.019986	0.001867
0.877251	0.034603	0.030924	0.057222
0.013194	0.023735	0.909002	0.054068
0.059225	0.879165	0.023123	0.038487
0.112927	0.612781	0.034021	0.240272
0.606496	0.080497	0.124436	0.188571

MOTIF	Kidney_E16.5_H3K9ac_88_115_0.515_1.184797e-51
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.196346	0.03166	0.699771	0.072223
0.063073	0.889822	0.041749	0.005355
0.909457	0.029761	0.028814	0.031967
0.01408	0.023283	0.962328	0.00031
0.225063	0.093909	0.654491	0.026538
0.262173	0.679619	0.026412	0.031795
0.904902	0.0	0.026267	0.068831
0.022322	0.043559	0.839161	0.094958
0.10572	0.820675	0.001519	0.072086

MOTIF	Forebrain_E11.5_H3K9ac_81_104_0.519_3.465545e-38
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.330294	0.0	0.524283	0.145423
0.162074	0.021229	0.813116	0.003581
0.207042	0.697511	0.089689	0.005758
0.865627	0.005996	0.067388	0.06099
0.109526	0.043233	0.843799	0.003442
0.319711	0.042563	0.633126	0.004601
0.071875	0.873814	0.037948	0.016363
0.893839	0.010583	0.048593	0.046986
0.0	0.02056	0.896547	0.082893
0.052061	0.831303	0.068926	0.047709
0.067199	0.348965	0.380442	0.203394

MOTIF	Limb_E12.5_H3K9ac_72_116_0.506_2.51482e-31
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.168195	0.038622	0.690119	0.103065
0.101919	0.738388	0.074618	0.085076
0.910211	0.016672	0.030139	0.042978
0.089702	0.078132	0.832166	0.0
0.362279	0.081429	0.551341	0.004952
0.045455	0.917577	0.007196	0.029773
0.934983	0.0	0.044123	0.020894
0.001365	0.031071	0.963223	0.004341
0.055964	0.792797	0.038312	0.112926

MOTIF	Midbrain_E11.5_H3K9ac_88_104_0.520_4.455961e-51
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.168271	0.038608	0.731128	0.061993
0.169783	0.765817	0.047529	0.016872
0.760586	0.01724	0.049849	0.172325
0.027443	0.177065	0.793059	0.002433
0.21613	0.115043	0.660756	0.008071
0.037242	0.914418	0.029901	0.018438
0.887621	0.016692	0.04124	0.054447
0.0026	0.016618	0.888161	0.092621
0.043308	0.863402	0.060266	0.033023
0.165244	0.270919	0.18536	0.378476

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K9ac_73_119_0.533_4.007365e-95
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.13894	0.041561	0.802943	0.016557
0.19591	0.720716	0.034	0.049374
0.841623	0.010636	0.064612	0.083129
0.062166	0.05995	0.871683	0.0062
0.223615	0.038578	0.677337	0.06047
0.053494	0.849604	0.085689	0.011213
0.893799	0.020897	0.039898	0.045406
0.0	0.176095	0.757105	0.0668
0.102652	0.738516	0.071962	0.086871

MOTIF	Neural-Tube_E13.5_H3K9ac_67_90_0.541_6.996205e-77
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.088133	0.033981	0.752317	0.125569
0.16482	0.711782	0.117855	0.005543
0.792247	0.056497	0.064139	0.087117
0.01773	0.105686	0.870005	0.006579
0.186305	0.1882	0.595134	0.030361
0.070539	0.813496	0.098706	0.017259
0.793451	0.087139	0.057544	0.061865
0.00098	0.133676	0.751771	0.113573
0.09695	0.732019	0.050743	0.120287
0.131953	0.52179	0.206836	0.13942

MOTIF	Heart_E12.5_H3K9ac_84_100_0.506_5.668401e-32
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.750641	0.056937	0.07526	0.117162
0.090809	0.047001	0.858792	0.003398
0.141524	0.793917	0.03019	0.03437
0.866392	0.035251	0.052049	0.046308
0.04369	0.07671	0.875766	0.003834
0.177858	0.121428	0.683419	0.017295
0.177442	0.757384	0.053372	0.011802
0.889144	0.022207	0.042532	0.046116
0.017946	0.128567	0.849282	0.004205

