MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Cranio-Facial_E15.5_H3K4me1_92_134_0.504_6.426725e-12
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.077032	0.358193	0.505636	0.059138
0.140206	0.014941	0.617661	0.227193
0.004961	0.014433	0.953292	0.027314
0.0	0.023367	0.818573	0.15806
0.902805	0.053019	0.033923	0.010253
0.256768	0.0	0.669433	0.073799
0.017417	0.0	0.977713	0.00487
0.911446	0.043387	0.036683	0.008484
0.886944	0.046932	0.055155	0.010969
0.570704	0.170206	0.239414	0.019676

MOTIF	Hindbrain_E14.5_H3K4me1_35_44_0.524_3.137801e-98
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.02626	0.0	0.91447	0.05927
0.0	0.067536	0.868381	0.064083
0.016153	0.01627	0.964709	0.002868
0.057549	0.024282	0.901955	0.016214
0.0	0.035239	0.964761	0.0
0.463705	0.497951	0.013199	0.025145
0.074712	0.28432	0.624075	0.016893
0.021239	0.023385	0.955376	0.0
0.884967	0.075947	0.039085	0.0

MOTIF	Cranio-Facial_E13.5_H3K4me1_102_90_0.501_3.710774e-18
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.053536	0.065338	0.740359	0.140768
0.027488	0.035406	0.83176	0.105347
0.015181	0.013142	0.944621	0.027056
0.190992	0.016968	0.774726	0.017314
0.020953	0.164487	0.807345	0.007215
0.863422	0.065844	0.0	0.070733
0.243025	0.055147	0.69792	0.003908
0.199447	0.055292	0.745261	0.0
0.904432	0.05394	0.007457	0.034171

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K4me1_79_48_0.510_1.76789e-43
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.043648	0.174646	0.636397	0.14531
0.0	0.051693	0.870485	0.077822
0.056667	0.175373	0.641664	0.126296
0.185338	0.020051	0.744471	0.05014
0.029023	0.009961	0.951111	0.009905
0.871767	0.072638	0.0	0.055595
0.14176	0.042341	0.796126	0.019774
0.133432	0.032422	0.833427	0.000719
0.872104	0.083235	0.024198	0.020463

MOTIF	Limb_E12.5_H3K4me1_32_42_0.523_1.121004e-155
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.018651	0.025656	0.734181	0.221511
0.041443	0.061366	0.882155	0.015036
0.021822	0.180577	0.646553	0.151048
0.074072	0.199271	0.698661	0.027995
0.005252	0.053085	0.936675	0.004988
0.751793	0.095246	0.033247	0.119714
0.04974	0.097426	0.844336	0.008497
0.031681	0.042662	0.925657	0.0
0.812651	0.119053	0.041127	0.02717

MOTIF	Heart_E15.5_H3K4me2_32_15_0.592_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.043066	0.851494	0.0	0.10544
0.011475	0.069383	0.878694	0.040448
0.054465	0.906511	0.015009	0.024015
0.015512	0.027776	0.773733	0.182978
0.128244	0.027653	0.795828	0.048275
0.020808	0.014002	0.915845	0.049345
0.063279	0.026942	0.800286	0.109493
0.283839	0.0463	0.543662	0.126199
0.041742	0.911712	0.030754	0.015792
0.134144	0.231666	0.208367	0.425823

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K4me2_9_11_0.667_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.027836	0.77702	0.106376	0.088769
0.067517	0.008438	0.726129	0.197916
0.124574	0.680667	0.082863	0.111896
0.007936	0.835119	0.085065	0.07188
0.113511	0.749585	0.061131	0.075773
0.028934	0.896416	0.066194	0.008457
0.025079	0.849572	0.034432	0.090918
0.017145	0.013271	0.936745	0.032839
0.032128	0.701462	0.216335	0.050075

MOTIF	Kidney_E16.5_H3K4me2_14_8_0.646_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.118386	0.668421	0.088546	0.124647
0.025174	0.009189	0.781316	0.184321
0.067769	0.75738	0.068768	0.106082
0.024114	0.87453	0.082823	0.018533
0.095221	0.64339	0.059311	0.202078
0.02727	0.855361	0.109368	0.008001
0.024015	0.819666	0.025555	0.130764
0.01833	0.003249	0.940903	0.037518
0.013285	0.966129	0.011595	0.00899

MOTIF	Forebrain_E12.5_H3K4me2_5_5_0.670_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.089923	0.681496	0.129884	0.098697
0.022683	0.032929	0.813066	0.131323
0.085868	0.740981	0.061185	0.111966
0.031382	0.855966	0.087465	0.025187
0.074864	0.796907	0.066297	0.061932
0.073521	0.711711	0.09651	0.118258
0.017049	0.815528	0.048606	0.118817
0.050943	0.050021	0.87074	0.028296
0.006587	0.815204	0.177629	0.000581

