MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Midbrain_E16.5_H3K36me3_65_143_0.531_3.558994e-148
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.058265	0.008016	0.912731	0.020988
0.052754	0.030616	0.892031	0.024598
0.007452	0.983757	0.0	0.008791
0.349367	0.580531	0.042061	0.028041
0.0307	0.020075	0.0016	0.947625
0.0	1.0	0.0	0.0
0.835536	0.137766	0.026697	0.0
0.34062	0.01342	0.645961	0.0
0.863842	0.014839	0.0583	0.063019

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K9me3_80_89_0.514_1.09495e-10
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.051811	0.813375	0.041915	0.092899
0.015408	0.031558	0.070238	0.882796
0.047698	0.045556	0.871486	0.03526
0.012142	0.016228	0.88435	0.08728
0.052726	0.806662	0.077811	0.0628
0.038697	0.835565	0.03455	0.091187
0.132598	0.078741	0.020377	0.768284
0.017069	0.9	0.032313	0.050619
0.622381	0.315563	0.019828	0.042228
0.442449	0.130464	0.192681	0.234406

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K9me3_96_47_0.512_2.257736e-15
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.015949	0.978996	0.005055	0.0
0.0334	0.001056	0.035059	0.930484
0.034233	0.008065	0.867763	0.089938
0.009271	0.002057	0.956128	0.032544
0.11292	0.560638	0.06394	0.262502
0.026303	0.785734	0.122603	0.065361
0.032726	0.054888	0.014024	0.898363
0.037694	0.904719	0.005756	0.051831
0.07855	0.837233	0.01084	0.073377
0.646715	0.00554	0.347745	0.0

MOTIF	Cranio-Facial_E13.5_H3K9me3_117_79_0.503_1.27653e-13
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.030315	0.883202	0.020508	0.065975
0.027223	0.007979	0.055733	0.909066
0.172243	0.015118	0.786812	0.025826
0.015421	0.038954	0.911248	0.034377
0.088666	0.647842	0.069128	0.194364
0.039163	0.905902	0.022138	0.032797
0.11652	0.0	0.010574	0.872907
0.014177	0.909642	0.021184	0.054997
0.164827	0.714665	0.010493	0.110015
0.415876	0.18098	0.392204	0.01094

MOTIF	Heart_E16.5_H3K9me3_58_22_0.529_9.529585e-50
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.020282	0.923859	0.023223	0.032637
0.008487	0.002345	0.008452	0.980716
0.016409	0.005892	0.92293	0.054769
0.035819	0.032768	0.821634	0.109778
0.048122	0.768331	0.039079	0.144468
0.014219	0.686924	0.026915	0.271943
0.05334	0.021489	0.037368	0.887803
0.064781	0.862313	0.049409	0.023497
0.191013	0.627074	0.012752	0.169161
0.265894	0.158661	0.547453	0.027993
0.14143	0.186381	0.104807	0.567383

MOTIF	Limb_E12.5_H3K9me3_120_59_0.510_5.644281e-27
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.024172	0.949277	0.006293	0.020258
0.017131	0.007916	0.056928	0.918024
0.04116	0.003093	0.860212	0.095535
0.02993	0.031834	0.873288	0.064949
0.044282	0.684043	0.118671	0.153004
0.091883	0.752836	0.045524	0.109758
0.074096	0.033394	0.013002	0.879508
0.015453	0.867358	0.0921	0.02509
0.266075	0.628134	0.01788	0.087911
0.26472	0.098878	0.612918	0.023485
0.013446	0.220507	0.101927	0.664119

MOTIF	Cranio-Facial_E14.5_H3K9me3_61_21_0.519_1.9311e-28
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.020472	0.903031	0.029156	0.047341
0.015931	0.004306	0.016517	0.963246
0.085728	0.003283	0.870697	0.040292
0.012063	0.033819	0.893803	0.060315
0.037359	0.803239	0.028921	0.130481
0.031417	0.807635	0.014644	0.146304
0.027307	0.008408	0.022098	0.942187
0.032294	0.848198	0.070798	0.04871
0.238876	0.659819	0.011251	0.090054
0.520057	0.018898	0.282598	0.178447

