MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K9me3_69_8_0.520_1.535164e-24 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.243145 0.272112 0.320848 0.163895 0.470119 0.182822 0.146764 0.200294 0.413171 0.242522 0.299151 0.045156 0.053749 0.882641 0.040474 0.023136 0.831605 0.007744 0.052304 0.108348 0.076488 0.145853 0.752053 0.025606 0.882469 0.01579 0.035286 0.066456 0.101312 0.096188 0.711327 0.091174 0.845673 0.028689 0.068895 0.056743 0.088537 0.793966 0.054654 0.062843 0.826786 0.015302 0.010168 0.147744 0.032251 0.058837 0.857731 0.051181 0.483301 0.235028 0.221648 0.060023 MOTIF Heart_E16.5_H3K9me3_104_121_0.504_3.734349e-11 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.059827 0.902988 0.007582 0.029604 0.926084 0.010281 0.026626 0.03701 0.061446 0.155834 0.723093 0.059627 0.942986 0.02119 0.024523 0.011301 0.128278 0.172706 0.683972 0.015044 0.838389 0.02979 0.073141 0.05868 0.134752 0.758538 0.086596 0.020114 0.76306 0.050683 0.010165 0.176092 0.039492 0.018074 0.912054 0.030379 0.176896 0.199302 0.469412 0.154389 0.319777 0.208239 0.138167 0.333817 0.189401 0.579186 0.027484 0.203929 0.434242 0.541446 0.013805 0.010508 MOTIF Cranio-Facial_E14.5_H3K9me3_93_59_0.510_7.02587e-16 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.062018 0.897722 0.005951 0.034309 0.852922 0.00929 0.024223 0.113565 0.186625 0.22272 0.545581 0.045074 0.943811 0.007259 0.025776 0.023155 0.115091 0.060109 0.780622 0.044178 0.667925 0.11204 0.106984 0.113051 0.054934 0.891707 0.028702 0.024657 0.916963 0.034902 0.004266 0.043869 0.029294 0.020418 0.826113 0.124176 0.320487 0.261606 0.347403 0.070504 0.413278 0.148469 0.236458 0.201794 0.3055 0.058375 0.230797 0.405328 MOTIF Midbrain_E14.5_H3K9me3_33_9_0.521_1.237808e-15 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.070344 0.883258 0.022781 0.023617 0.843602 0.008917 0.013875 0.133606 0.168945 0.109209 0.663675 0.05817 0.925042 0.007614 0.046568 0.020776 0.109685 0.045668 0.765046 0.079602 0.80816 0.028251 0.075871 0.087719 0.103526 0.787177 0.033378 0.07592 0.806836 0.013992 0.009945 0.169227 0.023871 0.022506 0.835973 0.117649 0.373238 0.170116 0.401181 0.055465 0.508838 0.061746 0.11125 0.318166 0.232169 0.027714 0.456315 0.283802 0.05569 0.564782 0.067893 0.311636 MOTIF Forebrain_E16.5_H3K9me3_78_86_0.504_0.0001205809 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.064029 0.902207 0.00791 0.025854 0.870419 0.029265 0.041515 0.058801 0.097347 0.149387 0.690145 0.063121 0.89581 0.040238 0.040697 0.023255 0.123301 0.169027 0.69077 0.016903 0.792466 0.043776 0.07295 0.090809 0.044423 0.903602 0.04421 0.007765 0.749173 0.072705 0.003632 0.17449 0.030199 0.019948 0.90404 0.045812 0.184621 0.224545 0.496375 0.09446 0.621331 0.011045 0.149649 0.217974 0.29175 0.318422 0.3732 0.016628 MOTIF Cranio-Facial_E13.5_H3K9me3_72_21_0.515_1.495299e-12 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.353283 0.325706 0.127799 0.193213 0.039262 0.941433 0.005287 0.014018 0.822549 0.023441 0.009993 0.144017 0.120285 