MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K4me1_22_90_0.539_5.627852e-93
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.805022	0.079395	0.080723	0.03486
0.884883	0.059402	0.050209	0.005507
0.038277	0.872574	0.011422	0.077727
0.636568	0.121819	0.241613	0.0
0.006855	0.231372	0.65485	0.106924
0.019875	0.96137	0.016302	0.002452
0.017247	0.116107	0.034439	0.832207
0.07467	0.152933	0.754064	0.018333
0.0	0.97491	0.006219	0.018871

MOTIF	Limb_E12.5_H3K4me1_4_135_0.550_1.888087e-211
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.798207	0.009588	0.063294	0.128911
0.828874	0.06485	0.050383	0.055893
0.96541	0.02618	0.004102	0.004308
0.036982	0.901453	0.006675	0.054891
0.834662	0.01375	0.144461	0.007127
0.002071	0.106356	0.77401	0.117563
0.173327	0.803456	0.008268	0.014949
0.076069	0.218625	0.055027	0.650279
0.05876	0.199344	0.689285	0.052612

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K4me1_8_163_0.549_2.708403e-205
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.137	0.311	0.484	0.068
0.585	0.084	0.151	0.18
0.274	0.023	0.67	0.033
0.01	0.958	0.019	0.013
0.657	0.011	0.118	0.214
0.032	0.006	0.811	0.151
0.232	0.718	0.023	0.027
0.015	0.015	0.016	0.954
0.132	0.039	0.76	0.069
0.026	0.174	0.215	0.585
0.026	0.272	0.182	0.52
0.295	0.157	0.049	0.498

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K4me1_29_168_0.534_8.796768e-64
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.09	0.117	0.714	0.079
0.746	0.059	0.109	0.086
0.096	0.072	0.765	0.067
0.1	0.721	0.101	0.078
0.775	0.056	0.061	0.108
0.091	0.067	0.754	0.088
0.098	0.738	0.08	0.084
0.081	0.058	0.063	0.798
0.073	0.087	0.746	0.094
0.076	0.095	0.085	0.744
0.06	0.092	0.098	0.75
0.082	0.079	0.088	0.751

MOTIF	Hindbrain_E15.5_H3K4me1_13_168_0.544_5.225839e-154
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.123	0.197	0.606	0.074
0.682	0.02	0.183	0.115
0.139	0.011	0.847	0.003
0.144	0.737	0.067	0.052
0.741	0.006	0.077	0.176
0.019	0.009	0.826	0.146
0.099	0.754	0.057	0.09
0.105	0.049	0.043	0.803
0.091	0.121	0.643	0.145
0.084	0.112	0.064	0.74
0.035	0.159	0.083	0.723
0.111	0.012	0.044	0.833

MOTIF	Neural-Tube_E12.5_H3K4me1_21_165_0.536_8.955346e-75
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.182	0.197	0.499	0.122
0.499	0.023	0.392	0.086
0.101	0.103	0.781	0.015
0.062	0.836	0.094	0.008
0.776	0.026	0.037	0.161
0.184	0.023	0.635	0.158
0.244	0.589	0.057	0.11
0.01	0.031	0.001	0.958
0.005	0.14	0.835	0.02
0.059	0.223	0.045	0.673
0.028	0.135	0.137	0.7
0.156	0.094	0.067	0.683

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K4me1_24_126_0.538_4.18107e-90
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.937894	0.0	0.05123	0.010876
0.286277	0.590292	0.025804	0.097626
0.932275	0.029383	0.038343	0.0
0.015236	0.046137	0.740017	0.19861
0.030738	0.946956	0.0	0.022306
0.076622	0.0645	0.03228	0.826599
0.134937	0.040981	0.824082	0.0
0.051515	0.864182	0.003463	0.08084
0.0	0.0	0.121749	0.878251

MOTIF	Hindbrain_P0_H3K4me1_21_75_0.531_8.537976e-38
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.915876	0.010842	0.059613	0.013669
0.038869	0.864911	0.092786	0.003434
0.925107	0.018144	0.056749	0.0
0.002172	0.015442	0.896968	0.085418
0.2376	0.710523	0.008829	0.043048
0.009659	0.099648	0.145632	0.74506
0.046628	0.354936	0.587351	0.011085
0.049526	0.8272	0.048744	0.074531
0.038476	0.098151	0.079186	0.784187

