MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Kidney_E16.5_H3K27me3_28_161_0.523_8.922717e-09 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.74 0.091 0.075 0.094 0.068 0.095 0.082 0.755 0.08 0.087 0.1 0.733 0.058 0.787 0.06 0.095 0.101 0.736 0.074 0.089 0.082 0.094 0.7 0.124 0.062 0.811 0.057 0.07 0.091 0.049 0.067 0.793 0.041 0.082 0.804 0.073 0.086 0.684 0.121 0.109 0.099 0.125 0.672 0.104 0.785 0.06 0.08 0.075 MOTIF Heart_E13.5_H3K4me2_10_160_0.614_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.093 0.078 0.122 0.707 0.105 0.891 0.001 0.003 0.109 0.045 0.802 0.044 0.003 0.719 0.006 0.272 0.223 0.001 0.009 0.767 0.134 0.468 0.129 0.268 0.113 0.304 0.486 0.097 0.164 0.171 0.346 0.319 MOTIF Kidney_E16.5_H3K4me2_13_156_0.646_8.865238e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.118 0.61 0.149 0.123 0.135 0.118 0.629 0.118 0.57 0.149 0.156 0.125 0.595 0.146 0.126 0.133 0.169 0.136 0.567 0.128 0.119 0.623 0.123 0.135 0.136 0.108 0.628 0.128 0.587 0.134 0.154 0.125 0.612 0.125 0.137 0.126 0.58 0.139 0.141 0.14 MOTIF Limb_E13.5_H3K4me2_4_153_0.656_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.111 0.188 0.127 0.574 0.066 0.198 0.134 0.602 0.122 0.688 0.022 0.168 0.122 0.128 0.626 0.124 0.038 0.724 0.065 0.173 0.12 0.116 0.071 0.693 0.067 0.575 0.197 0.161 0.025 0.706 0.182 0.087 0.127 0.119 0.729 0.025 0.329 0.242 0.218 0.211 MOTIF Forebrain_P0_H3K4me2_24_162_0.637_3.070035e-318 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.092 0.109 0.129 0.67 0.086 0.116 0.09 0.708 0.094 0.703 0.092 0.111 0.085 0.102 0.704 0.109 0.094 0.69 0.098 0.118 0.101 0.095 0.071 0.733 0.078 0.688 0.137 0.097 0.095 0.702 0.114 0.089 0.108 0.083 0.718 0.091 0.683 0.104 0.117 0.096 MOTIF Heart_E15.5_H3K4me2_11_155_0.623_5.836474e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.133 0.145 0.135 0.587 0.121 0.141 0.134 0.604 0.131 0.633 0.098 0.138 0.13 0.122 0.609 0.139 0.11 0.605 0.143 0.142 0.144 0.126 0.134 0.596 0.129 0.568 0.163 0.14 0.127 0.595 0.15 0.128 0.124 0.119 0.635 0.122 0.564 0.146 0.153 0.137 MOTIF Lung_E15.5_H3K4me2_10_157_0.650_3.804505e-315 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.131 0.148 0.136 0.585 0.132 0.152 0.142 0.574 0.132 0.633 0.101 0.134 0.124 0.118 0.628 0.13 0.116 0.6 0.141 0.143 0.141 0.132 0.134 0.593 0.133 0.575 0.151 0.141 0.123 0.617 0.133 0.127 0.115 0.117 0.647 0.121 0.549 0.165 0.138 0.148 MOTIF Midbrain_P0_H3K4me2_8_153_0.668_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.129 0.631 0.125 0.115 0.12 0.153 0.611 0.116 0.141 0.145 0.592 0.122 0.572 0.151 0.141 0.136 0.155 0.14 0.575 0.13 0.136 0.608 0.119 0.137 0.139 0.111 0.629 0.121 0.59 0.137 0.156 0.117 0.608 0.136 0.132 0.124 0.585 0.134 0.141 0.14 MOTIF Neural-Tube_E13.5_H3K4me2_6_152_0.674_1.230994e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.127 