MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Hindbrain_E13.5_H3K4me2_24_153_0.627_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.261 0.548 0.091 0.1 0.001 0.001 0.997 0.001 0.083 0.467 0.177 0.273 0.178 0.001 0.425 0.396 0.33 0.001 0.103 0.566 0.296 0.001 0.082 0.621 0.778 0.22 0.001 0.001 0.55 0.193 0.256 0.001 MOTIF Cranio-Facial_E14.5_H3K9ac_17_150_0.628_4.602914e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.125 0.151 0.141 0.583 0.144 0.141 0.14 0.575 0.157 0.137 0.553 0.153 0.591 0.141 0.133 0.135 0.633 0.12 0.135 0.112 0.587 0.136 0.137 0.14 0.142 0.593 0.132 0.133 0.118 0.134 0.616 0.132 0.128 0.633 0.118 0.121 0.126 0.119 0.635 0.12 MOTIF Kidney_E14.5_H3K9ac_29_163_0.617_2.43484e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.081 0.123 0.09 0.706 0.121 0.084 0.117 0.678 0.075 0.113 0.699 0.113 0.672 0.123 0.113 0.092 0.743 0.089 0.1 0.068 0.701 0.107 0.091 0.101 0.115 0.668 0.113 0.104 0.103 0.099 0.684 0.114 0.104 0.723 0.078 0.095 0.098 0.092 0.727 0.083 MOTIF Heart_E12.5_H3K9ac_23_156_0.582_2.775496e-191 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.146 0.24 0.443 0.171 0.141 0.642 0.094 0.123 0.131 0.133 0.623 0.113 0.135 0.177 0.175 0.513 0.094 0.1 0.09 0.716 0.076 0.081 0.134 0.709 0.243 0.11 0.097 0.55 0.584 0.137 0.117 0.162 0.654 0.136 0.108 0.102 0.448 0.176 0.176 0.2 MOTIF Liver_E12.5_H3K9ac_23_164_0.591_2.665582e-214 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.155 0.157 0.172 0.516 0.2 0.128 0.177 0.495 0.572 0.107 0.14 0.181 0.685 0.102 0.124 0.089 0.739 0.107 0.107 0.047 0.573 0.171 0.151 0.105 0.198 0.593 0.119 0.09 0.076 0.163 0.6 0.161 0.099 0.635 0.11 0.156 0.131 0.127 0.592 0.15 MOTIF Liver_E14.5_H3K9ac_35_169_0.590_4.070321e-157 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.093 0.136 0.097 0.674 0.094 0.106 0.102 0.698 0.663 0.118 0.094 0.125 0.576 0.256 0.072 0.096 0.697 0.099 0.106 0.098 0.151 0.098 0.667 0.084 0.094 0.669 0.095 0.142 0.088 0.184 0.606 0.122 0.147 0.671 0.07 0.112 0.094 0.101 0.698 0.107 MOTIF Hindbrain_E11.5_H3K9ac_42_171_0.588_1.550084e-132 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.29 0.169 0.332 0.209 0.246 0.206 0.286 0.262 0.084 0.246 0.044 0.626 0.044 0.085 0.125 0.746 0.868 0.084 0.004 0.044 0.464 0.004 0.286 0.245 0.385 0.406 0.044 0.165 0.085 0.084 0.827 0.004 0.085 0.584 0.125 0.206 0.343 0.085 0.407 0.165 0.302 0.367 0.166 0.165 0.293 0.249 0.209 0.249 MOTIF Forebrain_E11.5_H3K9ac_22_160_0.610_2.81161e-294 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.226 0.311 0.215 0.248 0.158 0.149 0.515 0.178 0.154 0.159 0.148 0.539 0.175 0.14 0.135 0.55 0.57 0.143 0.134 0.153 0.551 0.156 0.154 0.139 0.153 0.582 0.124 0.141 0.131 0.132 0.598 0.139 0.156 0.53 0.163 0.151 0.249 0.234 0.262 0.255 MOTIF Hindbrain_P0_H3K9ac_36_168_0.605_1.230983e-249 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.106 0.654 0.096 0.144 0.144 0.045 0.555 0.256 0.03 0.187 0.18 0.603 0.063 0.057 0.201 0.679 0.718 0.152 0.054 0.076 0.551 0.145 0.216 0.088 0.21 0.584 0.115 0.091 0.096 0.032 0.81 0.062 0.081 0.564 0.102 0.253 0.241 0.155 0.094 0.51 MOTIF Limb_E13.5_H3K9ac_26_167_0.592_1.270689e-279 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.116 0.114 0.67 0.1 0.106 0.701 0.083 0.11 0.111 0.106 0.657 0.126 0.099 0.106 0.118 0.677 0.109 0.103 0.118 0.67 0.67 0.11 0.096 0.124 0.675 0.105 0.116 0.104 0.104 0.393 0.403 0.1 0.105 0.677 0.092 0.126 0.119 0.079 0.697 0.105 MOTIF Lung_E15.5_H3K9ac_20_153_0.669_1.002926e-316 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.118 0.266 0.223 0.393 0.306 0.081 0.217 0.397 0.997 0.001 0.001 0.001 0.576 0.178 