MOTIF	Lung_P0_H3K4me1_22_87_0.527_1.2826e-45
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.878754	0.050885	0.058726	0.011635
0.025629	0.936746	0.014841	0.022785
0.947706	0.029799	0.022495	0.0
0.006352	0.025684	0.962727	0.005238
0.25128	0.707006	0.041713	0.0
0.047654	0.038962	0.30473	0.608654
0.111388	0.018621	0.860118	0.009873
0.250351	0.654232	0.007787	0.087629
0.0	0.180926	0.180349	0.638725
0.015198	0.0	0.0	0.984802

MOTIF	Limb_E13.5_H3K4me1_9_92_0.540_5.71641e-164
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.857278	0.075169	0.058593	0.00896
0.033826	0.892191	0.026204	0.047779
0.959797	0.027834	0.012369	0.0
0.0	0.019954	0.938275	0.041771
0.029086	0.936291	0.025763	0.008861
0.020819	0.203644	0.04616	0.729378
0.117347	0.064156	0.76126	0.057238
0.007729	0.45833	0.305942	0.227999
0.09485	0.077622	0.011635	0.815893

MOTIF	Midbrain_P0_H3K4me1_37_115_0.526_1.77439e-28
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.876965	0.0	0.080859	0.042176
0.0	0.920512	0.0	0.079488
0.910373	0.02415	0.065477	0.0
0.0	0.415419	0.572188	0.012393
0.0	0.825949	0.053109	0.120942
0.01223	0.028225	0.168329	0.791217
0.061834	0.026124	0.849401	0.062641
0.0	0.885237	0.104683	0.01008
0.051396	0.108791	0.009646	0.830167

MOTIF	Midbrain_E16.5_H3K4me1_44_92_0.522_6.776846e-42
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.878825	0.081551	0.0	0.039624
0.11716	0.734476	0.077557	0.070807
0.909435	0.041409	0.047703	0.001453
0.008918	0.186424	0.800988	0.003669
0.172569	0.789347	0.024229	0.013855
0.083946	0.062902	0.127437	0.725715
0.03928	0.00463	0.934837	0.021253
0.007405	0.812623	0.140854	0.039117
0.006639	0.142626	0.042211	0.808523
0.297256	0.449805	0.061603	0.191336

MOTIF	Neural-Tube_E14.5_H3K4me1_37_99_0.524_9.451533e-29
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.898612	0.034807	0.047933	0.018647
0.053585	0.857129	0.028597	0.060689
0.917723	0.024862	0.051153	0.006262
0.008134	0.203999	0.753901	0.033966
0.221321	0.686486	0.037423	0.054769
0.062688	0.027732	0.158604	0.750976
0.02786	0.006196	0.953036	0.012909
0.022995	0.764202	0.158733	0.05407
0.049697	0.099161	0.03162	0.819522

MOTIF	Midbrain_E12.5_H3K27me3_40_76_0.508_6.74319e-05
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.157297	0.634777	0.201129	0.006797
0.877586	0.074504	0.025351	0.022559
0.019685	0.016413	0.953415	0.010487
0.020073	0.577183	0.376121	0.026622
0.92512	0.030463	0.044418	0.0
0.027872	0.040247	0.898976	0.032905
0.032806	0.627598	0.339596	0.0
0.063321	0.052706	0.044902	0.839071
0.036301	0.030488	0.879707	0.053503
0.390871	0.083738	0.066243	0.459148

MOTIF	Heart_E14.5_H3K27me3_61_92_0.502_0.005297515
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.005493	0.707594	0.286914	0.0
0.85411	0.07843	0.051187	0.016274
0.020096	0.017094	0.944096	0.018715
0.007484	0.612532	0.337284	0.0427
0.894401	0.029272	0.056302	0.020025
0.021158	0.30745	0.671393	0.0
0.014336	0.941318	0.044346	0.0
0.069635	0.046623	0.050492	0.833251
0.059713	0.083323	0.856964	0.0

MOTIF	Limb_E13.5_H3K27me3_23_75_0.515_2.995898e-28
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.059882	0.679891	0.253363	0.006865
0.787723	0.116303	0.047603	0.04837
0.010883	0.094964	0.851281	0.042872
0.035081	0.860763	0.073377	0.030779
0.875232	0.070161	0.053876	0.000732
0.009053	0.096161	0.799957	0.094829
0.002569	0.737209	0.260222	0.0
0.087246	0.131408	0.037906	0.74344
0.115912	0.23577	0.56181	0.086508