MOTIF	Forebrain_E16.5_H3K9me3_47_57_0.524_1.70322e-12
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.096983	0.819253	0.019628	0.064135
0.035905	0.007602	0.045964	0.910528
0.09633	0.007395	0.872978	0.023297
0.020201	0.011378	0.905949	0.062472
0.015072	0.751251	0.067725	0.165951
0.04934	0.727238	0.0205	0.202922
0.050076	0.025132	0.049062	0.87573
0.046209	0.803586	0.015477	0.134728
0.105299	0.765349	0.051461	0.077891
0.312403	0.093808	0.441776	0.152014
0.257727	0.119069	0.030844	0.59236
0.027305	0.027344	0.746025	0.199326

MOTIF	Heart_E11.5_H3K9me3_45_31_0.524_8.008206e-24
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.066891	0.898016	0.01892	0.016173
0.026244	0.016214	0.036039	0.921503
0.055206	0.007218	0.898598	0.038978
0.026694	0.012878	0.906274	0.054154
0.076585	0.808494	0.044714	0.070207
0.054917	0.689648	0.06721	0.188226
0.081296	0.050963	0.032857	0.834884
0.040322	0.908628	0.035712	0.015337
0.20843	0.623293	0.014625	0.153652
0.226062	0.032743	0.672607	0.068588
0.343918	0.232447	0.142275	0.28136
0.254188	0.026969	0.564927	0.153916

MOTIF	Liver_P0_H3K9me3_92_74_0.510_1.547552e-09
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.100887	0.800046	0.041541	0.057526
0.024588	0.03656	0.069135	0.869717
0.037378	0.021514	0.893239	0.047868
0.015273	0.013207	0.962433	0.009086
0.066568	0.868611	0.013292	0.05153
0.022197	0.772202	0.014374	0.191227
0.144701	0.042786	0.05005	0.762462
0.025267	0.904836	0.061914	0.007983
0.062223	0.749355	0.014083	0.174339
0.383869	0.033189	0.54982	0.033122
0.235291	0.230847	0.037257	0.496605

MOTIF	Intestine_E16.5_H3K9me3_55_28_0.529_1.200518e-13
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.026027	0.94492	0.015927	0.013126
0.032799	0.0793	0.052969	0.834932
0.040894	0.014106	0.896882	0.048118
0.025717	0.054519	0.853147	0.066616
0.073748	0.725047	0.070995	0.130211
0.049074	0.707933	0.040844	0.202148
0.050516	0.014121	0.107324	0.828039
0.060807	0.857327	0.051992	0.029874
0.079451	0.807976	0.025227	0.087346
0.174543	0.22883	0.303648	0.292979
0.331071	0.03525	0.417496	0.216183

MOTIF	Kidney_E16.5_H3K9me3_47_37_0.525_1.376984e-31
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.037075	0.919624	0.01709	0.02621
0.015354	0.015236	0.016772	0.952638
0.033139	0.012777	0.893863	0.060222
0.041436	0.040309	0.8515	0.066754
0.054578	0.70717	0.096591	0.14166
0.085096	0.578068	0.023271	0.313565
0.048729	0.006397	0.05721	0.887664
0.036566	0.841298	0.10323	0.018906
0.157743	0.710877	0.014907	0.116473
0.28843	0.100384	0.400076	0.211111

MOTIF	Lung_E14.5_H3K9me3_71_90_0.511_7.2837e-07
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.056985	0.896313	0.021835	0.024867
0.135521	0.078038	0.031167	0.755274
0.026165	0.048259	0.866901	0.058675
0.028132	0.04046	0.886584	0.044824
0.096772	0.8017	0.038806	0.062722
0.057119	0.721541	0.02059	0.20075
0.033713	0.025995	0.055107	0.885186
0.029474	0.767348	0.12159	0.081588
0.142232	0.724932	0.047296	0.08554

MOTIF	Midbrain_E16.5_H3K9me3_86_69_0.510_9.1522e-10
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.026787	0.005808	0.038555	0.92885
0.092253	0.002109	0.872303	0.033335
0.100901	0.0	0.811743	0.087356
0.040252	0.926664	0.003537	0.029547
0.056949	0.906825	0.002804	0.033422
0.00671	0.028011	0.022404	0.942876
0.015136	0.962503	0.005147	0.017213
0.626866	0.338324	0.004416	0.030394
0.606002	0.0	0.393998	0.0

