MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K27me3_3_153_0.541_1.910286e-34
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.129	0.611	0.132	0.128
0.126	0.213	0.54	0.121
0.131	0.207	0.58	0.082
0.153	0.043	0.669	0.135
0.127	0.162	0.591	0.12
0.145	0.6	0.099	0.156
0.123	0.12	0.628	0.129
0.034	0.686	0.18	0.1
0.133	0.519	0.215	0.133
0.126	0.577	0.164	0.133

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K27me3_2_150_0.553_3.09349e-82
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.116	0.49	0.229	0.166
0.208	0.166	0.446	0.181
0.17	0.001	0.759	0.07
0.164	0.045	0.534	0.257
0.05	0.012	0.898	0.04
0.019	0.859	0.024	0.098
0.021	0.013	0.918	0.048
0.058	0.92	0.009	0.013
0.282	0.354	0.263	0.101
0.043	0.634	0.191	0.132

MOTIF	Hindbrain_P0_H3K27me3_1_150_0.542_7.445204e-35
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.222	0.322	0.242	0.213
0.162	0.252	0.394	0.192
0.259	0.119	0.544	0.078
0.264	0.037	0.453	0.246
0.029	0.077	0.789	0.105
0.052	0.813	0.056	0.079
0.069	0.001	0.917	0.013
0.058	0.807	0.063	0.072
0.252	0.428	0.048	0.271
0.078	0.543	0.112	0.267

MOTIF	Intestine_E16.5_H3K27ac_8_10_0.547_4.581079e-216
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.189397	0.622125	0.053748	0.134731
0.026243	0.021562	0.93522	0.016976
0.076955	0.791249	0.110771	0.021025
0.0	0.0	0.98122	0.01878
0.173365	0.766462	0.013467	0.046706
0.02599	0.618228	0.045104	0.310677
0.04012	0.804755	0.034581	0.120543
0.023275	0.935308	0.006851	0.034566
0.113655	0.052587	0.806367	0.027392

MOTIF	Kidney_E14.5_H3K27ac_9_5_0.556_8.793412e-168
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.093188	0.83914	0.04124	0.026431
0.050627	0.025301	0.913974	0.010099
0.056146	0.721583	0.083817	0.138454
0.033079	0.062428	0.849777	0.054716
0.084541	0.648695	0.126557	0.140207
0.096114	0.82145	0.031969	0.050467
0.125521	0.703946	0.035231	0.135301
0.024775	0.886762	0.060078	0.028385
0.091902	0.034356	0.839523	0.034219
0.055206	0.197942	0.70052	0.046332

MOTIF	Cranio-Facial_E11.5_H3K27ac_5_7_0.575_1.626538e-95
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.140885	0.66319	0.145327	0.050598
0.036942	0.033315	0.907398	0.022344
0.048237	0.797707	0.058954	0.095103
0.007274	0.030465	0.894315	0.067946
0.079709	0.639906	0.140408	0.139977
0.098008	0.766088	0.009935	0.125969
0.025353	0.823888	0.122298	0.028461
0.106656	0.778557	0.048929	0.065858
0.045511	0.038253	0.891631	0.024605

MOTIF	Intestine_E14.5_H3K27ac_8_10_0.564_5.457028e-242
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.102287	0.716736	0.103221	0.077756
0.061203	0.008086	0.892521	0.03819
0.10063	0.751774	0.115875	0.031721
0.01472	0.05709	0.890725	0.037465
0.087895	0.75582	0.058425	0.09786
0.03435	0.801293	0.040072	0.124285
0.11757	0.705753	0.102452	0.074226
0.110472	0.766665	0.083191	0.039672
0.070958	0.021884	0.883187	0.023971

MOTIF	Liver_E11.5_H3K27ac_9_7_0.562_2.758402e-188
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.091299	0.667306	0.142353	0.099042
0.047229	0.032722	0.884143	0.035906
0.17591	0.674296	0.106699	0.043095
0.015092	0.012139	0.905072	0.067698
0.071376	0.696347	0.126488	0.105789
0.022084	0.898381	0.029674	0.049861
0.07529	0.781884	0.041443	0.101383
0.090891	0.81807	0.050991	0.040048
0.096596	0.036402	0.854169	0.012833
0.150471	0.183591	0.434929	0.231008

