MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Midbrain_E15.5_H3K4me2_49_19_0.591_1.404462e-308 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.056282 0.934394 0.009324 0.0 0.076506 0.848568 0.022586 0.05234 0.049705 0.037359 0.740906 0.17203 0.023808 0.057961 0.836339 0.081893 0.171841 0.028398 0.717494 0.082267 0.05317 0.01792 0.923999 0.004911 0.908249 0.039431 0.016323 0.035997 0.099024 0.399855 0.486809 0.014312 0.062572 0.087315 0.827502 0.022611 0.247292 0.731585 0.0 0.021123 0.025141 0.025574 0.914832 0.034453 0.147342 0.180998 0.0 0.67166 MOTIF Heart_E16.5_H3K4me2_28_24_0.579_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.15079 0.04155 0.774943 0.032717 0.020953 0.799414 0.004844 0.174789 0.182828 0.034707 0.752744 0.029721 0.015717 0.936544 0.010014 0.037725 0.112829 0.082825 0.701315 0.103031 0.038962 0.067234 0.041877 0.851927 0.022247 0.791128 0.015977 0.170648 0.15588 0.775762 0.020736 0.047623 0.029642 0.891415 0.024063 0.05488 MOTIF Liver_E13.5_H3K4me2_25_19_0.583_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.150219 0.055881 0.576406 0.217494 0.084864 0.742558 0.158103 0.014476 0.025764 0.035513 0.868262 0.07046 0.023552 0.727187 0.054628 0.194633 0.006429 0.014346 0.941604 0.037621 0.069548 0.0 0.089161 0.841291 0.083978 0.843461 0.02041 0.05215 0.023496 0.906129 0.036182 0.034193 0.017102 0.859312 0.037302 0.086284 MOTIF Forebrain_P0_H3K4me2_31_27_0.613_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.097893 0.132598 0.743317 0.026193 0.121088 0.835187 0.035715 0.00801 0.154411 0.014155 0.773939 0.057494 0.189053 0.654513 0.057082 0.099352 0.016414 0.012918 0.9514 0.019268 0.043031 0.06075 0.033768 0.862451 0.055033 0.872775 0.039413 0.032779 0.132424 0.79257 0.048682 0.026324 0.158721 0.737903 0.050729 0.052647 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K4me2_32_21_0.611_3.257267e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.074219 0.043314 0.850303 0.032164 0.017285 0.861761 0.024971 0.095983 0.085307 0.019033 0.878216 0.017443 0.077833 0.55073 0.206868 0.164569 0.030025 0.071514 0.833379 0.065082 0.093189 0.023716 0.056709 0.826386 0.029244 0.896423 0.054748 0.019586 0.060465 0.772682 0.01778 0.149074 0.081681 0.766309 0.083117 0.068893 MOTIF Lung_E15.5_H3K4me2_19_18_0.616_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.065625 0.058026 0.847228 0.029121 0.120609 0.712401 0.053996 0.112993 0.061494 0.017246 0.861862 0.059398 0.076898 0.759993 0.05746 0.105649 0.064685 0.067882 0.812169 0.055264 0.061745 0.079064 0.090734 0.768456 0.032641 0.830586 0.019303 0.117469 0.086603 0.741698 0.024814 0.146885 0.026225 0.869993 0.069006 0.034776 MOTIF Neural-Tube_E12.5_H3K4me2_32_13_0.608_9.12067e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.057356 0.08527 0.759631 0.097743 0.125309 0.7578 0.065339 0.051552 0.04693 0.035233 0.885527 0.03231 0.104819 0.68124 0.059843 0.154098 0.025709 0.061212 0.838679 0.074401 0.069638 0.034818 0.003016 0.892527 0.028389 0.856348 0.009675 0.105587 0.057454 0.741942 0.077884 0.12272 0.00827 0.905882 0.031872 0.053976 MOTIF Stomach_E16.5_H3K4me2_20_26_0.622_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.107752 0.035883 0.690601 0.165764 0.014409 0.86497 0.041229 0.079392 0.132266 0.0 0.787663 0.08007 0.029781 0.851908 0.068138 0.050173 0.03965 0.03157 0.859321 0.069458 0.040903 0.0 0.086076 0.873022 0.035527 0.817415 0.016219 0.130839 0.101512 0.625159 0.034627 0.238701 0.023919 0.866847 0.062365 0.046869 MOTIF Cranio-Facial_E13.5_H3K4me2_40_19_0.582_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.230265 0.717687 0.019599 0.032449 0.032499 0.035668 0.926973 0.00486 0.11636 0.570967 0.056439 0.256235 0.013074 0.047168 0.889474 0.050284 0.040536 0.02994 0.042074 0.88745 0.025111 0.940373 0.019682 0.014834 0.153122 0.740476 0.033988 0.072414 0.097683 0.809928 