0.155 0.575 0.143 0.117 0.663 0.12 0.1 0.116 0.139 0.632 0.113 0.144 0.145 0.58 0.131 0.561 0.16 0.14 0.139 0.139 0.131 0.607 0.123 0.132 0.613 0.132 0.123 0.141 0.113 0.618 0.128 0.573 0.141 0.16 0.126 0.58 0.138 0.147 0.135 MOTIF Kidney_E16.5_H3K4me2_41_167_0.601_5.241486e-314 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 MOTIF Kidney_E14.5_H3K4me2_3_159_0.692_3.054044e-316 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.192 0.275 0.225 0.308 0.179 0.235 0.181 0.405 0.049 0.274 0.287 0.391 0.133 0.768 0.002 0.097 0.06 0.002 0.935 0.003 0.111 0.461 0.258 0.169 0.655 0.001 0.016 0.328 0.23 0.112 0.489 0.17 0.152 0.395 0.209 0.244 0.238 0.218 0.278 0.266 MOTIF Heart_E16.5_H3K4me2_6_156_0.623_5.315801e-315 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.144 0.727 0.028 0.101 0.019 0.001 0.859 0.121 0.008 0.757 0.029 0.206 0.183 0.188 0.143 0.486 0.057 0.192 0.621 0.13 0.194 0.757 0.03 0.019 0.136 0.026 0.672 0.166 0.575 0.056 0.366 0.003 0.912 0.001 0.086 0.001 0.633 0.067 0.178 0.122 MOTIF Intestine_P0_H3K4me2_2_155_0.658_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.138 0.139 0.135 0.588 0.111 0.141 0.12 0.628 0.12 0.154 0.138 0.588 0.135 0.603 0.119 0.143 0.126 0.153 0.589 0.132 0.122 0.63 0.129 0.119 0.149 0.153 0.551 0.147 0.124 0.153 0.588 0.135 0.13 0.621 0.124 0.125 0.116 0.125 0.616 0.143 MOTIF Cranio-Facial_E13.5_H3K4me2_4_155_0.663_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.269 0.152 0.125 0.455 0.146 0.542 0.147 0.165 0.124 0.152 0.527 0.197 0.103 0.565 0.273 0.059 0.491 0.088 0.203 0.219 0.346 0.137 0.373 0.144 0.265 0.487 0.096 0.152 0.214 0.043 0.604 0.139 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K4me2_3_151_0.674_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.284 0.299 0.024 0.393 0.068 0.181 0.047 0.704 0.029 0.441 0.073 0.457 0.135 0.487 0.095 0.282 0.158 0.148 0.524 0.17 0.09 0.549 0.329 0.032 0.337 0.291 0.168 0.204 0.107 0.111 0.67 0.112 0.092 0.812 0.027 0.069 0.095 0.151 0.585 0.169 MOTIF Forebrain_E12.5_H3K4me2_7_155_0.664_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.141 0.578 0.145 0.136 0.118 0.597 0.16 0.125 0.11 0.113 0.66 0.117 0.118 0.612 0.135 0.135 0.152 0.151 0.137 0.56 0.119 0.159 0.581 0.141 0.125 0.632 0.124 0.119 0.142 0.118 0.608 0.132 0.581 0.143 0.162 0.114 0.59 0.124 0.151 0.135 MOTIF Forebrain_E16.5_H3K4me2_8_153_0.664_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.135 0.568 0.154 0.143 0.122 0.603 0.155 0.12 0.102 0.105 0.679 0.114 0.125 0.603 0.132 0.14 0.152 0.153 0.14 0.555 0.115 0.158 0.589 0.138 0.118 0.642 0.114 0.126 0.139 0.125 0.613 0.123 0.569 0.155 0.151 0.125 0.581 0.126 0.148 0.145 MOTIF Kidney_E15.5_H3K4me2_3_152_0.663_4.682398e-313 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.137 0.146 0.118 0.599 0.104 0.123 0.049 0.724 0.103 0.212 0.133 0.552 