MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K4me1_71_61_0.513_6.712245e-39
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.130497	0.0	0.828041	0.041462
0.086198	0.75571	0.044742	0.11335
0.012809	0.85499	0.105133	0.027069
0.056742	0.870743	0.001677	0.070839
0.61209	0.20534	0.024732	0.157838
0.0	0.991349	0.0	0.008651
0.793791	0.027732	0.162986	0.015491
0.003006	0.006405	0.854384	0.136206
0.0	0.874826	0.087377	0.037797

MOTIF	Limb_E14.5_H3K4me1_67_46_0.512_8.216726e-28
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.053936	0.050701	0.809154	0.086209
0.027992	0.824312	0.115497	0.032199
0.029812	0.857356	0.105597	0.007234
0.0	0.993433	0.004968	0.001599
0.925922	0.014966	0.059112	0.0
0.0	0.988258	0.0	0.011742
0.454418	0.013058	0.29404	0.238484
0.00461	0.01463	0.958756	0.022005
0.082608	0.586251	0.08928	0.241861

MOTIF	Neural-Tube_E13.5_H3K4me1_88_41_0.507_1.25827e-13
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.019042	0.0	0.889635	0.091323
0.052759	0.896974	0.035228	0.015039
0.039559	0.889483	0.039019	0.031939
0.015101	0.902108	0.005874	0.076917
0.758562	0.041841	0.042507	0.157089
0.024145	0.913913	0.053789	0.008153
0.439227	0.035	0.407027	0.118746
0.006523	0.022411	0.828984	0.142083
0.009328	0.769799	0.06394	0.156933
0.020407	0.020868	0.143238	0.815487
0.018335	0.130784	0.0	0.850881

MOTIF	Limb_E14.5_H3K9me3_85_72_0.508_1.226723e-06
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.867864	0.021437	0.030836	0.079864
0.031437	0.004088	0.820567	0.143908
0.025711	0.220784	0.606522	0.146983
0.039859	0.904382	0.050856	0.004904
0.171964	0.045113	0.02115	0.761773
0.086561	0.05358	0.84735	0.01251
0.070085	0.066647	0.014975	0.848293
0.047033	0.017846	0.891014	0.044107
0.026007	0.105487	0.737922	0.130584
0.412806	0.277485	0.198286	0.111423

MOTIF	Lung_P0_H3K9me3_91_100_0.503_0.0006749798
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.743595	0.020378	0.026697	0.209331
0.021821	0.027216	0.886116	0.064846
0.029477	0.26381	0.524172	0.182541
0.019046	0.956276	0.019258	0.00542
0.03473	0.056699	0.030848	0.877724
0.07614	0.078606	0.79896	0.046294
0.036245	0.145338	0.030217	0.7882
0.027857	0.022372	0.914674	0.035096
0.092178	0.01264	0.812338	0.082845

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K9me3_84_56_0.513_6.957829e-08
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.1642	0.061082	0.612231	0.162488
0.908418	0.003131	0.054478	0.033973
0.073517	0.007715	0.864487	0.054281
0.040062	0.224891	0.686856	0.048191
0.031726	0.916307	0.04687	0.005097
0.127468	0.035274	0.004363	0.832895
0.135248	0.085667	0.766436	0.012648
0.074758	0.030518	0.031869	0.862855
0.147066	0.019757	0.794201	0.038976
0.063322	0.074161	0.706062	0.156455

MOTIF	Midbrain_E14.5_H3K9me3_107_57_0.503_0.0001296581
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.160334	0.163483	0.481173	0.19501
0.7862	0.040707	0.119754	0.053338
0.044588	0.000423	0.879662	0.075327
0.04384	0.22828	0.669005	0.058875
0.084708	0.786406	0.111219	0.017667
0.127146	0.019398	0.006728	0.846729
0.137409	0.028656	0.791455	0.04248
0.033839	0.029677	0.028463	0.908022
0.091762	0.003532	0.84543	0.059276
0.036039	0.012798	0.900142	0.051021

