MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K4me2_37_164_0.599_2.143437e-271
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1

MOTIF	Kidney_E15.5_H3K4me2_35_168_0.589_9.751053e-256
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.103	0.001	0.001	0.895
0.003	0.168	0.128	0.701
0.034	0.831	0.001	0.134
0.083	0.159	0.701	0.057
0.06	0.019	0.798	0.123
0.817	0.058	0.096	0.029
0.795	0.083	0.086	0.036
0.671	0.126	0.079	0.124
0.215	0.179	0.461	0.145
0.15	0.463	0.201	0.186

MOTIF	Lung_E14.5_H3K4me2_39_171_0.580_1.05752e-217
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.146	0.56	0.149	0.145
0.144	0.133	0.161	0.562
0.123	0.128	0.132	0.617
0.124	0.124	0.132	0.62
0.122	0.592	0.131	0.155
0.126	0.601	0.146	0.127
0.134	0.11	0.644	0.112
0.578	0.132	0.156	0.134
0.624	0.132	0.126	0.118
0.601	0.129	0.131	0.139

MOTIF	Midbrain_E14.5_H3K4me2_12_159_0.659_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.18	0.538	0.082	0.2
0.248	0.084	0.43	0.238
0.123	0.26	0.066	0.551
0.038	0.156	0.048	0.758
0.156	0.395	0.166	0.283
0.186	0.538	0.154	0.122
0.178	0.194	0.471	0.156
0.387	0.202	0.176	0.236

MOTIF	Liver_E11.5_H3K4me2_38_172_0.572_1.531009e-153
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.201	0.168	0.477	0.154
0.112	0.144	0.129	0.615
0.128	0.105	0.146	0.621
0.16	0.194	0.171	0.475
0.503	0.142	0.143	0.212
0.101	0.665	0.093	0.141
0.113	0.112	0.686	0.089
0.568	0.143	0.148	0.141
0.576	0.151	0.107	0.166
0.662	0.005	0.184	0.149

MOTIF	Liver_E15.5_H3K4me2_36_158_0.590_1.575122e-230
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.1	0.099	0.091	0.71
0.109	0.103	0.121	0.667
0.103	0.668	0.091	0.138
0.116	0.11	0.674	0.1
0.652	0.116	0.125	0.107
0.752	0.062	0.084	0.102
0.759	0.089	0.072	0.08
0.686	0.101	0.11	0.103
0.093	0.732	0.091	0.084
0.108	0.089	0.701	0.102

MOTIF	Cranio-Facial_E13.5_H3K4me2_54_170_0.567_2.152477e-139
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.289	0.197	0.15	0.364
0.185	0.211	0.202	0.402
0.101	0.108	0.101	0.69
0.143	0.547	0.139	0.171
0.156	0.105	0.576	0.163
0.081	0.238	0.489	0.191
0.757	0.078	0.09	0.075
0.757	0.082	0.108	0.053
0.722	0.079	0.115	0.084
0.121	0.643	0.124	0.112
0.194	0.275	0.216	0.314
0.326	0.158	0.249	0.267

MOTIF	Midbrain_E13.5_H3K4me2_14_166_0.644_1.148627e-315
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.132	0.586	0.146	0.136
0.135	0.144	0.577	0.144
0.135	0.173	0.148	0.544
0.084	0.145	0.107	0.664
0.011	0.174	0.014	0.801
0.134	0.543	0.162	0.161
0.132	0.596	0.152	0.12
0.164	0.029	0.682	0.125
0.502	0.173	0.161	0.164
0.553	0.139	0.147	0.161

MOTIF	Intestine_E16.5_H3K4me2_24_157_0.621_7.163779e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.119	0.142	0.147	0.592
0.123	0.628	0.113	0.136
0.123	0.154	0.603	0.12
0.143	0.143	0.597	0.117
0.608	0.128	0.136	0.128
0.644	0.116	0.13	0.11
0.575	0.119	0.155	0.151
0.143	0.6	0.132	0.125
0.119	0.134	0.595	0.152
0.147	0.152	0.144	0.557

MOTIF	Forebrain_E11.5_H3K4me2_21_161_0.656_1.992795e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.131	0.621	0.127	0.121
0.122	0.128	0.614	0.136
0.132	0.164	0.154	0.55
0.122	0.136	0.113	0.629
0.14	0.137	0.124	0.599
0.127	0.582	0.144	0.147
0.128	0.596	0.153	0.123
0.137	0.106	0.641	0.116
0.577	0.148	0.152	0.123
0.592	0.134	0.142	0.132

