MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Limb_E11.5_H3K4me2_28_171_0.630_4.476235e-321 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.731 0.001 0.267 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.997 MOTIF Forebrain_E14.5_H3K4me3_20_151_0.709_2.336773e-316 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.109 0.801 0.001 0.089 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.744 0.254 0.001 0.001 0.043 0.771 0.185 0.292 0.035 0.074 0.599 0.112 0.05 0.001 0.837 0.086 0.001 0.036 0.877 0.001 0.416 0.001 0.582 MOTIF Forebrain_P0_H3K4me3_18_152_0.706_5.388003e-318 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.152 0.297 0.441 0.11 0.108 0.001 0.376 0.515 0.101 0.028 0.077 0.794 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.081 0.178 0.74 0.148 0.231 0.104 0.517 MOTIF Cranio-Facial_E12.5_H3K4me3_3_152_0.755_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.373 0.159 0.263 0.205 0.557 0.127 0.235 0.081 0.995 0.001 0.003 0.001 0.479 0.218 0.13 0.173 0.269 0.432 0.033 0.265 0.011 0.276 0.524 0.189 0.001 0.958 0.04 0.001 0.176 0.001 0.822 0.001 0.291 0.306 0.239 0.164 0.335 0.236 0.164 0.265 MOTIF Cranio-Facial_E11.5_H3K4me3_2_152_0.760_3.102451e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.373 0.123 0.228 0.276 0.537 0.144 0.165 0.154 0.922 0.003 0.047 0.028 0.473 0.23 0.097 0.201 0.279 0.451 0.068 0.202 0.134 0.173 0.461 0.232 0.066 0.886 0.045 0.003 0.214 0.051 0.712 0.023 0.286 0.277 0.257 0.18 0.281 0.23 0.217 0.272 MOTIF Liver_E12.5_H3K4me3_7_154_0.694_6.288659e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.326 0.186 0.259 0.228 0.562 0.109 0.156 0.173 0.889 0.005 0.102 0.004 0.504 0.232 0.088 0.176 0.27 0.486 0.032 0.213 0.123 0.193 0.482 0.201 0.071 0.767 0.123 0.039 0.185 0.09 0.598 0.127 0.256 0.275 0.235 0.234 0.268 0.249 0.224 0.259 MOTIF Hindbrain_P0_H3K4me3_3_151_0.769_6.94869e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.388 0.212 0.266 0.134 0.64 0.161 0.163 0.036 0.907 0.001 0.091 0.001 0.583 0.298 0.061 0.058 0.127 0.688 0.001 0.184 0.001 0.15 0.772 0.077 0.001 0.997 0.001 0.001 0.002 0.001 0.996 0.001 0.336 0.354 0.165 0.146 0.279 0.165 0.22 0.336 MOTIF Midbrain_E14.5_H3K4me3_11_152_0.735_9.800141e-314 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.344 0.137 0.267 0.251 0.887 0.003 0.109 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.572 0.208 0.004 0.216 0.293 0.526 0.001 0.18 0.001 0.074 0.913 0.012 0.001 0.997 0.001 0.001 0.01 0.001 0.988 0.001 0.398 0.391 0.15 0.061 0.39 0.104 0.214 0.292 MOTIF Hindbrain_E11.5_H3K4me3_15_152_0.735_7.934532e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.496 0.13 0.232 0.142 0.937 0.001 0.054 0.008 0.992 0.001 0.006 0.001 0.643 0.185 0.001 0.171 0.254 0.487 0.027 0.232 0.001 0.295 0.605 0.099 0.001 0.997 0.001 0.001 0.016 0.001 0.982 0.001 0.302 0.324 0.253 0.121 0.334 0.127 0.184 0.354 MOTIF Midbrain_E11.5_H3K4me3_19_152_0.721_1.932383e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.375 0.162 0.262 0.2 0.923 0.002 0.074 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.503 0.263 0.001 0.233 0.379 0.395 0.042 0.184 0.001 0.242 0.497 0.26 0.001 0.997 0.001 0.001 0.015 0.001 0.983 0.001 0.29 0.291 0.258 0.161 0.205 0.252 0.26 0.283 MOTIF Neural-Tube_E12.5_H3K4me3_14_152_0.724_1.066553e-313 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.244 0.492 0.209 0.055 0.226 0.089 0.381 0.305 0.194 0.001 0.177 0.628 0.001 0.001 0.001 0.997 0.071 0.016 0.021 0.892 