MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Cranio-Facial_E15.5_H3K4me1_65_38_0.514_4.008575e-26
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.014391	0.924769	0.0	0.06084
0.087385	0.61544	0.146405	0.150771
0.01645	0.858606	0.124944	0.0
0.042816	0.024081	0.121428	0.811675
0.002013	0.012954	0.981052	0.003981
0.091502	0.024606	0.713423	0.170469
0.038135	0.006516	0.938927	0.016422
0.240048	0.034754	0.707605	0.017593
0.129448	0.788698	0.057249	0.024605
0.157177	0.392916	0.301704	0.148203

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K4me1_98_123_0.503_6.068531e-13
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.039942	0.796177	0.024907	0.138975
0.415216	0.501914	0.027973	0.054897
0.0	0.631658	0.368342	0.0
0.100725	0.035945	0.024953	0.838377
0.0	0.042031	0.947952	0.010018
0.04607	0.015386	0.879818	0.058726
0.047801	0.013697	0.896533	0.041969
0.0	0.047517	0.904316	0.048167
0.02778	0.90555	0.019756	0.046915

MOTIF	Midbrain_E15.5_H3K4me1_74_35_0.512_3.386536e-22
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.037762	0.937157	0.0	0.025081
0.193829	0.676229	0.044585	0.085357
0.015741	0.764216	0.220043	0.0
0.144503	0.234153	0.014981	0.606364
0.0	0.022092	0.977908	0.0
0.013228	0.02787	0.855302	0.1036
0.0	0.019313	0.956992	0.023695
0.045605	0.228005	0.673181	0.053208
0.066336	0.852178	0.031903	0.049583

MOTIF	Kidney_E16.5_H3K4me1_84_103_0.506_1.821018e-14
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.052448	0.856052	0.038468	0.053033
0.047238	0.735032	0.026354	0.191376
0.152984	0.703812	0.049096	0.094109
0.007325	0.881283	0.103751	0.00764
0.730389	0.06563	0.131553	0.072428
0.01464	0.092694	0.885674	0.006993
0.042729	0.023994	0.769102	0.164174
0.051964	0.030144	0.902919	0.014972
0.769018	0.008566	0.03866	0.183756

MOTIF	Cranio-Facial_E15.5_H3K4me1_69_96_0.513_6.066334e-25
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.049981	0.809159	0.035213	0.105647
0.037368	0.89344	0.034964	0.034228
0.175875	0.727751	0.020806	0.075568
0.004946	0.953114	0.02122	0.02072
0.806674	0.036357	0.124494	0.032475
0.006029	0.112269	0.874633	0.007069
0.192413	0.014803	0.687722	0.105062
0.225208	0.09216	0.676206	0.006426
0.867741	0.013164	0.069841	0.049255

MOTIF	Limb_E15.5_H3K4me1_77_87_0.510_3.120731e-18
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.083084	0.827209	0.049676	0.040032
0.035485	0.925718	0.019568	0.019228
0.215034	0.683066	0.015332	0.086568
0.00294	0.873743	0.112698	0.010619
0.811544	0.091349	0.068252	0.028855
0.001852	0.124247	0.868364	0.005537
0.158631	0.006009	0.700134	0.135226
0.200151	0.036859	0.755274	0.007716
0.816769	0.050716	0.060025	0.07249

MOTIF	Midbrain_E13.5_H3K4me1_62_76_0.518_2.891096e-35
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.079442	0.712652	0.115181	0.092725
0.042142	0.78495	0.04455	0.128359
0.09563	0.746527	0.037156	0.120687
0.0	0.850649	0.136693	0.012658
0.77513	0.040917	0.102734	0.081219
0.007086	0.068047	0.91735	0.007517
0.155932	0.019751	0.725673	0.098644
0.188638	0.045383	0.753552	0.012427
0.789648	0.080006	0.062199	0.068147

MOTIF	Limb_E13.5_H3K4me1_58_83_0.518_3.417051e-45
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.040242	0.821223	0.056396	0.082139
0.039185	0.797315	0.021916	0.141584
0.134762	0.688156	0.044095	0.132988
0.000776	0.887983	0.103904	0.007337
0.841371	0.016334	0.050655	0.091639
0.013638	0.066806	0.916725	0.002832
0.139916	0.01411	0.745066	0.100908
0.135863	0.019071	0.8293	0.015765
0.779628	0.109431	0.071889	0.039051

MOTIF	Midbrain_P0_H3K4me1_64_77_0.519_6.618461e-15
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.027552	0.805693	0.056155	0.1106
0.048473	0.734813	0.041622	0.175093
0.167317	0.735376	0.02291	0.074397
0.001918	0.891324	0.098187	0.008572
0.883872	0.027802	0.041307	0.047019
0.011376	0.089025	0.892435	0.007164
0.175126	0.009667	0.744174	0.071033
0.136695	0.065333	0.776729	0.021243
0.782179	0.107018	0.061151	0.049651

