MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Limb_E11.5_H3K4me2_64_173_0.562_4.56479e-83
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.139	0.588	0.143	0.13
0.16	0.13	0.549	0.161
0.59	0.119	0.171	0.12
0.678	0.087	0.147	0.088
0.576	0.134	0.139	0.151
0.128	0.609	0.117	0.146
0.166	0.059	0.166	0.609
0.148	0.118	0.6	0.134
0.173	0.624	0.148	0.055
0.582	0.141	0.127	0.15

MOTIF	Midbrain_P0_H3K4me2_64_165_0.559_3.86892e-84
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.35	0.016	0.102	0.532
0.206	0.027	0.484	0.284
0.179	0.556	0.028	0.237
0.57	0.097	0.018	0.315
0.296	0.175	0.335	0.194
0.37	0.167	0.021	0.443
0.027	0.108	0.011	0.854
0.22	0.047	0.014	0.719
0.483	0.105	0.121	0.291
0.33	0.271	0.236	0.162

MOTIF	Neural-Tube_E12.5_H3K4me2_61_166_0.564_3.237489e-150
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1

MOTIF	Cranio-Facial_E15.5_H3K27me3_20_164_0.528_5.656802e-13
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.115	0.651	0.119	0.115
0.13	0.132	0.611	0.127
0.693	0.113	0.094	0.1
0.697	0.108	0.077	0.118
0.105	0.078	0.09	0.727
0.083	0.1	0.081	0.736
0.106	0.079	0.084	0.731
0.092	0.094	0.716	0.098
0.106	0.703	0.103	0.088
0.736	0.092	0.077	0.095

MOTIF	Forebrain_E11.5_H3K27me3_24_170_0.531_2.750451e-16
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.094	0.102	0.09	0.714
0.09	0.111	0.679	0.12
0.098	0.708	0.106	0.088
0.748	0.073	0.088	0.091
0.763	0.083	0.089	0.065
0.695	0.111	0.093	0.101
0.102	0.087	0.109	0.702
0.081	0.111	0.113	0.695
0.125	0.616	0.135	0.124
0.105	0.115	0.678	0.102

MOTIF	Liver_P0_H3K27me3_34_167_0.540_1.872858e-20
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.117	0.657	0.115	0.111
0.125	0.11	0.642	0.123
0.673	0.122	0.129	0.076
0.684	0.118	0.089	0.109
0.091	0.076	0.102	0.731
0.068	0.11	0.082	0.74
0.092	0.076	0.061	0.771
0.094	0.098	0.704	0.104
0.118	0.676	0.111	0.095
0.72	0.074	0.099	0.107

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K4me1_9_156_0.556_3.660008e-155
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.095	0.767	0.038	0.1
0.11	0.068	0.656	0.166
0.75	0.136	0.061	0.053
0.742	0.076	0.056	0.126
0.088	0.003	0.007	0.902
0.005	0.05	0.039	0.906
0.084	0.027	0.084	0.805
0.074	0.095	0.769	0.062
0.066	0.834	0.062	0.038
0.87	0.057	0.021	0.052

MOTIF	Hindbrain_E14.5_H3K27me3_31_165_0.530_2.44989e-12
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.034	0.05	0.032	0.884
0.033	0.076	0.825	0.066
0.082	0.799	0.069	0.05
0.838	0.062	0.06	0.04
0.883	0.038	0.047	0.032
0.755	0.051	0.085	0.109
0.104	0.08	0.053	0.763
0.05	0.104	0.088	0.758
0.131	0.711	0.095	0.063
0.099	0.053	0.784	0.064

MOTIF	Midbrain_E11.5_H3K4me2_59_173_0.594_4.21418e-185
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.114	0.691	0.098	0.097
0.122	0.098	0.682	0.098
0.709	0.109	0.13	0.052
0.655	0.132	0.101	0.112
0.054	0.142	0.081	0.723
0.123	0.027	0.077	0.773
0.113	0.071	0.115	0.701
0.094	0.122	0.113	0.671
0.14	0.62	0.109	0.131
0.774	0.104	0.001	0.121

MOTIF	Forebrain_P0_H3K4me2_13_152_0.652_1.563183e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.365	0.001	0.229	0.405
0.294	0.119	0.291	0.297
0.334	0.429	0.236	0.001
0.438	0.155	0.185	0.222
0.829	0.001	0.169	0.001
0.997	0.001	0.001	0.001
0.311	0.078	0.244	0.368
0.133	0.274	0.272	0.321
0.058	0.94	0.001	0.001
0.001	0.001	0.997	0.001

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K4me2_20_156_0.646_2.395685e-313
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.342	0.001	0.175	0.482
0.25	0.151	0.368	0.232
0.178	0.44	0.175	0.207
0.44	0.007	0.278	0.275
0.748	0.002	0.249	0.001
0.882	0.001	0.001	0.116
0.426	0.001	0.158	0.415
0.137	0.279	0.231	0.353
0.124	0.64	0.059	0.177
0.052	0.048	0.849	0.051

MOTIF	Midbrain_E16.5_H3K4me2_35_161_0.608_2.310056e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.251	0.001	0.1	0.648
0.112	0.179	0.498	0.211
0.187	0.514	0.05	0.249
0.41	0.059	0.299	0.232
0.672	0.008	0.28	0.04
0.833	0.109	0.008	0.05
0.299	0.025	0.167	0.509
0.008	0.363	0.189	0.441
0.193	0.576	0.075	0.156
0.156	0.087	0.733	0.024

