MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Heart_E13.5_H3K27ac_42_11_0.522_8.545452e-146
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.032182	0.83176	0.055212	0.080846
0.052626	0.090478	0.836726	0.02017
0.00852	0.962044	0.0	0.029436
0.259706	0.051463	0.460422	0.228409
0.103518	0.700767	0.022608	0.173108
0.006188	0.007451	0.979068	0.007293
0.040008	0.044194	0.872803	0.042994
0.038418	0.058512	0.862482	0.040588
0.066452	0.856704	0.042223	0.034622
0.33428	0.598487	0.045606	0.021627

MOTIF	Limb_E11.5_H3K27ac_21_15_0.545_3.287038e-58
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.056091	0.743691	0.008239	0.191979
0.206791	0.06635	0.70755	0.019308
0.056929	0.834649	0.037028	0.071394
0.026308	0.05487	0.796751	0.122071
0.075778	0.746824	0.035589	0.141809
0.068453	0.025553	0.905994	0.0
0.05638	0.009666	0.896408	0.037546
0.039718	0.018262	0.887285	0.054734
0.129522	0.706002	0.008687	0.15579

MOTIF	Liver_E16.5_H3K4me2_6_3_0.632_6.241826e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.044975	0.905478	0.014278	0.035269
0.020821	0.047281	0.842054	0.089844
0.092581	0.807377	0.023058	0.076984
0.025241	0.017077	0.860249	0.097434
0.078783	0.831917	0.055453	0.033847
0.085086	0.015663	0.868359	0.030892
0.021094	0.020879	0.922855	0.035172
0.143482	0.060647	0.670823	0.125048
0.12972	0.711059	0.078781	0.08044
0.348806	0.059083	0.125271	0.466841
0.0	0.511771	0.488229	0.0
0.241685	0.415599	0.091186	0.25153
0.165116	0.096704	0.724903	0.013277

MOTIF	Cranio-Facial_E12.5_H3K4me2_17_11_0.642_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.029385	0.643738	0.086206	0.24067
0.036633	0.114336	0.834647	0.014384
0.005063	0.945999	0.044276	0.004662
0.100294	0.059891	0.792935	0.046881
0.025897	0.924616	0.031663	0.017824
0.059827	0.026142	0.728416	0.185615
0.024036	0.0	0.928646	0.047318
0.317975	0.0	0.642635	0.03939
0.057217	0.92477	0.0	0.018013
0.410693	0.533131	0.0	0.056176

MOTIF	Limb_E13.5_H3K4me2_21_10_0.622_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.065971	0.928124	0.005904	0.0
0.030408	0.055308	0.893589	0.020695
0.098402	0.800613	0.0364	0.064586
0.116063	0.081068	0.652604	0.150264
0.141117	0.766815	0.062114	0.029953
0.106655	0.051856	0.793953	0.047536
0.037496	0.010844	0.9167	0.03496
0.112498	0.043794	0.813628	0.030079
0.082706	0.767978	0.0251	0.124216
0.041117	0.132441	0.036239	0.790202
0.0	0.69171	0.30829	0.0

MOTIF	Limb_E15.5_H3K4me2_15_11_0.649_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.01171	0.708218	0.079774	0.200298
0.033696	0.029612	0.898535	0.038156
0.030621	0.890028	0.057151	0.0222
0.167302	0.000838	0.761244	0.070616
0.014899	0.960886	0.015585	0.00863
0.298394	0.023892	0.488117	0.189597
0.021951	0.009732	0.878714	0.089603
0.037568	0.028437	0.899125	0.034869
0.080283	0.775928	0.0	0.143789

MOTIF	Forebrain_E16.5_H3K4me2_12_8_0.651_1.26763e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.31148	0.370162	0.006989	0.311369
0.077755	0.868709	0.023478	0.030058
0.091522	0.104353	0.695431	0.108695
0.056055	0.824078	0.048712	0.071155
0.028691	0.057467	0.824136	0.089706
0.065207	0.81435	0.055552	0.064891
0.181117	0.050667	0.643202	0.125014
0.031643	0.009755	0.923805	0.034797
0.075435	0.065878	0.785311	0.073376
0.100454	0.757928	0.060415	0.081203

MOTIF	Stomach_P0_H3K4me2_13_13_0.642_2.235793e-313
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.114802	0.844282	0.005342	0.035574
0.100258	0.055556	0.716935	0.12725
0.169244	0.718477	0.057147	0.055132
0.048037	0.061902	0.862011	0.02805
0.067899	0.876368	0.01944	0.036293
0.160766	0.029373	0.624946	0.184915
0.048213	0.006263	0.903696	0.041828
0.042463	0.033918	0.886906	0.036714
0.143799	0.755943	0.060826	0.039432

