MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Liver_E14.5_H3K27me3_38_22_0.546_1.583634e-72 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.251329 0.428742 0.186669 0.13326 0.111455 0.005136 0.821495 0.061913 0.0 0.980051 0.018527 0.001422 0.039648 0.833985 0.054666 0.071701 0.031324 0.719825 0.05413 0.194721 0.086489 0.038508 0.83373 0.041273 0.028605 0.097897 0.860135 0.013363 0.020093 0.053159 0.862787 0.063961 0.043287 0.874145 0.048035 0.034533 MOTIF Hindbrain_P0_H3K9ac_34_34_0.608_4.667622e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.029598 0.939748 0.030654 0.0 0.065925 0.046397 0.867607 0.02007 0.213787 0.612804 0.009859 0.16355 0.128444 0.720848 0.114849 0.035859 0.016344 0.885892 0.097764 0.0 0.302013 0.05659 0.605799 0.035598 0.012789 0.024161 0.934947 0.028103 0.019819 0.038173 0.935564 0.006444 0.03656 0.936227 0.0 0.027213 MOTIF Liver_E15.5_H3K9ac_35_25_0.584_2.14431e-255 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.068366 0.908216 0.012308 0.011109 0.213919 0.040557 0.670767 0.074757 0.060057 0.805381 0.039712 0.094849 0.017493 0.918532 0.019033 0.044943 0.051195 0.820688 0.107112 0.021005 0.078684 0.026633 0.779373 0.115309 0.373418 0.013883 0.528933 0.083765 0.030848 0.010118 0.90624 0.052794 0.059665 0.845354 0.039119 0.055863 0.0 0.854191 0.076711 0.069098 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K4me3_56_23_0.596_1.74186e-194 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.171992 0.484567 0.266744 0.076697 0.011791 0.932097 0.0 0.056112 0.010922 0.96283 0.016179 0.01007 0.380877 0.529282 0.044419 0.045421 0.000364 0.013825 0.962192 0.023619 0.055782 0.030415 0.886908 0.026895 0.066405 0.005864 0.900003 0.027727 0.058543 0.707094 0.0 0.234363 0.12879 0.048188 0.760977 0.062046 0.111782 0.741214 0.070873 0.07613 0.146621 0.754324 0.0 0.099055 MOTIF Hindbrain_E11.5_H3K4me3_33_11_0.688_1.203467e-314 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.354164 0.352456 0.262114 0.031267 0.216612 0.040123 0.385282 0.357982 0.068439 0.120743 0.51495 0.295868 0.117665 0.823092 0.012395 0.046849 0.178448 0.00631 0.507039 0.308203 0.015964 0.863217 0.070071 0.050748 0.025932 0.911821 0.020143 0.042104 0.029451 0.887687 0.076548 0.006314 0.037813 0.024 0.911747 0.02644 0.036469 0.028426 0.925555 0.009551 0.053658 0.008343 0.81267 0.125329 0.149909 0.603207 0.169152 0.077733 MOTIF Kidney_P0_H3K4me3_41_8_0.651_5.080131e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.202685 0.344307 0.453008 0.0 0.409487 0.131655 0.214544 0.244313 0.072245 0.805106 0.085731 0.036918 0.11864 0.078577 0.541904 0.260879 0.026334 0.855158 0.009641 0.108868 0.022485 0.908737 0.044008 0.02477 0.046265 0.863928 0.039859 0.049949 0.063135 0.034442 0.863963 0.03846 0.027957 0.021668 0.915374 0.035001 0.117412 0.008813 0.831427 0.042348 0.10553 0.707908 0.134626 0.051936 MOTIF Intestine_P0_H3K4me3_32_18_0.649_2.763744e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.160947 0.747036 0.045889 0.046128 0.085346 0.021881 0.707969 0.184804 0.051487 0.720487 