MOTIF	Limb_E14.5_H3K4me1_144_192_0.501_4.273779e-05
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.086979	0.285808	0.443331	0.183882
0.034093	0.757934	0.034396	0.173576
0.151853	0.78458	0.01505	0.048518
0.011832	0.118805	0.011817	0.857546
0.003846	0.09486	0.853622	0.047671
0.033688	0.011652	0.827477	0.127183
0.024355	0.006147	0.844982	0.124516
0.204503	0.032393	0.745031	0.018073
0.841398	0.050594	0.04404	0.063967
0.051112	0.852164	0.024677	0.072046

MOTIF	Midbrain_E14.5_H3K4me1_57_27_0.517_8.975941e-17
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.029073	0.882983	0.028419	0.059525
0.044372	0.855262	0.020971	0.079395
0.021037	0.835319	0.106523	0.037121
0.131446	0.146481	0.045768	0.676306
0.034993	0.076306	0.865592	0.02311
0.04709	0.01489	0.827788	0.110232
0.123616	0.008234	0.855927	0.012222
0.170528	0.034526	0.771487	0.023459
0.690547	0.222366	0.041199	0.045888
0.262833	0.259633	0.133114	0.34442
0.035644	0.477164	0.304777	0.182416
0.401381	0.299081	0.035599	0.263939

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K4me1_43_19_0.521_1.041761e-40
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.022821	0.747168	0.124007	0.106004
0.076887	0.688712	0.092175	0.142227
0.032118	0.895128	0.043546	0.029208
0.065604	0.08932	0.030259	0.814817
0.025631	0.045604	0.913444	0.015322
0.036822	0.023126	0.859706	0.080346
0.155324	0.012679	0.812999	0.018998
0.144793	0.041996	0.746964	0.066247
0.755976	0.155458	0.049967	0.038599
0.313243	0.451265	0.122481	0.113011
0.155685	0.368066	0.387865	0.088384
0.397469	0.299063	0.161114	0.142353

MOTIF	Neural-Tube_E12.5_H3K4me1_74_25_0.512_7.012731e-12
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.028727	0.778169	0.058506	0.134598
0.063486	0.727183	0.058851	0.15048
0.014391	0.884048	0.090015	0.011546
0.047742	0.103758	0.029385	0.819116
0.012067	0.049786	0.927395	0.010752
0.043145	0.017422	0.844597	0.094836
0.083633	0.01764	0.882544	0.016184
0.136555	0.097607	0.71137	0.054468
0.737907	0.135436	0.035191	0.091466
0.145608	0.531467	0.124706	0.198219
0.307647	0.362882	0.139182	0.190288
0.384428	0.223676	0.282495	0.109402

MOTIF	Neural-Tube_E13.5_H3K4me1_48_21_0.520_2.457974e-40
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.036078	0.704671	0.132304	0.126946
0.074009	0.732487	0.097758	0.095746
0.025786	0.912046	0.05241	0.009758
0.10182	0.115503	0.028167	0.75451
0.04052	0.053561	0.889632	0.016287
0.053442	0.013419	0.831583	0.101556
0.059057	0.01829	0.906285	0.016369
0.153719	0.099308	0.687751	0.059221
0.751855	0.162503	0.028032	0.05761
0.312553	0.40167	0.099749	0.186027
0.270642	0.345114	0.218524	0.16572
0.318341	0.040268	0.262744	0.378647

MOTIF	Neural-Tube_E14.5_H3K4me1_53_38_0.516_9.613623e-16
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.031355	0.724113	0.125861	0.118671
0.071831	0.721637	0.055479	0.151053
0.01429	0.885371	0.070896	0.029443
0.058483	0.073436	0.035742	0.83234
0.015444	0.055548	0.918318	0.010691
0.023945	0.013077	0.860495	0.102482
0.084875	0.006014	0.895081	0.01403
0.153178	0.064454	0.70266	0.079708
0.682872	0.208471	0.045697	0.06296
0.275148	0.051161	0.16112	0.512571

MOTIF	Cranio-Facial_E14.5_H3K4me1_65_48_0.518_2.742892e-24
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.029685	0.862757	0.041754	0.065804
0.03612	0.84344	0.069079	0.051361
0.04199	0.854018	0.079591	0.024401
0.064616	0.135754	0.050964	0.748667
0.033357	0.085494	0.868295	0.012853
0.042802	0.010885	0.786745	0.159568
0.142881	0.011101	0.825484	0.020534
0.198651	0.042648	0.721589	0.037112
0.690264	0.047572	0.087933	0.174231

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K4me1_43_40_0.523_3.348159e-43
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.031972	0.783175	0.072842	0.112011
0.0841	0.720038	0.037269	0.158593
0.015339	0.88241	0.070589	0.031662
0.074948	0.086583	0.040688	0.797782
0.026073	0.040742	0.921584	0.011601
0.079554	0.037582	0.787683	0.095181
0.138801	0.006691	0.831873	0.022635
0.143411	0.039301	0.764436	0.052852
0.738606	0.12477	0.046553	0.090072