MOTIF	Liver_E15.5_H3K27me3_9_8_0.542_3.690569e-170
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.035941	0.859847	0.041246	0.062966
0.026882	0.125253	0.829003	0.018862
0.018654	0.943225	0.026045	0.012075
0.156336	0.05088	0.682109	0.110675
0.018188	0.72925	0.075443	0.177119
0.035934	0.017814	0.928193	0.018059
0.02291	0.027496	0.92571	0.023884
0.175162	0.01714	0.697619	0.110079
0.245037	0.640509	0.080239	0.034215
0.110684	0.450263	0.074436	0.364617

MOTIF	Kidney_P0_H3K27me3_12_7_0.551_2.480947e-40
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.072635	0.820266	0.04656	0.060538
0.084144	0.054997	0.760636	0.100224
0.011281	0.951773	0.015684	0.021262
0.020366	0.14292	0.727313	0.109401
0.061866	0.826424	0.03291	0.0788
0.036132	0.028667	0.733909	0.201292
0.034894	0.021161	0.832975	0.11097
0.02908	0.051378	0.801505	0.118037
0.095948	0.828476	0.03665	0.038926
0.125298	0.547541	0.123114	0.204048

MOTIF	Stomach_P0_H3K27me3_10_15_0.554_3.058656e-17
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.022848	0.797145	0.089474	0.090533
0.111384	0.060951	0.650624	0.17704
0.006004	0.85637	0.041894	0.095732
0.010291	0.07904	0.746744	0.163925
0.006278	0.808824	0.036413	0.148486
0.020576	0.019817	0.899705	0.059902
0.017477	0.03899	0.772354	0.171179
0.010877	0.014996	0.939882	0.034245
0.146943	0.791047	0.015205	0.046805

MOTIF	Intestine_E15.5_H3K27me3_4_7_0.554_2.791208e-74
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.097129	0.797797	0.027266	0.077807
0.056233	0.091168	0.732668	0.119931
0.013918	0.863124	0.021853	0.101105
0.021812	0.024258	0.845701	0.108229
0.050407	0.806814	0.050955	0.091824
0.041452	0.01734	0.884929	0.056279
0.045181	0.035434	0.777177	0.142208
0.081352	0.09929	0.724888	0.094469
0.057833	0.737183	0.021504	0.18348
0.122249	0.105181	0.32255	0.450019

MOTIF	Liver_E16.5_H3K27me3_5_6_0.619_1.055656e-199
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.040369	0.824323	0.071991	0.063317
0.095392	0.113089	0.706692	0.084828
0.01815	0.897202	0.037122	0.047525
0.068237	0.166391	0.679808	0.085564
0.036336	0.827514	0.039099	0.097051
0.189483	0.043414	0.711605	0.055498
0.017837	0.009397	0.936292	0.036474
0.09767	0.050632	0.834807	0.016891
0.089218	0.780374	0.009505	0.120903
0.082656	0.095937	0.348253	0.473155
0.113522	0.191961	0.562427	0.132091

MOTIF	Limb_E15.5_H3K4me3_22_7_0.682_1.444508e-312
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.028649	0.809585	0.05395	0.107816
0.104176	0.06933	0.682926	0.143568
0.09505	0.77943	0.039643	0.085877
0.039104	0.097778	0.667145	0.195972
0.047183	0.90197	0.030266	0.020581
0.058927	0.067749	0.757962	0.115363
0.029961	0.013048	0.922928	0.034063
0.07452	0.052309	0.851518	0.021652
0.059938	0.90288	0.014928	0.022253
0.417609	0.054844	0.034372	0.493175
0.003485	0.419565	0.541634	0.035316
0.024431	0.624053	0.213842	0.137673

MOTIF	Kidney_E14.5_H3K4me3_9_10_0.735_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.115963	0.846814	0.0	0.037222
0.025224	0.032542	0.924639	0.017594
0.152569	0.751247	0.036465	0.059719
0.048958	0.012553	0.794003	0.144485
0.046534	0.769801	0.165335	0.01833
0.198939	0.044213	0.608665	0.148183
0.069839	0.0	0.880182	0.049979
0.04347	0.058335	0.850632	0.047564
0.06844	0.81692	0.037514	0.077126

MOTIF	Midbrain_E13.5_H3K4me3_9_4_0.724_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.158019	0.399509	0.28889	0.153581
0.339755	0.397273	0.034942	0.22803
0.023901	0.93119	0.035401	0.009509
0.110758	0.092618	0.700762	0.095862
0.060354	0.854681	0.046519	0.038445
0.062798	0.058833	0.75191	0.126458
0.104978	0.774346	0.099588	0.021088
0.028664	0.090555	0.717735	0.163046
0.041094	0.056855	0.854723	0.047328
0.031351	0.065333	0.822424	0.080891
0.05784	0.828709	0.031201	0.08225

