MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Forebrain_E12.5_H3K4me3_75_100_0.558_8.729294e-157
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.626408	0.066361	0.057541	0.249689
0.014488	0.941509	0.044002	0.0
0.903001	0.0	0.050138	0.046861
0.0	0.283031	0.704447	0.012522
0.016374	0.95962	0.016269	0.007737
0.028478	0.607898	0.013575	0.350048
0.047338	0.785563	0.050668	0.116431
0.049692	0.0	0.908425	0.041883
0.006365	0.137597	0.848586	0.007452

MOTIF	Neural-Tube_E13.5_H3K4me3_62_38_0.593_1.953303e-314
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.018653	0.777143	0.082312	0.121892
0.798201	0.029467	0.11525	0.057083
0.016503	0.012509	0.942568	0.02842
0.0	0.997651	0.0	0.002349
0.117217	0.356345	0.042316	0.484122
0.032851	0.929796	0.034565	0.002789
0.065851	0.100948	0.783173	0.050027
0.019025	0.030672	0.944585	0.005718
0.192096	0.652244	0.070994	0.084665
0.0	0.354003	0.0	0.645997

MOTIF	Neural-Tube_E12.5_H3K4me3_71_57_0.553_1.975962e-79
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.567728	0.0	0.0	0.432272
0.0	0.864938	0.049143	0.085919
0.42878	0.020756	0.395399	0.155065
0.042019	0.063634	0.799104	0.095243
0.022918	0.933013	0.025114	0.018955
0.027319	0.940486	0.032195	0.0
0.180757	0.738454	0.0	0.080789
0.010053	0.0	0.968859	0.021088
0.0	0.018653	0.981347	0.0

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K4me3_75_55_0.570_6.706441e-296
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.12893	0.056052	0.547742	0.267275
0.0	0.819799	0.024754	0.155447
0.00538	0.970724	0.0	0.023895
0.022045	0.792934	0.0	0.185022
0.045656	0.00811	0.906777	0.039458
0.014867	0.052096	0.919348	0.01369
0.054565	0.005156	0.85021	0.090068
0.245476	0.644865	0.04653	0.063129
0.041705	0.857429	0.0	0.100865

MOTIF	Limb_E11.5_H3K4me3_45_21_0.663_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.053422	0.804748	0.041122	0.100707
0.099034	0.673329	0.116861	0.110776
0.17164	0.082704	0.65089	0.094766
0.059099	0.022004	0.869446	0.049451
0.02542	0.963674	0.0	0.010906
0.01771	0.768694	0.050836	0.162759
0.081038	0.71837	0.128953	0.071638
0.033334	0.040752	0.88446	0.041455
0.021972	0.011695	0.951939	0.014395

MOTIF	Lung_E14.5_H3K4me3_54_27_0.617_1.780972e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.051288	0.829497	0.098578	0.020637
0.133917	0.717114	0.061447	0.087522
0.248466	0.046255	0.541102	0.164177
0.031684	0.051632	0.845878	0.070806
0.035035	0.912872	0.015211	0.036882
0.034627	0.86641	0.052917	0.046045
0.143139	0.56378	0.137629	0.155452
0.041465	0.014187	0.926391	0.017957
0.021653	0.026565	0.938719	0.013063

MOTIF	Liver_E13.5_H3K4me3_28_12_0.638_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.078706	0.534386	0.251406	0.135503
0.10797	0.783002	0.092083	0.016945
0.007916	0.871356	0.02093	0.099798
0.080796	0.733312	0.075627	0.110265
0.014202	0.039091	0.842388	0.104318
0.265642	0.007653	0.720759	0.005946
0.009175	0.006008	0.967128	0.017689
0.163683	0.735622	0.065019	0.035677
0.053054	0.801308	0.110117	0.035521
0.024932	0.099306	0.845099	0.030663

MOTIF	Kidney_E14.5_H3K4me3_59_15_0.598_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.312677	0.261124	0.088679	0.33752
0.042492	0.524641	0.063333	0.369534
0.093584	0.801492	0.069679	0.035245
0.007757	0.946912	0.022566	0.022766
0.078434	0.781971	0.061525	0.07807
0.149815	0.027264	0.733981	0.08894
0.049032	0.036681	0.905496	0.008791
0.028456	0.035494	0.921947	0.014103
0.127945	0.817148	0.028896	0.026011
0.158308	0.554477	0.083698	0.203517
0.042458	0.035294	0.759409	0.162839

