MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K4me3_57_72_0.595_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.229947	0.770053	0.0	0.0
0.250539	0.017849	0.722659	0.008953
0.042303	0.749242	0.0	0.208454
0.006456	0.057263	0.809881	0.1264
0.074463	0.081226	0.844311	0.0
0.090643	0.030074	0.04113	0.838154
0.0	0.056479	0.939128	0.004393
0.847141	0.0347	0.062511	0.055647
0.015354	0.050803	0.826214	0.10763

MOTIF	Heart_E11.5_H3K4me3_51_68_0.606_1.963184e-271
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.115313	0.048959	0.786868	0.04886
0.008754	0.979978	0.0	0.011267
0.283561	0.014398	0.551517	0.150523
0.026247	0.93758	0.006992	0.029181
0.079335	0.008363	0.709085	0.203218
0.176602	0.040122	0.783276	0.0
0.076077	0.111666	0.0	0.812258
0.004488	0.03359	0.961922	0.0
0.80185	0.074537	0.026465	0.097147

MOTIF	Hindbrain_E14.5_H3K4me3_32_46_0.672_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.098114	0.062389	0.671537	0.16796
0.189799	0.790988	0.013536	0.005677
0.164409	0.01888	0.755342	0.061368
0.106465	0.712182	0.030703	0.15065
0.009368	0.017668	0.955644	0.01732
0.093562	0.045888	0.860549	0.0
0.109503	0.055703	0.071185	0.763609
0.0	0.018836	0.97504	0.006123
0.738616	0.059335	0.092074	0.109976

MOTIF	Lung_E14.5_H3K4me3_44_46_0.636_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.13571	0.036522	0.710034	0.117733
0.173414	0.790252	0.021597	0.014737
0.258646	0.009038	0.578403	0.153913
0.03534	0.826501	0.114671	0.023489
0.018243	0.0	0.871424	0.110333
0.039476	0.055014	0.90551	0.0
0.125649	0.102695	0.045819	0.725837
0.0	0.0	1.0	0.0
0.849266	0.022066	0.081165	0.047502

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K4me3_25_152_0.705_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.322	0.676	0.001	0.001
0.001	0.001	0.997	0.001
0.001	0.997	0.001	0.001
0.001	0.001	0.997	0.001
0.001	0.058	0.94	0.001
0.17	0.001	0.001	0.828
0.001	0.001	0.997	0.001
0.764	0.001	0.001	0.234

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K4me3_40_159_0.661_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.094	0.775	0.105	0.026
0.001	0.05	0.884	0.065
0.025	0.864	0.059	0.052
0.123	0.03	0.846	0.001
0.022	0.026	0.925	0.027
0.037	0.001	0.001	0.961
0.001	0.001	0.997	0.001
0.808	0.08	0.082	0.03

MOTIF	Neural-Tube_E15.5_H3K4me3_54_50_0.592_4.443667e-204
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.49583	0.139395	0.308913	0.055862
0.305219	0.648952	0.045829	0.0
0.013586	0.010594	0.941484	0.034335
0.01868	0.934154	0.040109	0.007057
0.256874	0.121094	0.582814	0.039218
0.0	0.016227	0.983773	0.0
0.102638	0.049332	0.0	0.84803
0.0	0.01558	0.98442	0.0
0.846419	0.0	0.070818	0.082763
0.0	0.130137	0.853676	0.016188

MOTIF	Cranio-Facial_E13.5_H3K4me2_22_22_0.611_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.380082	0.42928	0.139253	0.051385
0.023763	0.891911	0.037131	0.047195
0.056175	0.018837	0.900119	0.024869
0.014669	0.838811	0.032215	0.114305
0.019117	0.012213	0.944281	0.024389
0.255283	0.028764	0.624575	0.091378
0.100319	0.0	0.027191	0.87249
0.003068	0.033008	0.961423	0.0025
0.215576	0.68599	0.060823	0.037611
0.027285	0.740285	0.031356	0.201075

MOTIF	Kidney_E14.5_H3K4me2_10_154_0.668_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.087	0.841	0.055	0.017
0.001	0.029	0.884	0.086
0.001	0.966	0.032	0.001
0.036	0.027	0.858	0.079
0.024	0.062	0.913	0.001
0.078	0.001	0.137	0.784
0.001	0.03	0.968	0.001
0.836	0.062	0.07	0.032

MOTIF	Kidney_E16.5_H3K4me2_9_158_0.658_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.068	0.786	0.097	0.049
0.601	0.11	0.076	0.213
0.074	0.604	0.184	0.138
0.05	0.835	0.075	0.04
0.039	0.091	0.807	0.063
0.054	0.765	0.135	0.046
0.284	0.068	0.579	0.069
0.108	0.091	0.701	0.1

MOTIF	Limb_E11.5_H3K4me2_40_36_0.605_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.012321	0.964938	0.020972	0.001769
0.860284	0.032729	0.020577	0.08641
0.096252	0.791335	0.085297	0.027115
0.067798	0.659161	0.025317	0.247724
0.020154	0.017428	0.935969	0.026449
0.033129	0.741901	0.0282	0.19677
0.046452	0.067233	0.760851	0.125464
0.014154	0.015769	0.876533	0.093544
0.038126	0.704801	0.063294	0.193779

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K4me2_51_39_0.582_6.934283e-301
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.010536	0.885681	0.032265	0.071518
0.872481	0.013822	0.021243	0.092454
0.027426	0.903814	0.041834	0.026926
0.099088	0.614731	0.009394	0.276787
0.010349	0.050237	0.927844	0.011569
0.028438	0.743152	0.024475	0.203935
0.066238	0.017671	0.781535	0.134556
0.009043	0.038429	0.931196	0.021332
0.256073	0.671098	0.043596	0.029232

