MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Heart_E16.5_H3K4me3_2_6_0.691_2.26688e-315
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.612901	0.032078	0.355021
0.565546	0.088159	0.060085	0.28621
0.024118	0.896959	0.067081	0.011841
0.124974	0.053431	0.524052	0.297543
0.013968	0.91301	0.059388	0.013634
0.050395	0.848856	0.006566	0.094183
0.023199	0.056239	0.893199	0.027362
0.049289	0.768214	0.070035	0.112462
0.108421	0.001614	0.866754	0.02321
0.131303	0.717969	0.042548	0.108179
0.036458	0.030971	0.770897	0.161674

MOTIF	Hindbrain_P0_H3K4me3_1_7_0.794_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.241645	0.725651	0.011279	0.021425
0.095724	0.077028	0.603004	0.224243
0.02092	0.810731	0.092198	0.076151
0.044429	0.878344	0.024936	0.052291
0.076328	0.057124	0.742336	0.124212
0.03641	0.670568	0.231319	0.061703
0.019427	0.021367	0.936377	0.022829
0.042008	0.926293	0.008965	0.022734
0.046481	0.022293	0.883216	0.048009

MOTIF	Forebrain_E12.5_H3K4me3_1_8_0.772_1.973714e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.013062	0.865301	0.100808	0.020829
0.028473	0.002046	0.789535	0.179946
0.211082	0.742354	0.014844	0.03172
0.049375	0.899128	0.008953	0.042544
0.220077	0.01788	0.627002	0.13504
0.030427	0.746677	0.072448	0.150448
0.025292	0.049323	0.883183	0.042203
0.02631	0.908806	0.03918	0.025704
0.04794	0.032682	0.856916	0.062462
0.198155	0.038929	0.547803	0.215113

MOTIF	Limb_E11.5_H3K4me3_1_3_0.801_7.516626e-316
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.022215	0.911227	0.055239	0.011319
0.031183	0.00563	0.828207	0.13498
0.012444	0.920711	0.052648	0.014197
0.046163	0.839146	0.061774	0.052917
0.105108	0.068574	0.700583	0.125735
0.166788	0.691046	0.066478	0.075688
0.064719	0.022798	0.81108	0.101403
0.117007	0.779633	0.083671	0.019689
0.031236	0.0445	0.778315	0.145949
0.174802	0.029441	0.402053	0.393703

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K4me3_2_8_0.802_5.626023e-313
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.152769	0.714848	0.008061	0.124323
0.037431	0.062042	0.859706	0.040821
0.036367	0.926148	0.014	0.023486
0.267306	0.656939	0.044048	0.031707
0.093148	0.0	0.872667	0.034185
0.04071	0.833507	0.031268	0.094515
0.008344	0.071275	0.721112	0.199269
0.030638	0.741865	0.092028	0.135468
0.011926	0.032967	0.895177	0.059931

MOTIF	Heart_E13.5_H3K4me3_2_2_0.730_1.128868e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.046052	0.813386	0.038142	0.102421
0.093359	0.03682	0.799849	0.069973
0.018459	0.93424	0.038637	0.008664
0.198828	0.669464	0.031605	0.100102
0.017338	0.02865	0.927195	0.026817
0.150101	0.656207	0.146282	0.04741
0.042824	0.033836	0.834916	0.088423
0.104791	0.809502	0.06094	0.024767
0.112796	0.051179	0.779295	0.056729
0.354377	0.02295	0.30718	0.315493

MOTIF	Lung_E16.5_H3K4me3_1_8_0.750_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.221616	0.696988	0.022442	0.058954
0.029516	0.034253	0.881114	0.055117
0.023229	0.870264	0.039173	0.067333
0.121815	0.666759	0.01647	0.194956
0.026387	0.059733	0.888745	0.025134
0.180201	0.718224	0.039221	0.062355
0.050287	0.045335	0.80223	0.102148
0.022018	0.85048	0.059637	0.067866
0.051455	0.056296	0.818029	0.074221

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K4me3_2_4_0.764_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.193413	0.18792	0.420584	0.198083
0.057259	0.760777	0.029707	0.152257
0.030246	0.12497	0.775622	0.069162
0.028332	0.94274	0.004506	0.024423
0.058948	0.756795	0.139825	0.044431
0.029887	0.013679	0.846616	0.109818
0.135253	0.618388	0.141497	0.104862
0.014796	0.018677	0.938249	0.028278
0.119848	0.587315	0.156812	0.136025
0.039075	0.021493	0.899699	0.039733
0.364447	0.147306	0.217232	0.271015