MOTIF	Limb_E12.5_H3K4me1_57_49_0.514_2.573349e-22
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.024025	0.694931	0.130069	0.150975
0.067851	0.752172	0.029633	0.150344
0.020319	0.902838	0.055499	0.021344
0.063902	0.08579	0.030107	0.820201
0.016592	0.05121	0.920515	0.011683
0.089754	0.009819	0.780044	0.120383
0.113463	0.004185	0.869472	0.012879
0.186919	0.04341	0.726313	0.043357
0.719933	0.17199	0.045822	0.062255

MOTIF	Cranio-Facial_E12.5_H3K4me1_77_30_0.510_5.054803e-15
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.03162	0.781883	0.058137	0.12836
0.067108	0.74288	0.032609	0.157402
0.02745	0.862782	0.08967	0.020099
0.080757	0.10716	0.030897	0.781186
0.020818	0.047056	0.91839	0.013736
0.047812	0.031026	0.833428	0.087734
0.106736	0.008889	0.869819	0.014556
0.165375	0.071414	0.702817	0.060394
0.69937	0.151538	0.055499	0.093594
0.186115	0.381114	0.119567	0.313205

MOTIF	Limb_E14.5_H3K4me1_58_37_0.514_6.48034e-15
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.027923	0.77062	0.04744	0.154017
0.081195	0.690701	0.035391	0.192713
0.011222	0.935654	0.028008	0.025117
0.041949	0.110221	0.031979	0.815851
0.020294	0.061424	0.905201	0.013082
0.034265	0.017244	0.82695	0.12154
0.104336	0.001889	0.888682	0.005093
0.196248	0.033309	0.699206	0.071236
0.676046	0.135406	0.054676	0.133872
0.229445	0.362292	0.113161	0.295102

MOTIF	Midbrain_E12.5_H3K4me1_81_41_0.507_6.757757e-09
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.028015	0.742743	0.08559	0.143652
0.074872	0.675501	0.101288	0.14834
0.043251	0.856745	0.084973	0.015031
0.02258	0.107139	0.037096	0.833184
0.01421	0.054816	0.918823	0.012152
0.033715	0.038048	0.823578	0.10466
0.114501	0.008801	0.852921	0.023777
0.154153	0.031197	0.754535	0.060115
0.744965	0.132274	0.047187	0.075574
0.274547	0.397255	0.110726	0.217473

MOTIF	Stomach_E14.5_H3K4me1_94_71_0.504_8.259902e-08
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.024214	0.683432	0.022162	0.270192
0.102256	0.652121	0.051365	0.194258
0.048167	0.908365	0.028653	0.014816
0.015398	0.029431	0.045123	0.910048
0.008391	0.069561	0.911245	0.010803
0.037727	0.015468	0.897903	0.048903
0.142648	0.005908	0.834317	0.017128
0.128104	0.016773	0.757117	0.098005
0.780458	0.147852	0.0	0.07169
0.344576	0.335263	0.195359	0.124803

MOTIF	Cranio-Facial_E12.5_H3K9ac_68_44_0.516_1.930889e-09
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.050859	0.0	0.0	0.949141
0.015675	0.865768	0.095759	0.022798
0.182112	0.579515	0.033984	0.204389
0.013557	0.941235	0.031534	0.013674
0.075213	0.041091	0.053462	0.830234
0.0	0.021732	0.969156	0.009111
0.023275	0.056763	0.49475	0.425212
0.024252	0.22525	0.750498	0.0
0.207688	0.013871	0.707485	0.070955
0.031524	0.915147	0.031771	0.021557
0.040361	0.031844	0.869295	0.0585

MOTIF	Cranio-Facial_E11.5_H3K9ac_79_80_0.528_2.316084e-91
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.092919	0.847981	0.010775	0.048324
0.0	0.960273	0.015209	0.024518
0.079343	0.0	0.098614	0.822043
0.002431	0.164932	0.832636	0.0
0.00862	0.0	0.780231	0.211149
0.0	0.17856	0.82144	0.0
0.214595	0.019373	0.580391	0.185641
0.020669	0.917984	0.015016	0.04633
0.03826	0.101473	0.741651	0.118617

MOTIF	Midbrain_E13.5_H3K9ac_78_85_0.510_9.52081e-10
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.216523	0.445098	0.201365	0.137014
0.121367	0.023626	0.785943	0.069064
0.147814	0.577499	0.087892	0.186795
0.052944	0.732011	0.18043	0.034614
0.193627	0.745254	0.019053	0.042066
0.0	0.886562	0.113438	0.0
0.905077	0.02611	0.020709	0.048103
0.004108	0.038801	0.953806	0.003284
0.096456	0.041883	0.838673	0.022987
0.06979	0.869631	0.043618	0.016961