MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Heart_E13.5_H3K27ac_39_25_0.523_1.636478e-117
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0392	0.891083	0.045527	0.02419
0.043485	0.919491	0.022421	0.014602
0.021278	0.89834	0.048975	0.031407
0.005518	0.180331	0.803355	0.010797
0.036441	0.080851	0.603939	0.278769
0.00978	0.020647	0.964494	0.005079
0.021279	0.021895	0.764269	0.192557
0.259193	0.635842	0.042869	0.062096
0.045859	0.089556	0.856156	0.00843

MOTIF	Heart_E11.5_H3K27ac_36_30_0.530_6.733844e-87
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.019451	0.908963	0.048587	0.022998
0.03424	0.895959	0.013172	0.056629
0.021955	0.885005	0.014026	0.079014
0.007063	0.233203	0.734434	0.0253
0.011028	0.023591	0.759704	0.205677
0.041465	0.023869	0.710715	0.223951
0.03182	0.005298	0.79344	0.169441
0.043811	0.87024	0.028756	0.057193
0.155017	0.0	0.777861	0.067122

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K27ac_35_28_0.549_1.028208e-133
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.052052	0.839302	0.057672	0.050974
0.028382	0.88489	0.059169	0.027559
0.143509	0.825202	0.031289	0.0
0.012833	0.026252	0.960915	0.0
0.174293	0.025328	0.70994	0.090439
0.006878	0.039907	0.614181	0.339035
0.022047	0.050441	0.746839	0.180673
0.043779	0.873284	0.009299	0.073638
0.047976	0.079711	0.851187	0.021126

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K27me3_14_15_0.516_6.561979e-39
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.087324	0.868166	0.029265	0.015246
0.13682	0.808706	0.031132	0.023342
0.046696	0.899385	0.037223	0.016697
0.037729	0.216683	0.745588	0.0
0.135522	0.026878	0.816178	0.021422
0.038478	0.011666	0.757403	0.192453
0.024209	0.039126	0.735875	0.20079
0.045443	0.889995	0.031402	0.033161
0.027573	0.115561	0.806308	0.050557

MOTIF	Liver_E16.5_H3K27me3_18_19_0.583_4.992024e-162
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.010863	0.965495	0.0	0.023642
0.059808	0.756257	0.03909	0.144845
0.117277	0.031481	0.704578	0.146664
0.033284	0.053522	0.888988	0.024206
0.062477	0.040784	0.817807	0.078932
0.140234	0.056291	0.71214	0.091335
0.062723	0.881042	0.018146	0.038089
0.07477	0.116889	0.583728	0.224613
0.040544	0.920937	0.026946	0.011573

MOTIF	Hindbrain_P0_H3K27me3_18_13_0.528_9.084608e-17
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.34014	0.210205	0.035613	0.414042
0.010213	0.920466	0.013234	0.056086
0.01457	0.925414	0.02493	0.035086
0.032751	0.792435	0.028532	0.146282
0.046976	0.060772	0.844914	0.047338
0.088619	0.03815	0.812211	0.061019
0.05527	0.118756	0.748638	0.077336
0.15559	0.03958	0.731797	0.073034
0.123968	0.804088	0.048745	0.023199
0.11939	0.244362	0.566165	0.070083

MOTIF	Lung_E14.5_H3K27me3_26_18_0.542_5.827983e-55
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.014895	0.927089	0.032686	0.025329
0.040105	0.91132	0.01504	0.033535
0.049849	0.793274	0.044484	0.112393
0.077869	0.034601	0.774403	0.113127
0.090074	0.047602	0.8415	0.020824
0.067452	0.036292	0.826794	0.069462
0.114875	0.05115	0.806047	0.027929
0.143106	0.736261	0.027284	0.093349
0.110712	0.140158	0.579152	0.169978

MOTIF	Neural-Tube_E11.5_H3K27me3_24_13_0.552_5.382962e-46
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.018404	0.833201	0.048834	0.099561
0.016955	0.908534	0.048567	0.025944
0.029919	0.789535	0.02338	0.157166
0.142652	0.079315	0.701284	0.076749
0.094616	0.028464	0.83601	0.04091
0.057559	0.03683	0.834816	0.070795
0.099266	0.062698	0.815069	0.022967
0.108865	0.813635	0.028934	0.048567
0.120069	0.044213	0.656522	0.179196

MOTIF	Hindbrain_E11.5_H3K27me3_48_47_0.511_1.427697e-09
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.014562	0.934253	0.008634	0.042551
0.009296	0.662078	0.028365	0.300261
0.026867	0.947013	0.013155	0.012965
0.018131	0.702336	0.050925	0.228607
0.178109	0.049034	0.757904	0.014953
0.039423	0.046102	0.782774	0.131701
0.071134	0.046236	0.86261	0.02002
0.075677	0.022459	0.744069	0.157795
0.061031	0.843361	0.0	0.095607