MOTIF	Heart_E14.5_H3K4me2_12_10_0.611_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.031247	0.820879	0.071134	0.07674
0.018297	0.037906	0.784026	0.159771
0.10631	0.699584	0.036972	0.157134
0.042328	0.829613	0.098889	0.02917
0.094705	0.790858	0.042964	0.071473
0.019033	0.629716	0.21071	0.140541
0.036662	0.763626	0.054823	0.144889
0.013331	0.04001	0.900257	0.046403
0.009734	0.960341	0.024004	0.005921

MOTIF	Forebrain_E16.5_H3K4me2_6_7_0.672_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.113759	0.69501	0.080463	0.110768
0.024263	0.029465	0.896149	0.050123
0.028922	0.822361	0.030542	0.118175
0.030557	0.603235	0.183514	0.182693
0.069784	0.786197	0.090076	0.053944
0.085682	0.588766	0.197527	0.128026
0.026119	0.921795	0.027014	0.025072
0.025428	0.025344	0.92134	0.027889
0.014717	0.947834	0.022962	0.014488

MOTIF	Intestine_E15.5_H3K4me2_4_6_0.654_5.358764e-318
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.096422	0.755254	0.081933	0.066391
0.026612	0.019775	0.845699	0.107915
0.048603	0.721742	0.082883	0.146772
0.037723	0.694384	0.07349	0.194403
0.078575	0.776186	0.04358	0.101659
0.122405	0.638928	0.171438	0.067229
0.035894	0.887469	0.046692	0.029945
0.024066	0.016485	0.916495	0.042955
0.002397	0.938336	0.046543	0.012724
0.315938	0.0	0.268618	0.415444

MOTIF	Limb_E14.5_H3K4me2_4_6_0.684_5.152984e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.034976	0.810304	0.083946	0.070774
0.028031	0.028477	0.824713	0.118779
0.05475	0.748007	0.055909	0.141333
0.013177	0.828712	0.100332	0.057778
0.069386	0.776204	0.027787	0.126622
0.102239	0.55759	0.272683	0.067488
0.031338	0.920533	0.022246	0.025883
0.025541	0.013546	0.915862	0.045051
0.012788	0.877003	0.103598	0.006611
0.366076	0.053748	0.21655	0.363625

MOTIF	Cranio-Facial_E15.5_H3K4me3_43_23_0.630_2.234212e-315
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.018018	0.040892	0.872411	0.068679
0.009941	0.889382	0.046182	0.054495
0.025437	0.649693	0.0702	0.25467
0.098599	0.82611	0.043373	0.031918
0.13213	0.719559	0.04998	0.098331
0.134269	0.791931	0.041458	0.032342
0.04363	0.0	0.775466	0.180904
0.064011	0.87203	0.055516	0.008443
0.015534	0.794815	0.097552	0.092098

MOTIF	Forebrain_E12.5_H3K4me3_55_38_0.601_1.032492e-257
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.066451	0.013788	0.87597	0.04379
0.023301	0.780258	0.043493	0.152948
0.027146	0.857271	0.039404	0.07618
0.041717	0.874321	0.055775	0.028187
0.127498	0.810894	0.010282	0.051326
0.017116	0.910797	0.037668	0.034419
0.272209	0.005582	0.447686	0.274524
0.047945	0.723439	0.207496	0.02112
0.009274	0.960208	0.030518	0.0

MOTIF	Heart_E13.5_H3K4me3_9_10_0.677_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.12595	0.864267	0.003214	0.006569
0.011327	0.013278	0.717247	0.258148
0.007473	0.887973	0.052559	0.051994
0.028972	0.861199	0.048897	0.060933
0.023522	0.884087	0.011511	0.08088
0.213584	0.684155	0.066642	0.035618
0.032162	0.903289	0.051348	0.013202
0.059389	0.040895	0.835952	0.063764
0.147576	0.581867	0.217443	0.053113
0.013171	0.265721	0.497947	0.223161

MOTIF	Hindbrain_E11.5_H3K4me3_9_8_0.741_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.002779	0.934518	0.054845	0.007859
0.08766	0.687549	0.163662	0.06113
0.021382	0.01804	0.769877	0.190701
0.087144	0.701143	0.123895	0.087817
0.029818	0.874839	0.072599	0.022744
0.038295	0.789764	0.091497	0.080444
0.098353	0.678487	0.103169	0.119992
0.013935	0.864126	0.052735	0.069204
0.011268	0.056636	0.932097	0.0
0.169656	0.3664	0.340391	0.123553