MOTIF	Neural-Tube_E13.5_H3K27ac_28_9_0.539_4.277104e-222
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.012843	0.90329	0.051608	0.03226
0.07114	0.0	0.921155	0.007705
0.045478	0.783411	0.045591	0.12552
0.005117	0.037795	0.914331	0.042757
0.178748	0.800153	0.0	0.021099
0.023038	0.865348	0.045022	0.066591
0.384549	0.512855	0.059342	0.043254
0.004664	0.945948	0.028475	0.020913
0.306332	0.029428	0.651293	0.012947
0.148917	0.47729	0.358272	0.015521

MOTIF	Intestine_P0_H3K27ac_13_18_0.545_1.612921e-156
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.961357	0.038643	0.0
0.0297	0.064483	0.874211	0.031606
0.025008	0.0	0.95313	0.021862
0.291443	0.028458	0.552752	0.127346
0.049758	0.031335	0.764784	0.154123
0.022133	0.971254	0.0	0.006613
0.042229	0.053922	0.896675	0.007174
0.129605	0.776032	0.074265	0.020098
0.04037	0.653253	0.021983	0.284394

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K27ac_23_13_0.546_2.493753e-217
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.072822	0.034858	0.70075	0.19157
0.046951	0.848433	0.084369	0.020248
0.143103	0.032792	0.720515	0.10359
0.115507	0.811211	0.047802	0.025479
0.117729	0.697575	0.040581	0.144115
0.020267	0.941187	0.005106	0.03344
0.043984	0.87658	0.061423	0.018013
0.118765	0.0	0.792575	0.08866
0.011127	0.838707	0.104149	0.046016

MOTIF	Liver_P0_H3K27ac_24_9_0.539_1.626329e-216
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.081656	0.089197	0.797179	0.031968
0.044484	0.705325	0.157746	0.092445
0.030901	0.004724	0.845236	0.119138
0.070197	0.838029	0.028024	0.06375
0.018011	0.907725	0.023737	0.050527
0.066361	0.812168	0.059667	0.061804
0.021565	0.766063	0.08927	0.123102
0.041089	0.023732	0.913043	0.022135
0.160862	0.668788	0.11236	0.057989
0.323382	0.0	0.429252	0.247366

MOTIF	Limb_E11.5_H3K27ac_9_8_0.561_7.627306e-71
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.126324	0.329212	0.407174	0.13729
0.09486	0.03045	0.836813	0.037877
0.036639	0.747991	0.111495	0.103876
0.015884	0.026836	0.768695	0.188585
0.02703	0.762229	0.029182	0.181559
0.065507	0.806968	0.02046	0.107064
0.066775	0.764846	0.059713	0.108666
0.029948	0.846672	0.088621	0.034758
0.02193	0.02169	0.937208	0.019172
0.058177	0.741918	0.182104	0.017801

MOTIF	Heart_E13.5_H3K27ac_14_9_0.535_6.890037e-198
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.105313	0.015107	0.803469	0.076111
0.064745	0.672167	0.224023	0.039065
0.082033	0.008202	0.830259	0.079506
0.05956	0.846364	0.055373	0.038703
0.072447	0.758337	0.027626	0.14159
0.04356	0.818732	0.051388	0.086321
0.044893	0.886592	0.041887	0.026629
0.027778	0.02734	0.880363	0.06452
0.046831	0.746864	0.172298	0.034007

MOTIF	Midbrain_E12.5_H3K27ac_11_10_0.566_2.640831e-169
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.064053	0.018348	0.859519	0.058081
0.050095	0.757282	0.141569	0.051054
0.070353	0.02105	0.763718	0.144878
0.059887	0.7187	0.140595	0.080817
0.057737	0.744598	0.086138	0.111527
0.054343	0.849248	0.042245	0.054164
0.051442	0.809523	0.07505	0.063985
0.047372	0.026157	0.906931	0.019541
0.049753	0.780382	0.147422	0.022443

MOTIF	Midbrain_P0_H3K27ac_9_7_0.570_1.765076e-271
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.071424	0.055421	0.836198	0.036957
0.126155	0.747899	0.070904	0.055042
0.033221	0.038022	0.846225	0.082532
0.038512	0.814872	0.092379	0.054238
0.071712	0.734513	0.097962	0.095812
0.032574	0.772658	0.115927	0.078841
0.135103	0.675628	0.111531	0.077738
0.017032	0.065537	0.899068	0.018363
0.051673	0.821365	0.10661	0.020352

MOTIF	Stomach_E14.5_H3K27ac_18_5_0.548_3.088005e-117
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.04037	0.066898	0.850175	0.042556
0.035107	0.838839	0.055198	0.070856
0.033645	0.021616	0.793923	0.150815
0.03139	0.799367	0.061805	0.107438
0.063025	0.769072	0.105147	0.062755
0.043727	0.809978	0.069943	0.076351
0.051088	0.760689	0.115504	0.072719
0.074256	0.03245	0.862815	0.03048
0.033671	0.777914	0.167382	0.021033
0.727463	0.0	0.145657	0.12688

