MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K4me2_48_72_0.591_1.883832e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.913993	0.0	0.0	0.086007
0.008683	0.118466	0.829399	0.043452
0.020061	0.787978	0.040555	0.151406
0.209518	0.675088	0.037969	0.077425
0.01322	0.938758	0.007399	0.040623
0.030853	0.020217	0.653414	0.295516
0.111716	0.842887	0.045397	0.0
0.02679	0.750905	0.019344	0.202961
0.0	0.0	0.967633	0.032367

MOTIF	Intestine_P0_H3K4me2_49_25_0.574_4.362431e-287
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.082597	0.917403	0.0
0.858377	0.01703	0.037667	0.086925
0.018563	0.026691	0.782011	0.172735
0.10914	0.875414	0.015446	0.0
0.155536	0.713979	0.095768	0.034717
0.042169	0.706501	0.223562	0.027768
0.009916	0.034631	0.950088	0.005366
0.167143	0.786399	0.033139	0.013319
0.141031	0.830319	0.0	0.02865
0.221064	0.069294	0.561773	0.14787
0.06396	0.048134	0.864161	0.023744

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K9ac_34_45_0.609_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.900609	0.044334	0.055057	0.0
0.0	0.012654	0.987346	0.0
0.006717	0.906909	0.086374	0.0
0.331232	0.38676	0.024534	0.257474
0.0	0.807553	0.156915	0.035531
0.024764	0.04266	0.926504	0.006072
0.0	0.890799	0.099021	0.01018
0.104298	0.648759	0.0	0.246944
0.0	0.119599	0.880401	0.0

MOTIF	Lung_E16.5_H3K9ac_42_40_0.573_7.688109e-178
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.826657	0.0	0.092546	0.080796
0.0	0.024445	0.975555	0.0
0.010317	0.969415	0.0	0.020268
0.410127	0.473189	0.085007	0.031677
0.05657	0.896256	0.0	0.047173
0.021188	0.015128	0.804173	0.159511
0.0	0.680739	0.295741	0.023521
0.051938	0.880495	0.059062	0.008505
0.0	0.029741	0.711537	0.258722
0.070417	0.096922	0.0	0.832662

MOTIF	Forebrain_E16.5_H3K4me2_33_43_0.614_5.076228e-319
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.047713	0.923372	0.0	0.028915
0.035384	0.896708	0.016847	0.051062
0.082776	0.016881	0.838273	0.06207
0.007103	0.015274	0.977623	0.0
0.014959	0.942899	0.017371	0.02477
0.248082	0.064588	0.666474	0.020856
0.224741	0.027702	0.608504	0.139053
0.00786	0.051459	0.91767	0.023011
0.22247	0.601634	0.056858	0.119039

MOTIF	Liver_E16.5_H3K4me2_1_4_0.647_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.063084	0.842442	0.026903	0.06757
0.07412	0.03729	0.78192	0.10667
0.057757	0.821986	0.067099	0.053158
0.089247	0.704451	0.071985	0.134317
0.049888	0.831858	0.09136	0.026894
0.087768	0.040622	0.759759	0.111851
0.039624	0.868583	0.058236	0.033557
0.143803	0.678723	0.081549	0.095925
0.022888	0.030706	0.882808	0.063598
0.042679	0.457041	0.374531	0.125749

MOTIF	Forebrain_E12.5_H3K4me2_3_4_0.687_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.140324	0.743271	0.038387	0.078017
0.029866	0.024617	0.877757	0.06776
0.053657	0.860105	0.043819	0.042419
0.082901	0.713417	0.086879	0.116804
0.149212	0.623526	0.108838	0.118424
0.074864	0.051785	0.829068	0.044283
0.010107	0.785213	0.184564	0.020116
0.052577	0.853341	0.057783	0.036298
0.032373	0.0	0.901578	0.066049

MOTIF	Kidney_E16.5_H3K4me2_1_5_0.683_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.092455	0.82876	0.034556	0.044229
0.051259	0.021149	0.832748	0.094844
0.046627	0.853152	0.062029	0.038192
0.062963	0.726788	0.10779	0.102459
0.096131	0.727373	0.073995	0.102501
0.053172	0.063148	0.775435	0.108244
0.025499	0.839392	0.098838	0.036272
0.101133	0.73496	0.073107	0.090801
0.05709	0.048785	0.805575	0.088549

MOTIF	Heart_E15.5_H3K4me2_7_10_0.637_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.108304	0.800947	0.035985	0.054763
0.055746	0.030577	0.752807	0.16087
0.040089	0.831915	0.074534	0.053462
0.03359	0.91764	0.007773	0.040997
0.156123	0.749588	0.058661	0.035628
0.107434	0.033872	0.809097	0.049597
0.007326	0.806414	0.130672	0.055588
0.148522	0.661564	0.066946	0.122967
0.038847	0.010376	0.883321	0.067455

