MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Forebrain_E11.5_H3K4me2_100_63_0.511_8.33846e-23
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.018654	0.92104	0.016095	0.044212
0.73161	0.038809	0.113653	0.115928
0.024629	0.878078	0.028824	0.068469
0.106394	0.821884	0.057931	0.013791
0.101099	0.843797	0.032855	0.022249
0.067507	0.726407	0.143068	0.063018
0.02995	0.894368	0.03046	0.045222
0.73747	0.047002	0.166507	0.049021
0.071069	0.724867	0.147364	0.056699

MOTIF	Kidney_P0_H3K4me2_100_46_0.522_1.140339e-37
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.060046	0.647574	0.083064	0.209316
0.027392	0.925545	0.019543	0.02752
0.82008	0.031301	0.033694	0.114925
0.014744	0.887348	0.0403	0.057609
0.122366	0.746546	0.111927	0.019161
0.104796	0.819369	0.046065	0.029769
0.062062	0.637285	0.225664	0.07499
0.006886	0.890606	0.039792	0.062716
0.688497	0.065769	0.099812	0.145923
0.058002	0.845208	0.049038	0.047751

MOTIF	Kidney_E15.5_H3K4me2_73_46_0.531_4.193288e-68
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.007633	0.941675	0.014725	0.035966
0.669383	0.039242	0.21052	0.080855
0.025337	0.849528	0.062993	0.062143
0.151878	0.77101	0.052387	0.024725
0.068129	0.776465	0.025105	0.130302
0.148462	0.718475	0.032126	0.100936
0.010078	0.909867	0.056565	0.02349
0.780421	0.055609	0.077648	0.086322
0.05857	0.866326	0.05045	0.024654
0.057892	0.294636	0.495156	0.152317

MOTIF	Liver_P0_H3K4me2_96_49_0.502_2.047672e-16
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.046452	0.906814	0.014915	0.03182
0.827587	0.036522	0.055797	0.080095
0.015996	0.862849	0.046345	0.07481
0.16264	0.7807	0.043703	0.012957
0.177728	0.657074	0.029825	0.135374
0.190152	0.718518	0.050511	0.040819
0.003032	0.963475	0.009206	0.024288
0.84461	0.060068	0.057596	0.037726
0.073707	0.850194	0.050616	0.025483
0.112515	0.234332	0.520775	0.132377

MOTIF	Hindbrain_E11.5_H3K4me2_86_40_0.511_3.032445e-11
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.048901	0.846996	0.017048	0.087055
0.007895	0.936285	0.01205	0.04377
0.678677	0.029613	0.059588	0.232123
0.015199	0.850076	0.048212	0.086512
0.109768	0.837348	0.024568	0.028316
0.023781	0.711279	0.09802	0.16692
0.034713	0.806387	0.076955	0.081944
0.001956	0.876136	0.113256	0.008652
0.726895	0.05478	0.188294	0.030031
0.041597	0.294776	0.637613	0.026014

MOTIF	Lung_E14.5_H3K4me2_81_28_0.524_4.163895e-42
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.034269	0.89196	0.013869	0.059902
0.004339	0.934915	0.037313	0.023434
0.775445	0.034079	0.067228	0.123248
0.014235	0.855658	0.071226	0.058881
0.123501	0.820766	0.035095	0.020638
0.022964	0.775363	0.037298	0.164375
0.107868	0.731604	0.088054	0.072475
0.005941	0.862098	0.090316	0.041645
0.614865	0.079347	0.219398	0.08639
0.017951	0.411106	0.538181	0.032762

MOTIF	Midbrain_E12.5_H3K4me2_80_36_0.532_2.484786e-51
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.030565	0.851907	0.027377	0.090151
0.028698	0.915256	0.025319	0.030728
0.770072	0.040659	0.063853	0.125415
0.014676	0.846596	0.057583	0.081144
0.112648	0.85148	0.023679	0.012193
0.022031	0.826443	0.026901	0.124625
0.041115	0.70738	0.190552	0.060953
0.013659	0.822647	0.125164	0.03853
0.676013	0.072498	0.204627	0.046863
0.01095	0.400918	0.560374	0.027759

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K4me2_89_44_0.508_1.175637e-13
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.100352	0.849968	0.017391	0.032289
0.003048	0.923812	0.033151	0.03999
0.789538	0.023234	0.068719	0.118508
0.005145	0.862054	0.061335	0.071466
0.140201	0.811305	0.032898	0.015596
0.091438	0.71625	0.048796	0.143516
0.038106	0.737059	0.170634	0.0542
0.001821	0.855459	0.094319	0.048401
0.802218	0.080123	0.06334	0.054318
0.022754	0.299485	0.639906	0.037856

