MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Hindbrain_E14.5_H3K4me1_81_88_0.508_1.606218e-08
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.031203	0.848616	0.0	0.120181
0.004835	0.633686	0.344738	0.016741
0.015544	0.057913	0.023145	0.903397
0.005747	0.020477	0.96517	0.008607
0.019383	0.016331	0.539884	0.424402
0.01692	0.000982	0.962835	0.019263
0.016081	0.018005	0.925806	0.040108
0.757764	0.132514	0.067186	0.042536
0.052256	0.089379	0.795652	0.062713

MOTIF	Lung_P0_H3K4me1_89_111_0.506_1.980737e-13
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.073338	0.768201	0.064141	0.09432
0.006187	0.97869	0.015123	0.0
0.057526	0.019866	0.0	0.922608
0.012361	0.025856	0.961783	0.0
0.0	0.246219	0.753781	0.0
0.433741	0.0	0.566259	0.0
0.069377	0.02393	0.906693	0.0
0.784525	0.195242	0.0	0.020233
0.162672	0.0	0.800675	0.036652

MOTIF	Kidney_E15.5_H3K4me1_67_25_0.513_6.079412e-21
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.089157	0.750546	0.037389	0.122909
0.047497	0.690174	0.123941	0.138389
0.033941	0.014327	0.148331	0.803401
0.013878	0.698352	0.132819	0.154952
0.007381	0.889382	0.019848	0.08339
0.051335	0.814333	0.062477	0.071855
0.03099	0.890166	0.070706	0.008139
0.765474	0.029189	0.130218	0.075118
0.009439	0.050394	0.890372	0.049794
0.330334	0.003654	0.427851	0.238161
0.179339	0.002402	0.667956	0.150304

MOTIF	Midbrain_E16.5_H3K4me1_61_25_0.515_2.211186e-20
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.093872	0.634494	0.096874	0.17476
0.022126	0.68606	0.114953	0.176861
0.046088	0.020964	0.165277	0.767672
0.051767	0.650022	0.128217	0.169994
0.005174	0.944112	0.0141	0.036615
0.087376	0.828288	0.058682	0.025655
0.018002	0.940408	0.027627	0.013962
0.804617	0.028574	0.111381	0.055428
0.007951	0.022715	0.95154	0.017794
0.30426	0.015326	0.49057	0.189844
0.35689	0.047403	0.578752	0.016954

MOTIF	Midbrain_E11.5_H3K4me1_73_30_0.513_1.324328e-11
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.050581	0.679487	0.107043	0.162889
0.035023	0.711847	0.127582	0.125548
0.034266	0.021633	0.153708	0.790393
0.067775	0.743828	0.047418	0.14098
0.011233	0.808755	0.00956	0.170451
0.102373	0.771529	0.052414	0.073684
0.019428	0.933659	0.034026	0.012887
0.825045	0.030003	0.092508	0.052445
0.002679	0.036003	0.934874	0.026444
0.222172	0.012283	0.566794	0.198751
0.135017	0.490489	0.332797	0.041697

MOTIF	Lung_E14.5_H3K4me1_73_45_0.507_1.709039e-09
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.02972	0.44327	0.286322	0.240688
0.022927	0.634048	0.082285	0.260739
0.018454	0.710085	0.067925	0.203535
0.030966	0.004838	0.075216	0.888979
0.035516	0.770055	0.035364	0.159065
0.002247	0.802526	0.004693	0.190534
0.131399	0.785335	0.03771	0.045555
0.018051	0.931173	0.029305	0.021471
0.823372	0.031547	0.031194	0.113887
0.005798	0.04685	0.903343	0.044009

MOTIF	Forebrain_P0_H3K4me1_86_35_0.505_0.00505145
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.055153	0.840278	0.066223	0.038346
0.029026	0.741147	0.037625	0.192201
0.035724	0.026843	0.081988	0.855445
0.060428	0.555791	0.122699	0.261082
0.004107	0.952649	0.013082	0.030162
0.145977	0.814147	0.013833	0.026043
0.039323	0.91495	0.029371	0.016356
0.742503	0.031068	0.151262	0.075167
0.00758	0.035392	0.919727	0.0373
0.421615	0.149894	0.201576	0.226915

MOTIF	Cranio-Facial_E14.5_H3K4me1_93_27_0.508_6.878701e-09
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.080817	0.64446	0.118834	0.155888
0.030069	0.720362	0.108665	0.140904
0.027821	0.025678	0.106044	0.840457
0.048454	0.731963	0.049105	0.170478
0.007688	0.845065	0.011081	0.136166
0.120254	0.726477	0.113974	0.039295
0.026063	0.92804	0.033368	0.012529
0.850781	0.025661	0.09738	0.026178
0.011983	0.039605	0.900577	0.047835
0.469622	0.235237	0.10641	0.188731
0.09682	0.319563	0.386647	0.19697