MOTIF	Neural-Tube_E15.5_H3K27me3_34_63_0.513_1.616093e-10
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.119117	0.674707	0.169603	0.036573
0.65339	0.102958	0.149836	0.093815
0.023287	0.143963	0.803994	0.028756
0.034143	0.753909	0.161255	0.050693
0.893913	0.059849	0.029945	0.016292
0.00558	0.127593	0.804915	0.061912
0.015335	0.903837	0.063365	0.017464
0.062696	0.154981	0.059073	0.723249
0.086457	0.170805	0.701987	0.040751
0.000147	0.002797	0.25428	0.742776

MOTIF	Cranio-Facial_E12.5_H3K9me3_24_131_0.525_1.432947e-15
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.250363	0.414919	0.323392	0.011327
0.713425	0.005828	0.17152	0.109227
0.160585	0.252721	0.58353	0.003164
0.025504	0.904	0.056745	0.013751
0.958448	0.008989	0.004379	0.028184
0.04386	0.04548	0.85372	0.056941
0.013103	0.983604	0.0	0.003292
0.037317	0.022038	0.025404	0.915242
0.008625	0.016495	0.939204	0.035676

MOTIF	Forebrain_E16.5_H3K9me3_28_82_0.529_2.439836e-18
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.07784	0.780288	0.089336	0.052536
0.761521	0.035138	0.0654	0.137942
0.030342	0.190872	0.762978	0.015808
0.135837	0.737473	0.053122	0.073568
0.844808	0.051548	0.091656	0.011987
0.138981	0.093295	0.691061	0.076662
0.016947	0.792858	0.060574	0.12962
0.302788	0.043645	0.108555	0.545011
0.020551	0.148689	0.805676	0.025084

MOTIF	Limb_E15.5_H3K9me3_18_144_0.522_2.29232e-05
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.169087	0.620793	0.109183	0.100938
0.762011	0.022311	0.153984	0.061693
0.160349	0.007478	0.814999	0.017174
0.098205	0.819713	0.03835	0.043732
0.903693	0.03072	0.028595	0.036992
0.087946	0.010255	0.867157	0.034642
0.045874	0.814108	0.124627	0.01539
0.099184	0.05597	0.021073	0.823772
0.014938	0.144645	0.717358	0.123059

MOTIF	Midbrain_P0_H3K9me3_59_72_0.518_4.207402e-06
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.20561	0.575665	0.184839	0.033887
0.645131	0.088878	0.096651	0.169339
0.10958	0.036645	0.741681	0.112094
0.085866	0.781188	0.115903	0.017042
0.909666	0.072854	0.004275	0.013205
0.021641	0.046229	0.786646	0.145484
0.028566	0.826743	0.113343	0.031347
0.277309	0.038538	0.024715	0.659437
0.083567	0.01705	0.822036	0.077346

MOTIF	Midbrain_E14.5_H3K9me3_79_112_0.510_5.718812e-09
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.77242	0.014362	0.135149	0.078069
0.23761	0.019348	0.723821	0.019222
0.078944	0.869003	0.025117	0.026936
0.806011	0.003055	0.001	0.189934
0.018788	0.017425	0.900486	0.0633
0.012835	0.821087	0.160951	0.005127
0.07186	0.003607	0.031823	0.89271
0.002434	0.034424	0.941022	0.022119
0.575007	0.104869	0.229343	0.090781
0.141628	0.221726	0.366602	0.270043

MOTIF	Hindbrain_E11.5_H3K9me3_44_148_0.521_1.279694e-05
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.918732	0.02492	0.050701	0.005646
0.134867	0.038946	0.804446	0.021742
0.035031	0.892049	0.045079	0.02784
0.968037	0.012533	0.01943	0.0
0.0082	0.010236	0.957335	0.024229
0.019158	0.7712	0.153341	0.0563
0.075605	0.059441	0.024782	0.840173
0.081411	0.262024	0.580647	0.075919
0.694018	0.087985	0.042837	0.17516

MOTIF	Neural-Tube_E11.5_H3K9me3_25_142_0.517_6.395154e-05
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.858903	0.025836	0.074061	0.041201
0.053853	0.070699	0.875448	0.0
0.06949	0.838492	0.028507	0.063511
0.902694	0.005648	0.018413	0.073246
0.0	0.005794	0.79553	0.198676
0.011447	0.65298	0.292773	0.0428
0.039057	0.003304	0.008912	0.948727
0.022805	0.023734	0.927424	0.026038
0.305752	0.232008	0.038621	0.423619