0.047273 0.045117 0.12107 0.792112 0.053134 0.033684 0.2405 0.110909 0.346647 0.301943 MOTIF Hindbrain_E15.5_H3K4me2_32_14_0.620_5.756722e-317 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.121893 0.702215 0.048286 0.127605 0.025505 0.037164 0.935944 0.001387 0.097361 0.684871 0.033761 0.184007 0.013429 0.064872 0.84775 0.073949 0.049325 0.076802 0.032325 0.841548 0.013378 0.781378 0.015875 0.189369 0.12969 0.777994 0.033541 0.058774 0.048211 0.732629 0.03059 0.188571 0.023664 0.913235 0.016236 0.046865 0.15314 0.029549 0.484066 0.333245 MOTIF Forebrain_P0_H3K4me2_51_15_0.583_7.562663e-320 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.090603 0.691966 0.016048 0.201383 0.032748 0.018757 0.931814 0.016681 0.146004 0.631364 0.056289 0.166343 0.022302 0.026177 0.919515 0.032006 0.107422 0.012695 0.009803 0.87008 0.016722 0.91942 0.017065 0.046792 0.111622 0.673569 0.025469 0.18934 0.021173 0.922154 0.016704 0.03997 0.013805 0.875016 0.049012 0.062167 0.366245 0.239042 0.319381 0.075332 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K4me2_45_23_0.594_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.015172 0.805398 0.066561 0.112869 0.102691 0.059088 0.828245 0.009977 0.105156 0.685717 0.061634 0.147493 0.047676 0.050609 0.848915 0.0528 0.158225 0.0 0.023545 0.81823 0.008023 0.823679 0.020196 0.148102 0.112151 0.801413 0.033219 0.053216 0.051127 0.850259 0.036712 0.061903 0.027291 0.861328 0.021274 0.090108 MOTIF Cranio-Facial_E11.5_H3K4me2_34_18_0.631_4.928913e-315 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.040756 0.810744 0.036591 0.111909 0.02607 0.044547 0.92451 0.004873 0.168793 0.632471 0.066315 0.132422 0.008337 0.060694 0.898766 0.032203 0.095459 0.016279 0.054615 0.833646 0.007633 0.862739 0.02463 0.104998 0.085811 0.678026 0.042289 0.193873 0.067471 0.856667 0.020395 0.055467 0.079846 0.749525 0.041463 0.129166 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K4me2_31_17_0.613_5.190417e-318 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.036984 0.833247 0.035088 0.094681 0.056261 0.028532 0.894709 0.020498 0.113604 0.706971 0.061125 0.1183 0.048725 0.056051 0.763896 0.131328 0.086222 0.005583 0.040877 0.867319 0.016948 0.838379 0.047582 0.097091 0.062416 0.755002 0.019658 0.162924 0.069706 0.839283 0.047457 0.043554 0.060372 0.75658 0.075343 0.107705 MOTIF Limb_E12.5_H3K4me2_47_30_0.584_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.129234 0.638219 0.187598 0.04495 0.030223 0.038693 0.920946 0.010138 0.155812 0.671844 0.013503 0.158841 0.026681 0.055315 0.776989 0.141015 0.063499 0.037488 0.033292 0.86572 0.001894 0.830741 0.020714 0.146651 0.120111 0.77237 0.036416 0.071102 0.028194 0.923778 0.014711 0.033317 0.048927 0.876366 0.016951 0.057756 MOTIF Lung_P0_H3K4me2_44_27_0.590_8.169544e-314 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.091516 0.691106 0.193771 0.023607 0.025373 0.032663 0.928781 0.013182 0.120832 0.6314 0.113498 0.134269 0.020053 0.072826 0.854256 0.052865 0.05645 0.039239 0.038592 0.865718 0.015752 0.872041 0.029923 0.082284 0.076553 0.708392 0.047028 0.168027 0.015471 0.919908 0.016138 0.048483 0.041043 0.72949 0.084455 0.145012 MOTIF Forebrain_E15.5_H3K4me2_41_25_0.598_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.032266 0.806033 0.138069 0.023632 0.079301 0.051949 0.827151 0.041599 0.13642 0.616298 0.130459 0.116823 0.061801 0.047252 0.692382 0.198564 0.041461 0.03019 0.008906 0.919444 0.030748 0.813186 0.027253 0.128813 0.071644 0.853802 0.03826 0.036294 0.022568 0.910422 0.022934 0.044076 0.038772 0.762772 0.045191 0.153265 MOTIF Midbrain_E12.5_H3K4me2_41_17_0.594_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.107976 0.787742 0.09059 0.013691 0.030341 0.048998 0.839803 0.080858 0.132914 0.55108 0.182265 0.133741 0.0583 0.045236 0.776126 0.120338 0.062653 0.011254 0.031978 0.894114 