0.137037 0.709482 0.033195 0.838812 0.025868 0.049554 0.085767 0.085548 0.070259 0.779818 0.064375 0.744397 0.061792 0.092634 0.101178 0.069255 0.818554 0.035885 0.076307 0.832425 0.016925 0.009612 0.141038 0.022819 0.03383 0.907468 0.035884 0.096815 0.259892 0.562688 0.080606 0.416597 0.144348 0.282675 0.15638 MOTIF Heart_E11.5_H3K9me3_88_91_0.507_2.642562e-08 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.296289 0.395573 0.218751 0.089387 0.026254 0.942482 0.010292 0.020972 0.882915 0.025952 0.014 0.077133 0.040655 0.155868 0.744312 0.059165 0.742969 0.019264 0.115436 0.122331 0.072627 0.084103 0.768818 0.074452 0.78518 0.03926 0.089323 0.086238 0.072654 0.852063 0.04774 0.027543 0.772529 0.062896 0.0065 0.158074 0.031586 0.034696 0.909369 0.024349 0.247631 0.235369 0.42248 0.09452 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K9me3_87_15_0.512_2.453556e-12 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.245976 0.281111 0.370277 0.102637 0.036997 0.909157 0.034658 0.019188 0.812518 0.007736 0.066831 0.112915 0.097819 0.109591 0.777883 0.014706 0.835676 0.010734 0.102265 0.051326 0.071427 0.075175 0.801196 0.052203 0.728506 0.10781 0.099146 0.064538 0.076633 0.812461 0.053467 0.057439 0.796579 0.068869 0.007241 0.127312 0.0245 0.044876 0.881614 0.049009 0.299966 0.165139 0.480257 0.054638 MOTIF Liver_E12.5_H3K9me3_65_67_0.509_1.253324e-07 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.03515 0.934155 0.022479 0.008215 0.792266 0.017038 0.083138 0.107558 0.060273 0.038006 0.854821 0.0469 0.716484 0.053367 0.146946 0.083203 0.093689 0.063192 0.780255 0.062863 0.799883 0.035029 0.08565 0.079438 0.096091 0.786186 0.093544 0.024179 0.753173 0.081517 0.007691 0.157618 0.035671 0.067261 0.888696 0.008372 0.361476 0.193503 0.394743 0.050279 MOTIF Lung_E15.5_H3K9me3_48_87_0.511_0.001082546 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.030033 0.94673 0.013782 0.009455 0.885833 0.050921 0.030593 0.032653 0.098055 0.236637 0.59792 0.067389 0.910408 0.055867 0.012525 0.021201 0.048052 0.034454 0.821256 0.096238 0.664866 0.090023 0.09604 0.14907 0.052987 0.889698 0.026808 0.030507 0.762464 0.027533 0.004367 0.205635 0.008454 0.021353 0.941755 0.028437 0.513351 0.155193 0.253486 0.07797 MOTIF Heart_P0_H3K9me3_108_126_0.504_2.309348e-07 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.021328 0.937408 0.010124 0.03114 0.861074 0.014292 0.025457 0.099177 0.150486 0.1921 0.642729 0.014686 0.841971 0.006418 0.014688 0.136923 0.028066 0.03218 0.861075 0.078679 0.745008 0.032262 0.093839 0.128891 0.073385 0.845456 0.04601 0.035149 0.755502 0.071634 0.002189 0.170675 0.015464 0.054672 0.87679 0.053074 MOTIF Forebrain_E14.5_H3K9me3_65_31_0.512_3.539905e-09 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.050731 0.921441 0.005414 0.022414 0.829551 0.009115 0.019638 0.141696 0.179092 0.156815 0.647736 0.016357 0.91251 0.0054 0.045014 0.037076 0.095541 0.044119 0.773548 0.086793 0.768815 0.036341 0.079007 0.115837 0.053657 0.844925 0.022616 0.078802 0.822842 0.011231 