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K27me3_35_27_0.513_9.936925e-12
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.044879	0.772754	0.058307	0.124061
0.036467	0.850903	0.021383	0.091247
0.035508	0.829659	0.034856	0.099977
0.075818	0.753272	0.041092	0.129818
0.096674	0.013042	0.839197	0.051088
0.098634	0.063176	0.803458	0.034732
0.14819	0.031661	0.786746	0.033403
0.127487	0.037198	0.745386	0.089929
0.110211	0.822435	0.007827	0.059526

MOTIF	Midbrain_E16.5_H3K27me3_18_12_0.528_1.281163e-26
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.088348	0.739411	0.071673	0.100568
0.05547	0.808634	0.01795	0.117947
0.034498	0.838931	0.018096	0.108475
0.094829	0.82978	0.008353	0.067037
0.145818	0.032633	0.773907	0.047642
0.098722	0.083608	0.764719	0.052951
0.143488	0.027877	0.797981	0.030654
0.063995	0.017224	0.785356	0.133425
0.058874	0.858841	0.010961	0.071324
0.0	0.077131	0.922869	0.0

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K4me2_82_57_0.537_5.297656e-131
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.105124	0.114209	0.700322	0.080346
0.0585	0.89023	0.015749	0.035521
0.126813	0.756106	0.049987	0.067094
0.042086	0.802642	0.072859	0.082413
0.141002	0.692301	0.039269	0.127427
0.122955	0.024144	0.848829	0.004072
0.059832	0.012868	0.912751	0.014549
0.119792	0.021444	0.854276	0.004488
0.780465	0.042757	0.073322	0.103456

MOTIF	Intestine_E15.5_H3K4me2_62_36_0.558_9.890171e-246
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.060025	0.074833	0.800862	0.06428
0.161828	0.647376	0.08005	0.110747
0.114145	0.706617	0.096801	0.082438
0.070604	0.751881	0.067285	0.11023
0.023293	0.768287	0.074215	0.134206
0.101438	0.024008	0.847783	0.026772
0.093111	0.022657	0.857663	0.026569
0.12917	0.012855	0.850986	0.006989
0.865881	0.042696	0.041962	0.049461

MOTIF	Hindbrain_P0_H3K4me2_43_16_0.598_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.020536	0.911009	0.036278	0.032177
0.033134	0.916444	0.008595	0.041827
0.004034	0.815314	0.149265	0.031388
0.139132	0.120104	0.718229	0.022535
0.044163	0.064	0.832109	0.059728
0.063521	0.050648	0.811632	0.074199
0.044098	0.060188	0.799309	0.096405
0.038379	0.782539	0.031911	0.147171
0.08376	0.069963	0.604319	0.241959

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K4me2_33_13_0.619_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.058856	0.781973	0.036394	0.122777
0.021265	0.91724	0.038758	0.022737
0.070725	0.796555	0.041694	0.091026
0.149253	0.059124	0.72487	0.066753
0.089632	0.058751	0.808107	0.04351
0.040766	0.100022	0.782499	0.076714
0.109588	0.065951	0.785035	0.039426
0.051998	0.836181	0.013943	0.097877
0.073562	0.028268	0.814768	0.083401

MOTIF	Lung_E16.5_H3K4me2_41_22_0.586_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.019453	0.922908	0.016358	0.04128
0.05737	0.850513	0.04916	0.042958
0.081852	0.592632	0.21217	0.113346
0.122662	0.03297	0.74098	0.103388
0.195442	0.020788	0.76031	0.02346
0.076878	0.045169	0.787251	0.090701
0.054667	0.053018	0.873814	0.018501
0.067062	0.877219	0.020441	0.035278
0.066029	0.121254	0.766196	0.046521

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K4me2_65_51_0.559_1.496802e-187
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.043247	0.91099	0.0	0.045763
0.030241	0.903125	0.044271	0.022363
0.167621	0.773147	0.0	0.059233
0.014945	0.892581	0.049226	0.043248
0.057973	0.013531	0.919688	0.008808
0.06744	0.025631	0.882682	0.024247
0.045901	0.020307	0.901006	0.032786
0.134923	0.026835	0.832853	0.005389
0.371492	0.372028	0.139918	0.116563

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K4me2_93_45_0.509_2.531221e-23
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.088783	0.842465	0.0	0.068752
0.073584	0.823346	0.020456	0.082614
0.017175	0.935047	0.032522	0.015256
0.019705	0.779947	0.029314	0.171035
0.228223	0.015272	0.74119	0.015314
0.06153	0.108502	0.703266	0.126701
0.022292	0.039915	0.921126	0.016667
0.063954	0.05394	0.684014	0.198092
0.152089	0.784611	0.014673	0.048627
0.192853	0.02298	0.0	0.784167

