MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Cranio-Facial_E13.5_H3K4me3_42_51_0.631_4.511956e-319
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.036027	0.049231	0.814982	0.09976
0.009404	0.047673	0.936106	0.006816
0.05684	0.911682	0.008928	0.022549
0.066185	0.0	0.895357	0.038457
0.181731	0.078965	0.698175	0.041129
0.135829	0.807071	0.048528	0.008572
0.034003	0.695477	0.018776	0.251743
0.028161	0.951214	0.001112	0.019513
0.219066	0.599266	0.036761	0.144907

MOTIF	Kidney_E16.5_H3K4me3_25_50_0.664_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.575324	0.175829	0.108569	0.140277
0.020044	0.015253	0.964703	0.0
0.0	0.038749	0.929517	0.031734
0.123949	0.018702	0.857349	0.0
0.0	0.0	1.0	0.0
0.35481	0.289838	0.115285	0.240067
0.0	1.0	0.0	0.0
0.015707	0.0	0.984293	0.0
0.0	0.944673	0.055327	0.0

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K9ac_41_23_0.583_6.345229e-232
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.553012	0.262516	0.038149	0.146324
0.0135	0.810233	0.043172	0.133095
0.076637	0.0649	0.684103	0.174361
0.009612	0.048892	0.891844	0.049651
0.131467	0.690129	0.019179	0.159226
0.209048	0.053289	0.691684	0.045979
0.016857	0.0075	0.924035	0.051608
0.016595	0.940594	0.025028	0.017784
0.01424	0.831203	0.043596	0.110961
0.085733	0.850279	0.008059	0.055929
0.026216	0.546679	0.290633	0.136471

MOTIF	Kidney_E16.5_H3K9ac_25_19_0.583_1.68921e-315
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.165737	0.784459	0.049804	0.0
0.02069	0.064007	0.829718	0.085586
0.004707	0.058904	0.926748	0.009641
0.029545	0.732014	0.062196	0.176245
0.023717	0.074286	0.845772	0.056225
0.304927	0.034311	0.612613	0.048149
0.007303	0.635908	0.030126	0.326663
0.024535	0.936567	0.022562	0.016336
0.043969	0.912825	0.017245	0.025961
0.0	1.0	0.0	0.0
0.044219	0.048295	0.44392	0.463566

MOTIF	Heart_E15.5_H3K9ac_43_61_0.586_1.866953e-282
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.199581	0.0	0.750888	0.049531
0.008871	0.0	0.984137	0.006992
0.027086	0.891738	0.038783	0.042393
0.036381	0.016541	0.906255	0.040823
0.196341	0.0	0.449147	0.354512
0.0	0.930704	0.05065	0.018646
0.021828	0.742431	0.008915	0.226825
0.062893	0.853196	0.006483	0.077429
0.009658	0.893966	0.059738	0.036638

MOTIF	Lung_E15.5_H3K9ac_46_75_0.601_5.292563e-197
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.048735	0.029805	0.863545	0.057915
0.0	0.03761	0.94372	0.01867
0.00956	0.972767	0.0	0.017672
0.147236	0.0	0.807573	0.045191
0.057694	0.021167	0.562029	0.35911
0.168751	0.601619	0.020706	0.208924
0.07605	0.846175	0.023402	0.054373
0.060153	0.860569	0.007248	0.072029
0.032899	0.917091	0.018907	0.031102

MOTIF	Liver_E15.5_H3K9ac_26_11_0.608_3.714799e-314
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.030553	0.868565	0.066219	0.034662
0.102854	0.06047	0.702716	0.133959
0.002891	0.006833	0.952843	0.037433
0.023706	0.844093	0.038244	0.093957
0.094464	0.070651	0.800374	0.034511
0.072429	0.038189	0.824204	0.065178
0.041713	0.842848	0.045653	0.069786
0.114098	0.602764	0.063867	0.219271
0.040269	0.838231	0.068576	0.052924
0.316912	0.198859	0.143367	0.340862

MOTIF	Stomach_E15.5_H3K9ac_20_24_0.673_7.018297e-315
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.094765	0.81802	0.087215	0.0
0.107119	0.09002	0.75652	0.04634
0.0	0.072151	0.91883	0.009019
0.131254	0.7781	0.010532	0.080114
0.029203	0.055242	0.879908	0.035647
0.055628	0.0	0.869544	0.074828
0.017188	0.773408	0.022458	0.186946
0.066014	0.702854	0.0	0.231132
0.064731	0.782618	0.007661	0.14499

