MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Midbrain_E12.5_H3K27ac_54_30_0.531_9.097516e-50 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.109183 0.670995 0.136951 0.082871 0.032409 0.889752 0.062313 0.015526 0.766434 0.06502 0.077442 0.091104 0.009711 0.102786 0.873366 0.014137 0.125226 0.699121 0.155383 0.020269 0.027012 0.85319 0.111376 0.008422 0.796289 0.049268 0.071892 0.082551 0.004612 0.084095 0.868796 0.042497 0.064507 0.794925 0.098954 0.041613 0.329288 0.269983 0.282597 0.118131 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K27ac_55_45_0.529_2.85938e-58 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.098704 0.682533 0.144479 0.074284 0.031599 0.857355 0.098137 0.012909 0.802409 0.060966 0.036627 0.099998 0.005098 0.070202 0.90814 0.01656 0.124622 0.683352 0.164472 0.027554 0.053626 0.826358 0.110474 0.009542 0.784835 0.073566 0.065675 0.075923 0.00134 0.080424 0.874845 0.043391 0.086547 0.764012 0.09906 0.05038 MOTIF Midbrain_E15.5_H3K27ac_59_55_0.529_1.256595e-54 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.105172 0.677357 0.122871 0.0946 0.044435 0.826242 0.106889 0.022433 0.792282 0.048588 0.046787 0.112343 0.001901 0.061545 0.911251 0.025302 0.130168 0.677301 0.179542 0.012989 0.053567 0.853659 0.081425 0.01135 0.872533 0.02486 0.059089 0.043518 0.008996 0.105063 0.859453 0.026488 0.07203 0.732641 0.136098 0.059231 MOTIF Neural-Tube_E11.5_H3K27ac_40_18_0.538_3.879997e-34 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.059203 0.743998 0.138286 0.058514 0.017755 0.861133 0.113741 0.007371 0.736993 0.082479 0.048014 0.132514 0.007408 0.02176 0.939032 0.0318 0.09329 0.800784 0.08853 0.017396 0.032707 0.885334 0.066016 0.015942 0.689987 0.128798 0.052721 0.128494 0.009151 0.096676 0.848503 0.04567 0.037639 0.747808 0.169182 0.045371 0.0 0.033714 0.922016 0.04427 MOTIF Intestine_E14.5_H3K27ac_88_43_0.511_4.313268e-12 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.016729 0.939564 0.041914 0.001793 0.046008 0.052864 0.048694 0.852434 0.016862 0.1586 0.811066 0.013471 0.01958 0.034691 0.752284 0.193446 0.018176 0.870419 0.106975 0.00443 0.066769 0.090296 0.030205 0.812729 0.006564 0.075057 0.866134 0.052245 0.099423 0.270151 0.577174 0.053252 0.077579 0.782335 0.049087 0.090999 0.135239 0.253131 0.059616 0.552015 MOTIF Forebrain_E11.5_H3K27ac_76_86_0.510_4.869852e-09 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.074129 0.868314 0.032458 0.025099 0.057021 0.037245 0.038025 0.867709 0.001813 0.164462 0.820884 0.012841 0.016322 0.102808 0.68103 0.19984 0.005053 0.812165 0.179623 0.003158 0.066036 0.103216 0.030552 0.800196 0.035168 0.019482 0.871341 0.074008 0.077287 0.047341 0.805142 0.070231 0.127725 0.718317 0.078629 0.075329 MOTIF Midbrain_E11.5_H3K27ac_66_68_0.521_7.936722e-14 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.0574 0.897666 0.040174 0.004759 0.085625 0.022419 0.072755 0.819201 0.004982 0.119102 0.865771 0.010145 0.032501 0.025657 0.816411 0.125431 0.033598 0.811095 0.155307 0.0 0.127632 0.180572 0.020107 0.671689 0.02596 0.134681 0.829385 0.009974 0.051036 0.068071 0.824093 0.0568 0.094755 0.825587 0.064485 0.015173 MOTIF Kidney_E16.5_H3K27ac_64_41_0.516_3.506981e-15 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.066258 0.849769 0.071491 0.012483 0.053875 0.088971 0.044164 0.81299 0.012954 0.089031 0.860539 0.037477 0.034862 0.087969 0.766152 0.111017 0.032063 0.860294 0.106772 0.000871 0.103313 0.061796 0.036406 0.798485 0.012243 0.093194 0.852007 0.042556 0.073148 0.201014 0.666968 0.05887 0.097656 0.768353 0.063901 0.07009 