MOTIF	Hindbrain_P0_H3K4me1_73_36_0.505_7.374809e-05
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.023299	0.64181	0.102924	0.231967
0.023461	0.738342	0.063025	0.175172
0.032292	0.027034	0.044593	0.896081
0.0592	0.689059	0.060334	0.191407
0.003753	0.860949	0.005563	0.129735
0.126271	0.773389	0.066634	0.033706
0.029432	0.910782	0.034313	0.025473
0.839625	0.015206	0.116866	0.028302
0.003343	0.0504	0.896962	0.049296
0.315434	0.261354	0.17326	0.249952

MOTIF	Limb_E13.5_H3K4me1_95_39_0.506_3.514488e-08
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.028806	0.810565	0.11767	0.042959
0.032642	0.841382	0.041927	0.084049
0.040521	0.019372	0.100578	0.839529
0.045149	0.656244	0.128591	0.170016
0.000695	0.889377	0.022452	0.087476
0.165535	0.681012	0.046402	0.107051
0.02484	0.927221	0.035048	0.012891
0.765687	0.011975	0.137132	0.085205
0.00229	0.052283	0.910235	0.035192
0.470038	0.0	0.209043	0.320919

MOTIF	Cranio-Facial_E13.5_H3K4me1_98_56_0.503_7.414262e-09
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.068082	0.658256	0.120283	0.153378
0.025004	0.739866	0.062731	0.172399
0.026043	0.01312	0.035015	0.925822
0.025395	0.729545	0.093231	0.151829
0.002571	0.851072	0.010598	0.135759
0.106186	0.750973	0.038223	0.104619
0.02534	0.928036	0.035271	0.011353
0.756573	0.040049	0.105088	0.09829
0.002393	0.05096	0.888163	0.058484

MOTIF	Cranio-Facial_E15.5_H3K4me1_95_32_0.504_0.0001565326
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.19392	0.216449	0.09887	0.490762
0.036532	0.635841	0.154308	0.173319
0.029846	0.737593	0.0952	0.13736
0.030991	0.012933	0.060833	0.895242
0.023892	0.744483	0.091411	0.140214
0.009523	0.849592	0.019162	0.121722
0.084961	0.769957	0.072284	0.072798
0.023786	0.9212	0.036071	0.018943
0.784037	0.037932	0.102554	0.075477
0.006283	0.071712	0.875406	0.046599

MOTIF	Stomach_E15.5_H3K4me1_90_30_0.505_3.74832e-05
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.187575	0.173104	0.128828	0.510492
0.024611	0.721456	0.134442	0.119491
0.031194	0.736206	0.107631	0.124969
0.030123	0.00651	0.078781	0.884585
0.027295	0.731542	0.110328	0.130835
0.01523	0.829311	0.023981	0.131478
0.077943	0.746374	0.076534	0.099149
0.032558	0.904613	0.05015	0.012679
0.764103	0.034324	0.122353	0.07922
0.006657	0.045037	0.916518	0.031788

MOTIF	Neural-Tube_E14.5_H3K4me1_80_33_0.506_8.483007e-06
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.28752	0.264398	0.103675	0.344408
0.068663	0.696599	0.094226	0.140512
0.028659	0.715351	0.107872	0.148118
0.035201	0.008208	0.05951	0.897081
0.023973	0.744052	0.0951	0.136874
0.013866	0.852678	0.0135	0.119956
0.105526	0.754394	0.073161	0.066919
0.023422	0.92464	0.036836	0.015101
0.791977	0.025857	0.103419	0.078747
0.008632	0.051555	0.887743	0.05207

MOTIF	Stomach_E16.5_H3K4me1_86_38_0.503_0.0006582022
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.215911	0.366033	0.090468	0.327588
0.026113	0.654147	0.096169	0.223571
0.032175	0.685715	0.114725	0.167386
0.03462	0.013951	0.078321	0.873108
0.028776	0.781	0.035848	0.154376
0.008517	0.873939	0.009437	0.108107
0.107084	0.746194	0.067211	0.079512
0.037439	0.887921	0.058823	0.015818
0.802288	0.019447	0.096076	0.082188
0.009386	0.052298	0.908962	0.029354

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K27me3_54_67_0.508_3.772033e-12
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.04509	0.902672	0.036186	0.016052
0.01272	0.874592	0.050257	0.062431
0.019807	0.005297	0.029905	0.94499
0.00805	0.695529	0.023993	0.272428
0.020829	0.838184	0.007647	0.13334
0.09862	0.797683	0.085597	0.018099
0.122668	0.710918	0.149554	0.016861
0.776057	0.013309	0.089258	0.121376
0.012559	0.045902	0.923397	0.018141
0.155379	0.16007	0.235964	0.448587