MOTIF	Stomach_P0_H3K4me2_5_10_0.668_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.102267	0.76247	0.020936	0.114327
0.054372	0.025089	0.797349	0.12319
0.065606	0.81436	0.064907	0.055127
0.031295	0.845866	0.075079	0.04776
0.12376	0.756407	0.081915	0.037918
0.070418	0.025192	0.861305	0.043085
0.008406	0.809664	0.13247	0.04946
0.148281	0.657755	0.072005	0.121958
0.032223	0.013699	0.894466	0.059612

MOTIF	Heart_E14.5_H3K27ac_21_6_0.535_2.776244e-166
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.02541	0.933634	0.013965	0.02699
0.094277	0.010726	0.857176	0.037821
0.055313	0.825634	0.06515	0.053904
0.209199	0.633957	0.031029	0.125816
0.02088	0.89548	0.079037	0.004603
0.043106	0.042142	0.888067	0.026685
0.040268	0.869426	0.052998	0.037308
0.133527	0.64	0.066669	0.159805
0.094074	0.0257	0.828965	0.051261
0.0	0.089272	0.905069	0.005659
0.522138	0.0	0.041141	0.436721
0.048578	0.827633	0.123789	0.0

MOTIF	Hindbrain_E15.5_H3K27ac_10_21_0.573_5.364809e-286
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.113975	0.649556	0.060462	0.176007
0.022701	0.897904	0.036961	0.042435
0.041942	0.026257	0.825883	0.105918
0.00418	0.09409	0.901731	0.0
0.014518	0.959894	0.0	0.025588
0.009258	0.0	0.990742	0.0
0.381292	0.052728	0.291728	0.274252
0.0	0.049285	0.927486	0.023229
0.040073	0.851721	0.055047	0.05316

MOTIF	Liver_E16.5_H3K9ac_7_4_0.629_2.636664e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.022391	0.830428	0.076914	0.070267
0.031908	0.840328	0.047759	0.080006
0.063462	0.012269	0.844807	0.079462
0.029018	0.858068	0.060948	0.051966
0.079828	0.734182	0.08923	0.09676
0.112362	0.728989	0.043282	0.115367
0.059532	0.029764	0.779952	0.130753
0.003791	0.80284	0.160534	0.032835
0.073292	0.790382	0.066584	0.069742
0.08517	0.343569	0.474325	0.096937
0.132388	0.211822	0.568024	0.087765

MOTIF	Liver_P0_H3K9ac_17_5_0.604_9.547289e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.244459	0.392143	0.134222	0.229177
0.080885	0.321983	0.490409	0.106723
0.020314	0.819057	0.064541	0.096088
0.035804	0.848354	0.039235	0.076607
0.096926	0.025703	0.81303	0.064342
0.046245	0.84902	0.057171	0.047564
0.115577	0.660373	0.09033	0.13372
0.09322	0.679717	0.052754	0.174309
0.02463	0.031651	0.894702	0.049017
0.005079	0.849354	0.073021	0.072546
0.027943	0.868711	0.06692	0.036426
0.169356	0.411825	0.333759	0.08506
0.172619	0.131532	0.606706	0.089143

MOTIF	Cranio-Facial_E15.5_H3K9ac_14_4_0.681_3.570477e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.021903	0.748969	0.155772	0.073356
0.028513	0.858774	0.032267	0.080445
0.06836	0.025769	0.82946	0.076411
0.033553	0.744167	0.166654	0.055626
0.065634	0.758871	0.090351	0.085144
0.089699	0.723101	0.158079	0.02912
0.06613	0.005156	0.890386	0.038328
0.005782	0.905841	0.066281	0.022096
0.042592	0.793121	0.06088	0.103407
0.172308	0.364715	0.184283	0.278694

MOTIF	Stomach_E14.5_H3K9ac_11_5_0.687_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.020418	0.836499	0.057166	0.085917
0.022801	0.830478	0.024259	0.122462
0.079829	0.022146	0.823291	0.074734
0.063218	0.825501	0.061877	0.049404
0.064712	0.689036	0.107947	0.138305
0.100477	0.825081	0.048939	0.025503
0.064216	0.003498	0.892078	0.040209
0.006446	0.883485	0.068128	0.041941
0.089972	0.700826	0.052988	0.156214
0.107355	0.385034	0.238158	0.269452