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K9me3_117_106_0.503_1.333037e-05
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.017347	0.933144	0.030276	0.019232
0.007623	0.018824	0.077158	0.896395
0.070988	0.0	0.839871	0.089141
0.038115	0.017094	0.894009	0.050782
0.061164	0.595896	0.261358	0.081582
0.070138	0.836608	0.01017	0.083085
0.115208	0.016943	0.039041	0.828809
0.082078	0.856481	0.008595	0.052845
0.19023	0.780048	0.003709	0.026013
0.690303	0.198366	0.078029	0.033302

MOTIF	Kidney_E15.5_H3K9me3_89_78_0.507_3.828119e-09
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.04275	0.887218	0.055258	0.014774
0.034673	0.004708	0.009263	0.951355
0.103526	0.005634	0.8729	0.017941
0.037039	0.01387	0.887849	0.061243
0.074379	0.671971	0.015155	0.238495
0.008048	0.815613	0.007578	0.168761
0.025306	0.045378	0.092366	0.83695
0.038127	0.737641	0.102219	0.122013
0.121241	0.809754	0.003326	0.065678
0.595719	0.28558	0.082452	0.03625

MOTIF	Limb_E13.5_H3K9me3_96_84_0.515_2.275131e-37
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.068739	0.142353	0.788908
0.022524	0.07003	0.782778	0.124668
0.034813	0.086112	0.864993	0.014082
0.815403	0.062874	0.084362	0.037361
0.021679	0.070387	0.87889	0.029044
0.245337	0.088718	0.646495	0.01945
0.088953	0.86556	0.043928	0.001559
0.00152	0.751747	0.066541	0.180193
0.824137	0.105751	0.007887	0.062225

MOTIF	Forebrain_E11.5_H3K9me3_48_122_0.518_1.578215e-06
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.018645	0.049153	0.050117	0.882085
0.011377	0.014263	0.895469	0.078891
0.126895	0.037324	0.801024	0.034757
0.781252	0.060611	0.083354	0.074783
0.088986	0.106385	0.707504	0.097125
0.06367	0.036257	0.886248	0.013825
0.223317	0.65251	0.023821	0.100353
0.014664	0.925071	0.031205	0.02906
0.871867	0.073504	0.015915	0.038714
0.240358	0.388049	0.0	0.371593

MOTIF	Lung_E14.5_H3K9me3_69_99_0.512_2.797328e-05
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.147379	0.148591	0.355103	0.348928
0.023539	0.146567	0.056521	0.773373
0.035719	0.040531	0.782846	0.140904
0.125335	0.118907	0.743671	0.012086
0.929018	0.008015	0.033029	0.029938
0.052893	0.049987	0.861782	0.035338
0.021453	0.05508	0.89692	0.026547
0.258601	0.695705	0.018412	0.027281
0.014591	0.917682	0.024913	0.042815
0.860282	0.067921	0.020527	0.051269

MOTIF	Hindbrain_E11.5_H3K9me3_49_106_0.519_0.001086873
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.125281	0.092171	0.035482	0.747066
0.094999	0.019775	0.783304	0.101922
0.119832	0.075191	0.758306	0.046671
0.834468	0.046001	0.013842	0.105689
0.166188	0.005138	0.71187	0.116804
0.031369	0.045663	0.893076	0.029893
0.015431	0.926949	0.025285	0.032336
0.019673	0.880299	0.021965	0.078063
0.860414	0.071873	0.017955	0.049757

MOTIF	Neural-Tube_E11.5_H3K9me3_47_116_0.510_0.001503979
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.091288	0.109515	0.056069	0.743128
0.073164	0.055211	0.805619	0.066005
0.126905	0.073777	0.762986	0.036332
0.904549	0.019157	0.039361	0.036934
0.060388	0.064377	0.821572	0.053663
0.117263	0.060778	0.800508	0.021451
0.089239	0.812271	0.020117	0.078374
0.174623	0.686292	0.03019	0.108895
0.761436	0.05986	0.068476	0.110228