0.070731 0.157295 0.007859 0.887461 0.033905 0.070775 0.065475 0.846327 0.039477 0.048722 0.091212 0.046625 0.804661 0.057502 0.070726 0.050516 0.866294 0.012465 0.044039 0.041925 0.907058 0.006978 0.173781 0.708838 0.073197 0.044185 MOTIF Lung_E14.5_H3K4me3_41_20_0.648_2.186927e-316 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.064468 0.792776 0.035308 0.107448 0.097752 0.0479 0.626921 0.227427 0.019317 0.913739 0.040223 0.026721 0.045619 0.841454 0.0237 0.089227 0.108534 0.827093 0.047935 0.016438 0.130316 0.013656 0.79597 0.060058 0.019067 0.016418 0.918843 0.045672 0.138 0.060308 0.739947 0.061745 0.070721 0.73957 0.149476 0.040233 MOTIF Midbrain_E12.5_H3K4me3_35_23_0.667_3.120216e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.041655 0.944989 0.007363 0.005993 0.184872 0.035651 0.430751 0.348726 0.047142 0.870738 0.051049 0.031071 0.019269 0.722728 0.02381 0.234193 0.01549 0.940348 0.041717 0.002446 0.023713 0.0 0.945519 0.030768 0.024816 0.0 0.958766 0.016418 0.075861 0.075032 0.760416 0.088692 0.069025 0.675954 0.215468 0.039553 MOTIF Cranio-Facial_E15.5_H3K4me2_41_14_0.603_7.052164e-317 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.021582 0.925397 0.011594 0.041426 0.020918 0.874466 0.018688 0.085928 0.053755 0.910285 0.01975 0.01621 0.114058 0.051094 0.74376 0.091087 0.137956 0.035157 0.804586 0.0223 0.11102 0.037321 0.813002 0.038657 0.115075 0.799639 0.048241 0.037045 0.128479 0.02837 0.764803 0.078349 0.009667 0.300191 0.58667 0.103473 0.632706 0.058327 0.096939 0.212027 MOTIF Liver_E16.5_H3K4me2_43_19_0.576_3.480323e-316 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.012593 0.886451 0.059005 0.041951 0.060494 0.890961 0.023445 0.0251 0.160944 0.732392 0.060454 0.046209 0.169277 0.053312 0.767717 0.009694 0.185795 0.0314 0.761275 0.02153 0.194676 0.030987 0.767851 0.006487 0.071433 0.719024 0.024713 0.18483 0.008446 0.016078 0.937027 0.038449 0.023339 0.908151 0.013995 0.054515 0.440256 0.142349 0.0 0.417395 MOTIF Limb_E14.5_H3K4me2_37_21_0.600_1.209072e-313 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.058414 0.873327 0.0 0.06826 0.024895 0.922505 0.01385 0.03875 0.039722 0.916101 0.018859 0.025318 0.032629 0.044293 0.892981 0.030097 0.029482 0.017945 0.945897 0.006676 0.214601 0.020338 0.679185 0.085876 0.451801 0.487376 0.02491 0.035913 0.031384 0.030418 0.884041 0.054157 0.042197 0.780284 0.061976 0.115543 0.174396 0.034423 0.113635 0.677546 MOTIF Stomach_E14.5_H3K4me2_37_8_0.615_4.259407e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.0 0.331929 0.668071 0.0 0.468251 0.048072 0.262185 0.221493 0.061228 0.152213 0.555605 0.230953 0.111409 0.800101 0.057001 0.031488 0.031797 0.110071 0.591647 0.266485 0.071883 0.740533 0.037761 0.149823 0.019006 0.826463 0.022418 0.132113 0.039032 0.872003 0.046307 0.042658 0.052227 0.012456 0.881268 0.05405 0.024261 0.015388 0.949611 0.01074 0.0719 0.056815 0.832687 0.038598 0.068126 0.730106 0.136517 0.06525 MOTIF Liver_E11.5_H3K4me2_37_10_0.577_1.211951e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.164356 