MOTIF	Forebrain_E11.5_H3K9ac_37_29_0.598_3.933501e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.1714	0.761212	0.032499	0.034888
0.033495	0.0	0.905951	0.060554
0.004607	0.026752	0.963999	0.004642
0.062675	0.719178	0.050548	0.167598
0.096371	0.036448	0.845095	0.022086
0.24145	0.011819	0.493314	0.253418
0.001948	0.928379	0.050381	0.019292
0.03641	0.843779	0.0212	0.098611
0.051887	0.873462	0.014631	0.06002

MOTIF	Heart_E16.5_H3K9ac_24_23_0.575_2.582576e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.127505	0.835863	0.009514	0.027119
0.035661	0.023809	0.859222	0.081308
0.005284	0.008691	0.978507	0.007518
0.236255	0.56358	0.07954	0.120625
0.139691	0.034561	0.779548	0.046199
0.16959	0.022998	0.57996	0.227452
0.013095	0.916745	0.019355	0.050805
0.035204	0.85316	0.033267	0.078369
0.039635	0.855885	0.064571	0.03991

MOTIF	Kidney_E14.5_H3K9ac_26_30_0.626_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.045332	0.897599	0.039761	0.017308
0.025964	0.002542	0.921063	0.050431
0.002962	0.027577	0.9568	0.012661
0.027903	0.73637	0.08169	0.154036
0.117556	0.038435	0.811278	0.032731
0.178548	0.047336	0.507718	0.266397
0.081776	0.743098	0.041725	0.133402
0.037677	0.889521	0.004342	0.06846
0.061878	0.834915	0.047078	0.056129

MOTIF	Lung_P0_H3K9ac_26_33_0.643_7.792803e-317
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.162133	0.726248	0.040125	0.071494
0.041646	0.028063	0.859081	0.07121
0.011352	0.029077	0.950258	0.009314
0.050701	0.804167	0.012134	0.132998
0.024061	0.05254	0.879764	0.043635
0.154748	0.04838	0.460892	0.335979
0.035741	0.777921	0.038562	0.147776
0.03264	0.906002	0.025172	0.036186
0.073461	0.859783	0.011264	0.055492

MOTIF	Stomach_E14.5_H3K9ac_25_26_0.671_1.182158e-315
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.082841	0.850518	0.056491	0.010149
0.053287	0.021923	0.865786	0.059004
0.0	0.0553	0.936763	0.007938
0.058604	0.7492	0.060533	0.131663
0.008854	0.046638	0.918452	0.026056
0.231022	0.008251	0.543745	0.216983
0.099106	0.797021	0.020638	0.083235
0.023735	0.914805	0.0	0.06146
0.160973	0.732853	0.007298	0.098876

MOTIF	Stomach_E16.5_H3K9ac_31_17_0.582_3.612483e-314
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.092971	0.7533	0.129541	0.024188
0.064428	0.0	0.907327	0.028245
0.005466	0.019016	0.970598	0.00492
0.030049	0.852488	0.078878	0.038585
0.006849	0.0	0.928611	0.06454
0.134197	0.0	0.470356	0.395448
0.05082	0.87233	0.0	0.07685
0.037322	0.890092	0.0	0.072586
0.179804	0.781282	0.007329	0.031585

MOTIF	Heart_E13.5_H3K9ac_29_13_0.559_6.046341e-286
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.012908	0.935417	0.033557	0.018117
0.138264	0.705204	0.024189	0.132343
0.014919	0.018194	0.853636	0.113252
0.151619	0.063035	0.729928	0.055419
0.058953	0.024381	0.902003	0.014663
0.055662	0.885895	0.042388	0.016055
0.289366	0.455412	0.165337	0.089886
0.037251	0.013893	0.888207	0.060649
0.050083	0.889005	0.044672	0.01624
0.300633	0.265359	0.0	0.434008

MOTIF	Hindbrain_E11.5_H3K9ac_41_19_0.589_3.821581e-260
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.118368	0.80573	0.043093	0.032809
0.160827	0.034057	0.723586	0.08153
0.124632	0.00833	0.825574	0.041464
0.005338	0.009461	0.963268	0.021933
0.144771	0.703622	0.027119	0.124488
0.068825	0.787004	0.021927	0.122244
0.064601	0.014944	0.711656	0.2088
0.021947	0.904563	0.037372	0.036117
0.055009	0.906532	0.008143	0.030317
0.22914	0.207439	0.296479	0.266942