MOTIF	Intestine_E15.5_H3K4me3_6_2_0.728_4.730043e-317
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.026759	0.857695	0.086979	0.028567
0.048023	0.845297	0.068595	0.038085
0.068796	0.019	0.847156	0.065047
0.021512	0.912999	0.032669	0.03282
0.040647	0.792608	0.079163	0.087582
0.073512	0.736118	0.083207	0.107164
0.047741	0.699265	0.166577	0.086416
0.048302	0.708094	0.154744	0.08886
0.109522	0.032176	0.775786	0.082516
0.232397	0.42762	0.134964	0.205019
0.126584	0.306507	0.468594	0.098315

MOTIF	Intestine_P0_H3K4me3_17_5_0.696_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.04592	0.906671	0.036546	0.010863
0.019036	0.7837	0.143986	0.053278
0.086017	0.028465	0.693467	0.192051
0.055218	0.878157	0.030806	0.03582
0.022682	0.700818	0.063157	0.213343
0.130687	0.73294	0.066596	0.069777
0.021013	0.873256	0.074877	0.030854
0.033475	0.781597	0.068652	0.116277
0.048223	0.009414	0.893346	0.049017
0.172955	0.5968	0.216402	0.013843

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K4me3_9_8_0.734_2.225215e-315
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.12288	0.692174	0.129888	0.055058
0.027676	0.029536	0.815467	0.127322
0.097226	0.688444	0.082582	0.131748
0.025833	0.885807	0.06304	0.02532
0.076354	0.685437	0.069531	0.168677
0.024634	0.846015	0.114347	0.015005
0.024299	0.828191	0.041923	0.105587
0.022923	0.024958	0.885186	0.066933
0.00649	0.780751	0.174442	0.038316

MOTIF	Kidney_E15.5_H3K4me3_6_6_0.728_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.038588	0.811941	0.064481	0.08499
0.02671	0.032173	0.792917	0.1482
0.072759	0.763915	0.058536	0.10479
0.06532	0.650956	0.163436	0.120287
0.075263	0.804797	0.059594	0.060346
0.028717	0.689942	0.158991	0.122349
0.024185	0.832661	0.05329	0.089864
0.02264	0.023575	0.92092	0.032865
0.005501	0.927842	0.058709	0.007948

MOTIF	Midbrain_E16.5_H3K4me3_23_10_0.676_4.110626e-321
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.009024	0.971062	0.01397	0.005944
0.007945	0.813474	0.169175	0.009406
0.098437	0.013173	0.60925	0.27914
0.030636	0.887753	0.030833	0.050778
0.017745	0.842344	0.085989	0.053922
0.046355	0.817636	0.054174	0.081835
0.024455	0.726613	0.066327	0.182605
0.017688	0.778608	0.040443	0.163261
0.027623	0.040607	0.889372	0.042398
0.0	0.824166	0.153573	0.022261

MOTIF	Midbrain_E12.5_H3K9ac_21_13_0.621_2.749426e-319
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.959682	0.023979	0.016339
0.007031	0.918127	0.045584	0.029259
0.163649	0.016421	0.479189	0.340742
0.025174	0.882325	0.052309	0.040192
0.023228	0.901664	0.049606	0.025502
0.139377	0.711764	0.060243	0.088616
0.019301	0.605608	0.221581	0.15351
0.022041	0.84456	0.033377	0.100022
0.02955	0.002849	0.935019	0.032582

MOTIF	Lung_E15.5_H3K9ac_11_7_0.682_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.038436	0.835609	0.027492	0.098463
0.086127	0.725409	0.126331	0.062133
0.025687	0.01979	0.795488	0.159035
0.05852	0.819198	0.089529	0.032752
0.019984	0.735945	0.068191	0.17588
0.107219	0.727399	0.089129	0.076252
0.081207	0.775409	0.09979	0.043593
0.020446	0.913022	0.045862	0.02067
0.038294	0.027629	0.919949	0.014128
0.427261	0.033345	0.511394	0.028001

MOTIF	Neural-Tube_E11.5_H3K9ac_29_7_0.616_1.554335e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.024596	0.865136	0.084216	0.026052
0.063342	0.843837	0.068548	0.024274
0.086106	0.016481	0.7614	0.136014
0.024698	0.905914	0.034756	0.034632
0.045743	0.779239	0.05831	0.116708
0.062038	0.702608	0.099906	0.135448
0.049864	0.801808	0.066354	0.081973
0.076419	0.711092	0.154102	0.058387
0.120525	0.031128	0.76366	0.084687