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K9me3_103_92_0.503_4.658242e-07
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.744561	0.039648	0.119674	0.096116
0.114644	0.008247	0.779342	0.097767
0.164447	0.090874	0.668649	0.07603
0.144063	0.757406	0.089835	0.008696
0.154926	0.024421	0.026095	0.794558
0.047323	0.020468	0.887336	0.044873
0.065469	0.006664	0.039438	0.888429
0.062746	0.011589	0.902719	0.022946
0.024472	0.023887	0.89353	0.058111

MOTIF	Hindbrain_P0_H3K9me3_109_66_0.502_1.480469e-06
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.70074	0.028473	0.075759	0.195028
0.130177	0.007588	0.709571	0.152663
0.149763	0.106633	0.641072	0.102532
0.065353	0.826119	0.087484	0.021044
0.044385	0.014946	0.004428	0.936242
0.076035	0.033891	0.865653	0.024421
0.066478	0.009411	0.017432	0.906679
0.08151	0.020287	0.876074	0.022129
0.043015	0.074335	0.787835	0.094815

MOTIF	Neural-Tube_E14.5_H3K9me3_85_67_0.504_0.005593072
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.566674	0.032987	0.077912	0.322427
0.155251	0.002588	0.70064	0.141521
0.060372	0.143202	0.72589	0.070536
0.042126	0.827798	0.119756	0.010321
0.105589	0.01621	0.009807	0.868394
0.061838	0.021515	0.904413	0.012235
0.044087	0.036991	0.028485	0.890438
0.023667	0.008629	0.900409	0.067295
0.047324	0.022648	0.881834	0.048195

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K9me3_113_90_0.503_2.966771e-06
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.112284	0.853081	0.019125	0.01551
0.003401	0.855421	0.008888	0.13229
0.10072	0.880983	0.000575	0.017722
0.890007	0.028777	0.008268	0.072949
0.101607	0.763358	0.084754	0.050281
0.864787	0.019218	0.073526	0.042469
0.233883	0.031655	0.674486	0.059976
0.010149	0.826879	0.034735	0.128237
0.066828	0.884483	0.032879	0.01581

MOTIF	Limb_E11.5_H3K9me3_44_54_0.519_9.431251e-05
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.10358	0.651795	0.160916	0.083708
0.03825	0.848497	0.031804	0.081448
0.919178	0.015112	0.030328	0.035383
0.096265	0.75767	0.081252	0.064813
0.828262	0.070616	0.073454	0.027668
0.059537	0.027092	0.866749	0.046621
0.102964	0.738589	0.114248	0.044199
0.127859	0.814106	0.018607	0.039428
0.716173	0.085475	0.025117	0.173236

MOTIF	Neural-Tube_E11.5_H3K9me3_58_62_0.507_0.0005043862
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.076202	0.766467	0.087283	0.070048
0.030252	0.845908	0.02527	0.098571
0.894206	0.034546	0.022428	0.04882
0.068412	0.81361	0.082261	0.035716
0.855025	0.051625	0.035583	0.057767
0.037337	0.071508	0.809916	0.081239
0.113472	0.678344	0.160831	0.047353
0.097316	0.809175	0.008228	0.085281
0.792494	0.068063	0.03067	0.108772

MOTIF	Heart_P0_H3K9me3_95_48_0.509_6.369051e-08
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.117838	0.811321	0.022274	0.048568
0.044365	0.878868	0.006933	0.069834
0.028486	0.943919	8e-05	0.027515
0.936721	0.010517	0.029845	0.022917
0.141903	0.707046	0.075645	0.075406
0.845629	0.005272	0.013997	0.135102
0.007209	0.007508	0.866341	0.118942
0.228814	0.500074	0.215616	0.055496
0.131743	0.806704	0.035539	0.026015
0.471907	0.305853	0.055218	0.167022

