MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K27me3_16_170_0.529_4.045039e-12
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.083	0.15	0.128	0.639
0.046	0.178	0.144	0.632
0.091	0.558	0.181	0.17
0.168	0.095	0.615	0.122
0.137	0.134	0.656	0.073
0.61	0.112	0.141	0.137
0.12	0.166	0.15	0.564
0.068	0.175	0.106	0.651
0.13	0.573	0.118	0.179
0.146	0.195	0.501	0.158

MOTIF	Forebrain_E16.5_H3K4me3_18_160_0.676_6.226867e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.126	0.157	0.574	0.143
0.118	0.631	0.126	0.125
0.148	0.102	0.622	0.128
0.59	0.134	0.149	0.127
0.124	0.142	0.124	0.61
0.125	0.137	0.124	0.614
0.561	0.15	0.144	0.145
0.143	0.616	0.13	0.111
0.123	0.129	0.607	0.141
0.149	0.133	0.144	0.574

MOTIF	Hindbrain_E11.5_H3K4me3_2_150_0.801_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.229	0.33	0.218	0.224
0.001	0.001	0.607	0.391
0.283	0.248	0.236	0.234
0.309	0.244	0.198	0.25
0.342	0.026	0.257	0.375
0.153	0.268	0.322	0.256
0.001	0.997	0.001	0.001
0.001	0.001	0.916	0.082
0.198	0.292	0.282	0.228
0.301	0.21	0.217	0.272

MOTIF	Forebrain_E11.5_H3K4me3_13_157_0.722_1.009677e-314
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.552	0.169	0.125	0.154
0.151	0.142	0.585	0.122
0.111	0.642	0.117	0.13
0.135	0.123	0.623	0.119
0.618	0.115	0.151	0.116
0.57	0.159	0.135	0.136
0.137	0.14	0.146	0.577
0.118	0.583	0.133	0.166
0.117	0.612	0.15	0.121
0.112	0.123	0.636	0.129

MOTIF	Liver_E11.5_H3K4me3_25_161_0.665_6.059578e-312
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.575	0.152	0.127	0.146
0.155	0.144	0.571	0.13
0.118	0.628	0.119	0.135
0.144	0.105	0.621	0.13
0.622	0.114	0.144	0.12
0.588	0.139	0.133	0.14
0.144	0.136	0.139	0.581
0.122	0.148	0.117	0.613
0.135	0.606	0.117	0.142
0.133	0.129	0.597	0.141

MOTIF	Lung_E16.5_H3K4me3_24_161_0.660_5.680238e-315
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.077	0.103	0.04	0.78
0.001	0.302	0.272	0.424
0.001	0.738	0.099	0.162
0.286	0.034	0.664	0.016
0.594	0.082	0.323	0.001
0.763	0.087	0.096	0.054
0.157	0.236	0.198	0.409
0.001	0.445	0.001	0.553
0.039	0.777	0.001	0.183
0.05	0.116	0.833	0.001

MOTIF	Heart_E13.5_H3K4me3_33_168_0.645_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.058	0.142	0.143	0.657
0.055	0.279	0.176	0.49
0.25	0.556	0.027	0.167
0.077	0.03	0.821	0.072
0.283	0.523	0.153	0.041
0.553	0.047	0.078	0.322
0.031	0.101	0.357	0.511
0.041	0.296	0.047	0.616
0.058	0.78	0.014	0.148
0.061	0.207	0.501	0.231

MOTIF	Kidney_E14.5_H3K4me3_21_161_0.694_1.68315e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.128	0.131	0.136	0.605
0.125	0.149	0.137	0.589
0.125	0.607	0.117	0.151
0.114	0.121	0.643	0.122
0.139	0.57	0.154	0.137
0.588	0.142	0.14	0.13
0.142	0.136	0.581	0.141
0.133	0.155	0.135	0.577
0.128	0.626	0.111	0.135
0.121	0.125	0.616	0.138

MOTIF	Kidney_P0_H3K4me3_18_159_0.692_1.296219e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.124	0.606	0.137	0.133
0.135	0.121	0.61	0.134
0.59	0.128	0.148	0.134
0.651	0.11	0.125	0.114
0.576	0.131	0.128	0.165
0.145	0.152	0.147	0.556
0.12	0.605	0.133	0.142
0.142	0.124	0.612	0.122
0.581	0.141	0.152	0.126
0.615	0.127	0.129	0.129

MOTIF	Liver_E13.5_H3K4me3_31_161_0.630_3.749517e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.1	0.092	0.091	0.717
0.101	0.112	0.117	0.67
0.102	0.694	0.095	0.109
0.103	0.091	0.701	0.105
0.68	0.091	0.13	0.099
0.103	0.092	0.115	0.69
0.095	0.097	0.073	0.735
0.097	0.114	0.093	0.696
0.097	0.718	0.083	0.102
0.104	0.097	0.699	0.1

