MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Limb_E14.5_H3K27me3_18_157_0.555_1.56125e-48
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.671	0.001	0.177	0.151
0.016	0.14	0.765	0.079
0.001	0.129	0.737	0.133
0.001	0.954	0.001	0.044
0.126	0.001	0.872	0.001
0.004	0.992	0.001	0.003
0.001	0.997	0.001	0.001
0.151	0.77	0.001	0.078

MOTIF	Hindbrain_E11.5_H3K27me3_9_22_0.555_4.358347e-48
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.05259	0.761679	0.04315	0.142581
0.31183	0.028091	0.616957	0.043122
0.022001	0.042896	0.886	0.049103
0.10258	0.029544	0.859091	0.008785
0.091333	0.855894	0.019382	0.033391
0.01858	0.0	0.96031	0.02111
0.186723	0.594113	0.19382	0.025345
0.04466	0.837235	0.071917	0.046188
0.104006	0.843119	0.027541	0.025335

MOTIF	Liver_E11.5_H3K4me3_32_15_0.649_1.408087e-321
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	1.0	0.0	0.0
0.218699	0.01772	0.742474	0.021107
0.012414	0.019683	0.946659	0.021243
0.060559	0.873205	0.016767	0.049469
0.032938	0.170038	0.716464	0.080561
0.051479	0.889771	0.014107	0.044642
0.032804	0.885974	0.040905	0.040317
0.141796	0.721977	0.099852	0.036375
0.296547	0.020354	0.552613	0.130486
0.059105	0.0	0.940895	0.0

MOTIF	Liver_P0_H3K4me3_11_14_0.689_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.038866	0.080304	0.809823	0.071006
0.050599	0.884866	0.018023	0.046512
0.034342	0.0331	0.872413	0.060145
0.060775	0.026225	0.851479	0.061521
0.142639	0.701134	0.0572	0.099027
0.037568	0.028006	0.724923	0.209503
0.071595	0.78362	0.051403	0.093382
0.049002	0.784831	0.055392	0.110775
0.083858	0.765709	0.072977	0.077456

MOTIF	Midbrain_E11.5_H3K4me3_20_15_0.721_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.012006	0.094263	0.698947	0.194785
0.106236	0.830507	0.024184	0.039073
0.043194	0.024237	0.882698	0.04987
0.079009	0.014737	0.885299	0.020955
0.204473	0.618111	0.033363	0.144053
0.009831	0.01517	0.910159	0.06484
0.11515	0.703011	0.04203	0.139809
0.027075	0.763224	0.054867	0.154834
0.03933	0.885736	0.017957	0.056976

MOTIF	Kidney_P0_H3K4me3_9_9_0.728_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.099086	0.743964	0.099293	0.057657
0.043511	0.036962	0.794622	0.124905
0.060606	0.013378	0.894487	0.031529
0.087869	0.874512	0.009388	0.028232
0.028633	0.0	0.74502	0.226346
0.028397	0.816947	0.045938	0.108718
0.074427	0.841784	0.036514	0.047275
0.11304	0.648428	0.055596	0.182936
0.034448	0.041961	0.813443	0.110148

MOTIF	Cranio-Facial_E12.5_H3K4me3_14_8_0.708_3.538377e-315
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.010604	0.942591	0.041132	0.005673
0.150452	0.058566	0.742371	0.048611
0.027904	0.00311	0.945297	0.023689
0.09804	0.695601	0.074914	0.131445
0.135893	0.072244	0.741587	0.050275
0.15065	0.690007	0.056104	0.103239
0.027685	0.927343	0.022535	0.022437
0.116924	0.683114	0.039379	0.160582
0.094313	0.054638	0.822508	0.02854
0.094078	0.141493	0.753863	0.010565

MOTIF	Forebrain_P0_H3K4me3_11_11_0.724_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.091554	0.868346	0.022463	0.017637
0.046597	0.006219	0.896027	0.051158
0.052667	0.050766	0.847926	0.04864
0.196909	0.645528	0.060702	0.096862
0.081986	0.071408	0.636656	0.20995
0.048426	0.878754	0.026253	0.046566
0.023168	0.932154	0.009055	0.035624
0.084209	0.715561	0.059398	0.140832
0.070266	0.049342	0.783518	0.096874

MOTIF	Liver_E16.5_H3K4me3_4_9_0.682_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.042698	0.89168	0.035436	0.030187
0.117246	0.058476	0.786921	0.037358
0.090647	0.068096	0.777522	0.063735
0.18391	0.668261	0.074967	0.072862
0.103158	0.109898	0.721918	0.065026
0.087698	0.845606	0.033096	0.0336
0.074763	0.876147	0.009023	0.040067
0.076403	0.824726	0.051263	0.047608
0.079107	0.038318	0.780952	0.101623