0.115 0.131 0.432 0.213 0.063 0.292 0.22 0.297 0.251 0.232 0.089 0.58 0.155 0.176 0.127 0.027 0.659 0.187 MOTIF Limb_E11.5_H3K9ac_22_156_0.597_2.083765e-176 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.158 0.54 0.146 0.156 0.141 0.139 0.568 0.152 0.485 0.2 0.177 0.137 0.176 0.168 0.187 0.47 0.013 0.121 0.092 0.774 0.122 0.033 0.073 0.772 0.683 0.144 0.078 0.095 0.648 0.103 0.208 0.041 0.205 0.545 0.156 0.094 0.193 0.117 0.524 0.166 MOTIF Cranio-Facial_E14.5_H3K9ac_27_164_0.613_8.389864e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.146 0.577 0.138 0.139 0.124 0.141 0.583 0.152 0.128 0.118 0.148 0.606 0.163 0.13 0.151 0.556 0.632 0.122 0.126 0.12 0.655 0.132 0.127 0.086 0.578 0.151 0.142 0.129 0.115 0.149 0.588 0.148 0.131 0.627 0.117 0.125 0.144 0.119 0.598 0.139 MOTIF Hindbrain_E15.5_H3K9ac_36_160_0.634_1.313279e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.082 0.704 0.106 0.108 0.097 0.103 0.655 0.145 0.092 0.109 0.104 0.695 0.104 0.084 0.127 0.685 0.726 0.082 0.102 0.09 0.73 0.113 0.095 0.062 0.698 0.095 0.108 0.099 0.097 0.117 0.705 0.081 0.098 0.707 0.086 0.109 0.103 0.093 0.696 0.108 MOTIF Neural-Tube_E15.5_H3K9ac_36_159_0.627_2.891011e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.105 0.683 0.106 0.106 0.099 0.102 0.668 0.131 0.091 0.118 0.1 0.691 0.096 0.087 0.122 0.695 0.719 0.087 0.097 0.097 0.73 0.113 0.078 0.079 0.726 0.093 0.086 0.095 0.099 0.112 0.676 0.113 0.093 0.721 0.09 0.096 0.098 0.101 0.693 0.108 MOTIF Kidney_E15.5_H3K9ac_18_157_0.665_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.143 0.146 0.56 0.151 0.137 0.618 0.121 0.124 0.129 0.126 0.607 0.138 0.148 0.589 0.141 0.122 0.111 0.125 0.614 0.15 0.129 0.143 0.144 0.584 0.138 0.12 0.135 0.607 0.591 0.128 0.136 0.145 0.624 0.135 0.13 0.111 0.603 0.139 0.13 0.128 MOTIF Heart_E13.5_H3K9ac_13_152_0.577_2.023452e-282 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.294 0.55 0.075 0.081 0.219 0.109 0.589 0.083 0.24 0.477 0.106 0.176 0.123 0.075 0.492 0.31 0.194 0.102 0.126 0.578 0.162 0.075 0.103 0.66 0.521 0.043 0.108 0.328 0.576 0.158 0.141 0.125 MOTIF Intestine_E16.5_H3K9ac_10_151_0.607_2.95472e-304 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.193 0.632 0.054 0.121 0.132 0.073 0.695 0.1 0.116 0.432 0.218 0.235 0.123 0.081 0.4 0.395 0.154 0.12 0.13 0.596 0.27 0.05 0.101 0.579 0.481 0.101 0.096 0.322 0.475 0.162 0.158 0.204 MOTIF Kidney_E16.5_H3K9ac_3_151_0.628_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.193 0.583 0.108 0.116 0.167 0.107 0.646 0.08 0.223 0.428 0.205 0.143 0.22 0.101 0.364 0.315 0.218 0.07 0.223 0.488 0.338 0.039 0.041 0.582 0.482 0.14 0.106 0.272 0.447 0.256 0.115 0.183 MOTIF Midbrain_E15.5_H3K9ac_15_153_0.662_1.616325e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.321 0.249 0.119 0.311 0.046 0.167 0.263 0.524 0.255 0.082 0.19 0.473 0.54 0.04 0.07 0.35 0.623 0.313 0.009 0.055 0.471 0.242 0.048 0.239 0.215 0.246 0.339 0.201 0.023 0.758 0.125 0.094 0.087 0.09 0.714 0.109 0.244 0.274 0.253 0.228 MOTIF Heart_E11.5_H3K9ac_9_153_0.601_3.49197e-315 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.215 0.733 0.051 0.001 0.091 0.001 0.907 0.001 0.096 0.748 0.076 0.08 0.028 0.039 0.778 0.155 0.172 0.056 0.176 0.596 0.085 0.012 0.086 0.817 0.713 0.063 0.074 0.15 0.707 0.166 0.06 0.067 MOTIF Stomach_E15.5_H3K9ac_24_155_0.663_4.052923e-284 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.724 0.09 0.102 0.084 0.083 0.125 0.704 0.088 0.098 0.09 0.106 0.706 0.12 0.1 0.098 0.682 0.698 0.118 0.086 0.098 0.69 0.115 0.101 0.094 0.096 0.711 0.106 0.087 0.103 0.088 0.703 0.106 0.107 0.71 0.09 0.093 0.108 0.11 0.673 0.109