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K4me2_52_34_0.574_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.011768	0.954786	0.028642	0.004803
0.860452	0.026907	0.012558	0.100083
0.014388	0.890337	0.07596	0.019314
0.261826	0.674226	0.023772	0.040176
0.023399	0.034181	0.935161	0.007259
0.181619	0.617485	0.032168	0.168728
0.031314	0.031844	0.799027	0.137815
0.025657	0.029046	0.797732	0.147565
0.205759	0.696433	0.074961	0.022848

MOTIF	Limb_E13.5_H3K4me2_42_30_0.577_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.016338	0.967882	0.004491	0.01129
0.909934	0.016298	0.024791	0.048977
0.022793	0.803702	0.078309	0.095196
0.172779	0.750823	0.038248	0.038149
0.013086	0.01069	0.908894	0.067331
0.184591	0.670062	0.009567	0.135779
0.119742	0.038083	0.789858	0.052318
0.034551	0.060839	0.791797	0.112813
0.152806	0.725315	0.048765	0.073115

MOTIF	Intestine_E15.5_H3K4me3_7_156_0.720_8.004038e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.133	0.66	0.112	0.095
0.082	0.105	0.733	0.08
0.074	0.773	0.071	0.082
0.082	0.076	0.735	0.107
0.083	0.59	0.23	0.097
0.217	0.004	0.13	0.649
0.143	0.127	0.717	0.013
0.527	0.147	0.142	0.184
0.22	0.159	0.103	0.518
0.174	0.098	0.103	0.625

MOTIF	Stomach_E15.5_H3K4me3_26_169_0.677_1.356968e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.211	0.253	0.327	0.21
0.129	0.615	0.139	0.117
0.122	0.132	0.621	0.125
0.128	0.608	0.138	0.126
0.117	0.122	0.629	0.132
0.09	0.678	0.132	0.1
0.126	0.095	0.116	0.663
0.088	0.126	0.684	0.102
0.58	0.156	0.131	0.133
0.11	0.135	0.14	0.615
0.099	0.129	0.127	0.645
0.192	0.241	0.232	0.335

MOTIF	Liver_E13.5_H3K4me3_15_155_0.664_2.592829e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.258	0.25	0.297	0.195
0.068	0.156	0.717	0.059
0.001	0.986	0.001	0.012
0.032	0.026	0.93	0.012
0.062	0.117	0.76	0.061
0.227	0.057	0.116	0.6
0.039	0.075	0.844	0.042
0.692	0.149	0.103	0.056
0.47	0.212	0.166	0.152
0.309	0.214	0.229	0.248

MOTIF	Heart_E16.5_H3K4me3_1_157_0.697_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.195	0.024	0.199	0.582
0.179	0.429	0.178	0.214
0.467	0.132	0.049	0.352
0.024	0.645	0.27	0.061
0.188	0.701	0.024	0.087
0.009	0.011	0.96	0.02
0.186	0.597	0.212	0.005
0.17	0.13	0.662	0.038

MOTIF	Cranio-Facial_E12.5_H3K4me3_31_159_0.678_3.973423e-316
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.085	0.75	0.112	0.053
0.032	0.069	0.827	0.072
0.075	0.855	0.038	0.032
0.096	0.092	0.77	0.042
0.027	0.05	0.862	0.061
0.093	0.045	0.074	0.788
0.019	0.077	0.864	0.04
0.723	0.101	0.077	0.099
0.049	0.09	0.095	0.766
0.078	0.072	0.051	0.799

MOTIF	Cranio-Facial_E14.5_H3K4me3_28_157_0.668_7.322493e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.056	0.822	0.062	0.06
0.056	0.06	0.814	0.07
0.08	0.806	0.068	0.046
0.073	0.071	0.784	0.072
0.046	0.106	0.774	0.074
0.085	0.04	0.076	0.799
0.039	0.049	0.901	0.011
0.721	0.084	0.088	0.107
0.061	0.12	0.074	0.745
0.06	0.067	0.04	0.833

MOTIF	Forebrain_P0_H3K4me3_12_153_0.723_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.058	0.751	0.076	0.115
0.028	0.101	0.78	0.091
0.024	0.843	0.093	0.04
0.061	0.097	0.714	0.128
0.074	0.107	0.767	0.052
0.133	0.058	0.059	0.75
0.078	0.134	0.716	0.072
0.679	0.119	0.089	0.113

MOTIF	Liver_E11.5_H3K4me3_13_160_0.693_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.075	0.678	0.144	0.103
0.034	0.131	0.749	0.086
0.039	0.867	0.083	0.011
0.096	0.039	0.73	0.135
0.055	0.122	0.737	0.086
0.148	0.056	0.106	0.69
0.044	0.079	0.824	0.053
0.726	0.11	0.083	0.081

MOTIF	Limb_E11.5_H3K4me3_14_157_0.731_8.437085e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.131	0.615	0.126	0.128
0.102	0.122	0.663	0.113
0.114	0.655	0.124	0.107
0.131	0.137	0.605	0.127
0.133	0.139	0.589	0.139
0.153	0.156	0.141	0.55
0.141	0.134	0.577	0.148
0.574	0.16	0.138	0.128
0.141	0.143	0.147	0.569
0.128	0.13	0.138	0.604

MOTIF	Stomach_P0_H3K4me3_16_156_0.704_3.254299e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.131	0.615	0.132	0.122
0.104	0.125	0.664	0.107
0.111	0.643	0.135	0.111
0.13	0.139	0.604	0.127
0.13	0.137	0.591	0.142
0.155	0.152	0.149	0.544
0.147	0.133	0.564	0.156
0.568	0.15	0.132	0.15
0.135	0.142	0.14	0.583
0.127	0.123	0.126	0.624