MOTIF	Liver_E12.5_H3K4me3_5_6_0.699_1.243336e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.025892	0.864278	0.054567	0.055263
0.078713	0.049563	0.765483	0.106241
0.048107	0.048314	0.858535	0.045044
0.10384	0.777134	0.061121	0.057905
0.092879	0.022461	0.709501	0.175158
0.073078	0.783371	0.046166	0.097385
0.066276	0.787139	0.045765	0.10082
0.025191	0.863579	0.046527	0.064702
0.093156	0.059349	0.801207	0.046288
0.043128	0.191768	0.639072	0.126032

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K4me3_6_6_0.751_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.059998	0.892424	0.031035	0.016544
0.077236	0.036366	0.791999	0.094399
0.041409	0.031541	0.866319	0.060731
0.143849	0.738601	0.04245	0.0751
0.084435	0.027102	0.816013	0.07245
0.093047	0.770866	0.049173	0.086914
0.057438	0.755776	0.087113	0.099673
0.096355	0.788979	0.030142	0.084524
0.076015	0.04866	0.782675	0.09265

MOTIF	Neural-Tube_E12.5_H3K4me3_8_8_0.749_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.028198	0.890709	0.048478	0.032615
0.111105	0.040383	0.774884	0.073628
0.0457	0.055069	0.859547	0.039684
0.164188	0.715494	0.050824	0.069493
0.066436	0.030478	0.744969	0.158117
0.065777	0.781702	0.045439	0.107082
0.045715	0.796862	0.047138	0.110285
0.073972	0.80969	0.042951	0.073388
0.074336	0.025132	0.827375	0.073157

MOTIF	Intestine_E14.5_H3K4me3_26_32_0.694_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.041589	0.775414	0.037496	0.1455
0.054828	0.904801	0.0	0.04037
0.081513	0.0	0.857495	0.060993
0.051092	0.0	0.904461	0.044447
0.287828	0.0	0.675632	0.03654
0.036849	0.929169	0.0	0.033983
0.013701	0.0	0.912262	0.074037
0.017014	0.964609	0.0	0.018377
0.248207	0.26658	0.027138	0.458076

MOTIF	Neural-Tube_E15.5_H3K4me3_42_24_0.627_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.869341	0.093159	0.0375
0.019361	0.738554	0.0	0.242084
0.046327	0.013553	0.929457	0.010664
0.069859	0.012287	0.85353	0.064323
0.040808	0.052006	0.897698	0.009488
0.072242	0.868915	0.021332	0.037511
0.194867	0.014357	0.688616	0.102161
0.010745	0.975693	0.0	0.013561
0.292459	0.370507	0.024047	0.312988
0.158939	0.653774	0.048494	0.138793

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K4me3_55_56_0.603_2.382603e-305
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.218524	0.76314	0.0	0.018336
0.0	0.963932	0.020923	0.015145
0.450716	0.038207	0.462062	0.049015
0.031587	0.0	0.932976	0.035437
0.084882	0.01648	0.839247	0.059391
0.0	0.983073	0.0	0.016927
0.241702	0.019024	0.668066	0.071208
0.021339	0.938759	0.025049	0.014854
0.021247	0.87096	0.022807	0.084986

MOTIF	Forebrain_E16.5_H3K4me3_23_28_0.667_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.01251	0.905244	0.065303	0.016943
0.121792	0.813612	0.035331	0.029266
0.038836	0.052588	0.865363	0.043214
0.024636	0.043323	0.920575	0.011466
0.273218	0.027079	0.505604	0.194099
0.050801	0.738142	0.035812	0.175245
0.021993	0.029851	0.8784	0.069756
0.022972	0.72564	0.02354	0.227848
0.020183	0.909202	0.02312	0.047496

MOTIF	Heart_E13.5_H3K4me3_53_21_0.603_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.01415	0.947358	0.011946	0.026546
0.03075	0.768356	0.052857	0.148036
0.025654	0.031943	0.829675	0.112729
0.043528	0.042957	0.790174	0.123342
0.158939	0.037883	0.663146	0.140033
0.064309	0.71982	0.042974	0.172897
0.099253	0.05322	0.80011	0.047416
0.018411	0.914175	0.039338	0.028076
0.021425	0.928498	0.017844	0.032234
0.141912	0.37394	0.0	0.484148