MOTIF	Forebrain_E11.5_H3K4me3_56_15_0.624_3.247843e-314
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.076479	0.721366	0.069124	0.133031
0.007371	0.935656	0.038877	0.018096
0.077453	0.816214	0.062755	0.043579
0.130019	0.029441	0.774442	0.066098
0.047236	0.020258	0.926984	0.005522
0.07954	0.119194	0.782522	0.018744
0.135887	0.76101	0.067333	0.035771
0.117992	0.624665	0.066901	0.190442
0.024085	0.044823	0.850012	0.08108
0.382767	0.0	0.389111	0.228122

MOTIF	Neural-Tube_E11.5_H3K4me3_26_12_0.680_1.106223e-312
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.055307	0.329513	0.294046	0.321134
0.053149	0.757362	0.063006	0.126483
0.007918	0.867636	0.02215	0.102296
0.067772	0.830655	0.057499	0.044074
0.078636	0.042375	0.830877	0.048111
0.041373	0.03055	0.919967	0.00811
0.029445	0.027616	0.857452	0.085488
0.119149	0.766064	0.030134	0.084653
0.081468	0.642613	0.156703	0.119216
0.064289	0.095937	0.767794	0.07198

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K4me3_37_15_0.652_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.051245	0.751583	0.15894	0.038232
0.024173	0.802762	0.161209	0.011855
0.087937	0.856732	0.031402	0.023929
0.108803	0.038253	0.800588	0.052356
0.062697	0.035029	0.888713	0.013561
0.041499	0.049898	0.836842	0.07176
0.061968	0.808884	0.047554	0.081594
0.097847	0.738161	0.013619	0.150373
0.063928	0.021389	0.778325	0.136358

MOTIF	Limb_E11.5_H3K4me3_33_13_0.686_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.046087	0.660387	0.179162	0.114364
0.023864	0.906737	0.053901	0.015498
0.025912	0.820268	0.084824	0.068996
0.09778	0.030141	0.809396	0.062684
0.117972	0.031771	0.839099	0.011159
0.081395	0.114027	0.784498	0.020081
0.057301	0.790567	0.061708	0.090424
0.105725	0.738509	0.039893	0.115872
0.080919	0.034831	0.824249	0.060001

MOTIF	Kidney_P0_H3K4me3_49_17_0.632_3.362654e-316
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.015024	0.875241	0.075243	0.034492
0.009563	0.893654	0.011335	0.085447
0.02829	0.786233	0.043317	0.142161
0.082269	0.035662	0.800329	0.081741
0.139383	0.069187	0.787273	0.004158
0.033058	0.007357	0.936649	0.022936
0.143653	0.765843	0.060403	0.030101
0.119734	0.661891	0.073034	0.145341
0.07845	0.071008	0.701409	0.149133

MOTIF	Forebrain_E16.5_H3K4me3_40_13_0.622_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.060572	0.832298	0.07294	0.03419
0.007293	0.846869	0.070361	0.075476
0.083672	0.809232	0.03239	0.074706
0.085327	0.035116	0.813661	0.065897
0.175378	0.056401	0.761294	0.006927
0.084507	0.015687	0.873194	0.026611
0.052938	0.798547	0.078409	0.070107
0.104447	0.710892	0.046233	0.138428
0.062122	0.035298	0.76389	0.13869

MOTIF	Stomach_E14.5_H3K4me3_47_18_0.643_1.864668e-317
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.012951	0.902091	0.053313	0.031645
0.037145	0.775148	0.073552	0.114154
0.036739	0.797011	0.029817	0.136433
0.138008	0.032213	0.809536	0.020244
0.142045	0.062876	0.785482	0.009597
0.07346	0.035524	0.869773	0.021243
0.050977	0.873368	0.043224	0.032431
0.120755	0.705038	0.048076	0.126131
0.100641	0.030716	0.763267	0.105376

MOTIF	Cranio-Facial_E13.5_H3K4me3_40_14_0.636_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.016102	0.752286	0.148278	0.083335
0.025119	0.87873	0.035788	0.060363
0.073267	0.818275	0.026753	0.081705
0.120974	0.029236	0.810627	0.039163
0.06325	0.034302	0.869224	0.033224
0.072432	0.044661	0.856637	0.02627
0.116292	0.775866	0.039065	0.068776
0.108002	0.657945	0.069972	0.164082
0.097127	0.060646	0.776757	0.065469

