MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Midbrain_E11.5_H3K27ac_22_86_0.557_7.678779e-49
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.942239	0.0	0.0	0.057761
0.026522	0.019704	0.781406	0.172368
0.305571	0.690882	0.003547	0.0
0.128817	0.072045	0.070493	0.728645
0.167862	0.0	0.491578	0.34056
0.018949	0.969077	0.0	0.011974
0.010232	0.91738	0.046923	0.025466
0.060754	0.0	0.912374	0.026872
0.009417	0.016208	0.958018	0.016357

MOTIF	Heart_E15.5_H3K4me2_5_152_0.639_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.142	0.155	0.166	0.537
0.123	0.603	0.132	0.142
0.123	0.605	0.133	0.139
0.121	0.163	0.619	0.097
0.131	0.139	0.605	0.125
0.141	0.598	0.147	0.114
0.546	0.153	0.156	0.145
0.129	0.137	0.63	0.104
0.131	0.643	0.107	0.119
0.109	0.137	0.617	0.137

MOTIF	Intestine_E14.5_H3K4me2_2_151_0.668_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.142	0.147	0.154	0.557
0.118	0.607	0.133	0.142
0.107	0.637	0.14	0.116
0.11	0.161	0.626	0.103
0.132	0.143	0.601	0.124
0.163	0.559	0.151	0.127
0.536	0.153	0.157	0.154
0.136	0.136	0.614	0.114
0.126	0.63	0.123	0.121
0.112	0.13	0.631	0.127

MOTIF	Intestine_P0_H3K4me2_14_160_0.623_1.538303e-313
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.232	0.34	0.23	0.199
0.154	0.127	0.58	0.139
0.142	0.539	0.159	0.16
0.155	0.191	0.163	0.491
0.145	0.166	0.519	0.17
0.142	0.541	0.174	0.143
0.109	0.598	0.171	0.122
0.129	0.168	0.558	0.145
0.15	0.143	0.558	0.149
0.274	0.27	0.206	0.25

MOTIF	Limb_E13.5_H3K4me2_12_164_0.637_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.054	0.297	0.361	0.288
0.067	0.657	0.091	0.185
0.263	0.286	0.034	0.417
0.097	0.352	0.494	0.057
0.089	0.448	0.32	0.144
0.026	0.859	0.114	0.001
0.134	0.261	0.478	0.128
0.135	0.339	0.492	0.034

MOTIF	Heart_E11.5_H3K4me2_32_166_0.592_5.452741e-315
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.059	0.23	0.576	0.135
0.011	0.938	0.05	0.001
0.346	0.062	0.071	0.521
0.149	0.183	0.667	0.001
0.008	0.864	0.113	0.015
0.045	0.74	0.143	0.072
0.128	0.077	0.769	0.026
0.105	0.084	0.81	0.001
0.449	0.319	0.223	0.008
0.562	0.136	0.081	0.221

MOTIF	Midbrain_E15.5_H3K4me2_42_172_0.599_1.800977e-273
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.006	0.753	0.15	0.091
0.08	0.057	0.145	0.718
0.018	0.19	0.716	0.076
0.006	0.862	0.131	0.001
0.083	0.746	0.115	0.056
0.076	0.063	0.78	0.081
0.001	0.061	0.919	0.019
0.063	0.794	0.132	0.011
0.722	0.114	0.025	0.139
0.001	0.063	0.906	0.03
0.062	0.788	0.129	0.021
0.205	0.209	0.267	0.319

MOTIF	Heart_E14.5_H3K4me2_15_153_0.603_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.092	0.146	0.569	0.193
0.052	0.859	0.001	0.088
0.15	0.001	0.001	0.848
0.038	0.145	0.637	0.18
0.001	0.997	0.001	0.001
0.001	0.63	0.368	0.001
0.199	0.001	0.799	0.001
0.421	0.067	0.33	0.181

MOTIF	Midbrain_E14.5_H3K4me2_11_155_0.659_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.08	0.194	0.466	0.26
0.072	0.87	0.001	0.057
0.142	0.001	0.001	0.856
0.077	0.319	0.454	0.151
0.001	0.94	0.001	0.058
0.001	0.931	0.067	0.001
0.001	0.001	0.997	0.001
0.103	0.435	0.382	0.08

MOTIF	Forebrain_E12.5_H3K4me2_37_164_0.609_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.001	0.087	0.806	0.106
0.018	0.926	0.001	0.055
0.063	0.001	0.001	0.935
0.034	0.118	0.72	0.128
0.001	0.932	0.04	0.027
0.001	0.997	0.001	0.001
0.098	0.001	0.9	0.001
0.048	0.044	0.889	0.019