MOTIF	Midbrain_E12.5_H3K4me3_52_45_0.617_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.075618	0.779917	0.063121	0.081344
0.105779	0.637174	0.028987	0.22806
0.198444	0.011591	0.631789	0.158177
0.06383	0.010944	0.877104	0.048122
0.038977	0.0	0.921117	0.039906
0.019541	0.838941	0.0	0.141519
0.038254	0.004355	0.824511	0.132879
0.026808	0.910839	0.013407	0.048946
0.031881	0.878739	0.064433	0.024947

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K4me3_56_20_0.600_3.550372e-304
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.019817	0.940467	0.023157	0.016559
0.125527	0.715317	0.033246	0.125911
0.144619	0.032212	0.660721	0.162448
0.02879	0.004469	0.942484	0.024257
0.157656	0.047354	0.666164	0.128826
0.021814	0.855335	0.011521	0.11133
0.039366	0.023295	0.848603	0.088736
0.02764	0.917202	0.028072	0.027086
0.162519	0.710999	0.040738	0.085744
0.277284	0.57079	0.035135	0.116791
0.38282	0.035661	0.099608	0.481912

MOTIF	Neural-Tube_E11.5_H3K4me3_23_32_0.689_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.088072	0.789376	0.030908	0.091644
0.025295	0.742008	0.030195	0.202503
0.025835	0.05748	0.859846	0.056839
0.07425	0.0	0.891388	0.034361
0.084721	0.0	0.635633	0.279645
0.016357	0.935319	0.019062	0.029262
0.018643	0.03092	0.821037	0.1294
0.017938	0.969177	0.0	0.012885
0.15476	0.632384	0.012218	0.200638

MOTIF	Liver_E14.5_H3K4me3_36_38_0.644_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.059702	0.863402	0.06361	0.013286
0.130035	0.660399	0.0	0.209567
0.181975	0.01628	0.741707	0.060038
0.087102	0.0	0.870132	0.042766
0.065815	0.0	0.736991	0.197194
0.030908	0.944215	0.0	0.024877
0.046804	0.027843	0.881492	0.04386
0.011175	0.962448	0.0	0.026377
0.0	0.731211	0.014494	0.254296

MOTIF	Neural-Tube_E12.5_H3K4me3_34_29_0.658_1.786864e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.002978	0.949359	0.024066	0.023597
0.168175	0.71413	0.0	0.117695
0.176898	0.017087	0.649345	0.15667
0.049785	0.0	0.905699	0.044516
0.072489	0.095071	0.719343	0.113098
0.085767	0.895139	0.0	0.019094
0.08523	0.034033	0.756699	0.124038
0.0	0.962788	0.022173	0.015039
0.108519	0.648679	0.056837	0.185965

MOTIF	Hindbrain_E14.5_H3K4me3_26_13_0.684_9.104794e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.012253	0.975521	0.0	0.012226
0.055111	0.88401	0.002556	0.058324
0.056283	0.044474	0.848911	0.050332
0.221241	0.031769	0.645698	0.101292
0.038091	0.003637	0.848003	0.110269
0.034223	0.939443	0.00397	0.022364
0.086024	0.032721	0.676464	0.204791
0.013397	0.935395	0.0263	0.024908
0.14149	0.521869	0.061515	0.275127
0.164648	0.134698	0.623387	0.077267
0.638788	0.186764	0.0	0.174448

MOTIF	Midbrain_E13.5_H3K4me3_50_15_0.618_5.829955e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.011082	0.958568	0.012967	0.017383
0.128809	0.678545	0.061604	0.131042
0.11273	0.042731	0.807667	0.036873
0.187288	0.004621	0.772762	0.03533
0.147921	0.016891	0.769399	0.06579
0.06436	0.907184	0.01011	0.018346
0.066212	0.027228	0.701137	0.205423
0.011872	0.916892	0.045781	0.025456
0.15105	0.720231	0.031579	0.097141
0.156333	0.351655	0.391836	0.100177
0.815573	0.017416	0.028601	0.138409

MOTIF	Stomach_E14.5_H3K4me3_34_17_0.672_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.951112	0.016591	0.032298
0.027549	0.903857	0.037447	0.031147
0.07176	0.04158	0.841867	0.044793
0.044053	0.033452	0.887842	0.034653
0.051244	0.027335	0.891232	0.030189
0.035495	0.87232	0.049815	0.04237
0.125749	0.03037	0.510619	0.333261
0.009436	0.975479	0.0	0.015084
0.152923	0.455762	0.043368	0.347947
0.016815	0.414147	0.424277	0.144762