MOTIF	Midbrain_E13.5_H3K4me3_1_6_0.805_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.143145	0.226642	0.249043	0.381169
0.046293	0.726023	0.067907	0.159777
0.032786	0.071518	0.659606	0.23609
0.181623	0.712192	0.034643	0.071543
0.056812	0.87136	0.036782	0.035046
0.028463	0.036597	0.815466	0.119474
0.19633	0.737955	0.048658	0.017058
0.013751	0.034142	0.925619	0.026488
0.026526	0.934912	0.019951	0.018612
0.033033	0.008359	0.910163	0.048444

MOTIF	Kidney_E14.5_H3K4me3_1_6_0.788_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.010063	0.797873	0.071621	0.120443
0.129707	0.053028	0.680126	0.13714
0.06819	0.814565	0.030089	0.087156
0.052824	0.865155	0.034451	0.04757
0.021426	0.059704	0.802035	0.116836
0.255697	0.559859	0.098747	0.085697
0.010919	0.069826	0.885487	0.033769
0.018451	0.847929	0.105176	0.028444
0.026625	0.061863	0.872685	0.038828

MOTIF	Cranio-Facial_E12.5_H3K4me3_1_3_0.808_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.020603	0.857756	0.059492	0.062149
0.078303	0.09477	0.700157	0.12677
0.058094	0.854374	0.029406	0.058126
0.042582	0.804681	0.10609	0.046646
0.097698	0.044256	0.776087	0.081959
0.137508	0.70403	0.100705	0.057757
0.038277	0.072586	0.873543	0.015594
0.087168	0.723911	0.096267	0.092654
0.03987	0.055533	0.803903	0.100694

MOTIF	Midbrain_P0_H3K4me3_1_4_0.805_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.055108	0.789479	0.070692	0.08472
0.081519	0.072592	0.681616	0.164272
0.076438	0.844929	0.030206	0.048427
0.049894	0.84651	0.035262	0.068334
0.028127	0.068317	0.837361	0.066195
0.164462	0.668963	0.107557	0.059018
0.015702	0.025952	0.945831	0.012514
0.105508	0.695027	0.115888	0.083576
0.035635	0.02719	0.78243	0.154746

MOTIF	Stomach_E15.5_H3K4me3_12_11_0.705_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.010356	0.97955	0.0	0.010094
0.069408	0.835027	0.035547	0.060018
0.013116	0.051414	0.916344	0.019126
0.305204	0.558553	0.025582	0.110661
0.136607	0.020473	0.811822	0.031098
0.024939	0.927139	0.011521	0.0364
0.058267	0.0	0.863137	0.078596
0.010479	0.053072	0.905275	0.031175
0.082185	0.478346	0.0	0.439469
0.011177	0.029949	0.793396	0.165478
0.803179	0.147266	0.0	0.049554

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K27me3_12_14_0.542_1.690348e-45
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.146304	0.021366	0.787111	0.045219
0.017605	0.838059	0.049431	0.094905
0.144859	0.076112	0.576956	0.202073
0.007476	0.927275	0.060503	0.004746
0.071105	0.093306	0.791634	0.043955
0.21374	0.011672	0.759484	0.015104
0.129551	0.68001	0.100724	0.089715
0.0	0.045513	0.883152	0.071336
0.913448	0.045601	0.0	0.040952
0.127631	0.126218	0.374237	0.371914

MOTIF	Heart_P0_H3K4me2_15_19_0.626_1.612355e-316
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.018103	0.96119	0.0	0.020707
0.080301	0.02306	0.868687	0.027952
0.097294	0.762572	0.01291	0.127225
0.016628	0.923778	0.0	0.059594
0.120822	0.034999	0.844179	0.0
0.018919	0.591536	0.056171	0.333373
0.09083	0.021864	0.873496	0.01381
0.017267	0.842162	0.053818	0.086753
0.774461	0.04294	0.01147	0.171129
0.0	0.224446	0.628079	0.147475