MOTIF	Lung_E16.5_H3K9ac_34_12_0.580_1.392449e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.118241	0.804445	0.044284	0.033031
0.078103	0.042447	0.699734	0.179716
0.13405	0.010238	0.838345	0.017367
0.049364	0.044857	0.884675	0.021104
0.105951	0.778194	0.035656	0.080199
0.157458	0.755454	0.031465	0.055623
0.056031	0.032591	0.753828	0.157549
0.029629	0.872694	0.07454	0.023137
0.04036	0.863374	0.046506	0.04976
0.23988	0.18836	0.214794	0.356966

MOTIF	Midbrain_E11.5_H3K9ac_32_15_0.601_2.748274e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.068356	0.793737	0.113465	0.024442
0.100901	0.060908	0.775065	0.063126
0.138916	0.034553	0.811647	0.014884
0.043944	0.033784	0.898988	0.023285
0.10318	0.797433	0.022303	0.077084
0.169023	0.649979	0.035632	0.145366
0.051975	0.044213	0.771229	0.132584
0.012547	0.903864	0.074354	0.009234
0.109307	0.790184	0.049931	0.050578
0.019911	0.448271	0.134757	0.397062

MOTIF	Limb_E13.5_H3K9ac_30_15_0.584_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.113682	0.814853	0.035897	0.035567
0.091664	0.03948	0.69493	0.173926
0.048851	0.008854	0.926625	0.01567
0.02892	0.033452	0.902328	0.035301
0.151046	0.776904	0.042214	0.029836
0.079256	0.758587	0.02029	0.141866
0.085913	0.015733	0.728404	0.169949
0.007836	0.896259	0.049856	0.046049
0.118724	0.667604	0.099958	0.113713

MOTIF	Midbrain_E14.5_H3K9ac_21_16_0.610_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.100422	0.800403	0.070968	0.028206
0.082187	0.055007	0.810702	0.052105
0.114801	0.018896	0.838203	0.028099
0.025444	0.034795	0.873292	0.06647
0.156535	0.698525	0.027384	0.117556
0.100802	0.79593	0.058423	0.044844
0.042049	0.021019	0.791151	0.145781
0.008118	0.932414	0.046577	0.012891
0.060366	0.734404	0.06971	0.13552

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K9ac_19_14_0.606_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.118146	0.720936	0.093652	0.067266
0.123433	0.012133	0.80219	0.062244
0.005728	0.03049	0.961476	0.002306
0.048604	0.840689	0.034798	0.075909
0.09697	0.037885	0.800922	0.064222
0.099423	0.006947	0.772189	0.12144
0.006116	0.954444	0.020774	0.018666
0.022554	0.756985	0.062463	0.157999
0.131315	0.667715	0.046338	0.154632

MOTIF	Limb_E14.5_H3K9ac_11_8_0.634_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.082615	0.880573	0.025261	0.01155
0.090331	0.035325	0.735332	0.139011
0.124556	0.076347	0.793032	0.006065
0.013946	0.025661	0.913658	0.046736
0.170063	0.694873	0.03434	0.100725
0.050525	0.82025	0.045853	0.083373
0.093303	0.009676	0.829464	0.067557
0.018927	0.894399	0.065892	0.020782
0.082032	0.705421	0.074636	0.137911
0.249324	0.191683	0.39731	0.161683

MOTIF	Neural-Tube_E11.5_H3K9ac_8_11_0.635_1.289605e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.020527	0.964409	0.011964	0.0031
0.081879	0.055723	0.71774	0.144658
0.107751	0.051932	0.8117	0.028616
0.088501	0.02246	0.853368	0.035671
0.180887	0.656992	0.070945	0.091176
0.057211	0.853203	0.047109	0.042477
0.083803	0.019203	0.812845	0.084149
0.002695	0.929063	0.061475	0.006767
0.094476	0.748843	0.050475	0.106206
0.121653	0.16562	0.566045	0.146682

MOTIF	Stomach_P0_H3K9ac_21_27_0.605_3.511962e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.033359	0.928313	0.015986	0.022342
0.032058	0.004804	0.815888	0.14725
0.009631	0.0	0.98685	0.00352
0.27927	0.401049	0.050181	0.269499
0.037234	0.050945	0.906908	0.004913
0.226391	0.079985	0.636126	0.057498
0.023883	0.945267	0.02423	0.00662
0.02114	0.837263	0.0	0.141597
0.036798	0.821019	0.061806	0.080378
0.0	0.051768	0.948232	0.0