MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K4me1_15_153_0.540_1.117832e-128
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.342	0.156	0.21	0.291
0.081	0.076	0.054	0.789
0.138	0.115	0.068	0.679
0.795	0.085	0.016	0.104
0.769	0.073	0.065	0.093
0.14	0.073	0.078	0.709
0.08	0.745	0.114	0.061
0.815	0.079	0.001	0.105
0.166	0.503	0.167	0.164
0.199	0.156	0.454	0.191
0.053	0.719	0.115	0.113
0.298	0.325	0.035	0.342

MOTIF	Hindbrain_E15.5_H3K4me1_15_152_0.543_1.521993e-163
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.334	0.172	0.246	0.248
0.132	0.12	0.63	0.118
0.162	0.545	0.144	0.149
0.147	0.146	0.557	0.15
0.12	0.074	0.122	0.684
0.13	0.124	0.622	0.124
0.637	0.124	0.105	0.134
0.124	0.101	0.105	0.67
0.123	0.093	0.114	0.67
0.655	0.112	0.109	0.124
0.674	0.104	0.11	0.112
0.258	0.213	0.207	0.322

MOTIF	Cranio-Facial_E14.5_H3K4me1_18_167_0.536_1.259325e-71
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.7	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1

MOTIF	Cranio-Facial_E15.5_H3K4me1_14_160_0.539_2.98699e-99
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.7	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K4me1_11_161_0.551_5.414808e-204
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.1	0.084	0.096	0.72
0.125	0.091	0.096	0.688
0.749	0.073	0.059	0.119
0.732	0.071	0.059	0.138
0.11	0.078	0.09	0.722
0.127	0.638	0.117	0.118
0.694	0.118	0.088	0.1
0.091	0.689	0.112	0.108
0.137	0.095	0.666	0.102
0.091	0.703	0.112	0.094

MOTIF	Stomach_E15.5_H3K4me1_3_157_0.547_1.193661e-92
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.077	0.134	0.732	0.057
0.151	0.54	0.129	0.18
0.066	0.167	0.526	0.241
0.102	0.107	0.187	0.604
0.243	0.105	0.519	0.133
0.439	0.214	0.116	0.23
0.116	0.051	0.057	0.776
0.173	0.01	0.023	0.794
0.752	0.056	0.046	0.146
0.688	0.096	0.134	0.082

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K9ac_46_161_0.571_2.534528e-113
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.211	0.656	0.019	0.114
0.102	0.091	0.7	0.107
0.307	0.043	0.212	0.438
0.152	0.073	0.631	0.144
0.248	0.47	0.093	0.189
0.308	0.087	0.011	0.594
0.285	0.027	0.238	0.45
0.723	0.012	0.01	0.255
0.558	0.176	0.124	0.142
0.324	0.125	0.011	0.54

MOTIF	Hindbrain_E15.5_H3K9ac_66_174_0.565_6.240614e-80
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.683	0.116	0.098	0.103
0.673	0.102	0.1	0.125
0.12	0.101	0.099	0.68
0.112	0.108	0.105	0.675
0.694	0.11	0.092	0.104
0.717	0.104	0.094	0.085
0.124	0.111	0.127	0.638
0.114	0.677	0.107	0.102
0.71	0.119	0.051	0.12
0.135	0.607	0.134	0.124
0.13	0.138	0.586	0.146
0.122	0.661	0.109	0.108

MOTIF	Neural-Tube_E15.5_H3K9ac_61_162_0.577_9.069619e-130
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.106	0.111	0.679	0.104
0.138	0.598	0.133	0.131
0.157	0.082	0.622	0.139
0.115	0.065	0.7	0.12
0.119	0.115	0.67	0.096
0.652	0.116	0.112	0.12
0.104	0.088	0.119	0.689
0.101	0.1	0.123	0.676
0.652	0.114	0.116	0.118
0.67	0.107	0.103	0.12
0.109	0.103	0.103	0.685
0.093	0.094	0.108	0.705

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K4me2_29_152_0.605_7.39042e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.174	0.202	0.361	0.263
0.105	0.321	0.321	0.253
0.096	0.361	0.317	0.227
0.153	0.172	0.089	0.586
0.791	0.126	0.064	0.019
0.997	0.001	0.001	0.001
0.001	0.001	0.001	0.997
0.002	0.003	0.014	0.981
0.731	0.002	0.118	0.149
0.421	0.206	0.345	0.027

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K4me2_39_161_0.601_1.93222e-287
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.105	0.708	0.075	0.112
0.079	0.061	0.736	0.124
0.138	0.636	0.13	0.096
0.148	0.644	0.086	0.122
0.104	0.097	0.105	0.694
0.685	0.107	0.107	0.101
0.741	0.072	0.092	0.095
0.102	0.074	0.081	0.743
0.1	0.083	0.094	0.723
0.692	0.084	0.11	0.114

