MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Liver_E13.5_H3K27ac_60_168_0.525_8.44668e-37 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.082 0.085 0.087 0.746 0.071 0.081 0.11 0.738 0.094 0.085 0.078 0.743 0.721 0.089 0.074 0.116 0.388 0.468 0.081 0.064 0.739 0.111 0.07 0.08 0.735 0.097 0.091 0.077 0.761 0.057 0.093 0.089 0.125 0.087 0.711 0.077 0.091 0.735 0.087 0.087 0.764 0.076 0.063 0.097 0.136 0.108 0.679 0.077 MOTIF Midbrain_P0_H3K27ac_28_171_0.552_7.347448e-82 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 MOTIF Stomach_E15.5_H3K27ac_14_161_0.542_3.458869e-61 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.063 0.816 0.078 0.043 0.065 0.02 0.029 0.886 0.033 0.069 0.844 0.054 0.12 0.67 0.085 0.125 0.131 0.159 0.67 0.04 0.027 0.059 0.029 0.885 0.025 0.036 0.041 0.898 0.034 0.009 0.044 0.913 0.047 0.073 0.051 0.829 0.829 0.079 0.044 0.048 0.849 0.069 0.052 0.03 0.911 0.024 0.027 0.038 MOTIF Forebrain_E15.5_H3K27me3_11_157_0.536_6.791044e-20 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.178 0.497 0.167 0.159 0.15 0.138 0.585 0.127 0.16 0.561 0.156 0.123 0.167 0.162 0.52 0.151 0.132 0.15 0.143 0.575 0.089 0.126 0.098 0.687 0.063 0.151 0.087 0.699 0.154 0.146 0.13 0.57 0.645 0.146 0.148 0.061 0.657 0.136 0.104 0.103 MOTIF Liver_E11.5_H3K27me3_22_157_0.531_2.174805e-18 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 MOTIF Midbrain_E14.5_H3K27me3_27_170_0.531_3.413962e-13 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Forebrain_P0_H3K4me3_51_159_0.629_3.631375e-288 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 MOTIF Hindbrain_E15.5_H3K4me3_48_160_0.617_1.151533e-246 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 MOTIF Intestine_E16.5_H3K4me3_44_163_0.615_6.373109e-246 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 MOTIF Midbrain_P0_H3K4me3_58_168_0.607_3.569154e-187 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.126 0.079 0.698 0.097 0.133 0.646 0.099 0.122 0.141 0.133 0.608 0.118 0.072 0.076 0.076 0.776 0.049 0.058 0.058 0.835 0.042 0.06 0.06 0.838 0.096 0.078 0.084 0.742 0.772 0.075 0.083 0.07 0.842 0.049 0.063 0.046 0.837 0.054 0.053 0.056 0.747 0.073 0.086 0.094 0.13 0.658 0.1 0.112 MOTIF Cranio-Facial_E14.5_H3K4me3_65_161_0.604_1.135839e-212 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Neural-Tube_E11.5_H3K4me3_52_163_0.617_6.21264e-213 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Liver_E15.5_H3K4me3_45_168_0.619_2.175684e-263 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.091 0.723 0.055 0.131 0.086 0.132 0.735 0.047 0.086 0.026 0.126 0.762 0.248 0.193 0.067 0.492 0.127 0.167 0.21 0.497 0.68 0.148 0.167 0.005 0.479 0.309 0.167 0.045 0.376 0.25 0.167 0.207 0.474 0.172 0.269 0.086 0.027 0.652 0.167 0.154 0.07 0.291 0.491 0.149 0.094 0.178 0.373 0.354 MOTIF Neural-Tube_E12.5_H3K4me3_46_166_0.618_7.971313e-187 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K27me3_27_164_0.522_7.513612e-12 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.015 0.092 0.068 0.825 0.033 0.041 0.043 0.883 0.036 0.058 0.081 0.825 0.752 0.09 0.082 0.076 0.867 0.039 0.064 0.03 0.876 0.001 0.031 0.092 0.899 0.07 0.001 0.03 0.102 0.039 0.79 0.069 0.04 0.082 0.81 0.068 0.076 0.817 0.038 0.069 0.892 0.055 0.033 0.02 0.767 0.078 0.083 0.072 MOTIF Cranio-Facial_E15.5_H3K4me1_4_156_0.554_1.066201e-177 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.062 0.061 0.833 0.044 0.074 0.773 0.074 0.079 0.115 0.107 0.675 0.103 0.057 0.086 0.061 0.796 0.04 0.043 0.058 0.859 0.037 0.05 0.049 0.864 0.086 0.1 0.066 0.748 0.801 0.065 0.063 0.071 0.837 0.06 0.048 0.055 0.811 0.07 0.05 0.069 MOTIF Liver_E13.5_H3K4me1_52_156_0.526_1.499728e-56 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 MOTIF Midbrain_E13.5_H3K4me1_5_147_0.556_3.220529e-232 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.027198 0.023697 0.936075 0.01303 0.0 0.923063 0.076937 0.0 0.21976 0.440431 0.233425 0.106384 0.034426 0.053923 0.018809 0.892841 0.01837 0.034658 0.023405 0.923567 0.003359 0.0 0.031868 0.964773 0.26677 0.01328 0.079279 0.640671 0.950707 0.021695 0.008982 0.018616 0.936726 0.009761 0.004758 0.048755 0.74189 0.02727 0.04176 0.189081 MOTIF Lung_P0_H3K9ac_66_172_0.538_2.429249e-25 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.118 0.117 0.638 0.127 0.123 0.635 0.117 0.125 0.126 0.647 0.077 0.15 0.107 0.114 0.087 0.692 0.086 0.108 0.106 0.7 0.083 0.104 0.099 0.714 0.122 0.122 0.095 0.661 0.623 0.126 0.123 0.128 0.158 0.603 0.127 0.112 0.709 0.105 0.076 0.11 0.693 0.1 0.109 0.098 0.686 0.107 0.11 0.097 MOTIF Heart_E16.5_H3K9ac_55_170_0.543_2.772157e-68 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 MOTIF Midbrain_E12.5_H3K9ac_65_166_0.553_9.787132e-69 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.256 0.192 0.226 0.327 0.129 0.127 0.579 0.165 0.133 0.586 0.142 0.139 0.149 0.57 0.101 0.18 0.117 0.121 0.088 0.674 0.085 0.115 0.103 0.697 0.092 0.11 0.106 0.692 0.137 0.128 0.127 0.608 0.608 0.125 0.128 0.139 0.674 0.112 0.111 0.103 0.671 0.103 0.111 0.115 0.314 0.212 0.233 0.241