0.003151 0.162776 0.024119 0.024088 0.838731 0.113061 0.277692 0.264902 0.353121 0.104285 MOTIF Hindbrain_E15.5_H3K9me3_18_19_0.535_7.770269e-36 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.061202 0.899267 0.003252 0.036278 0.862088 0.007127 0.016305 0.114479 0.218054 0.104141 0.651918 0.025887 0.9403 0.004964 0.031019 0.023718 0.122685 0.032439 0.710096 0.134781 0.833874 0.026121 0.053978 0.086028 0.073725 0.807259 0.0154 0.103617 0.769176 0.00797 0.004999 0.217855 0.043935 0.010819 0.908906 0.03634 0.356814 0.197395 0.360595 0.085196 MOTIF Heart_E13.5_H3K9me3_120_59_0.512_3.727202e-37 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.053149 0.909312 0.012214 0.025325 0.812776 0.005636 0.0233 0.158288 0.147105 0.150955 0.646459 0.055481 0.924399 0.007331 0.048389 0.01988 0.035969 0.085066 0.800222 0.078743 0.772073 0.091466 0.082611 0.05385 0.088535 0.813969 0.031264 0.066231 0.817883 0.020387 0.00522 0.156511 0.020418 0.01361 0.871008 0.094965 0.38728 0.108413 0.402285 0.102023 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K9me3_86_35_0.515_9.221627e-23 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.050077 0.896768 0.019433 0.033721 0.840433 0.006112 0.012901 0.140554 0.167605 0.144308 0.618307 0.06978 0.938714 0.005895 0.035905 0.019486 0.034165 0.05274 0.824852 0.088244 0.813798 0.040834 0.069017 0.076351 0.075521 0.806555 0.021261 0.096663 0.805862 0.014841 0.010479 0.168817 0.020151 0.024731 0.817899 0.137219 MOTIF Hindbrain_E13.5_H3K9me3_39_6_0.526_5.506908e-33 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.047448 0.909807 0.020119 0.022626 0.818482 0.010788 0.015735 0.154995 0.159759 0.102359 0.706521 0.031361 0.895448 0.011366 0.042608 0.050578 0.098011 0.062791 0.779671 0.059527 0.750615 0.100987 0.094837 0.053562 0.071047 0.818385 0.040028 0.07054 0.787094 0.053048 0.012311 0.147548 0.031856 0.052391 0.857251 0.058501 0.461594 0.214555 0.25551 0.068341 MOTIF Forebrain_E13.5_H3K9me3_58_29_0.521_1.376946e-40 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.043574 0.922024 0.021059 0.013343 0.82282 0.005099 0.014555 0.157527 0.085535 0.096892 0.784598 0.032975 0.853377 0.015857 0.057698 0.073068 0.085832 0.092568 0.744775 0.076825 0.7804 0.077424 0.079219 0.062958 0.095999 0.817868 0.024964 0.06117 0.777839 0.034503 0.0099 0.177758 0.035922 0.080093 0.813266 0.070719 MOTIF Hindbrain_P0_H3K9me3_56_55_0.518_3.262605e-10 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.060612 0.897949 0.012919 0.028519 0.864107 0.004871 0.012361 0.118662 0.136442 0.102584 0.7221 0.038873 0.922202 0.009495 0.044054 0.024249 0.125434 0.036209 0.771267 0.067089 0.712136 0.074457 0.113799 0.099608 0.071737 0.797827 0.032841 0.097594 0.815042 0.024622 0.009703 0.150633 0.023314 0.031832 0.846333 0.098522 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K9me3_51_14_0.519_1.854867e-31 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.060056 0.891993 0.026336 0.021614 0.873248 0.006356 0.013498 0.106899 0.105313 0.072044 0.777607 0.045035 0.930785 