0.096506 0.181919 0.202647 0.518929 MOTIF Limb_E13.5_H3K27ac_55_42_0.522_8.211575e-20 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.038264 0.836992 0.122433 0.002311 0.060615 0.085185 0.048279 0.80592 0.00971 0.07933 0.852458 0.058501 0.013545 0.063028 0.817324 0.106103 0.028344 0.929346 0.037732 0.004578 0.113348 0.056345 0.090829 0.739479 0.00962 0.088647 0.843685 0.058048 0.063193 0.247989 0.629177 0.05964 0.060286 0.778595 0.07808 0.083039 MOTIF Cranio-Facial_E15.5_H3K27ac_48_24_0.526_3.336559e-33 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.06421 0.807523 0.119868 0.008399 0.073536 0.080267 0.044187 0.802009 0.011172 0.077418 0.877882 0.033528 0.019042 0.06236 0.810584 0.108014 0.031831 0.869311 0.094792 0.004065 0.093695 0.0532 0.075956 0.77715 0.007813 0.104508 0.852926 0.034752 0.057936 0.22994 0.661588 0.050536 0.045626 0.798196 0.077522 0.078656 0.12017 0.163981 0.407769 0.308079 MOTIF Limb_E15.5_H3K27ac_38_24_0.530_3.869849e-42 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.073364 0.763899 0.149587 0.01315 0.091721 0.092464 0.039499 0.776316 0.023102 0.112645 0.840083 0.02417 0.020852 0.072881 0.815416 0.09085 0.033088 0.924278 0.038928 0.003706 0.17259 0.028025 0.089467 0.709918 0.004841 0.078778 0.879685 0.036696 0.046341 0.216117 0.688855 0.048686 0.071476 0.79569 0.071903 0.060931 0.092289 0.150588 0.279621 0.477502 MOTIF Neural-Tube_E14.5_H3K27ac_63_54_0.523_1.629882e-22 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.073214 0.713899 0.212888 0.0 0.049077 0.080755 0.044348 0.825821 0.0 0.152956 0.827367 0.019676 0.024167 0.115331 0.762516 0.097986 0.011764 0.856512 0.125558 0.006166 0.166005 0.1046 0.095181 0.634214 0.007478 0.08282 0.897623 0.01208 0.032221 0.060564 0.865124 0.042092 0.049153 0.854415 0.0392 0.057232 MOTIF Limb_E14.5_H3K27ac_84_56_0.508_2.724021e-08 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.008763 0.957284 0.033952 0.0 0.055096 0.005751 0.017954 0.921199 0.00862 0.120106 0.84441 0.026864 0.021206 0.093476 0.711469 0.173848 0.024995 0.840468 0.133031 0.001506 0.19462 0.061245 0.047688 0.696447 0.018958 0.103287 0.862783 0.014973 0.103359 0.095766 0.743737 0.057138 0.109943 0.701307 0.108549 0.080202 0.059107 0.371426 0.564706 0.004761 0.305534 0.021769 0.005559 0.667138 MOTIF Stomach_E14.5_H3K27ac_83_40_0.515_2.891176e-10 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.083503 0.86767 0.048828 0.0 0.04447 0.093678 0.023662 0.838189 0.011507 0.115444 0.853056 0.019993 0.015431 0.062832 0.800269 0.121468 0.004946 0.958896 0.032188 0.003971 0.042467 0.034615 0.034172 0.888745 0.004532 0.13235 0.78787 0.075247 0.077685 0.33813 0.518177 0.066008 0.055362 0.684618 0.107863 0.152157 0.101921 0.439409 0.421108 0.037561 0.667426 0.0 0.096497 0.236077 MOTIF Forebrain_E16.5_H3K9ac_78_78_0.528_1.965051e-43 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.159977 0.123146 0.030313 0.686564 0.037287 0.162736 0.386278 0.4137 0.035901 0.849105 0.047878 0.067117 0.166917 0.824809 0.008274 0.0 0.366848 0.365418 0.03976 0.227974 0.088017 0.063896 0.796757 0.05133 0.130396 0.757507 0.094097 0.018 0.0 0.952166 0.042204 0.005631 0.875009 0.038459 0.011306 0.075225 0.0 0.033686 0.936453 0.029862 0.0099 0.948458 0.041642 0.0 MOTIF Forebrain_E14.5_H3K9ac_87_128_0.501_7.709548e-17 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.000135 0.876812 0.123053 0.0 0.077959 0.01082 0.008992 0.902229 0.0 0.0 0.989896 0.010104 0.049046 0.017868 0.784303 0.148783 0.032501 0.886092 0.066863 0.014544 0.11718 0.155157 0.0 0.727663 0.028015 0.033563 0.875292 0.06313 0.076691 0.261844 