MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Lung_P0_H3K27ac_9_161_0.551_2.025781e-89 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.091 0.093 0.085 0.731 0.082 0.1 0.094 0.724 0.104 0.109 0.112 0.675 0.094 0.725 0.099 0.082 0.72 0.101 0.08 0.099 0.676 0.118 0.126 0.08 0.105 0.693 0.117 0.085 0.105 0.111 0.664 0.12 0.11 0.719 0.084 0.087 0.108 0.11 0.674 0.108 MOTIF Neural-Tube_E11.5_H3K27ac_7_166_0.573_9.439263e-83 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.33 0.154 0.311 0.205 0.247 0.199 0.345 0.209 0.008 0.967 0.024 0.001 0.034 0.038 0.883 0.045 0.21 0.092 0.177 0.521 0.176 0.215 0.109 0.499 0.483 0.184 0.28 0.053 0.564 0.135 0.157 0.144 0.465 0.143 0.203 0.189 0.448 0.217 0.173 0.161 0.281 0.208 0.321 0.19 0.343 0.252 0.206 0.198 MOTIF Lung_E14.5_H3K27me3_28_165_0.537_3.971377e-15 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.114 0.59 0.147 0.149 0.153 0.101 0.605 0.141 0.134 0.574 0.212 0.08 0.112 0.12 0.504 0.264 0.118 0.143 0.066 0.673 0.127 0.001 0.149 0.723 0.124 0.078 0.681 0.117 0.779 0.088 0.132 0.001 0.84 0.006 0.04 0.114 0.746 0.022 0.12 0.112 MOTIF Stomach_E14.5_H3K27me3_14_168_0.554_1.965441e-21 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.107 0.068 0.048 0.777 0.048 0.07 0.052 0.83 0.034 0.829 0.097 0.04 0.797 0.097 0.04 0.066 0.769 0.076 0.087 0.068 0.097 0.771 0.079 0.053 0.058 0.089 0.765 0.088 0.062 0.799 0.084 0.055 0.068 0.043 0.833 0.056 0.035 0.092 0.826 0.047 MOTIF Cranio-Facial_E13.5_H3K27me3_30_164_0.512_3.449239e-09 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.302 0.178 0.036 0.485 0.001 0.001 0.052 0.946 0.056 0.067 0.147 0.73 0.001 0.593 0.179 0.227 0.596 0.162 0.001 0.241 0.559 0.275 0.13 0.036 0.242 0.609 0.033 0.116 0.001 0.274 0.518 0.207 MOTIF Forebrain_E12.5_H3K27me3_13_176_0.513_7.198623e-06 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.073 0.735 0.063 0.129 0.001 0.078 0.86 0.061 0.121 0.124 0.063 0.692 0.039 0.001 0.105 0.855 0.12 0.034 0.703 0.143 0.593 0.163 0.085 0.159 0.693 0.001 0.122 0.184 0.867 0.001 0.027 0.105 MOTIF Neural-Tube_E13.5_H3K27me3_9_173_0.518_1.600729e-09 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.068 0.83 0.05 0.052 0.091 0.07 0.034 0.805 0.042 0.055 0.044 0.859 0.068 0.11 0.066 0.756 0.078 0.805 0.046 0.071 0.837 0.065 0.039 0.059 0.806 0.06 0.07 0.064 0.118 0.749 0.064 0.069 0.077 0.091 0.737 0.095 0.073 0.048 0.061 0.818 MOTIF Midbrain_E12.5_H3K27me3_37_157_0.508_0.0001163431 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.085 0.026 0.015 0.874 0.047 0.043 0.003 0.907 0.093 0.068 0.061 0.778 0.211 0.589 0.091 0.109 0.824 0.041 0.036 0.099 0.809 0.064 0.078 0.049 0.206 0.596 0.102 0.096 0.092 0.131 0.625 0.152 MOTIF Cranio-Facial_E13.5_H3K4me2_16_159_0.624_2.124274e-316 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.086 0.109 0.094 0.711 0.105 0.106 0.105 0.684 0.648 0.102 0.114 0.136 0.088 0.72 0.104 0.088 0.699 0.096 0.084 0.121 0.094 0.091 0.717 0.098 0.104 0.7 0.092 0.104 0.105 0.105 0.689 0.101 0.091 0.722 0.091 0.096 0.097 0.091 0.711 0.101 MOTIF Forebrain_E11.5_H3K4me2_6_152_0.695_5.124982e-315 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.077 0.142 0.05 0.731 0.128 0.062 0.07 0.74 0.416 0.172 0.185 0.227 0.141 0.672 0.114 0.073 0.594 0.123 0.132 0.151 0.096 0.154 0.637 0.113 0.044 0.887 0.032 0.037 0.049 0.089 0.823 0.039 0.082 0.766 0.113 0.039 0.068 0.076 0.759 0.097 MOTIF Forebrain_E16.5_H3K4me2_19_156_0.642_8.446537e-314 