0.026234 0.846861 0.018027 0.108878 0.065073 0.777478 0.08302 0.07443 0.044702 0.883582 0.032028 0.039688 0.027347 0.846166 0.060244 0.066242 MOTIF Intestine_E14.5_H3K4me2_26_19_0.624_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.052324 0.807476 0.086388 0.053812 0.036407 0.081311 0.831841 0.05044 0.054693 0.040502 0.858627 0.046178 0.156472 0.026872 0.79856 0.018096 0.075935 0.015456 0.904807 0.003802 0.78802 0.067424 0.018983 0.125572 0.132702 0.778346 0.048585 0.040366 0.171601 0.08666 0.577268 0.164471 0.058748 0.884259 0.034805 0.022188 0.089438 0.257341 0.466892 0.186329 MOTIF Stomach_E16.5_H3K4me2_27_21_0.610_9.295228e-318 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.081746 0.778083 0.0903 0.049871 0.10819 0.019899 0.817582 0.05433 0.03836 0.014488 0.915349 0.031802 0.060882 0.018442 0.89749 0.023186 0.23403 0.027711 0.734545 0.003714 0.812209 0.038604 0.021124 0.128063 0.175926 0.771154 0.047795 0.005125 0.246065 0.03673 0.672706 0.0445 0.055259 0.862297 0.057844 0.0246 0.104471 0.194193 0.612883 0.088454 MOTIF Cranio-Facial_E12.5_H3K4me2_59_29_0.559_2.500391e-101 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.002896 0.929503 0.046166 0.021435 0.066315 0.832396 0.03948 0.061809 0.049901 0.129239 0.797793 0.023066 0.087817 0.045384 0.816191 0.050608 0.174944 0.032441 0.777791 0.014824 0.205596 0.043273 0.701588 0.049544 0.905013 0.006747 0.054706 0.033534 0.141663 0.035258 0.811653 0.011426 0.146268 0.125541 0.71647 0.011721 0.594816 0.304607 0.036929 0.063649 0.594507 0.070092 0.047353 0.288048 MOTIF Heart_E14.5_H3K4me2_64_46_0.543_5.205511e-158 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.001869 0.955352 0.021851 0.020928 0.08649 0.815086 0.019122 0.079302 0.059972 0.061821 0.825571 0.052635 0.017954 0.062857 0.791886 0.127303 0.273156 0.111007 0.595378 0.020459 0.228896 0.036984 0.729364 0.004756 0.876764 0.023975 0.066916 0.032346 0.166597 0.0509 0.765461 0.017043 0.039912 0.008463 0.942906 0.008719 0.503326 0.384051 0.02574 0.086883 MOTIF Heart_E11.5_H3K4me3_64_46_0.574_4.460235e-119 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.515011 0.278837 0.053356 0.152795 0.008614 0.894686 0.073883 0.022817 0.048132 0.882256 0.028321 0.041291 0.033954 0.041636 0.848863 0.075547 0.227291 0.057456 0.615587 0.099666 0.022179 0.0 0.907333 0.070489 0.334335 0.027415 0.634995 0.003255 0.869378 0.017522 0.059555 0.053545 0.227787 0.067413 0.696579 0.008222 0.067164 0.024422 0.902388 0.006027 0.319062 0.52671 0.061763 0.092464 MOTIF Cranio-Facial_E13.5_H3K4me3_59_42_0.589_1.458852e-183 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.00289 0.919672 0.072105 0.005333 0.042942 0.767978 0.055827 0.133253 0.034535 0.054852 0.89075 0.019863 0.019835 0.053446 0.844993 0.081725 0.223876 0.117458 0.530779 0.127887 0.290006 0.040995 0.663634 0.005365 0.883666 0.022794 0.057848 0.035692 0.046504 0.035479 0.854689 0.063328 0.043175 0.059296 0.878306 0.019223 0.234749 0.383064 0.07164 0.310546 0.453772 0.055187 0.330019 0.161022 MOTIF Heart_E13.5_H3K4me3_55_68_0.594_5.616473e-317 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.035931 0.861736 0.066759 0.035573 0.006689 0.90699 0.028117 0.058204 0.036973 0.005716 0.909685 0.047626 0.023338 0.031448 0.848626 0.096588 0.366278 0.014698 0.508606 0.110417 0.152405 0.006345 0.84125 0.0 0.864985 0.064623 0.025206 0.045186 0.210814 0.057072 0.65486 0.077254 0.058368 0.049137 0.860333 0.032163 MOTIF Midbrain_P0_H3K4me3_63_58_0.600_5.434924e-262 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.016789 0.799611 0.077971 0.105628 0.013598 0.963611 0.0 0.02279 0.182294 0.0 0.816334 0.001372 0.010934 0.088739 0.76843 0.131898 0.345919 0.031844 0.425387 0.19685 0.020963 0.025076 0.949813 0.004148 0.783322 0.087291 0.059847 0.06954 0.025231 0.023259 0.933075 0.018434 0.040282 0.095277 0.844791 0.019649