0.01018 0.044585 0.01445 0.122054 0.037961 0.771731 0.068254 0.765777 0.069125 0.105233 0.059865 0.16193 0.73243 0.032374 0.073267 0.767574 0.062063 0.011588 0.158775 0.035301 0.06404 0.824327 0.076332 MOTIF Midbrain_E13.5_H3K9me3_77_7_0.517_1.192416e-18 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.049353 0.90544 0.027102 0.018106 0.824538 0.00888 0.043276 0.123306 0.123226 0.10431 0.752721 0.019743 0.86932 0.016445 0.074537 0.039697 0.076266 0.091338 0.779217 0.053179 0.759379 0.105975 0.082661 0.051984 0.085231 0.837214 0.02924 0.048316 0.792411 0.048596 0.010256 0.148737 0.037856 0.056199 0.83661 0.069335 0.323651 0.3164 0.311558 0.048391 0.394311 0.157267 0.285511 0.162911 MOTIF Forebrain_E12.5_H3K9me3_110_30_0.504_2.985248e-07 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.067022 0.891894 0.024544 0.01654 0.828964 0.012137 0.04602 0.112879 0.105815 0.137114 0.713498 0.043572 0.890374 0.012155 0.044126 0.053344 0.071256 0.137784 0.736283 0.054676 0.7982 0.082629 0.069049 0.050122 0.045462 0.847457 0.057777 0.049303 0.776571 0.052707 0.011025 0.159697 0.035879 0.060581 0.828503 0.075037 0.312987 0.158229 0.467176 0.061608 0.439555 0.058819 0.311781 0.189845 MOTIF Neural-Tube_E12.5_H3K9me3_107_10_0.505_1.036589e-09 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.045601 0.850943 0.089789 0.013668 0.84553 0.007107 0.01859 0.128773 0.088317 0.114722 0.783522 0.01344 0.827467 0.014709 0.117424 0.040401 0.065194 0.121759 0.75987 0.053177 0.793682 0.049777 0.081577 0.074964 0.107341 0.790537 0.049021 0.053101 0.806582 0.049403 0.012661 0.131353 0.027593 0.054463 0.864392 0.053552 0.402001 0.139318 0.424191 0.03449 0.410917 0.0911 0.31665 0.181333 MOTIF Neural-Tube_E13.5_H3K9me3_98_7_0.513_8.676648e-12 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.062985 0.892743 0.017596 0.026676 0.817148 0.003278 0.010941 0.168633 0.197982 0.103981 0.653839 0.044199 0.888271 0.009981 0.038502 0.063246 0.094362 0.041412 0.769157 0.095068 0.806898 0.035608 0.086478 0.071016 0.073287 0.839166 0.028172 0.059375 0.838194 0.0105 0.005101 0.146205 0.024283 0.042876 0.862311 0.07053 0.399214 0.155435 0.386606 0.058745 0.514139 0.059932 0.383951 0.041978 0.441067 0.252869 0.209965 0.096098 MOTIF Forebrain_E11.5_H3K9me3_75_170_0.509_1.25844e-05 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.016 0.001 0.439 0.544 0.399 0.228 0.372 0.001 0.032 0.489 0.016 0.463 0.023 0.056 0.001 0.92 0.015 0.001 0.983 0.001 0.13 0.121 0.111 0.638 0.125 0.561 0.158 0.156 0.151 0.231 0.085 0.533 0.352 0.267 0.38 0.001 0.001 0.219 0.001 0.779 0.229 0.001 0.769 0.001 0.343 0.655 0.001 0.001 MOTIF Midbrain_E11.5_H3K9me3_62_145_0.505_0.001294889 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.739866 0.114158 0.145976 0.0 0.037083 0.882127 0.030988 0.049802 0.02513 0.009296 0.020995 0.944579 0.02025 0.0 0.955682 0.024068 0.025846 0.119469 0.030919 0.823767 0.084747 0.851571 0.04049 0.023192 0.021764 0.18703 0.019645 0.771561 0.160931 0.465404 0.340941 0.032724 0.012308 0.011369 0.007267 0.969056