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K4me3_10_5_0.725_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.109998	0.163934	0.553265	0.172803
0.220717	0.549464	0.029083	0.200736
0.072048	0.851992	0.017029	0.058931
0.062625	0.079918	0.769926	0.087531
0.063265	0.792203	0.067189	0.077343
0.026515	0.061638	0.825639	0.086208
0.10905	0.771401	0.047134	0.072415
0.145782	0.040258	0.660194	0.153766
0.028706	0.003322	0.937577	0.030395
0.040069	0.042664	0.874617	0.04265
0.146027	0.715148	0.060277	0.078548

MOTIF	Stomach_E15.5_H3K4me3_8_6_0.713_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.293615	0.469362	0.008196	0.228827
0.039474	0.918716	0.01018	0.03163
0.080785	0.08131	0.733689	0.104216
0.060794	0.839353	0.027081	0.072771
0.053915	0.098395	0.720412	0.127278
0.120049	0.798434	0.053432	0.028086
0.125248	0.040178	0.698887	0.135687
0.02329	0.020128	0.926529	0.030052
0.080757	0.033297	0.853642	0.032303
0.171868	0.695094	0.076444	0.056594

MOTIF	Heart_E13.5_H3K4me3_10_8_0.676_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.033557	0.766728	0.060922	0.138793
0.02255	0.109788	0.838622	0.02904
0.126133	0.756759	0.030207	0.086901
0.06775	0.02273	0.734521	0.175
0.055006	0.90077	0.027775	0.01645
0.047046	0.039349	0.773704	0.139902
0.042985	0.067647	0.849844	0.039524
0.17398	0.05534	0.740282	0.030398
0.052837	0.858963	0.018076	0.070124
0.402432	0.247937	0.039566	0.310066

MOTIF	Neural-Tube_E11.5_H3K4me3_11_11_0.738_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.045325	0.911125	0.035023	0.008527
0.074011	0.039784	0.712602	0.173603
0.029729	0.916849	0.035157	0.018265
0.051921	0.054965	0.800112	0.093002
0.129379	0.823042	0.015913	0.031666
0.050213	0.047325	0.71981	0.182652
0.037451	0.005845	0.912897	0.043807
0.112035	0.038635	0.805856	0.043474
0.181833	0.658638	0.033408	0.126122
0.21381	0.269411	0.0	0.516778

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K4me3_13_11_0.729_4.841843e-322
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.035748	0.816098	0.049478	0.098677
0.102034	0.077008	0.676695	0.144262
0.104396	0.781674	0.027798	0.086132
0.037164	0.084407	0.724336	0.154093
0.037522	0.917121	0.027857	0.0175
0.043725	0.03556	0.806391	0.114324
0.041877	0.034272	0.886089	0.037761
0.143406	0.0722	0.742293	0.0421
0.053021	0.898331	0.017543	0.031105
0.164501	0.583133	0.022101	0.230265

MOTIF	Heart_E14.5_H3K4me3_13_13_0.703_2.025777e-313
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.208751	0.66804	0.033844	0.089366
0.120003	0.079617	0.663308	0.137073
0.135938	0.755577	0.027604	0.080881
0.05835	0.071794	0.736902	0.132954
0.007513	0.950878	0.009812	0.031798
0.061148	0.043035	0.829779	0.066038
0.035785	0.007124	0.911747	0.045344
0.095074	0.03833	0.836622	0.029974
0.073002	0.830522	0.006244	0.090233

MOTIF	Lung_E16.5_H3K4me3_10_11_0.689_1.79799e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.382454	0.223297	0.332692	0.061557
0.104543	0.759769	0.063611	0.072077
0.135777	0.070679	0.611554	0.18199
0.010524	0.869465	0.042073	0.077938
0.059757	0.069653	0.667602	0.202988
0.063351	0.865352	0.045255	0.026041
0.051288	0.044029	0.851231	0.053452
0.030757	0.007545	0.923975	0.037724
0.134675	0.043688	0.772416	0.04922
0.028011	0.905611	0.036335	0.030043

MOTIF	Stomach_E16.5_H3K4me3_4_6_0.706_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.260593	0.145135	0.440133	0.15414
0.046179	0.902909	0.024095	0.026817
0.080827	0.165866	0.662049	0.091258
0.069439	0.821143	0.041561	0.067857
0.04301	0.073154	0.769153	0.114683
0.07923	0.810197	0.082238	0.028336
0.141181	0.030823	0.743384	0.084612
0.038487	0.006762	0.924485	0.030266
0.101078	0.033799	0.822703	0.042419
0.111369	0.742971	0.082131	0.063529