MOTIF	Cranio-Facial_E13.5_H3K4me3_24_156_0.675_1.627537e-316
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.197	0.293	0.26	0.25
0.086	0.703	0.102	0.109
0.053	0.091	0.739	0.117
0.522	0.153	0.165	0.16
0.548	0.1	0.169	0.183
0.597	0.069	0.091	0.243
0.241	0.128	0.058	0.573
0.197	0.177	0.168	0.457

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K4me3_37_157_0.653_7.901467e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.215	0.192	0.434	0.159
0.103	0.66	0.085	0.152
0.067	0.012	0.762	0.159
0.306	0.164	0.22	0.311
0.714	0.049	0.064	0.173
0.639	0.041	0.103	0.217
0.223	0.05	0.04	0.687
0.145	0.046	0.101	0.708
0.532	0.102	0.065	0.301
0.642	0.151	0.115	0.092

MOTIF	Hindbrain_P0_H3K4me3_47_160_0.625_4.46657e-306
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.115	0.095	0.683	0.107
0.099	0.703	0.08	0.118
0.113	0.078	0.694	0.115
0.135	0.102	0.114	0.649
0.678	0.106	0.097	0.119
0.71	0.102	0.098	0.09
0.106	0.084	0.064	0.746
0.089	0.097	0.106	0.708
0.71	0.093	0.098	0.099
0.718	0.113	0.086	0.083

MOTIF	Limb_E12.5_H3K4me3_44_157_0.623_1.090419e-248
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.154	0.142	0.515	0.189
0.12	0.607	0.134	0.139
0.116	0.147	0.582	0.155
0.223	0.118	0.114	0.545
0.578	0.15	0.143	0.129
0.593	0.131	0.126	0.15
0.126	0.127	0.123	0.624
0.128	0.152	0.12	0.6
0.563	0.118	0.124	0.195
0.504	0.172	0.173	0.151

MOTIF	Liver_E13.5_H3K4me3_34_157_0.627_1.713548e-298
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.362	0.217	0.229	0.191
0.767	0.105	0.125	0.003
0.488	0.106	0.18	0.226
0.241	0.105	0.166	0.488
0.234	0.207	0.001	0.558
0.177	0.411	0.177	0.234
0.156	0.512	0.181	0.151
0.001	0.001	0.888	0.11
0.244	0.187	0.185	0.384
0.318	0.118	0.131	0.432

MOTIF	Stomach_E15.5_H3K4me3_37_172_0.651_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.167	0.155	0.375	0.303
0.271	0.478	0.018	0.233
0.419	0.001	0.369	0.211
0.368	0.225	0.208	0.198
0.291	0.1	0.246	0.363
0.318	0.097	0.032	0.553
0.112	0.302	0.001	0.585
0.111	0.134	0.293	0.462

MOTIF	Limb_E14.5_H3K9ac_9_164_0.637_1.724974e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.294	0.151	0.333	0.222
0.434	0.236	0.076	0.254
0.416	0.148	0.182	0.254
0.592	0.327	0.077	0.004
0.076	0.04	0.326	0.558
0.289	0.147	0.111	0.452
0.218	0.148	0.147	0.488
0.04	0.915	0.04	0.005
0.005	0.077	0.913	0.005
0.111	0.667	0.039	0.183
0.04	0.398	0.325	0.238
0.257	0.294	0.223	0.226

MOTIF	Hindbrain_P0_H3K9ac_39_158_0.603_8.980989e-222
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.107	0.106	0.676	0.111
0.086	0.722	0.082	0.11
0.101	0.089	0.71	0.1
0.122	0.103	0.133	0.642
0.682	0.101	0.108	0.109
0.72	0.086	0.092	0.102
0.099	0.088	0.087	0.726
0.09	0.094	0.093	0.723
0.704	0.085	0.1	0.111
0.693	0.119	0.098	0.09

MOTIF	Midbrain_E15.5_H3K9ac_31_159_0.621_1.145854e-266
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.131	0.139	0.577	0.153
0.124	0.617	0.126	0.133
0.125	0.116	0.612	0.147
0.172	0.137	0.139	0.552
0.613	0.121	0.122	0.144
0.595	0.124	0.132	0.149
0.15	0.127	0.113	0.61
0.14	0.116	0.127	0.617
0.608	0.117	0.117	0.158
0.602	0.131	0.137	0.13

MOTIF	Stomach_P0_H3K9ac_51_166_0.565_4.497213e-113
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.103	0.103	0.089	0.705
0.737	0.078	0.095	0.09
0.682	0.104	0.103	0.111
0.101	0.094	0.103	0.702
0.09	0.126	0.092	0.692
0.682	0.129	0.094	0.095
0.096	0.736	0.093	0.075
0.102	0.092	0.705	0.101
0.105	0.676	0.104	0.115
0.114	0.682	0.106	0.098