MOTIF	Lung_E16.5_H3K27me3_17_35_0.561_2.146776e-59
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.077472	0.018633	0.840989	0.062907
0.137589	0.044695	0.771823	0.045893
0.194727	0.041648	0.733544	0.030081
0.012197	0.972953	0.01485	0.0
0.020291	0.0	0.957506	0.022203
0.009265	0.908723	0.038814	0.043198
0.178375	0.686792	0.027663	0.107169
0.0359	0.602628	0.0	0.361472
0.040385	0.88984	0.047813	0.021963

MOTIF	Neural-Tube_E11.5_H3K27me3_11_38_0.567_1.171175e-48
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.053655	0.029157	0.917188	0.0
0.023538	0.020875	0.813154	0.142433
0.153305	0.046862	0.72595	0.073883
0.043956	0.92189	0.017342	0.016812
0.008451	0.0	0.948508	0.043041
0.128805	0.836791	0.007092	0.027312
0.126045	0.783485	0.05695	0.033521
0.034105	0.68087	0.018192	0.266832
0.03568	0.781864	0.052637	0.12982

MOTIF	Kidney_E16.5_H3K27me3_14_26_0.537_1.420002e-65
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.121073	0.060351	0.703739	0.114837
0.025081	0.114701	0.770353	0.089865
0.101393	0.057977	0.825949	0.014681
0.039552	0.916025	0.0	0.044423
0.015109	0.0	0.946576	0.038315
0.082138	0.71219	0.014396	0.191276
0.005069	0.73512	0.037586	0.222225
0.045826	0.849229	0.0	0.104945
0.055094	0.839225	0.055392	0.050289

MOTIF	Intestine_P0_H3K27me3_15_39_0.552_1.074254e-54
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.036686	0.0	0.936818	0.026495
0.134301	0.061948	0.698958	0.104793
0.083608	0.027418	0.83114	0.057833
0.008588	0.942822	0.01009	0.038499
0.033623	0.011871	0.93723	0.017276
0.101231	0.680895	0.065859	0.152015
0.054078	0.852856	0.029871	0.063195
0.106948	0.669669	0.006958	0.216426
0.014707	0.795128	0.046677	0.143488

MOTIF	Lung_P0_H3K27me3_17_42_0.557_1.449695e-34
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.07197	0.028932	0.861279	0.037819
0.157049	0.083073	0.725091	0.034787
0.013177	0.072145	0.889022	0.025655
0.079548	0.88128	0.0	0.039172
0.026748	0.014785	0.92613	0.032337
0.104162	0.7059	0.015319	0.174619
0.116567	0.764144	0.02948	0.089808
0.096212	0.712863	0.032156	0.158769
0.0	0.874506	0.009251	0.116243

MOTIF	Stomach_E16.5_H3K27me3_20_40_0.544_2.641864e-35
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.039432	0.009535	0.875452	0.075581
0.074721	0.016698	0.850151	0.058429
0.080631	0.138226	0.681119	0.100024
0.037563	0.890982	0.04466	0.026796
0.047075	0.0	0.901634	0.051291
0.024905	0.808009	0.017899	0.149187
0.07105	0.692806	0.027629	0.208515
0.096117	0.714908	0.021524	0.16745
0.049266	0.905523	0.0	0.045211

MOTIF	Midbrain_E15.5_H3K4me3_24_50_0.680_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.0	0.574651	0.425349
0.069802	0.072804	0.495588	0.361805
0.0	0.0	0.959219	0.040781
0.0	0.990021	0.0	0.009979
0.003703	0.0	0.996297	0.0
0.046972	0.808542	0.107674	0.036812
0.0	0.926583	0.031332	0.042085
0.458659	0.355839	0.073357	0.112146
0.0	0.958232	0.0	0.041768

MOTIF	Neural-Tube_E13.5_H3K4me3_21_34_0.700_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.856629	0.066646	0.076725
0.118223	0.0	0.815587	0.06619
0.039694	0.0	0.898577	0.061729
0.05721	0.034617	0.891174	0.016998
0.0	0.95949	0.023945	0.016565
0.011656	0.0	0.988344	0.0
0.111749	0.479511	0.078624	0.330116
0.091154	0.859342	0.040938	0.008565
0.158147	0.607193	0.0	0.23466