MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Forebrain_P0_H3K27me3_9_158_0.537_2.806235e-18
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.07	0.748	0.105	0.077
0.129	0.637	0.094	0.14
0.09	0.153	0.648	0.109
0.093	0.694	0.135	0.078
0.128	0.08	0.707	0.085
0.673	0.123	0.146	0.058
0.749	0.058	0.109	0.084
0.084	0.12	0.701	0.095
0.087	0.116	0.106	0.691
0.058	0.101	0.091	0.75

MOTIF	Hindbrain_E14.5_H3K27me3_17_153_0.546_1.133193e-34
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.138	0.609	0.146	0.107
0.131	0.166	0.553	0.15
0.124	0.166	0.592	0.118
0.147	0.558	0.166	0.129
0.145	0.134	0.652	0.069
0.6	0.188	0.189	0.023
0.619	0.113	0.168	0.1
0.135	0.161	0.61	0.094
0.123	0.155	0.146	0.576
0.08	0.114	0.175	0.631

MOTIF	Neural-Tube_E15.5_H3K27me3_5_154_0.524_4.682564e-20
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.234	0.283	0.246	0.237
0.159	0.536	0.149	0.156
0.142	0.153	0.555	0.15
0.153	0.553	0.15	0.144
0.164	0.139	0.549	0.148
0.561	0.152	0.156	0.131
0.575	0.132	0.151	0.142
0.15	0.143	0.55	0.157
0.143	0.15	0.158	0.549
0.234	0.222	0.254	0.291

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K27me3_9_157_0.545_1.261768e-37
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.083	0.123	0.693	0.101
0.116	0.683	0.104	0.097
0.102	0.092	0.715	0.091
0.1	0.696	0.119	0.085
0.129	0.099	0.691	0.081
0.679	0.123	0.126	0.072
0.735	0.071	0.119	0.075
0.081	0.094	0.727	0.098
0.092	0.115	0.124	0.669
0.086	0.103	0.1	0.711

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K4me3_18_153_0.699_3.395802e-318
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.169	0.829	0.001	0.001
0.035	0.098	0.866	0.001
0.199	0.331	0.252	0.218
0.235	0.127	0.297	0.341
0.279	0.13	0.26	0.332
0.319	0.233	0.166	0.282
0.325	0.161	0.201	0.312
0.376	0.001	0.094	0.529
0.001	0.275	0.001	0.723
0.262	0.265	0.079	0.394

MOTIF	Hindbrain_E15.5_H3K4me3_1_151_0.775_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.111	0.795	0.017	0.077
0.039	0.001	0.959	0.001
0.152	0.528	0.145	0.175
0.262	0.134	0.294	0.31
0.292	0.185	0.189	0.333
0.369	0.174	0.001	0.456
0.277	0.197	0.191	0.335
0.3	0.175	0.204	0.32

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K4me3_2_151_0.761_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.052	0.855	0.078	0.015
0.028	0.174	0.792	0.006
0.022	0.762	0.158	0.058
0.001	0.228	0.737	0.034
0.369	0.192	0.367	0.072
0.604	0.039	0.168	0.189
0.165	0.166	0.453	0.217
0.445	0.156	0.05	0.349

MOTIF	Cranio-Facial_E15.5_H3K4me3_6_153_0.731_3.386025e-316
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.075	0.81	0.007	0.108
0.026	0.016	0.933	0.025
0.03	0.885	0.063	0.022
0.095	0.06	0.726	0.119
0.51	0.157	0.231	0.102
0.652	0.049	0.113	0.186
0.159	0.153	0.487	0.201
0.123	0.126	0.023	0.728
0.033	0.116	0.048	0.803
0.103	0.187	0.056	0.654

MOTIF	Cranio-Facial_E11.5_H3K4me3_16_156_0.714_3.672569e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.108	0.691	0.093	0.108
0.09	0.088	0.738	0.084
0.093	0.729	0.097	0.081
0.106	0.079	0.711	0.104
0.645	0.108	0.141	0.106
0.682	0.111	0.102	0.105
0.112	0.112	0.67	0.106
0.112	0.102	0.087	0.699
0.074	0.11	0.09	0.726
0.101	0.105	0.087	0.707

MOTIF	Liver_E12.5_H3K4me3_23_158_0.649_3.196231e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.112	0.71	0.086	0.092
0.092	0.083	0.743	0.082
0.086	0.709	0.107	0.098
0.103	0.088	0.707	0.102
0.667	0.112	0.116	0.105
0.692	0.099	0.107	0.102
0.106	0.119	0.665	0.11
0.093	0.098	0.093	0.716
0.085	0.122	0.083	0.71
0.107	0.107	0.106	0.68

MOTIF	Liver_E14.5_H3K4me3_29_160_0.649_2.253718e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.116	0.7	0.099	0.085
0.095	0.084	0.735	0.086
0.09	0.707	0.109	0.094
0.12	0.086	0.667	0.127
0.677	0.103	0.112	0.108
0.696	0.096	0.107	0.101
0.119	0.108	0.676	0.097
0.101	0.094	0.075	0.73
0.09	0.113	0.084	0.713
0.106	0.099	0.098	0.697

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K4me3_1_152_0.797_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.369	0.144	0.234	0.253
0.541	0.044	0.271	0.144
0.42	0.169	0.212	0.199
0.281	0.296	0.187	0.237
0.151	0.168	0.227	0.454
0.128	0.3	0.168	0.404
0.056	0.642	0.013	0.289
0.076	0.169	0.647	0.108
0.006	0.992	0.001	0.001
0.215	0.035	0.567	0.183