0.124 0.652 0.038 0.186 0.15 0.123 0.605 0.122 0.185 0.548 0.161 0.106 0.422 0.176 0.186 0.216 0.151 0.173 0.56 0.116 0.121 0.714 0.055 0.11 0.121 0.107 0.611 0.161 MOTIF Limb_E15.5_H3K4me2_7_153_0.670_7.25997e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.139 0.147 0.122 0.592 0.118 0.137 0.113 0.632 0.12 0.158 0.142 0.58 0.126 0.617 0.113 0.144 0.128 0.122 0.631 0.119 0.152 0.581 0.145 0.122 0.533 0.163 0.158 0.146 0.143 0.136 0.598 0.123 0.13 0.631 0.117 0.122 0.137 0.125 0.604 0.134 MOTIF Lung_E16.5_H3K4me2_15_158_0.622_1.733963e-313 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.109 0.713 0.088 0.09 0.106 0.078 0.702 0.114 0.084 0.717 0.098 0.101 0.12 0.094 0.09 0.696 0.079 0.119 0.707 0.095 0.097 0.701 0.096 0.106 0.106 0.101 0.678 0.115 0.7 0.108 0.108 0.084 0.721 0.087 0.109 0.083 0.667 0.104 0.128 0.101 MOTIF Forebrain_E13.5_H3K4me2_13_156_0.633_7.941149e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.255 0.236 0.239 0.269 0.155 0.163 0.134 0.548 0.149 0.152 0.165 0.534 0.14 0.577 0.134 0.149 0.137 0.143 0.591 0.129 0.161 0.549 0.162 0.128 0.487 0.187 0.171 0.155 0.151 0.149 0.554 0.146 0.133 0.576 0.149 0.142 0.215 0.236 0.316 0.232 MOTIF Limb_E14.5_H3K4me2_14_153_0.654_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.253 0.226 0.243 0.278 0.151 0.159 0.143 0.547 0.138 0.162 0.166 0.534 0.131 0.596 0.122 0.151 0.132 0.145 0.598 0.125 0.161 0.538 0.167 0.134 0.47 0.197 0.179 0.154 0.153 0.153 0.551 0.143 0.134 0.572 0.142 0.152 0.218 0.23 0.312 0.24 MOTIF Lung_P0_H3K4me2_12_155_0.640_8.44169e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.237 0.326 0.224 0.213 0.154 0.143 0.567 0.136 0.137 0.542 0.16 0.161 0.154 0.187 0.186 0.472 0.148 0.163 0.533 0.156 0.13 0.599 0.137 0.134 0.141 0.122 0.607 0.13 0.531 0.161 0.161 0.147 0.552 0.14 0.159 0.149 0.269 0.25 0.232 0.249 MOTIF Forebrain_E11.5_H3K4me2_17_155_0.663_3.551642e-316 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.256 0.232 0.239 0.273 0.153 0.153 0.142 0.552 0.139 0.157 0.166 0.538 0.146 0.588 0.125 0.141 0.14 0.135 0.595 0.13 0.163 0.527 0.169 0.141 0.482 0.196 0.177 0.145 0.149 0.152 0.554 0.145 0.129 0.574 0.146 0.151 0.22 0.227 0.315 0.238 MOTIF Neural-Tube_E14.5_H3K4me2_18_155_0.667_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.25 0.246 0.244 0.26 0.147 0.165 0.148 0.54 0.137 0.161 0.163 0.539 0.14 0.589 0.127 0.144 0.134 0.139 0.599 0.128 0.152 0.537 0.171 0.14 0.482 0.187 0.176 0.156 0.154 0.151 0.556 0.139 0.133 0.578 0.142 0.147 0.21 0.233 0.318 0.238 MOTIF Stomach_P0_H3K4me2_3_155_0.673_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.227 0.222 0.192 0.359 0.209 0.092 0.083 0.616 0.106 0.122 0.124 0.648 0.096 0.711 0.083 0.11 0.103 0.093 0.704 0.1 0.068 0.639 0.151 0.142 0.316 0.232 0.212 0.24 0.288 0.077 0.561 0.074 0.1 0.71 0.091 0.099 0.112 0.087 0.578 0.223