0.093985 0.139648 0.602012 0.027982 0.931518 0.014336 0.026163 0.009335 0.932108 0.022273 0.036284 0.163885 0.698259 0.0353 0.102557 0.05051 0.017577 0.910319 0.021594 0.044688 0.023116 0.898207 0.033989 0.141809 0.042105 0.804399 0.011686 0.401284 0.544607 0.019146 0.034963 0.10556 0.017195 0.806726 0.070519 0.018166 0.913552 0.039711 0.028571 0.087157 0.133711 0.515982 0.26315 0.500487 0.289843 0.123438 0.086231 0.374186 0.066562 0.494327 0.064925 MOTIF Midbrain_E11.5_H3K4me2_52_16_0.602_1.347899e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.19434 0.190308 0.066074 0.549278 0.007988 0.896809 0.052118 0.043085 0.01699 0.935233 0.033923 0.013854 0.123707 0.693347 0.053846 0.129099 0.256455 0.042771 0.534856 0.165919 0.024811 0.033035 0.90767 0.034485 0.043263 0.023631 0.914374 0.018733 0.058656 0.787295 0.00649 0.147559 0.022828 0.040838 0.87196 0.064374 0.02124 0.915171 0.045114 0.018474 0.332971 0.090931 0.296884 0.279213 MOTIF Forebrain_E15.5_H3K4me2_28_14_0.633_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.090312 0.690703 0.029428 0.189557 0.01103 0.951846 0.010031 0.027093 0.042926 0.898533 0.011648 0.046894 0.047175 0.035815 0.885347 0.031663 0.049245 0.012142 0.913211 0.025402 0.164434 0.003328 0.73013 0.102108 0.088287 0.730038 0.042822 0.138853 0.14297 0.060808 0.632824 0.163398 0.113508 0.833755 0.037083 0.015654 0.303551 0.12418 0.380536 0.191732 MOTIF Kidney_P0_H3K4me2_28_11_0.606_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.043235 0.756139 0.131094 0.069532 0.025478 0.918468 0.025739 0.030315 0.04526 0.905695 0.012599 0.036446 0.127667 0.028883 0.804193 0.039257 0.03819 0.015643 0.925063 0.021104 0.10073 0.019699 0.826474 0.053097 0.262417 0.604234 0.025011 0.108339 0.116478 0.044195 0.670314 0.169013 0.101663 0.802762 0.040635 0.05494 0.21723 0.160009 0.466177 0.156584 MOTIF Midbrain_E13.5_H3K4me2_24_6_0.626_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.547402 0.274112 0.169039 0.009447 0.299 0.315122 0.158662 0.227216 0.051684 0.813912 0.069874 0.064531 0.023824 0.880002 0.065459 0.030715 0.042081 0.843909 0.08133 0.03268 0.065721 0.016331 0.808959 0.108989 0.032652 0.051903 0.894511 0.020934 0.153545 0.048926 0.642926 0.154602 0.086802 0.716318 0.0265 0.17038 0.182769 0.060755 0.710605 0.04587 0.01319 0.960445 0.009892 0.016473 0.25207 0.011692 0.509569 0.226669 MOTIF Stomach_E15.5_H3K4me2_17_9_0.644_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.023007 0.939155 0.02652 0.011318 0.037807 0.82597 0.008768 0.127455 0.036474 0.043657 0.818485 0.101385 0.108255 0.075333 0.72338 0.093032 0.038407 0.014271 0.928143 0.019179 0.049647 0.709205 0.128744 0.112403 0.096951 0.076901 0.766085 0.060063 0.037152 0.852824 0.04288 0.067144 0.11576 0.034047 0.653845 0.196348 MOTIF Lung_E15.5_H3K9ac_40_19_0.625_8.749734e-299 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.03048 0.938371 0.003885 0.027264 0.019407 0.835028 0.04333 0.102235 0.040268 0.893311 0.041597 0.024823 0.191295 0.042984 0.59825 0.167471 0.098161 0.03221 0.861251 