MOTIF	Liver_P0_H3K4me3_28_168_0.655_2.328241e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.146	0.114	0.13	0.61
0.122	0.176	0.111	0.591
0.14	0.579	0.118	0.163
0.167	0.133	0.573	0.127
0.627	0.103	0.194	0.076
0.555	0.128	0.151	0.166
0.179	0.175	0.165	0.481
0.084	0.175	0.078	0.663
0.117	0.657	0.056	0.17
0.121	0.094	0.664	0.121

MOTIF	Hindbrain_E14.5_H3K4me3_27_157_0.682_6.747581e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.582	0.023	0.355	0.04
0.516	0.153	0.193	0.138
0.254	0.228	0.093	0.425
0.024	0.549	0.149	0.278
0.075	0.578	0.275	0.072
0.017	0.031	0.951	0.001
0.323	0.198	0.194	0.286
0.505	0.007	0.18	0.308

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K4me3_35_174_0.679_2.768515e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.081	0.093	0.092	0.734
0.094	0.108	0.092	0.706
0.091	0.722	0.071	0.116
0.117	0.107	0.67	0.106
0.12	0.1	0.705	0.075
0.657	0.114	0.112	0.117
0.087	0.098	0.111	0.704
0.072	0.116	0.104	0.708
0.106	0.692	0.108	0.094
0.097	0.099	0.7	0.104

MOTIF	Cranio-Facial_E11.5_H3K4me3_24_165_0.693_5.534231e-312
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.088	0.11	0.089	0.713
0.1	0.111	0.115	0.674
0.087	0.734	0.072	0.107
0.121	0.095	0.682	0.102
0.109	0.097	0.718	0.076
0.669	0.088	0.104	0.139
0.098	0.099	0.111	0.692
0.078	0.119	0.093	0.71
0.091	0.71	0.097	0.102
0.094	0.095	0.697	0.114

MOTIF	Limb_E11.5_H3K4me3_31_164_0.691_6.252491e-313
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.097	0.106	0.082	0.715
0.088	0.119	0.1	0.693
0.107	0.721	0.073	0.099
0.109	0.101	0.698	0.092
0.108	0.099	0.71	0.083
0.668	0.092	0.1	0.14
0.108	0.088	0.102	0.702
0.077	0.125	0.077	0.721
0.099	0.685	0.101	0.115
0.098	0.118	0.686	0.098

MOTIF	Midbrain_E15.5_H3K4me3_18_163_0.689_3.596304e-320
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.135	0.133	0.127	0.605
0.115	0.152	0.144	0.589
0.122	0.64	0.107	0.131
0.126	0.15	0.602	0.122
0.153	0.132	0.587	0.128
0.591	0.139	0.127	0.143
0.145	0.132	0.14	0.583
0.106	0.163	0.138	0.593
0.132	0.596	0.123	0.149
0.125	0.128	0.613	0.134

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K4me3_24_165_0.686_3.881502e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.135	0.141	0.128	0.596
0.117	0.147	0.148	0.588
0.118	0.642	0.11	0.13
0.126	0.146	0.601	0.127
0.123	0.139	0.61	0.128
0.582	0.137	0.138	0.143
0.14	0.137	0.141	0.582
0.121	0.154	0.128	0.597
0.138	0.588	0.125	0.149
0.126	0.123	0.616	0.135

MOTIF	Neural-Tube_E11.5_H3K4me3_17_161_0.715_8.39302e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.134	0.13	0.137	0.599
0.12	0.159	0.14	0.581
0.125	0.625	0.11	0.14
0.126	0.148	0.61	0.116
0.131	0.132	0.604	0.133
0.58	0.133	0.141	0.146
0.142	0.137	0.142	0.579
0.124	0.161	0.129	0.586
0.127	0.608	0.125	0.14
0.122	0.117	0.627	0.134

MOTIF	Cranio-Facial_E15.5_H3K4me3_27_166_0.661_2.355963e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.663	0.098	0.13	0.109
0.118	0.688	0.106	0.088
0.118	0.107	0.67	0.105
0.71	0.115	0.095	0.08
0.688	0.106	0.108	0.098
0.093	0.123	0.102	0.682
0.085	0.748	0.085	0.082
0.075	0.729	0.1	0.096
0.085	0.125	0.7	0.09
0.099	0.086	0.722	0.093

MOTIF	Limb_E13.5_H3K4me3_14_156_0.697_1.477206e-312
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.134	0.148	0.126	0.592
0.128	0.588	0.14	0.144
0.11	0.637	0.139	0.114
0.119	0.142	0.628	0.111
0.145	0.144	0.594	0.117
0.567	0.135	0.146	0.152
0.141	0.138	0.139	0.582
0.119	0.158	0.139	0.584
0.125	0.609	0.124	0.142
0.126	0.129	0.619	0.126

MOTIF	Stomach_E14.5_H3K4me3_21_160_0.706_1.22812e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.256	0.244	0.246	0.254
0.136	0.542	0.161	0.161
0.117	0.602	0.163	0.118
0.112	0.168	0.608	0.112
0.164	0.149	0.548	0.139
0.534	0.158	0.149	0.159
0.158	0.157	0.161	0.524
0.136	0.17	0.155	0.539
0.15	0.545	0.142	0.163
0.221	0.231	0.313	0.235