MOTIF	Neural-Tube_E15.5_H3K4me3_29_10_0.663_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.057359	0.771897	0.08256	0.088184
0.027789	0.844097	0.068143	0.059972
0.079511	0.83984	0.042176	0.038473
0.08404	0.041758	0.810726	0.063476
0.116067	0.040421	0.832419	0.011093
0.059602	0.018502	0.898917	0.022978
0.128535	0.685521	0.135168	0.050775
0.105885	0.705797	0.061701	0.126617
0.030436	0.055019	0.818311	0.096233

MOTIF	Heart_E11.5_H3K4me3_44_17_0.616_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.050602	0.799819	0.119354	0.030226
0.015586	0.936012	0.034757	0.013645
0.084588	0.792693	0.027808	0.094911
0.121804	0.03958	0.771669	0.066947
0.137713	0.023844	0.823256	0.015187
0.040753	0.040647	0.873667	0.044932
0.127411	0.738757	0.057001	0.076831
0.087288	0.704415	0.041743	0.166555
0.038402	0.047118	0.786437	0.128043

MOTIF	Lung_E15.5_H3K4me3_46_13_0.634_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.02521	0.809631	0.08325	0.081908
0.032176	0.845752	0.098398	0.023674
0.080303	0.823245	0.030917	0.065535
0.113197	0.025711	0.787838	0.073254
0.097671	0.048026	0.842824	0.01148
0.03843	0.042646	0.85699	0.061934
0.100803	0.761929	0.054341	0.082927
0.075112	0.718732	0.049389	0.156767
0.036987	0.070327	0.771804	0.120882

MOTIF	Stomach_E16.5_H3K4me3_47_16_0.614_2.806293e-321
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.051635	0.811976	0.053657	0.082732
0.034132	0.88146	0.035596	0.048812
0.061153	0.815203	0.049313	0.074331
0.090955	0.055152	0.78001	0.073883
0.103201	0.022532	0.85942	0.014847
0.035099	0.007073	0.91216	0.045668
0.125557	0.722514	0.057991	0.093937
0.061631	0.682767	0.079658	0.175944
0.08526	0.067013	0.711283	0.136444

MOTIF	Hindbrain_E14.5_H3K4me3_38_21_0.649_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.049478	0.780906	0.076256	0.093359
0.004804	0.85763	0.046825	0.090741
0.059272	0.879661	0.032546	0.02852
0.120517	0.017428	0.816001	0.046054
0.045557	0.024691	0.920467	0.009284
0.034799	0.008704	0.928371	0.028126
0.157456	0.670479	0.067097	0.104969
0.098075	0.702342	0.052838	0.146745
0.122014	0.081098	0.652649	0.14424

MOTIF	Heart_E13.5_H3K4me3_48_16_0.611_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.052859	0.806076	0.051921	0.089144
0.024604	0.831302	0.059145	0.084949
0.085555	0.813769	0.0359	0.064775
0.104616	0.044417	0.780801	0.070166
0.047376	0.051188	0.887875	0.013562
0.025352	0.041081	0.913071	0.020496
0.111933	0.752623	0.046533	0.08891
0.126668	0.608429	0.137808	0.127095
0.065484	0.029154	0.796269	0.109093

MOTIF	Kidney_E16.5_H3K4me3_52_19_0.606_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.040375	0.797808	0.065415	0.096401
0.019251	0.870266	0.027514	0.082969
0.065595	0.781285	0.043912	0.109209
0.129942	0.03962	0.748335	0.082103
0.032855	0.030781	0.925633	0.010731
0.031562	0.024824	0.914538	0.029075
0.060678	0.716191	0.117198	0.105933
0.104781	0.702988	0.037605	0.154625
0.039296	0.034789	0.770656	0.155259

MOTIF	Stomach_P0_H3K4me3_63_22_0.611_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.054749	0.790446	0.028232	0.126572
0.028139	0.83323	0.05979	0.078841
0.100081	0.80406	0.031343	0.064517
0.120148	0.043932	0.764281	0.071639
0.042313	0.046545	0.901196	0.009946
0.031071	0.017821	0.921422	0.029687
0.060516	0.762554	0.076075	0.100855
0.094496	0.728327	0.038762	0.138415
0.09946	0.046532	0.691772	0.162235