0.008378 0.181174 0.026812 0.683753 0.108261 0.048912 0.834471 0.04627 0.070347 0.126518 0.043295 0.757295 0.072892 0.004947 0.905234 0.079444 0.010375 0.171307 0.036877 0.360427 0.431388 0.007835 0.274811 0.608793 0.10856 MOTIF Neural-Tube_E15.5_H3K9ac_52_14_0.591_2.542471e-221 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.495058 0.352998 0.057096 0.094848 0.216599 0.250272 0.0 0.533129 0.037461 0.89288 0.009736 0.059924 0.017332 0.929503 0.015545 0.03762 0.027746 0.900814 0.021033 0.050408 0.04677 0.0348 0.886315 0.032115 0.043231 0.017009 0.925653 0.014107 0.037223 0.016226 0.927447 0.019104 0.240141 0.604108 0.029753 0.125998 0.095256 0.020609 0.57434 0.309795 0.080943 0.866629 0.010545 0.041882 0.345442 0.061523 0.283148 0.309887 0.0 0.535663 0.236293 0.228045 MOTIF Hindbrain_P0_H3K9ac_32_28_0.610_9.194209e-314 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.011986 0.924042 0.051597 0.012375 0.084954 0.853634 0.036922 0.02449 0.318498 0.603528 0.058747 0.019228 0.008639 0.063477 0.758586 0.169298 0.172973 0.030204 0.786398 0.010424 0.043398 0.014141 0.772823 0.169638 0.019409 0.885855 0.065054 0.029683 0.032258 0.0 0.877539 0.090203 0.109077 0.876429 0.0 0.014494 MOTIF Midbrain_E15.5_H3K9ac_50_44_0.583_1.56501e-186 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.041518 0.870771 0.013587 0.074124 0.026728 0.93057 0.006421 0.036281 0.135969 0.587402 0.0 0.276628 0.10526 0.031896 0.803802 0.059042 0.048115 0.034297 0.889732 0.027856 0.064333 0.0 0.921531 0.014135 0.383498 0.581388 0.0 0.035114 0.050687 0.028208 0.891277 0.029828 0.041081 0.912775 0.016281 0.029862 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K9ac_53_23_0.568_9.236128e-211 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.209754 0.0 0.103203 0.687043 0.277487 0.172875 0.172344 0.377295 0.042174 0.856255 0.082599 0.018972 0.053467 0.920227 0.012047 0.014259 0.125451 0.554813 0.014877 0.304859 0.125892 0.053719 0.809248 0.01114 0.132252 0.021527 0.808978 0.037242 0.04101 0.016473 0.851568 0.090949 0.047302 0.888171 0.02469 0.039838 0.035168 0.012114 0.816966 0.135751 0.143246 0.828693 0.006318 0.021742 MOTIF Neural-Tube_E12.5_H3K9ac_36_21_0.602_3.16666e-278 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.252555 0.200638 0.093834 0.452973 0.104333 0.830365 0.005096 0.060206 0.011587 0.764577 0.048072 0.175763 0.085965 0.64455 0.053198 0.216286 0.014136 0.044306 0.907209 0.034349 0.037891 0.016972 0.90056 0.044577 0.189855 0.049702 0.664049 0.096394 0.057057 0.721864 0.111509 0.109569 0.055489 0.009016 0.917144 0.018351 0.018282 0.962404 0.012302 0.007012 MOTIF Stomach_P0_H3K9ac_38_22_0.581_1.905352e-181 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.046091 0.838407 0.082252 0.03325 0.029483 0.810046 0.009819 0.150652 0.04638 0.900962 0.010359 0.042299 0.057366 0.027388 0.873073 0.042173 0.0354 0.021996 0.936338 0.006266 0.225478 0.038281 0.720343 0.015898 0.03803 0.85966 0.063429 0.038881 0.388258 0.046047 0.528653 0.037042 0.101405 0.898595 0.0 0.0 0.461734 0.232712 0.059089 0.246465