MOTIF	Forebrain_E12.5_H3K4me2_98_51_0.524_5.863811e-45
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.031454	0.875714	0.020344	0.072487
0.043934	0.868906	0.063745	0.023416
0.744865	0.049497	0.067419	0.138219
0.008547	0.853021	0.072722	0.065709
0.107954	0.839404	0.031414	0.021228
0.021311	0.806908	0.024015	0.147765
0.057744	0.673197	0.166339	0.10272
0.002839	0.869629	0.093147	0.034385
0.659743	0.087946	0.064149	0.188162
0.00999	0.417685	0.545906	0.026419

MOTIF	Hindbrain_P0_H3K4me2_105_54_0.509_4.405525e-31
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.047042	0.886476	0.009434	0.057048
0.012139	0.914115	0.036903	0.036844
0.630114	0.035166	0.086731	0.247988
0.026585	0.852243	0.050023	0.07115
0.096745	0.852207	0.021769	0.029278
0.057999	0.75624	0.02745	0.158312
0.035429	0.747505	0.133572	0.083494
0.029556	0.900039	0.032329	0.038076
0.721641	0.058034	0.069786	0.150539
0.047188	0.426405	0.497456	0.028951

MOTIF	Liver_E11.5_H3K4me2_71_33_0.516_5.098738e-31
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.036905	0.923956	0.01474	0.024399
0.035666	0.910131	0.03938	0.014823
0.674241	0.046461	0.093182	0.186116
0.014635	0.87157	0.05321	0.060585
0.106829	0.835139	0.029227	0.028804
0.076223	0.751992	0.037207	0.134577
0.061699	0.713458	0.153146	0.071698
0.032293	0.908122	0.031197	0.028388
0.72741	0.064225	0.11218	0.096185
0.071084	0.334893	0.569499	0.024524

MOTIF	Cranio-Facial_E14.5_H3K4me2_94_55_0.510_3.395255e-14
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.086603	0.855975	0.020631	0.036791
0.010227	0.909103	0.030807	0.049863
0.761528	0.036575	0.061665	0.140232
0.012309	0.837556	0.062687	0.087448
0.123105	0.818793	0.032438	0.025664
0.025029	0.735696	0.039699	0.199576
0.119889	0.647483	0.140125	0.092503
0.003986	0.916331	0.043184	0.036499
0.727373	0.072181	0.061776	0.138671
0.013119	0.355937	0.590581	0.040363

MOTIF	Liver_E14.5_H3K4me2_98_55_0.502_0.001714205
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.046689	0.875703	0.018541	0.059066
0.002691	0.970723	0.01442	0.012166
0.673763	0.031728	0.069151	0.225358
0.007373	0.876718	0.042418	0.073491
0.118131	0.841729	0.030707	0.009434
0.031963	0.759883	0.032111	0.176043
0.146062	0.625705	0.122615	0.105618
0.005383	0.918806	0.029897	0.045914
0.8051	0.079727	0.038462	0.076711
0.024396	0.234227	0.693396	0.047981

MOTIF	Midbrain_E13.5_H3K4me2_96_56_0.515_8.2032e-28
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.01876	0.901792	0.01015	0.069299
0.002564	0.917525	0.051615	0.028296
0.811736	0.019681	0.034911	0.133671
0.002966	0.871475	0.051969	0.07359
0.096844	0.854882	0.027158	0.021115
0.03563	0.756219	0.061656	0.146495
0.036097	0.670747	0.188772	0.104385
0.011702	0.841114	0.102018	0.045165
0.572646	0.096208	0.17261	0.158536

MOTIF	Limb_E15.5_H3K4me2_99_54_0.505_1.255245e-20
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.048361	0.900867	0.014379	0.036393
0.004878	0.932742	0.015023	0.047356
0.761896	0.030994	0.085434	0.121676
0.006458	0.857894	0.061272	0.074376
0.110928	0.830406	0.039242	0.019423
0.096019	0.72328	0.033311	0.14739
0.057786	0.696969	0.15861	0.086636
0.002094	0.862879	0.082188	0.052839
0.744178	0.063569	0.064803	0.12745

MOTIF	Midbrain_P0_H3K4me2_87_68_0.507_1.374066e-25
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.045934	0.871895	0.006772	0.0754
0.029697	0.87675	0.047735	0.045818
0.735227	0.034697	0.090831	0.139245
0.00817	0.897284	0.032613	0.061933
0.079337	0.866355	0.03059	0.023718
0.123806	0.727266	0.019155	0.129772
0.036604	0.670487	0.199834	0.093076
0.032551	0.896707	0.040786	0.029956
0.739108	0.05424	0.106135	0.100517