MOTIF	Kidney_E16.5_H3K4me2_83_50_0.529_4.135078e-86
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.062094	0.866698	0.0	0.071207
0.027183	0.88229	0.03429	0.056237
0.021753	0.874787	0.063574	0.039886
0.021693	0.838491	0.028471	0.111344
0.243118	0.0	0.756882	0.0
0.042988	0.045683	0.87897	0.032359
0.0	0.050468	0.930838	0.018694
0.115662	0.049915	0.67879	0.155633
0.235482	0.559528	0.110805	0.094185

MOTIF	Limb_E13.5_H3K4me2_83_61_0.528_1.436296e-146
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.030222	0.892764	0.0	0.077014
0.018354	0.700008	0.05289	0.228748
0.037033	0.872105	0.042224	0.048638
0.0	0.795316	0.007441	0.197243
0.210996	0.01745	0.742472	0.029082
0.054995	0.012698	0.873995	0.058313
0.0	0.025161	0.952986	0.021854
0.060413	0.016295	0.832983	0.090309
0.244006	0.590319	0.0	0.165675

MOTIF	Limb_E12.5_H3K4me2_73_24_0.551_1.323794e-190
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.079602	0.739005	0.064501	0.116892
0.054008	0.770231	0.03876	0.137002
0.037584	0.85718	0.041088	0.064149
0.025647	0.834828	0.036095	0.10343
0.124553	0.02709	0.825424	0.022934
0.113255	0.060815	0.769747	0.056184
0.076282	0.028725	0.872241	0.022752
0.1111	0.05259	0.740206	0.096104
0.11409	0.767969	0.04624	0.071701

MOTIF	Midbrain_P0_H3K4me2_59_36_0.568_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.091553	0.70922	0.035018	0.16421
0.058634	0.787354	0.025951	0.128061
0.098878	0.82912	0.009504	0.062498
0.023614	0.934512	0.00687	0.035004
0.124854	0.025559	0.836573	0.013015
0.121157	0.078598	0.728237	0.072008
0.167953	0.024579	0.757117	0.05035
0.062735	0.0	0.91012	0.027145
0.11369	0.729793	0.0829	0.073617

MOTIF	Stomach_E16.5_H3K4me2_97_101_0.504_5.601167e-14
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.18065	0.704691	0.0	0.114658
0.013052	0.854002	0.0155	0.117446
0.022152	0.956377	0.021471	0.0
0.020892	0.740647	0.0	0.238461
0.377199	0.026555	0.580493	0.015753
0.033678	0.0	0.915512	0.050811
0.0	0.047864	0.925753	0.026383
0.040151	0.0	0.728274	0.231575
0.065764	0.921881	0.0	0.012355

MOTIF	Hindbrain_E11.5_H3K9ac_43_15_0.584_4.505047e-230
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.07885	0.190747	0.329773	0.40063
0.055439	0.122717	0.442472	0.379371
0.045775	0.892793	0.039428	0.022004
0.022168	0.935009	0.014426	0.028398
0.05435	0.720505	0.048803	0.176342
0.132518	0.031842	0.770219	0.065421
0.16891	0.016864	0.758712	0.055514
0.064085	0.062092	0.753908	0.119915
0.05461	0.020523	0.890594	0.034273
0.061547	0.788386	0.017557	0.132511
0.071143	0.042471	0.809516	0.076871

MOTIF	Liver_P0_H3K9ac_38_15_0.571_2.19645e-213
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.015831	0.892161	0.028552	0.063456
0.022218	0.900553	0.021769	0.05546
0.009167	0.927478	0.013234	0.050121
0.111334	0.161236	0.616585	0.110845
0.025943	0.050691	0.91192	0.011445
0.143725	0.026775	0.718093	0.111407
0.096351	0.043727	0.837404	0.022518
0.082034	0.702267	0.052012	0.163687
0.058711	0.039229	0.870678	0.031383
0.539407	0.105702	0.048022	0.306869
0.013319	0.497096	0.267769	0.221816

MOTIF	Neural-Tube_E11.5_H3K9ac_50_12_0.577_6.560093e-163
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.046695	0.827875	0.037887	0.087542
0.05484	0.835964	0.035929	0.073267
0.017359	0.848654	0.045827	0.08816
0.092295	0.131872	0.714752	0.061081
0.069296	0.063896	0.829909	0.0369
0.048907	0.05588	0.802828	0.092385
0.099173	0.022465	0.829847	0.048516
0.177162	0.699336	0.020289	0.103212
0.049721	0.042715	0.834331	0.073233
0.347276	0.077354	0.01731	0.55806
0.250065	0.220793	0.402335	0.126806