MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Stomach_E15.5_H3K27ac_15_160_0.542_1.690517e-67 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Liver_E14.5_H3K4me2_21_158_0.607_1.630745e-285 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.892 0.003 0.104 0.001 0.984 0.014 0.001 0.001 0.382 0.231 0.187 0.201 0.148 0.442 0.164 0.246 0.249 0.138 0.322 0.291 0.402 0.29 0.25 0.058 0.488 0.168 0.068 0.277 0.23 0.349 0.389 0.032 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 MOTIF Heart_E14.5_H3K4me2_18_161_0.596_8.179811e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.721 0.09 0.107 0.082 0.736 0.101 0.089 0.074 0.7 0.102 0.114 0.084 0.105 0.654 0.138 0.103 0.13 0.077 0.69 0.103 0.696 0.113 0.114 0.077 0.734 0.069 0.098 0.099 0.139 0.116 0.644 0.101 0.085 0.724 0.081 0.11 0.096 0.091 0.7 0.113 MOTIF Cranio-Facial_E13.5_H3K4me2_9_153_0.634_7.741218e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.603 0.122 0.137 0.138 0.628 0.125 0.126 0.121 0.563 0.147 0.154 0.136 0.138 0.6 0.13 0.132 0.152 0.12 0.608 0.12 0.579 0.154 0.146 0.121 0.592 0.145 0.131 0.132 0.162 0.146 0.554 0.138 0.11 0.658 0.113 0.119 0.122 0.126 0.615 0.137 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K4me2_5_154_0.671_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.613 0.119 0.144 0.124 0.691 0.12 0.112 0.077 0.494 0.167 0.198 0.142 0.178 0.508 0.161 0.153 0.159 0.105 0.618 0.118 0.491 0.207 0.191 0.11 0.577 0.165 0.135 0.123 0.196 0.163 0.481 0.16 0.06 0.818 0.052 0.07 0.066 0.107 0.708 0.119 MOTIF Kidney_E14.5_H3K4me2_9_157_0.672_1.915578e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.695 0.125 0.1 0.08 0.918 0.024 0.047 0.011 0.534 0.145 0.21 0.111 0.142 0.566 0.168 0.124 0.154 0.028 0.736 0.082 0.476 0.278 0.205 0.041 0.736 0.122 0.089 0.053 0.238 0.163 0.504 0.095 0.006 0.979 0.002 0.013 0.021 0.016 0.857 0.106 MOTIF Lung_P0_H3K4me2_4_153_0.657_1.356061e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.08 0.861 0.044 0.015 0.06 0.027 0.856 0.057 0.093 0.167 0.185 0.555 0.001 0.027 0.052 0.92 0.049 0.242 0.194 0.515 0.027 0.872 0.055 0.046 0.126 0.228 0.514 0.132 0.091 0.108 0.534 0.267 0.028 0.185 0.09 0.697 0.063 0.091 0.06 0.786 MOTIF Forebrain_E12.5_H3K4me2_65_167_0.573_6.362854e-157 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 MOTIF Forebrain_E13.5_H3K4me2_50_162_0.569_6.941839e-150 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.097 0.071 0.764 0.068 0.082 0.773 0.053 0.092 0.039 0.105 0.784 0.072 0.073 0.763 0.062 0.102 0.092 0.034 0.04 0.834 0.037 0.069 0.077 0.817 0.062 0.051 0.058 0.829 0.047 0.103 0.798 0.052 0.074 0.042 0.034 0.85 0.061 0.049 0.101 0.789 MOTIF Midbrain_E13.5_H3K4me2_67_160_0.561_5.325669e-129 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 MOTIF Cranio-Facial_E12.5_H3K4me2_30_158_0.611_2.654561e-296 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 MOTIF Forebrain_E11.5_H3K4me2_40_162_0.622_2.21539e-320 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 MOTIF Liver_E11.5_H3K4me2_32_165_0.582_5.978948e-223 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 MOTIF Neural-Tube_E15.5_H3K4me2_35_161_0.606_4.595554e-316 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 MOTIF Neural-Tube_E13.5_H3K4me3_68_169_0.583_6.599665e-123 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.73 0.096 0.097 0.077 0.116 0.1 0.697 0.087 0.109 0.67 0.114 0.107 0.112 0.116 0.695 0.077 0.094 0.104 0.098 0.704 0.025 0.085 0.072 0.818 0.016 0.11 0.087 0.787 0.066 0.043 0.101 0.79 0.069 0.117 0.693 0.121 0.006 0.095 0.042 0.857 0.055 0.08 0.084 0.781 0.059 0.083 0.082 0.776 MOTIF Neural-Tube_E15.5_H3K4me3_63_170_0.578_1.898384e-100 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.867 0.049 0.044 0.04 0.871 0.032 0.062 0.035 0.891 0.041 0.035 0.033 0.819 0.044 0.084 0.053 0.081 0.798 0.096 0.025 0.861 0.072 0.037 0.03 0.852 0.073 0.06 0.015 0.911 0.025 0.044 0.02 0.094 0.099 0.776 0.031 0.089 0.818 0.049 0.044 0.114 0.083 0.736 0.067 0.054 0.802 0.076 0.068 MOTIF Forebrain_E14.5_H3K9ac_49_165_0.567_1.46086e-92 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.349 0.216 0.246 0.19 0.649 0.125 0.12 0.106 0.634 0.108 0.153 0.105 0.152 0.594 0.151 0.103 0.677 0.121 0.108 0.094 0.646 0.138 0.139 0.077 0.684 0.091 0.128 0.097 0.124 0.118 0.663 0.095 0.147 0.593 0.138 0.122 0.168 0.12 0.551 0.161 0.115 0.126 0.648 0.111 0.238 0.312 0.233 0.218 MOTIF Intestine_E16.5_H3K9ac_39_165_0.558_4.070244e-84 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K9ac_55_170_0.562_4.73962e-84 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 MOTIF Midbrain_E14.5_H3K9ac_36_154_0.585_1.687478e-145 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.125 0.649 0.104 0.122 0.095 0.128 0.678 0.099 0.089 0.69 0.113 0.108 0.071 0.116 0.703 0.11 0.067 0.756 0.08 0.097 0.061 0.076 0.004 0.859 0.001 0.111 0.1 0.788 0.044 0.062 0.071 0.823 0.068 0.108 0.724 0.1 0.074 0.102 0.075 0.749 0.043 0.092 0.093 0.772 0.033 0.087 0.08 0.8 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K9ac_51_164_0.567_1.867091e-98 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.756 0.079 0.092 0.073 0.807 0.062 0.073 0.058 0.785 0.067 0.073 0.075 0.783 0.065 0.084 0.068 0.101 0.744 0.081 0.074 0.82 0.074 0.046 0.06 0.785 0.083 0.094 0.038 0.784 0.082 0.068 0.066 0.1 0.12 0.129 0.651 0.09 0.711 0.099 0.1 0.146 0.111 0.612 0.131 0.071 0.763 0.084 0.082