MOTIF	Limb_E13.5_H3K4me2_96_55_0.509_8.720647e-29
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.018579	0.88232	0.016559	0.082542
0.006867	0.93343	0.023504	0.036199
0.811142	0.020755	0.035802	0.132301
0.010123	0.840773	0.057009	0.092094
0.145775	0.801333	0.028362	0.02453
0.031107	0.766025	0.041917	0.160951
0.129825	0.697465	0.143185	0.029525
0.00448	0.901794	0.037859	0.055867
0.719218	0.083908	0.06405	0.132824
0.036046	0.482963	0.442741	0.038249

MOTIF	Kidney_E15.5_H3K4me2_89_69_0.514_3.744357e-29
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.060048	0.8529	0.009523	0.07753
0.002009	0.937035	0.017591	0.043365
0.794877	0.045245	0.045544	0.114334
0.005107	0.889728	0.058289	0.046876
0.129677	0.814952	0.029876	0.025495
0.023251	0.754469	0.02739	0.19489
0.121837	0.687458	0.117512	0.073193
0.001713	0.853459	0.101232	0.043597
0.676555	0.134816	0.064815	0.123814

MOTIF	Neural-Tube_E12.5_H3K4me2_97_73_0.517_3.014583e-39
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.011954	0.877458	0.030569	0.080019
0.001767	0.948913	0.016576	0.032744
0.757597	0.05431	0.031271	0.156822
0.001903	0.868757	0.063938	0.065402
0.129172	0.810513	0.035902	0.024413
0.018462	0.685955	0.096123	0.19946
0.095255	0.674094	0.16773	0.062921
0.000489	0.92836	0.031425	0.039726
0.675418	0.100074	0.051612	0.172897

MOTIF	Kidney_E14.5_H3K4me3_99_58_0.504_9.254203e-07
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.04908	0.887914	0.018097	0.044908
0.006987	0.93641	0.02146	0.035144
0.753165	0.055254	0.05535	0.136231
0.009372	0.811309	0.051317	0.128002
0.140872	0.800008	0.031803	0.027317
0.022212	0.767404	0.017733	0.19265
0.017511	0.625931	0.288024	0.068535
0.004054	0.905105	0.060827	0.030013
0.783029	0.065644	0.058251	0.093076
0.033644	0.040475	0.870518	0.055363
0.027718	0.469938	0.449745	0.052599

MOTIF	Liver_E13.5_H3K4me3_83_52_0.508_5.022196e-08
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.028049	0.941278	0.007886	0.022786
0.002611	0.972722	0.023153	0.001514
0.770768	0.048154	0.087548	0.093529
0.009848	0.804214	0.039402	0.146537
0.178963	0.777082	0.025707	0.018248
0.022756	0.735115	0.018114	0.224016
0.050236	0.720006	0.112794	0.116963
0.012119	0.950987	0.031261	0.005633
0.625058	0.061671	0.271879	0.041392
0.054842	0.066601	0.822621	0.055936

MOTIF	Heart_E13.5_H3K4me3_100_52_0.517_7.320612e-16
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.012903	0.920913	0.009108	0.057075
0.019511	0.909809	0.041927	0.028753
0.600781	0.038412	0.096965	0.263842
0.039559	0.87463	0.043168	0.042643
0.101702	0.830072	0.032613	0.035613
0.079323	0.702348	0.044373	0.173956
0.023679	0.720179	0.188337	0.067804
0.053634	0.89152	0.02902	0.025825
0.772491	0.055888	0.047942	0.123679
0.063477	0.247859	0.671812	0.016853
0.066049	0.581852	0.262765	0.089334

MOTIF	Liver_E16.5_H3K4me3_83_44_0.508_1.5305e-11
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.028786	0.924307	0.01248	0.034428
0.032698	0.930717	0.011375	0.02521
0.739599	0.032011	0.099676	0.128713
0.017439	0.843632	0.057682	0.081247
0.118848	0.813449	0.039644	0.02806
0.034379	0.732629	0.076936	0.156056
0.023995	0.72886	0.183283	0.063863
0.031805	0.906797	0.036585	0.024812
0.640813	0.054557	0.191486	0.113143
0.044993	0.250771	0.677151	0.027086

MOTIF	Liver_P0_H3K4me3_62_45_0.515_2.930076e-14
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.055394	0.892248	0.020798	0.03156
0.028321	0.933034	0.007405	0.03124
0.651822	0.029783	0.098234	0.220161
0.037106	0.861504	0.040863	0.060528
0.111437	0.839783	0.020294	0.028486
0.096435	0.752198	0.034984	0.116384
0.023458	0.759954	0.128306	0.088282
0.034258	0.907403	0.035581	0.022758
0.681215	0.048446	0.185456	0.084882
0.064624	0.334203	0.577256	0.023917