MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Lung_E16.5_H3K4me3_57_172_0.578_1.016964e-131 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Heart_E15.5_H3K4me3_63_172_0.582_6.121489e-164 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Kidney_E16.5_H3K4me3_67_169_0.577_1.548365e-116 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.742 0.097 0.089 0.072 0.78 0.072 0.096 0.052 0.789 0.051 0.09 0.07 0.117 0.047 0.751 0.085 0.108 0.102 0.729 0.061 0.793 0.074 0.086 0.047 0.82 0.064 0.074 0.042 0.738 0.09 0.097 0.075 0.103 0.731 0.088 0.078 0.107 0.694 0.09 0.109 0.097 0.086 0.721 0.096 0.106 0.713 0.1 0.081 MOTIF Neural-Tube_E11.5_H3K4me3_82_169_0.563_2.077265e-45 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.835 0.043 0.087 0.035 0.876 0.085 0.016 0.023 0.902 0.028 0.069 0.001 0.087 0.001 0.911 0.001 0.072 0.104 0.788 0.036 0.907 0.073 0.014 0.006 0.914 0.029 0.056 0.001 0.742 0.089 0.108 0.061 0.088 0.789 0.061 0.062 0.104 0.718 0.049 0.129 0.043 0.04 0.82 0.097 0.097 0.798 0.031 0.074 MOTIF Forebrain_E14.5_H3K4me2_52_167_0.584_9.136414e-172 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.112 0.649 0.113 0.126 0.1 0.108 0.681 0.111 0.096 0.695 0.113 0.096 0.104 0.08 0.661 0.155 0.055 0.097 0.754 0.094 0.053 0.124 0.082 0.741 0.026 0.079 0.058 0.837 0.029 0.096 0.066 0.809 0.032 0.115 0.058 0.795 0.04 0.803 0.079 0.078 0.05 0.107 0.028 0.815 0.051 0.097 0.091 0.761 MOTIF Kidney_E16.5_H3K4me2_60_166_0.570_2.580587e-136 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.869 0.042 0.058 0.031 0.844 0.06 0.074 0.022 0.898 0.015 0.051 0.036 0.085 0.027 0.82 0.068 0.085 0.068 0.823 0.024 0.896 0.04 0.048 0.016 0.926 0.032 0.033 0.009 0.826 0.041 0.082 0.051 0.05 0.83 0.089 0.031 0.114 0.727 0.077 0.082 0.071 0.066 0.777 0.086 0.088 0.767 0.08 0.065 MOTIF Cranio-Facial_E11.5_H3K4me2_59_172_0.583_4.544496e-118 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Limb_E12.5_H3K4me2_53_171_0.572_2.599143e-161 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Cranio-Facial_E14.5_H3K4me2_55_165_0.564_3.655572e-106 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.813 0.049 0.079 0.059 0.833 0.081 0.067 0.019 0.867 0.003 0.06 0.07 0.141 0.065 0.756 0.038 0.13 0.67 0.177 0.023 0.913 0.041 0.016 0.03 0.873 0.052 0.07 0.005 0.765 0.08 0.11 0.045 0.122 0.644 0.139 0.095 0.165 0.54 0.114 0.181 0.101 0.108 0.661 0.13 0.118 0.667 0.135 0.08 MOTIF Limb_E14.5_H3K4me2_47_165_0.576_2.115133e-161 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Liver_P0_H3K4me2_41_164_0.558_2.027633e-121 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Lung_E15.5_H3K4me2_56_163_0.573_1.149786e-176 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Heart_P0_H3K9ac_52_163_0.559_7.640343e-66 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.05 0.078 0.778 0.094 0.05 0.832 0.067 0.051 0.105 0.061 0.727 0.107 0.063 0.063 0.799 0.075 0.031 0.119 0.062 0.788 0.015 0.07 0.036 0.879 0.023 0.048 0.053 0.876 0.016 0.88 0.058 0.046 0.041 0.867 0.027 0.065 0.039 0.043 0.04 0.878 0.029 0.065 0.084 0.822 0.034 0.052 0.038 0.876 MOTIF Intestine_E15.5_H3K9ac_52_171_0.575_1.96204e-72 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.739 0.093 0.097 0.071 0.767 0.081 0.09 0.062 0.776 0.053 0.1 0.071 0.097 0.055 0.778 0.07 0.102 0.099 0.737 0.062 0.77 0.086 0.087 0.057 0.807 0.075 0.069 0.049 0.715 0.089 0.121 0.075 0.061 0.762 0.106 0.071 0.112 0.693 0.091 0.104 0.101 0.091 0.724 0.084 0.102 0.733 0.086 0.079 MOTIF Forebrain_E11.5_H3K9ac_50_172_0.577_1.925556e-117 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Intestine_E16.5_H3K9ac_34_168_0.565_8.604602e-107 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Limb_E12.5_H3K9ac_46_166_0.566_1.029225e-89 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Hindbrain_P0_H3K9ac_54_163_0.577_5.363144e-120 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Liver_P0_H3K9ac_51_167_0.553_1.187485e-67 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 MOTIF Stomach_E16.5_H3K9ac_42_170_0.570_1.530125e-135 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Stomach_P0_H3K9ac_45_164_0.575_2.729627e-94 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1