0.60142 0.060046 0.082055 0.829748 0.01889 0.069306 MOTIF Limb_E14.5_H3K9ac_90_86_0.509_3.071468e-21 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.015891 0.86251 0.121599 0.0 0.140559 0.039247 0.068868 0.751326 0.0 0.167824 0.821406 0.01077 0.006008 0.099138 0.778974 0.115881 0.01487 0.819798 0.165332 0.0 0.104364 0.032608 0.059311 0.803717 0.012378 0.095853 0.891768 0.0 0.031438 0.097662 0.80612 0.06478 0.112763 0.760538 0.010819 0.11588 0.243195 0.011961 0.281871 0.462972 MOTIF Cranio-Facial_E13.5_H3K9me3_89_41_0.511_4.353155e-15 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.141205 0.807711 0.011872 0.039211 0.039083 0.92211 0.007468 0.031339 0.788837 0.043092 0.022923 0.145148 0.138295 0.02302 0.728561 0.110124 0.00328 0.886482 0.070475 0.039763 0.023833 0.945353 0.006779 0.024035 0.588504 0.157754 0.022748 0.230993 0.056005 0.091727 0.827718 0.02455 0.905233 0.024971 0.049733 0.020062 0.267976 0.040596 0.493732 0.197696 0.433977 0.00655 0.431064 0.128409 0.0 0.571407 0.351562 0.077031 MOTIF Limb_E15.5_H3K9me3_5_145_0.528_7.292342e-10 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.148441 0.787756 0.033189 0.030614 0.035632 0.921099 0.037456 0.005814 0.69482 0.098208 0.10485 0.102123 0.315653 0.03722 0.553372 0.093755 0.010162 0.847636 0.087631 0.054572 0.031187 0.825409 0.024982 0.118422 0.859739 0.014223 0.025811 0.100227 0.012302 0.035468 0.916073 0.036157 0.904516 0.046809 0.0 0.048674 MOTIF Kidney_E15.5_H3K9me3_113_113_0.503_9.146899e-06 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.056371 0.871205 0.005364 0.06706 0.057569 0.763991 0.150861 0.02758 0.767251 0.057389 0.049606 0.125753 0.008634 0.063233 0.845944 0.082188 0.017845 0.872527 0.061651 0.047977 0.005331 0.92775 0.058594 0.008325 0.707398 0.085509 0.007493 0.1996 0.028626 0.035984 0.901881 0.033508 0.676543 0.249005 0.041918 0.032534 MOTIF Neural-Tube_E13.5_H3K9me3_136_77_0.502_4.753939e-07 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.038116 0.893424 0.008693 0.059767 0.0 0.981482 0.00906 0.009458 0.697827 0.060188 0.102451 0.139534 0.011605 0.082861 0.795397 0.110136 0.015156 0.943216 0.02941 0.012218 0.003994 0.959913 0.008225 0.027868 0.652274 0.150373 0.003535 0.193817 0.04242 0.052711 0.810571 0.094298 0.722265 0.247846 0.001231 0.028658 MOTIF Limb_E15.5_H3K9me3_43_115_0.517_2.574473e-06 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.0 0.935019 0.056998 0.007983 0.737048 0.002249 0.021607 0.239095 0.056629 0.025066 0.889549 0.028756 0.039764 0.831002 0.107233 0.022001 0.075159 0.851714 0.048326 0.024801 0.65516 0.0212 0.142001 0.181638 0.14237 0.020965 0.810646 0.026019 0.808449 0.021254 0.04457 0.125728 0.022581 0.04511 0.928785 0.003524 0.08816 0.599128 0.203862 0.10885 MOTIF Neural-Tube_E14.5_H3K9me3_78_139_0.506_0.001604308 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.837632 0.044411 0.018552 0.099405 0.006639 0.663937 0.294698 0.034726 0.970079 0.002405 0.00123 0.026285 0.0 0.186607 0.793047 0.020346 0.086733 0.80365 0.030149 0.079469 0.041463 0.807611 0.003402 0.147525 0.9149 0.048008 0.002574 0.034518 0.254683 0.022397 0.677453 0.045467 0.886781 0.071861 0.02171 0.019648 MOTIF Neural-Tube_E14.5_H3K9me3_83_109_0.504_0.01852172 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.028492 0.684965 0.233542 0.053001 0.871825 0.099722 0.0 0.028452 0.004023 0.218459 0.746765 0.030753 0.008613 0.93728 0.016127 0.03798 0.028898 0.949766 0.014673 0.006662 0.887602 0.036719 0.026385 0.049294 0.094283 0.070607 0.798648 0.036462 0.892403 0.077734 0.002997 0.026867 0.025067 0.111811 0.693108 0.170013