MOTIF	Liver_E13.5_H3K4me3_1_154_0.730_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.118	0.62	0.013	0.249
0.01	0.106	0.802	0.082
0.008	0.773	0.134	0.085
0.167	0.017	0.652	0.164
0.505	0.178	0.181	0.136
0.488	0.167	0.12	0.224
0.386	0.167	0.193	0.254
0.224	0.152	0.191	0.433

MOTIF	Liver_E11.5_H3K4me3_8_157_0.714_6.317762e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.156	0.643	0.064	0.137
0.066	0.125	0.705	0.104
0.087	0.71	0.12	0.083
0.127	0.092	0.657	0.124
0.485	0.176	0.188	0.152
0.596	0.156	0.134	0.114
0.175	0.164	0.493	0.169
0.136	0.161	0.108	0.595
0.17	0.141	0.116	0.573
0.542	0.171	0.115	0.172

MOTIF	Lung_E16.5_H3K4me3_4_152_0.733_3.327387e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.185	0.615	0.092	0.108
0.08	0.114	0.709	0.097
0.082	0.669	0.164	0.085
0.119	0.094	0.67	0.117
0.282	0.22	0.259	0.238
0.361	0.192	0.198	0.25
0.316	0.057	0.277	0.351
0.1	0.197	0.097	0.606
0.093	0.134	0.108	0.665
0.348	0.089	0.079	0.484

MOTIF	Intestine_E14.5_H3K4me3_25_157_0.699_5.440997e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.093	0.712	0.096	0.099
0.096	0.089	0.718	0.097
0.103	0.706	0.092	0.099
0.111	0.092	0.691	0.106
0.708	0.092	0.102	0.098
0.713	0.094	0.099	0.094
0.694	0.11	0.099	0.097
0.104	0.109	0.115	0.672
0.094	0.098	0.108	0.7
0.685	0.111	0.102	0.102

MOTIF	Midbrain_E16.5_H3K4me3_8_154_0.703_4.721498e-312
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.137	0.587	0.134	0.142
0.113	0.132	0.631	0.124
0.111	0.623	0.147	0.119
0.137	0.112	0.611	0.14
0.575	0.13	0.154	0.141
0.631	0.115	0.13	0.124
0.59	0.119	0.138	0.153
0.148	0.127	0.132	0.593
0.151	0.128	0.125	0.596
0.561	0.135	0.135	0.169

MOTIF	Neural-Tube_E13.5_H3K4me3_22_154_0.698_8.763969e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.258	0.111	0.177	0.453
0.787	0.106	0.008	0.099
0.337	0.001	0.543	0.119
0.137	0.332	0.175	0.356
0.762	0.015	0.101	0.122
0.381	0.301	0.212	0.106
0.061	0.815	0.041	0.083
0.044	0.045	0.866	0.045
0.083	0.755	0.082	0.08
0.344	0.083	0.349	0.225

MOTIF	Forebrain_E16.5_H3K4me3_6_152_0.735_3.293195e-318
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.127	0.559	0.197	0.117
0.001	0.003	0.975	0.021
0.053	0.887	0.059	0.001
0.133	0.062	0.67	0.135
0.117	0.175	0.35	0.359
0.182	0.12	0.206	0.492
0.396	0.136	0.189	0.279
0.365	0.185	0.096	0.354
0.119	0.159	0.022	0.7
0.06	0.078	0.053	0.809

MOTIF	Limb_E11.5_H3K4me3_2_152_0.795_3.231646e-312
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.317	0.166	0.254	0.262
0.457	0.12	0.269	0.154
0.659	0.056	0.271	0.014
0.556	0.193	0.244	0.007
0.413	0.235	0.171	0.181
0.289	0.25	0.206	0.255
0.194	0.448	0.058	0.3
0.094	0.168	0.546	0.192
0.035	0.933	0.003	0.029
0.172	0.133	0.528	0.167

MOTIF	Limb_E13.5_H3K4me3_23_154_0.684_3.6542e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.541	0.133	0.195	0.131
0.685	0.083	0.148	0.084
0.739	0.06	0.087	0.114
0.609	0.113	0.162	0.116
0.495	0.309	0.024	0.171
0.161	0.346	0.185	0.308
0.179	0.48	0.08	0.26
0.102	0.116	0.699	0.083
0.052	0.833	0.067	0.048
0.225	0.056	0.484	0.235

MOTIF	Liver_E15.5_H3K4me3_5_157_0.690_8.188511e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.429	0.057	0.299	0.216
0.617	0.066	0.224	0.093
0.588	0.097	0.163	0.152
0.469	0.166	0.158	0.207
0.429	0.179	0.121	0.271
0.253	0.288	0.173	0.285
0.18	0.464	0.085	0.271
0.228	0.051	0.595	0.126
0.001	0.997	0.001	0.001
0.138	0.051	0.6	0.211

MOTIF	Lung_E15.5_H3K4me3_48_170_0.630_3.327547e-283
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7

MOTIF	Intestine_P0_H3K4me3_13_154_0.698_1.047663e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.133	0.604	0.134	0.129
0.101	0.124	0.646	0.129
0.113	0.64	0.136	0.111
0.129	0.13	0.615	0.126
0.118	0.152	0.59	0.14
0.161	0.147	0.14	0.552
0.138	0.152	0.565	0.145
0.145	0.141	0.131	0.583
0.111	0.14	0.135	0.614
0.137	0.132	0.139	0.592

MOTIF	Stomach_E16.5_H3K4me3_16_154_0.682_2.723735e-313
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.134	0.616	0.124	0.126
0.112	0.123	0.64	0.125
0.117	0.64	0.129	0.114
0.123	0.131	0.614	0.132
0.123	0.152	0.583	0.142
0.143	0.143	0.149	0.565
0.131	0.145	0.553	0.171
0.134	0.146	0.137	0.583
0.12	0.139	0.135	0.606
0.132	0.136	0.134	0.598