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K4me2_19_165_0.642_4.161305e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.124	0.607	0.134	0.135
0.131	0.125	0.6	0.144
0.136	0.152	0.147	0.565
0.118	0.131	0.115	0.636
0.14	0.136	0.131	0.593
0.123	0.581	0.151	0.145
0.12	0.605	0.159	0.116
0.143	0.108	0.635	0.114
0.577	0.147	0.148	0.128
0.599	0.125	0.149	0.127

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K4me2_20_166_0.617_1.850207e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.082	0.7	0.107	0.111
0.117	0.097	0.685	0.101
0.083	0.15	0.123	0.644
0.038	0.123	0.069	0.77
0.085	0.112	0.093	0.71
0.068	0.709	0.103	0.12
0.092	0.719	0.101	0.088
0.1	0.107	0.709	0.084
0.647	0.123	0.126	0.104
0.706	0.09	0.087	0.117

MOTIF	Kidney_P0_H3K4me2_19_157_0.626_5.466286e-313
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.111	0.683	0.095	0.111
0.111	0.104	0.682	0.103
0.092	0.106	0.102	0.7
0.066	0.103	0.071	0.76
0.091	0.089	0.071	0.749
0.09	0.691	0.097	0.122
0.088	0.699	0.105	0.108
0.113	0.09	0.691	0.106
0.669	0.109	0.109	0.113
0.675	0.105	0.109	0.111

MOTIF	Midbrain_E14.5_H3K4me2_35_171_0.617_2.428034e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.103	0.69	0.098	0.109
0.108	0.101	0.681	0.11
0.099	0.105	0.105	0.691
0.074	0.089	0.075	0.762
0.095	0.081	0.097	0.727
0.092	0.692	0.113	0.103
0.102	0.686	0.096	0.116
0.14	0.073	0.68	0.107
0.68	0.107	0.104	0.109
0.708	0.092	0.106	0.094

MOTIF	Midbrain_P0_H3K4me2_7_158_0.673_3.424779e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.111	0.65	0.127	0.112
0.096	0.115	0.641	0.148
0.132	0.209	0.179	0.48
0.081	0.156	0.043	0.72
0.116	0.133	0.113	0.638
0.12	0.525	0.179	0.176
0.122	0.584	0.184	0.11
0.176	0.057	0.674	0.093
0.509	0.182	0.168	0.141
0.578	0.11	0.151	0.161

MOTIF	Neural-Tube_E13.5_H3K4me2_9_166_0.657_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.094	0.619	0.119	0.168
0.174	0.125	0.551	0.15
0.132	0.203	0.166	0.499
0.041	0.175	0.022	0.762
0.122	0.15	0.118	0.61
0.111	0.528	0.195	0.166
0.113	0.611	0.175	0.101
0.179	0.052	0.719	0.05
0.522	0.186	0.174	0.118
0.549	0.136	0.176	0.139

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K4me2_6_164_0.673_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.001	0.781	0.001	0.217
0.248	0.094	0.523	0.135
0.103	0.268	0.208	0.421
0.001	0.234	0.001	0.764
0.144	0.001	0.001	0.854
0.147	0.383	0.227	0.243
0.146	0.62	0.105	0.129
0.165	0.001	0.76	0.074
0.281	0.278	0.245	0.196
0.466	0.166	0.14	0.228

MOTIF	Stomach_E15.5_H3K4me2_18_154_0.644_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.235	0.232	0.084	0.448
0.015	0.203	0.001	0.781
0.342	0.101	0.001	0.556
0.089	0.398	0.245	0.269
0.056	0.619	0.248	0.077
0.209	0.001	0.712	0.078
0.257	0.298	0.181	0.264
0.411	0.117	0.148	0.324

MOTIF	Kidney_E15.5_H3K27me3_37_160_0.512_6.720646e-08
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.099	0.117	0.095	0.689
0.105	0.097	0.103	0.695
0.134	0.577	0.143	0.146
0.153	0.09	0.602	0.155
0.109	0.101	0.683	0.107
0.706	0.096	0.107	0.091
0.694	0.093	0.117	0.096
0.691	0.094	0.105	0.11
0.107	0.123	0.121	0.649
0.654	0.116	0.12	0.11
0.113	0.109	0.104	0.674
0.102	0.101	0.109	0.688

MOTIF	Neural-Tube_E13.5_H3K27me3_13_172_0.516_3.615882e-13
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.096	0.241	0.127	0.536
0.532	0.151	0.169	0.148
0.138	0.156	0.002	0.704
0.06	0.19	0.102	0.648
0.043	0.092	0.161	0.704
0.234	0.496	0.188	0.082
0.196	0.214	0.518	0.072
0.053	0.161	0.565	0.221
0.696	0.171	0.088	0.045
0.611	0.083	0.154	0.152

MOTIF	Hindbrain_E15.5_H3K4me2_57_167_0.577_1.930168e-192
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7