MOTIF	Heart_E11.5_H3K4me2_29_38_0.595_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.013321	0.026599	0.938076	0.022005
0.033061	0.672245	0.027293	0.2674
0.10664	0.012165	0.754232	0.126963
0.039082	0.882723	0.02202	0.056175
0.074527	0.012012	0.843639	0.069822
0.168582	0.023124	0.794536	0.013758
0.065105	0.535838	0.07098	0.328078
0.0	0.004481	0.987829	0.00769
0.977854	0.0	0.0	0.022146

MOTIF	Limb_E11.5_H3K4me2_19_18_0.650_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.004203	0.0	0.995797	0.0
0.156409	0.734679	0.020301	0.088611
0.075908	0.013737	0.701376	0.20898
0.13725	0.672856	0.02809	0.161805
0.054564	0.040629	0.880138	0.024669
0.07802	0.010967	0.909131	0.001882
0.073754	0.662811	0.043922	0.219513
0.0	0.057485	0.930634	0.011882
0.856084	0.031547	0.037138	0.075232
0.047318	0.460779	0.289719	0.202183

MOTIF	Kidney_E16.5_H3K4me2_23_31_0.629_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0078	0.0	0.985352	0.006848
0.057336	0.754181	0.037959	0.150524
0.215089	0.0	0.776585	0.008326
0.13078	0.652901	0.041235	0.175085
0.054062	0.02698	0.904306	0.014652
0.140663	0.046657	0.793137	0.019543
0.0	0.848327	0.054922	0.096751
0.0	0.064789	0.926714	0.008497
0.899785	0.0	0.019357	0.080859

MOTIF	Neural-Tube_E15.5_H3K4me2_7_38_0.664_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.209147	0.022171	0.768682	0.0
0.029687	0.844588	0.027581	0.098143
0.158646	0.022024	0.805805	0.013525
0.147315	0.831176	0.0	0.021509
0.041559	0.011534	0.914573	0.032334
0.307466	0.085055	0.607479	0.0
0.053193	0.815111	0.024447	0.107249
0.0	0.050649	0.941357	0.007994
0.922782	0.0	0.0	0.077218

MOTIF	Forebrain_P0_H3K4me3_37_49_0.659_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.012171	0.033789	0.941647	0.012393
0.056346	0.682387	0.037091	0.224176
0.209242	0.030232	0.741278	0.019248
0.119192	0.565745	0.037443	0.277619
0.037484	0.016736	0.92588	0.0199
0.009639	0.034701	0.950016	0.005644
0.091973	0.6177	0.031354	0.258973
0.0	0.027523	0.963077	0.0094
0.927514	0.0	0.0	0.072486

MOTIF	Neural-Tube_E12.5_H3K4me3_25_17_0.686_9.08682e-312
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.02693	0.0	0.95891	0.014161
0.031151	0.926024	0.024774	0.018051
0.116092	0.021603	0.848223	0.014083
0.207561	0.486054	0.026577	0.279808
0.034971	0.021747	0.936384	0.006897
0.141847	0.053362	0.797841	0.00695
0.047539	0.56515	0.093745	0.293566
0.0	0.050997	0.937161	0.011843
0.875637	0.0	0.038252	0.086111
0.10408	0.264702	0.614784	0.016434
0.515375	0.377377	0.107248	0.0

MOTIF	Cranio-Facial_E15.5_H3K9ac_16_23_0.680_1.735817e-314
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.025691	0.023247	0.937362	0.013701
0.224051	0.68942	0.020308	0.066221
0.006429	0.033598	0.781866	0.178107
0.16776	0.691925	0.017327	0.122988
0.051597	0.040273	0.864222	0.043909
0.00634	0.078951	0.909991	0.004718
0.024742	0.59973	0.05373	0.321798
0.0	0.0	1.0	0.0
0.817253	0.072129	0.0	0.110618

MOTIF	Limb_E13.5_H3K9ac_17_21_0.602_5.928788e-322
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.008668	0.0	0.983138	0.008194
0.0	0.970634	0.0	0.029366
0.199958	0.029985	0.543004	0.227053
0.110058	0.79334	0.039836	0.056765
0.045238	0.044992	0.791139	0.118631
0.088535	0.043876	0.858211	0.009378
0.046324	0.88223	0.0	0.071445
0.0	0.042837	0.922945	0.034218
0.824042	0.02737	0.059499	0.089088
0.0	0.318849	0.66539	0.015761