0.201 0.252 0.049 0.499 MOTIF Lung_E16.5_H3K4me3_14_157_0.683_3.487645e-314 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.035 0.763 0.103 0.099 0.203 0.193 0.483 0.121 0.597 0.148 0.188 0.067 0.652 0.131 0.192 0.025 0.563 0.165 0.176 0.096 0.165 0.524 0.158 0.153 0.152 0.171 0.505 0.172 0.16 0.542 0.157 0.141 0.161 0.156 0.528 0.155 0.516 0.17 0.158 0.156 0.158 0.154 0.171 0.517 0.259 0.125 0.141 0.475 MOTIF Kidney_E14.5_H3K4me3_3_153_0.765_6.059031e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.276 0.229 0.257 0.238 0.533 0.146 0.167 0.154 0.566 0.15 0.142 0.142 0.527 0.158 0.158 0.157 0.176 0.505 0.161 0.158 0.129 0.559 0.165 0.147 0.109 0.15 0.612 0.129 0.124 0.608 0.151 0.117 0.146 0.151 0.557 0.146 0.246 0.258 0.262 0.234 MOTIF Intestine_P0_H3K4me3_4_152_0.745_2.554464e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.299 0.218 0.255 0.228 0.563 0.134 0.162 0.141 0.597 0.114 0.153 0.136 0.514 0.179 0.15 0.157 0.165 0.559 0.129 0.147 0.12 0.156 0.585 0.139 0.122 0.616 0.153 0.109 0.159 0.12 0.6 0.121 0.478 0.183 0.188 0.152 0.259 0.246 0.249 0.246 MOTIF Liver_P0_H3K4me3_14_152_0.682_2.235167e-314 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.119 0.157 0.131 0.593 0.119 0.488 0.112 0.28 0.088 0.202 0.545 0.165 0.057 0.685 0.156 0.102 0.151 0.095 0.594 0.16 0.145 0.105 0.261 0.49 0.104 0.156 0.114 0.626 0.148 0.164 0.116 0.572 MOTIF Midbrain_E15.5_H3K4me3_1_151_0.781_1.478102e-317 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.435 0.195 0.198 0.172 0.373 0.286 0.293 0.048 0.486 0.151 0.179 0.184 0.374 0.277 0.163 0.186 0.206 0.547 0.086 0.161 0.101 0.232 0.564 0.103 0.088 0.711 0.174 0.027 0.137 0.068 0.638 0.157 MOTIF Forebrain_E13.5_H3K4me3_15_152_0.707_1.29823e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.115 0.702 0.065 0.118 0.083 0.058 0.783 0.076 0.071 0.735 0.131 0.063 0.068 0.051 0.746 0.135 0.076 0.102 0.111 0.711 0.056 0.035 0.047 0.862 0.084 0.059 0.099 0.758 0.073 0.701 0.122 0.104 MOTIF Heart_E15.5_H3K4me3_15_156_0.691_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.08 0.74 0.066 0.114 0.064 0.077 0.805 0.054 0.077 0.717 0.135 0.071 0.09 0.073 0.7 0.137 0.067 0.093 0.119 0.721 0.048 0.05 0.033 0.869 0.075 0.085 0.095 0.745 0.077 0.704 0.08 0.139 MOTIF Cranio-Facial_E13.5_H3K4me3_5_153_0.747_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.131 0.646 0.117 0.106 0.089 0.105 0.729 0.077 0.101 0.687 0.14 0.072 0.111 0.069 0.666 0.154 0.155 0.146 0.146 0.553 0.091 0.142 0.098 0.669 0.136 0.135 0.147 0.582 0.148 0.469 0.153 0.23 MOTIF Hindbrain_E13.5_H3K4me3_4_151_0.759_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.089 0.721 0.179 0.011 0.095 0.123 0.674 0.108 0.065 0.731 0.184 0.02 0.108 0.108 0.661 0.123 0.158 0.135 0.184 0.523 0.094 0.14 0.19 0.576 0.189 0.146 0.189 0.475 0.149 0.632 0.166 0.053 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K4me3_10_153_0.720_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.089 0.131 0.109 0.671 0.09 0.772 0.046 0.092 0.061 0.055 0.827 0.057 0.079 0.756 0.093 0.072 0.139 0.083 0.696 0.082 0.095 0.097 0.102 0.706 0.071 0.066 0.071 0.792 0.065 0.058 0.095 0.782 MOTIF Stomach_E15.5_H3K4me3_10_152_0.709_5.618199e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.109 0.326 0.407 0.157 0.73 0.087 0.09 0.093 0.793 0.062 0.091 0.054 0.734 0.104 0.092 0.07 0.098 0.75 0.069 0.083 0.073 0.089 0.759 0.079 0.06 0.787 0.081 0.072 0.088 0.071 0.757 0.084 0.69 0.111 0.117 0.082 0.324 0.177 0.244 0.255