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K4me2_16_164_0.626_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.049	0.05	0.836	0.065
0.02	0.948	0.001	0.031
0.071	0.062	0.001	0.866
0.001	0.092	0.816	0.091
0.001	0.933	0.065	0.001
0.001	0.997	0.001	0.001
0.068	0.038	0.893	0.001
0.058	0.142	0.781	0.019

MOTIF	Midbrain_E12.5_H3K4me2_7_152_0.658_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.132	0.718	0.055	0.095
0.012	0.014	0.849	0.125
0.001	0.965	0.033	0.001
0.4	0.01	0.001	0.589
0.038	0.065	0.88	0.017
0.079	0.819	0.083	0.019
0.069	0.644	0.23	0.057
0.066	0.005	0.928	0.001
0.131	0.314	0.54	0.015
0.505	0.216	0.206	0.073

MOTIF	Neural-Tube_E12.5_H3K4me2_19_155_0.628_5.955467e-320
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.179	0.191	0.08	0.55
0.001	0.748	0.205	0.046
0.001	0.935	0.001	0.063
0.033	0.146	0.776	0.045
0.001	0.047	0.951	0.001
0.135	0.791	0.073	0.001
0.9	0.017	0.001	0.082
0.001	0.005	0.993	0.001
0.075	0.835	0.089	0.001
0.054	0.257	0.519	0.17

MOTIF	Limb_E15.5_H3K4me2_13_160_0.650_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.077	0.75	0.088	0.085
0.074	0.067	0.774	0.085
0.027	0.875	0.068	0.03
0.092	0.07	0.046	0.792
0.055	0.095	0.779	0.071
0.075	0.788	0.083	0.054
0.067	0.82	0.073	0.04
0.075	0.057	0.833	0.035
0.039	0.058	0.847	0.056
0.743	0.105	0.08	0.072

MOTIF	Stomach_E15.5_H3K4me2_11_156_0.652_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.166	0.213	0.155	0.466
0.091	0.655	0.145	0.109
0.086	0.729	0.108	0.077
0.097	0.159	0.692	0.052
0.009	0.01	0.893	0.088
0.168	0.643	0.17	0.019
0.748	0.015	0.052	0.185
0.129	0.14	0.726	0.005
0.102	0.798	0.064	0.036
0.061	0.137	0.675	0.127

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K9ac_8_165_0.606_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.001	0.153	0.689	0.157
0.101	0.762	0.001	0.136
0.063	0.085	0.175	0.677
0.007	0.146	0.644	0.203
0.001	0.833	0.103	0.063
0.001	0.773	0.225	0.001
0.112	0.001	0.85	0.037
0.079	0.086	0.665	0.17

MOTIF	Midbrain_E13.5_H3K9ac_17_154_0.608_2.003021e-318
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.031	0.075	0.854	0.04
0.025	0.958	0.001	0.016
0.04	0.001	0.109	0.85
0.036	0.093	0.87	0.001
0.019	0.957	0.001	0.023
0.001	0.934	0.064	0.001
0.082	0.001	0.916	0.001
0.038	0.142	0.8	0.02

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K9ac_25_162_0.601_7.681697e-314
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.045	0.812	0.092	0.051
0.021	0.857	0.057	0.065
0.078	0.799	0.069	0.054
0.063	0.056	0.829	0.052
0.019	0.058	0.894	0.029
0.028	0.875	0.06	0.037
0.123	0.082	0.052	0.743
0.025	0.072	0.825	0.078
0.017	0.883	0.067	0.033
0.061	0.807	0.068	0.064
0.077	0.06	0.799	0.064
0.044	0.045	0.876	0.035

MOTIF	Limb_E13.5_H3K9ac_23_168_0.598_5.849217e-272
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.103	0.77	0.063	0.064
0.061	0.047	0.837	0.055
0.071	0.049	0.833	0.047
0.045	0.851	0.047	0.057
0.11	0.05	0.056	0.784
0.039	0.114	0.775	0.072
0.062	0.835	0.042	0.061
0.075	0.798	0.063	0.064
0.093	0.049	0.73	0.128
0.071	0.085	0.789	0.055

MOTIF	Neural-Tube_E13.5_H3K9ac_24_158_0.593_2.59919e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.243	0.621	0.096	0.04
0.148	0.153	0.621	0.078
0.001	0.029	0.969	0.001
0.33	0.52	0.001	0.149
0.396	0.001	0.001	0.602
0.001	0.117	0.574	0.308
0.001	0.997	0.001	0.001
0.001	0.89	0.001	0.108
0.153	0.001	0.655	0.191
0.182	0.307	0.503	0.008