MOTIF	Cranio-Facial_E14.5_H3K9me3_98_34_0.508_2.329925e-19
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.137241	0.747754	0.031576	0.083429
0.041867	0.904007	0.016654	0.037471
0.019172	0.883547	0.003162	0.09412
0.938562	0.027911	0.01246	0.021068
0.038496	0.893729	0.023956	0.043819
0.870809	0.014125	0.029384	0.085682
0.013591	0.024474	0.915561	0.046374
0.19074	0.428488	0.159292	0.221481
0.09921	0.787918	0.086924	0.025948
0.204972	0.305516	0.246503	0.24301

MOTIF	Hindbrain_E14.5_H3K9me3_125_29_0.506_4.492602e-10
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.147991	0.696876	0.069916	0.085217
0.016863	0.941236	0.029243	0.012659
0.07317	0.861253	0.004248	0.061329
0.949559	0.032215	0.008973	0.009253
0.012485	0.86914	0.04476	0.073615
0.89044	0.01533	0.017549	0.076681
0.020269	0.037448	0.790929	0.151355
0.153282	0.506227	0.120052	0.220439
0.096719	0.808071	0.066755	0.028455
0.378291	0.290028	0.15601	0.175672

MOTIF	Forebrain_P0_H3K9me3_101_24_0.503_2.350269e-06
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.113301	0.701044	0.117926	0.067728
0.086145	0.802724	0.022562	0.08857
0.051944	0.883455	0.006066	0.058535
0.886279	0.021185	0.022841	0.069696
0.047867	0.824451	0.074478	0.053204
0.899011	0.013322	0.025044	0.062622
0.015253	0.056579	0.833611	0.094557
0.096965	0.626942	0.097294	0.1788
0.138611	0.717972	0.057127	0.08629

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K9me3_109_28_0.501_4.791802e-08
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.120714	0.691509	0.114495	0.073282
0.074767	0.814153	0.037837	0.073243
0.006189	0.925999	0.005209	0.062603
0.86488	0.049511	0.011953	0.073656
0.032504	0.865601	0.063094	0.038801
0.866578	0.015506	0.037812	0.080103
0.019121	0.038962	0.846804	0.095113
0.111385	0.61062	0.103421	0.174573
0.115782	0.790316	0.047971	0.045931

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K9me3_108_25_0.503_5.511995e-08
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.133582	0.700229	0.067321	0.098868
0.050202	0.812386	0.045679	0.091733
0.030584	0.89371	0.008339	0.067367
0.839618	0.06174	0.026602	0.07204
0.054372	0.832089	0.044093	0.069446
0.825739	0.022688	0.041929	0.109644
0.01451	0.093296	0.777414	0.11478
0.079753	0.66629	0.109615	0.144342
0.075182	0.827381	0.038383	0.059054

MOTIF	Midbrain_E14.5_H3K9me3_103_41_0.505_1.250545e-08
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.169887	0.64857	0.074197	0.107345
0.014686	0.924098	0.020907	0.040309
0.022396	0.90163	0.00134	0.074635
0.912075	0.030243	0.008093	0.049589
0.021148	0.865579	0.053993	0.059279
0.900926	0.004167	0.023223	0.071684
0.022195	0.044711	0.81556	0.117535
0.117738	0.52994	0.132846	0.219477
0.17426	0.752178	0.033686	0.039877

MOTIF	Neural-Tube_E15.5_H3K9me3_92_26_0.509_2.70396e-17
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.089622	0.670451	0.157356	0.082571
0.015532	0.889246	0.014064	0.081158
0.027773	0.949796	0.003155	0.019277
0.945172	0.008022	0.017229	0.029576
0.021372	0.806821	0.0667	0.105107
0.844592	0.019168	0.053093	0.083148
0.019491	0.190182	0.682238	0.10809
0.056844	0.728745	0.036405	0.178006
0.073557	0.846891	0.046249	0.033304
0.630467	0.156058	0.033165	0.18031