MOTIF	Stomach_E16.5_H3K9ac_103_110_0.503_1.871378e-30
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.82678	0.037879	0.070361	0.06498
0.105995	0.033071	0.851428	0.009506
0.100594	0.842719	0.048564	0.008124
0.75106	0.020275	0.062616	0.166049
0.037306	0.092994	0.861936	0.007763
0.149293	0.133134	0.698785	0.018789
0.157174	0.769501	0.068849	0.004476
0.873298	0.039506	0.030397	0.056799
0.014293	0.147422	0.826678	0.011606

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K9ac_36_173_0.587_7.430025e-202
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.072	0.115	0.744	0.069
0.093	0.752	0.098	0.057
0.702	0.105	0.079	0.114
0.078	0.07	0.791	0.061
0.075	0.103	0.763	0.059
0.084	0.763	0.115	0.038
0.736	0.074	0.092	0.098
0.054	0.079	0.819	0.048
0.068	0.778	0.091	0.063
0.09	0.694	0.103	0.113
0.083	0.083	0.723	0.111
0.075	0.733	0.118	0.074

MOTIF	Kidney_P0_H3K9ac_82_111_0.508_3.079658e-36
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.135884	0.802305	0.052776	0.009035
0.721317	0.028857	0.185263	0.064563
0.023092	0.017639	0.945817	0.013452
0.043688	0.028681	0.916785	0.010847
0.304181	0.54063	0.153093	0.002096
0.907109	0.044655	0.018771	0.029465
0.00771	0.042659	0.940448	0.009184
0.134037	0.725949	0.055992	0.084021
0.017578	0.842582	0.046133	0.093708
0.636963	0.041309	0.201013	0.120716

MOTIF	Forebrain_E16.5_H3K9ac_81_113_0.518_1.441565e-53
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.067421	0.893006	0.037879	0.001694
0.886458	0.004604	0.033782	0.075156
0.018203	0.042643	0.932114	0.007041
0.176807	0.022304	0.793954	0.006935
0.157152	0.64846	0.193426	0.000961
0.830123	0.069545	0.044468	0.055863
0.009139	0.051475	0.84235	0.097036
0.156711	0.768161	0.063625	0.011502
0.069518	0.637599	0.10449	0.188394
0.187538	0.212629	0.356856	0.242978

MOTIF	Hindbrain_E14.5_H3K9ac_80_101_0.523_2.238898e-49
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.086053	0.847739	0.056814	0.009393
0.762511	0.004093	0.062593	0.170803
0.025937	0.063843	0.903661	0.006559
0.183652	0.060564	0.746263	0.00952
0.168665	0.784273	0.046606	0.000456
0.904651	0.019283	0.055054	0.021011
0.008449	0.023103	0.890481	0.077967
0.15672	0.745056	0.045232	0.052992
0.01801	0.708003	0.055983	0.218004
0.123289	0.091069	0.597952	0.18769

MOTIF	Midbrain_E16.5_H3K9ac_106_120_0.514_6.341012e-64
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.115584	0.837078	0.037859	0.009478
0.823276	0.015855	0.058461	0.102408
0.026268	0.051063	0.920429	0.002241
0.210895	0.050298	0.735825	0.002982
0.264501	0.700829	0.032655	0.002015
0.912889	0.012009	0.024682	0.050419
0.016063	0.00534	0.910732	0.067866
0.12165	0.849558	0.017221	0.01157
0.093539	0.686951	0.017258	0.202252

MOTIF	Stomach_P0_H3K9ac_77_121_0.529_4.241507e-39
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.959564	0.0	0.0	0.040436
0.056038	0.030631	0.913331	0.0
0.12015	0.048974	0.694872	0.136004
0.363831	0.624365	0.011804	0.0
0.833665	0.0	0.030925	0.13541
0.035224	0.043374	0.906807	0.014595
0.0293	0.914691	0.025084	0.030925
0.015844	0.831629	0.030925	0.121602
0.0	0.28181	0.608285	0.109904