MOTIF	Liver_E13.5_H3K27me3_36_74_0.519_1.845776e-52
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.015784	0.891465	0.041945	0.050806
0.007547	0.859546	0.061762	0.071145
0.020957	0.01491	0.015424	0.948708
0.0	0.694076	0.017463	0.288461
0.0	0.982102	0.0	0.017898
0.039135	0.920774	0.027495	0.012596
0.219696	0.498735	0.266881	0.014688
0.839141	0.024969	0.130752	0.005138
0.016609	0.040289	0.936267	0.006835
0.008849	0.281362	0.255291	0.454498

MOTIF	Kidney_E14.5_H3K27ac_91_60_0.505_4.736098e-05
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.094029	0.54341	0.117803	0.244758
0.046827	0.613184	0.138863	0.201125
0.024922	0.660898	0.141285	0.172895
0.023893	0.002367	0.055892	0.917848
0.016801	0.784455	0.119027	0.079718
0.007544	0.822049	0.029974	0.140432
0.120276	0.808366	0.047633	0.023725
0.009381	0.885377	0.095799	0.009443
0.792868	0.030621	0.087011	0.0895
0.013019	0.049409	0.922188	0.015384

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K27ac_95_50_0.505_0.000358451
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.011319	0.866701	0.056462	0.065518
0.015425	0.729233	0.04627	0.209072
0.037403	0.020886	0.048686	0.893025
0.047425	0.539393	0.147658	0.265524
0.0	0.944761	0.022103	0.033136
0.108108	0.840365	0.016349	0.035178
0.034741	0.916903	0.03025	0.018106
0.724727	0.027057	0.205794	0.042422
0.003497	0.04701	0.903741	0.045752
0.416285	0.254298	0.240438	0.088979

MOTIF	Hindbrain_E11.5_H3K27ac_79_55_0.508_1.231447e-05
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.068611	0.650673	0.143782	0.136933
0.021485	0.703664	0.117149	0.157703
0.04964	0.009178	0.041197	0.899984
0.031619	0.762486	0.045503	0.160391
0.0054	0.89207	0.014921	0.087609
0.097835	0.795437	0.042617	0.064111
0.014051	0.895887	0.07774	0.012321
0.743484	0.020469	0.148371	0.087676
0.007633	0.037202	0.902521	0.052644
0.356314	0.331951	0.153027	0.158708

MOTIF	Limb_E14.5_H3K27ac_95_63_0.502_0.001772228
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.032955	0.685199	0.054213	0.227632
0.012513	0.674924	0.132065	0.180499
0.044381	0.005204	0.03304	0.917375
0.039742	0.739705	0.044953	0.175601
0.006604	0.944904	0.015397	0.033095
0.117526	0.768279	0.028752	0.085442
0.020537	0.867024	0.101835	0.010605
0.740304	0.020159	0.166104	0.073433
0.003891	0.03944	0.916742	0.039927
0.358219	0.346965	0.147556	0.147261

MOTIF	Midbrain_E13.5_H3K27ac_84_51_0.510_1.498769e-06
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.026289	0.241141	0.183447	0.549123
0.111007	0.162833	0.132758	0.593402
0.021347	0.702128	0.077854	0.198672
0.125873	0.021297	0.015892	0.836938
0.010662	0.937697	0.026573	0.025069
0.043674	0.832037	0.01559	0.1087
0.057665	0.773802	0.021919	0.146614
0.045573	0.873715	0.052475	0.028237
0.543505	0.044179	0.244156	0.168161
0.004538	0.02634	0.952713	0.016408
0.110258	0.802811	0.061423	0.025507

MOTIF	Heart_P0_H3K27me3_42_70_0.505_0.002305866
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.01798	0.731466	0.192063	0.05849
0.019785	0.890855	0.038075	0.051285
0.078468	0.012242	0.041562	0.867728
0.087177	0.45863	0.214405	0.239789
0.0	0.960487	0.015801	0.023712
0.134726	0.811578	0.025356	0.02834
0.025855	0.848812	0.113211	0.012122
0.873428	0.009631	0.063013	0.053928
0.004503	0.022937	0.960399	0.012161
0.215943	0.333709	0.214362	0.235985

MOTIF	Intestine_E16.5_H3K9ac_85_112_0.504_1.295393e-10
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.009322	0.754002	0.052266	0.184409
0.038002	0.012887	0.087937	0.861174
0.059022	0.656641	0.024012	0.260325
0.051408	0.939693	0.0	0.008899
0.026736	0.781668	0.03236	0.159236
0.013716	0.799214	0.035946	0.151125
0.855483	0.021741	0.11225	0.010525
0.017388	0.031859	0.924146	0.026608
0.159196	0.695051	0.08052	0.065233