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K4me2_33_155_0.595_8.209908e-256
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.115	0.065	0.072	0.748
0.038	0.045	0.83	0.087
0.176	0.553	0.105	0.166
0.756	0.003	0.058	0.183
0.96	0.001	0.038	0.001
0.8	0.024	0.001	0.175
0.148	0.089	0.087	0.676
0.158	0.322	0.177	0.343
0.199	0.692	0.039	0.07
0.049	0.001	0.886	0.064

MOTIF	Stomach_P0_H3K4me2_50_165_0.567_3.386091e-110
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.069	0.06	0.039	0.832
0.064	0.086	0.801	0.049
0.084	0.757	0.055	0.104
0.834	0.075	0.031	0.06
0.854	0.033	0.06	0.053
0.834	0.048	0.035	0.083
0.067	0.052	0.116	0.765
0.089	0.067	0.101	0.743
0.104	0.778	0.048	0.07
0.048	0.062	0.801	0.089

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K4me3_60_166_0.590_2.034017e-160
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.054	0.048	0.045	0.853
0.069	0.118	0.744	0.069
0.776	0.079	0.084	0.061
0.808	0.062	0.054	0.076
0.819	0.049	0.06	0.072
0.793	0.072	0.092	0.043
0.047	0.032	0.06	0.861
0.061	0.069	0.093	0.777
0.075	0.789	0.053	0.083
0.083	0.067	0.781	0.069

MOTIF	Midbrain_E15.5_H3K4me3_63_171_0.602_2.956935e-170
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.034	0.05	0.068	0.848
0.08	0.076	0.777	0.067
0.76	0.094	0.081	0.065
0.795	0.062	0.058	0.085
0.828	0.055	0.056	0.061
0.821	0.061	0.06	0.058
0.085	0.043	0.106	0.766
0.055	0.072	0.064	0.809
0.062	0.807	0.051	0.08
0.081	0.052	0.789	0.078

MOTIF	Cranio-Facial_E14.5_H3K9ac_13_167_0.631_1.482898e-312
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.133	0.668	0.049	0.15
0.121	0.072	0.701	0.106
0.406	0.18	0.283	0.13
0.14	0.497	0.167	0.196
0.01	0.088	0.208	0.694
0.004	0.073	0.048	0.875
0.04	0.157	0.018	0.785
0.086	0.239	0.213	0.461
0.129	0.684	0.085	0.102
0.126	0.147	0.596	0.131

MOTIF	Kidney_E14.5_H3K9ac_35_156_0.608_1.865654e-230
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.14	0.679	0.117	0.064
0.127	0.012	0.764	0.097
0.551	0.092	0.217	0.14
0.247	0.496	0.224	0.033
0.006	0.344	0.052	0.598
0.001	0.031	0.014	0.954
0.001	0.042	0.028	0.929
0.053	0.288	0.186	0.473
0.095	0.75	0.033	0.122
0.261	0.122	0.528	0.089

MOTIF	Kidney_E16.5_H3K9ac_32_162_0.572_5.614026e-134
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.13	0.652	0.115	0.103
0.133	0.117	0.612	0.138
0.581	0.124	0.166	0.129
0.572	0.142	0.14	0.146
0.114	0.138	0.122	0.626
0.09	0.121	0.119	0.67
0.137	0.146	0.125	0.592
0.15	0.138	0.153	0.559
0.16	0.545	0.14	0.155
0.591	0.139	0.122	0.148

MOTIF	Lung_E14.5_H3K9ac_37_158_0.601_4.246212e-200
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.137	0.007	0.143	0.713
0.22	0.142	0.513	0.125
0.547	0.151	0.089	0.213
0.872	0.062	0.044	0.022
0.976	0.001	0.022	0.001
0.886	0.04	0.05	0.024
0.12	0.206	0.043	0.631
0.214	0.194	0.08	0.512
0.068	0.773	0.029	0.13
0.048	0.031	0.836	0.085

MOTIF	Forebrain_P0_H3K9ac_45_160_0.587_1.471969e-129
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.326	0.068	0.091	0.515
0.143	0.046	0.562	0.249
0.267	0.532	0.055	0.146
0.605	0.031	0.112	0.252
0.675	0.044	0.247	0.034
0.905	0.013	0.032	0.05
0.331	0.106	0.132	0.431
0.063	0.365	0.212	0.361
0.197	0.567	0.055	0.181
0.14	0.008	0.723	0.129

MOTIF	Hindbrain_P0_H3K9ac_53_171_0.578_1.001767e-139
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.151	0.134	0.123	0.592
0.135	0.136	0.575	0.154
0.132	0.61	0.122	0.136
0.58	0.128	0.152	0.14
0.627	0.115	0.146	0.112
0.605	0.123	0.132	0.14
0.148	0.133	0.131	0.588
0.12	0.152	0.124	0.604
0.148	0.601	0.121	0.13
0.128	0.128	0.615	0.129

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K9ac_36_158_0.604_6.983521e-188
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.171	0.036	0.066	0.727
0.17	0.106	0.551	0.173
0.142	0.59	0.093	0.175
0.714	0.03	0.124	0.132
0.861	0.01	0.109	0.02
0.795	0.034	0.029	0.142
0.191	0.098	0.08	0.631
0.078	0.168	0.042	0.712
0.158	0.682	0.072	0.088
0.083	0.07	0.782	0.065

MOTIF	Neural-Tube_E11.5_H3K9ac_46_162_0.582_8.700706e-109
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.216	0.073	0.087	0.624
0.113	0.091	0.55	0.246
0.24	0.559	0.136	0.065
0.832	0.035	0.049	0.084
0.713	0.051	0.2	0.036
0.72	0.072	0.04	0.168
0.206	0.143	0.156	0.494
0.093	0.236	0.164	0.507
0.201	0.577	0.049	0.173
0.129	0.087	0.657	0.127