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.094 0.717 0.093 0.096 0.09 0.099 0.704 0.107 0.101 0.706 0.092 0.101 0.099 0.09 0.706 0.105 0.1 0.687 0.108 0.105 0.095 0.09 0.098 0.717 0.113 0.111 0.686 0.09 0.695 0.101 0.103 0.101 0.69 0.106 0.1 0.104 0.693 0.099 0.104 0.104 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K4me2_51_167_0.588_1.107234e-230 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.087 0.125 0.097 0.691 0.064 0.145 0.116 0.675 0.084 0.135 0.124 0.657 0.071 0.759 0.098 0.072 0.688 0.109 0.065 0.138 0.09 0.118 0.708 0.084 0.143 0.622 0.116 0.119 0.129 0.137 0.596 0.138 0.127 0.62 0.121 0.132 0.111 0.139 0.606 0.144 0.079 0.707 0.111 0.103 0.109 0.122 0.095 0.674 MOTIF Cranio-Facial_E12.5_H3K4me2_5_153_0.667_7.829556e-315 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.234 0.31 0.221 0.235 0.138 0.151 0.555 0.156 0.132 0.604 0.134 0.13 0.14 0.116 0.604 0.14 0.132 0.561 0.148 0.159 0.146 0.183 0.177 0.495 0.136 0.145 0.564 0.155 0.168 0.549 0.144 0.139 0.5 0.154 0.179 0.167 0.261 0.229 0.275 0.235 MOTIF Hindbrain_E13.5_H3K4me2_7_157_0.672_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.057 0.792 0.058 0.093 0.077 0.114 0.72 0.089 0.048 0.829 0.088 0.035 0.071 0.037 0.761 0.131 0.051 0.669 0.13 0.15 0.191 0.001 0.01 0.798 0.016 0.119 0.755 0.11 0.188 0.557 0.14 0.115 0.579 0.133 0.147 0.141 0.554 0.123 0.224 0.099 MOTIF Heart_P0_H3K4me2_19_166_0.623_3.614584e-320 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.09 0.096 0.115 0.699 0.114 0.121 0.116 0.649 0.108 0.083 0.679 0.13 0.034 0.751 0.116 0.099 0.747 0.039 0.124 0.09 0.115 0.108 0.685 0.092 0.123 0.711 0.081 0.085 0.099 0.086 0.708 0.107 0.141 0.696 0.087 0.076 0.109 0.093 0.673 0.125 MOTIF Midbrain_E11.5_H3K4me2_41_169_0.622_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K4me2_6_152_0.666_6.326089e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.126 0.619 0.13 0.125 0.107 0.127 0.644 0.122 0.119 0.642 0.133 0.106 0.136 0.143 0.591 0.13 0.14 0.148 0.565 0.147 0.163 0.142 0.141 0.554 0.142 0.133 0.581 0.144 0.586 0.142 0.143 0.129 0.618 0.127 0.136 0.119 0.601 0.129 0.132 0.138 MOTIF Heart_E13.5_H3K4me2_38_161_0.569_5.773271e-206 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.068 0.046 0.029 0.857 0.061 0.076 0.081 0.782 0.116 0.086 0.067 0.731 0.154 0.681 0.089 0.076 0.774 0.108 0.048 0.07 0.73 0.098 0.13 0.042 0.086 0.736 0.119 0.059 0.116 0.059 0.711 0.114 MOTIF Lung_E14.5_H3K4me2_18_157_0.614_7.914275e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.102 0.094 0.091 0.713 0.082 0.097 0.1 0.721 0.095 0.1 0.118 0.687 0.106 0.693 0.095 0.106 0.721 0.11 0.081 0.088 0.676 0.097 0.133 0.094 0.129 0.67 0.104 0.097 0.106 0.117 0.667 0.11 0.084 0.747 0.082 0.087 0.098 0.093 0.703 0.106 MOTIF Limb_E14.5_H3K4me2_13_152_0.655_2.132238e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.059 0.864 0.001 0.076 0.002 0.01 0.889 0.099 0.225 0.448 0.313 0.014 0.21 0.091 0.381 0.317 0.077 0.285 0.212 0.426 0.201 0.001 0.235 0.563 0.358 0.043 0.516 0.083 0.649 0.137 0.122 0.092 0.963 0.014 0.021 0.002 0.741 0.023 0.106 0.13 MOTIF Midbrain_E13.5_H3K4me2_6_154_0.680_1.94402e-318 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.075 0.878 0.013 0.034 0.001 0.005 0.993 0.001 0.001 0.725 0.21 0.064 0.191 0.039 0.498 0.271 0.092 0.246 0.297 0.366 0.12 0.197 0.149 0.534 0.228 0.137 0.51 0.125 0.574 0.201 0.173 0.052 0.868 0.063 0.068 0.001 0.665 0.001 0.193 0.141