MOTIF	Midbrain_E13.5_H3K9ac_10_43_0.614_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.05966	0.868406	0.0	0.071934
0.044871	0.861855	0.068716	0.024559
0.040143	0.015891	0.908114	0.035852
0.0	0.080942	0.919058	0.0
0.007686	0.978385	0.0	0.013929
0.0	0.0	0.930268	0.069732
0.290875	0.017374	0.632751	0.059
0.108127	0.026431	0.743186	0.122255
0.337466	0.620969	0.034203	0.007363

MOTIF	Neural-Tube_E12.5_H3K9ac_34_25_0.605_2.882712e-313
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.039271	0.897525	0.0	0.063204
0.18952	0.719881	0.051729	0.03887
0.107961	0.073703	0.717578	0.100758
0.000729	0.013816	0.983543	0.001912
0.028274	0.863187	0.017994	0.090545
0.052619	0.072756	0.708123	0.166502
0.099072	0.021675	0.80485	0.074404
0.054766	0.074496	0.866933	0.003806
0.217464	0.621433	0.091257	0.069847

MOTIF	Heart_E13.5_H3K9ac_8_9_0.584_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.144018	0.815215	0.017208	0.02356
0.046653	0.025712	0.866886	0.060749
0.099311	0.822169	0.057624	0.020896
0.028385	0.807756	0.060327	0.103532
0.014328	0.893482	0.055779	0.036411
0.133895	0.014824	0.671354	0.179927
0.046416	0.82454	0.092645	0.036399
0.098354	0.656268	0.063469	0.181909
0.063627	0.02668	0.871789	0.037905

MOTIF	Kidney_E16.5_H3K9ac_6_9_0.622_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.137953	0.778627	0.046432	0.036988
0.021323	0.020445	0.790597	0.167635
0.017832	0.8515	0.071988	0.05868
0.028034	0.775454	0.068042	0.12847
0.163658	0.699522	0.111891	0.024929
0.06586	0.011228	0.91107	0.011843
0.00948	0.896457	0.073108	0.020954
0.169805	0.648294	0.05338	0.128521
0.084617	0.017116	0.832464	0.065804

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K9ac_8_6_0.630_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.036549	0.885644	0.025775	0.052032
0.061993	0.049705	0.702535	0.185767
0.051647	0.857553	0.041393	0.049406
0.06531	0.780589	0.066416	0.087685
0.113205	0.774154	0.072473	0.040168
0.077409	0.03221	0.751415	0.138965
0.021445	0.840581	0.101912	0.036062
0.112911	0.74024	0.051333	0.095516
0.064788	0.025666	0.863635	0.045911

MOTIF	Limb_E11.5_H3K9ac_3_7_0.631_8.080559e-312
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.114553	0.802196	0.016394	0.066856
0.025327	0.019144	0.846991	0.108539
0.064543	0.818528	0.053861	0.063068
0.058928	0.680248	0.097974	0.16285
0.15436	0.722342	0.102255	0.021043
0.052149	0.021981	0.800729	0.125141
0.024943	0.892971	0.06306	0.019026
0.062313	0.804103	0.05715	0.076434
0.051921	0.025872	0.844038	0.078168

MOTIF	Forebrain_E11.5_H3K9ac_2_8_0.657_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.119891	0.811636	0.021392	0.047081
0.057078	0.023458	0.804477	0.114987
0.059438	0.800673	0.09029	0.049599
0.070609	0.720562	0.096783	0.112046
0.107701	0.789807	0.078906	0.023586
0.053897	0.021553	0.832035	0.092515
0.012752	0.902746	0.05706	0.027442
0.127432	0.685462	0.073485	0.11362
0.034299	0.033013	0.84837	0.084317

MOTIF	Liver_E14.5_H3K9ac_3_8_0.637_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.089777	0.83651	0.021259	0.052455
0.052987	0.032775	0.826272	0.087966
0.059513	0.798309	0.082232	0.059946
0.064685	0.704897	0.106753	0.123665
0.073953	0.829669	0.070066	0.026313
0.06558	0.030291	0.797	0.107129
0.016177	0.89969	0.052799	0.031333
0.127408	0.684001	0.083683	0.104909
0.052513	0.03033	0.815734	0.101423

MOTIF	Stomach_P0_H3K9ac_2_7_0.636_2.048233e-315
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.098523	0.803224	0.034028	0.064226
0.056505	0.069878	0.758652	0.114965
0.058828	0.844911	0.054157	0.042104
0.060505	0.708085	0.109734	0.121676
0.132768	0.741638	0.102696	0.022898
0.089559	0.055656	0.808078	0.046708
0.00967	0.824967	0.137588	0.027776
0.142811	0.739671	0.089751	0.027767
0.044088	0.029309	0.821404	0.105199